Hsur
| HSUR1 | |
|---|---|
 Консервативная вторичная структура HSUR1. | |
| Идентификаторы | |
| Символ | HSUR1 |
| RFAM | RF01802 |
| Другие данные | |
| РНК тип | СНРНА |
| Домен (ы) | Герпесвирус Саимири , герпесвирус Ателс |
| PDB Структуры | PDBE |
| HSUR2 | |
|---|---|
 Консервативная вторичная структура HSUR2. | |
| Идентификаторы | |
| Символ | HSUR2 |
| RFAM | RF01802 |
| Другие данные | |
| РНК тип | СНРНА |
| Домен (ы) | Герпесвирус Саимири , герпесвирус Ателс |
| PDB Структуры | PDBE |
Хсурс ( герпесвирус -самири ) - это вирусные мелкие регуляторные РНК . Они найдены в герпесвирусе самири , который отвечает за агрессивные Т-клеточные лейкозы у приматов . Это ядерные РНК, которые связывают белки -хозяева с образованием небольших ядерных рибонуклеопротеинов (SNRNP). [ 1 ] РНК составляют 114–143 нуклеотидов в длину, а семейство HSUR было подразделено на HSURS, пронумерованные от 1 до 7. [ 2 ] Функция HSURS еще не идентифицирована; Они не влияют на транскрипцию, поэтому, как полагают, действуют посттранскрипционно, потенциально влияя на стабильность мРНК- хозяев . [ 1 ]
HSUR1 и 2 являются наиболее консервативными членами семьи в подгруппах HSV. Было показано, что HSUR1 связывает гетерогенный частиц частиц рибонуклеопротеина белок hnrnpd in vivo . [ 3 ] Другие hsurs связывают , как/elavl1 . [ 2 ] Они транскрибируются РНК -полимеразой II с промоторами , сходными с промоткой URNAS [ 1 ]
Особенности, разделенные всеми HSURS, включают: [ 1 ]
- 5'-триметилгуанозиновые колпачки
- 3 ′ терминальных стволовых петлей
- Канонический сат -связывающий белок SM (auuuuug)
Предлагаемая роль HSURS заключается в том, что они используют путь РНК-интерференции (RNAi) для манипулирования экспрессией генов-клеток-хозяина. Одна идентифицированная miRNA , которая реагирует на HSURS, является miR-27 . [ 4 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Конрад Н.К., Фок В., Казалла Д., Бора С., Стейц Дж. А. (2006). «Задача вирусных SNRNP» . Холодная весна Harb. Симптат Квадрат Биол . 71 : 377–384. doi : 10.1101/sqb.2006.71.057 . PMID 17381320 .
- ^ Jump up to: а беременный Tycowski KT, Kolev NG, Conrad NK, Fok V. и Steitz JA 2006. Постоянный мир мелких ядерных рибонуклеопротеинов. В мире РНК, 3 -е издание (ред. RF Gesteland et al.), С. 327. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbour, Нью -Йорк.
- ^ Кук Х.Л., Мишо Хе, Стейц Дж. (Май 2004 г.). «Маленькие ядерные РНК герпесвирус-самири рекрутируют, связывающие Au-связывающие белки, но не изменяют уровни мРНК, богатые AU, содержащимися AU, в Т-клетках, трансформированных вирусами» . Мол Клетка. Биол . 24 (10): 4522–4533. doi : 10.1128/mcb.24.10.4522-4533.2004 . PMC 400482 . PMID 15121869 .
- ^ Казалла, D; Ярио, т; Steitz, JA (18 июня 2010 г.). «Повышенная регуляция микроРНК-хозяина некодирующей РНК герпесвируса самири» . Наука . 328 (5985): 1563–1566. doi : 10.1126/science.1187197 . PMC 3075239 . PMID 20558719 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Albrecht JC, Fleckenstein B (апрель 1992 г.). «Нуклеотидная последовательность HSUR 6 и HSUR 7, два небольших РНК герпесвируса самири» . Нуклеиновые кислоты Res . 20 (7): 1810. DOI : 10.1093/NAR/20.7.1810 . PMC 312282 . PMID 1315960 .
- Lee Si, Murthy SC, Trimble JJ, Desrosiers RC, Steitz JA (август 1988 г.). «Четыре романа U RNA кодируются герпесвирусом». Клетка . 54 (5): 599–607. doi : 10.1016/s0092-8674 (88) 80004-7 . PMID 2842058 . S2CID 32003539 .
- Кук Х.Л., Мишо Хе, Стейц Дж. (Май 2004 г.). «Маленькие ядерные РНК герпесвирус-самири рекрутируют, связывающие Au-связывающие белки, но не изменяют уровни мРНК, богатые AU, содержащимися AU, в Т-клетках, трансформированных вирусами» . Мол Клетка. Биол . 24 (10): 4522–4533. doi : 10.1128/mcb.24.10.4522-4533.2004 . PMC 400482 . PMID 15121869 .
- Wassarman Da, Lee Si, Steitz Ja (февраль 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность РНК HSUR 5 от герпесвируса самири» . Нуклеиновые кислоты Res . 17 (3): 1258. doi : 10.1093/nar/17.3.1258 . PMC 331759 . PMID 2537954 .
- Ли С.И., Стейц Дж.А. (август 1990 г.). «Герпесвирусные самири экспрессируются и собираются в частицы рибонуклеопротеинов в отсутствие других вирусных генов» . J. Virol . 64 (8): 3905–3915. doi : 10.1128/JVI.64.8.3905-3915.1990 . PMC 249686 . PMID 2164602 .
- Fan XC, Myer Ve, Steitz Ja (октябрь 1997 г.). «Элементы, богатые AU, нацелены на небольшие ядерные РНК, а также мРНК для быстрой деградации» . Гены Дев . 11 (19): 2557–2568. doi : 10.1101/gad.11.19.2557 . PMC 316563 . PMID 9334320 .
- Myer Ve, Lee Si, Steitz Ja (февраль 1992 г.). «Вирусные малые ядерные рибонуклеопротеины связывают белок, участвующий в дестабилизации РНК мессенджера» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 89 (4): 1296–1300. doi : 10.1073/pnas.89.4.1296 . PMC 48436 . PMID 1311093 .
- Chou CS, Medveczky MM, Geck P, стих P, MedVeczzy PG (апрель 1995 г.). «Экспрессия IL-2 и IL-4 в T-лимфоцитах, трансформированных Herpesvrus saimiri » Вирусология 208 (2): 418–4 Doi : 10.1006/ viro.1995.1 PMID 7747414 .
- Geck P, Whitaker SA, Medveczky MM, Last TJ, Medveczky PG (январь 1994). «Небольшая экспрессия РНК из онкогенной области высоко онкогенной штамма герпесвируса самири». Вирусные гены . 8 (1): 25–34. doi : 10.1007/bf01703599 . PMID 8209420 . S2CID 43914499 .