Протеопедия
 | |
| Тип бизнеса | Некоммерческая организация |
|---|---|
Тип сайта | Интернет-энциклопедия |
| Доступно в | Английский |
| Создано | Джоэл Л. Сассман, Эран Ходис и Хайме Прилуски |
| URL-адрес | proteopedia.org |
| Коммерческий | Нет |
| Запущен | 2007 |
| Текущий статус | Вечная работа |
Протеопедия — это вики , 3D-энциклопедия белков и других молекул . [1] [2] [3] [4]
Веб-сайт
[ редактировать ]Сайт содержит страницу со всеми записями в Банке данных белков (PDB), а также страницы, более подробно описывающие белковые структуры в целом, такие как ацетилхолинэстераза , [5] гемоглобин , [6] и фотосистема II [7] с представлением Jmol , которое выделяет функциональные сайты и лиганды . Он использует инструмент создания сцен, поэтому пользователям не нужно изучать язык сценариев JSmol для создания индивидуальных молекулярных сцен. Пользовательские сцены легко прикрепляются к «зеленым ссылкам» в описательном тексте, который отображает эти сцены в JSmol. Веб-браузер — это все, что необходимо для доступа к сайту и 3D-информации; никаких программ просмотра не требуется устанавливать.
Протеопедия стала лауреатом премии 2010 года за лучший сайт журнала The Scientist . [8]
Условия лицензирования
[ редактировать ]Весь добавляемый пользователем контент бесплатен и подпадает под действие лицензии GNU Free Documentation License . Протеопедия размещена в Израильском центре структурной протеомики. [9] в Институте науки Вейцмана .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ходис Э., Прилуски Дж., Марц Э., Силман И., Моулт Дж., Сассман Дж.Л. (2008). «Протеопедия — научная вики, устраняющая разрыв между трехмерной структурой и функцией биомакромолекул» . Геном Биол . 9 (8): 121 р. дои : 10.1186/gb-2008-9-8-r121 . ПМЦ 2575511 . ПМИД 18673581 .
- ^ Марц Э (2009). «Proteopedia.Org: научная «Вики», устраняющая разрыв между трехмерной структурой и функцией биомакромолекул» . Биополимеры . 92 (1): 76–7. дои : 10.1002/bip.21126 . ПМИД 19117028 .
- ^ Ходис Э., Прилуски Дж., Сассман Дж.Л. (2010). «Протеопедия: совместный виртуальный трехмерный веб-ресурс, посвященный структуре и функциям белков и биомолекул». Образование в области биохимии и молекулярной биологии . 38 (5): 341–2. дои : 10.1002/bmb.20431 . ПМИД 21567857 .
- ^ Прилуски, Дж; Ходис, Э.; Каннер, Д.; Декейтер, Вашингтон; Оберхользер, К.; Марц, Э.; Берчанский, А.; Харель, М.; Сассман, Дж. Л. (август 2011 г.). «Протеопедия: отчет о состоянии совместной трехмерной веб-энциклопедии белков и других биомолекул». Журнал структурной биологии . 175 (2): 244–252. дои : 10.1016/j.jsb.2011.04.011 . ПМИД 21536137 .
- ^ «Ацетилхолинэстераза» . Протеопедия.
- ^ «Гемоглобин» . Протеопедия.
- ^ «Фотосистема II» . Протеопедия.
- ^ Луиджи С. (сентябрь 2010 г.). «Web Gems Представляем победителей первого ежегодного конкурса Labbies, наши призы за лучшие веб-мультимедиа от лабораторий: Победитель веб-сайта: Proteopedia» . Ученый . 24 (9): 47. Архивировано из оригинала 12 апреля 2011 г. Проверено 15 декабря 2010 г.
Очень увлекательно. Заставлял меня искать и играть (и учиться) с ним долгое время. Очень информативный и хороший ресурс.
- ^ «Израильский центр структурной протеомики» . 12 ноября 2015 г.