Подавление экспрессии гена теплового шока (ROSE)

Подавление экспрессии гена теплового шока (ROSE)
Подавление экспрессии гена теплового шока (ROSE)
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности ROSE
Идентификаторы
Символ	РОЗА
Рфам	RF00435
Другие данные
РНК Тип	Цис-рег ; терморегулятор
Домен(ы)	Бактерии
ТАК	ТАК: 0000204
PDB Структуры	ПДБе

Элемент подавления экспрессии гена теплового шока (ROSE) представляет собой элемент РНК, обнаруженный в 5'-UTR некоторых белков теплового шока мРНК . Элемент ROSE представляет собой термометр РНК , который отрицательно регулирует теплового шока экспрессию генов . Считается, что вторичная структура изменяется под воздействием температуры, поэтому это термометр РНК. Эта структура блокирует доступ к месту связывания рибосомы при нормальной температуре. Однако во время теплового шока структура меняется, освобождая сайт связывания рибосомы и позволяя происходить экспрессии. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Частичная структура этого элемента РНК была определена с помощью ЯМР . ^{[ 1 ]}

РОЗА ₁ и РОЗА _АТ2

ROSE ₁ и ROSE _AT2 являются конкретными примерами элементов ROSE. ^{[ 4 ]} ROSE ₁ обнаружен в Bradyrhizobium japonicum , тогда как ROSE _AT2 является близкородственным элементом Agrobacterium tumefaciens . Два элемента РНК имеют схожие вторичные структуры , причем ROSE ₁ имеет дополнительную шпильку . ^{[ 4 ]} Все элементы ROSE содержат характерную «выпуклую букву G» напротив сайта связывания последовательности Шайна-Дальгарно , без этого нуклеотида термометр РНК теряет свою чувствительность к температуре. ^{[ 5 ]}

ИПбА

Экспрессию белка теплового шока IpbA у видов Pseudomonas контролируют с помощью РНК-термометра типа ROSE. Этот термометр состоит всего из двух шпилек. Он ингибирует трансляцию IpbA при низких температурах и разрешает трансляцию при повышении температуры. ^{[ 6 ]}

rhlA и lsdI ROSE элементы, подобные

Pseudomonas aeruginosa quorum sensing -зависимые факторы вирулентности могут подвергаться терморегуляции. ROSE-термометр, присутствующий в 5'UTR rhlA , и ROSE-подобный термометр в 5'UTR lasI блокируют трансляцию при более низких температурах. ^{[ 7 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Чоудхури С., Марис С., Аллен Ф.Х., Нарберхаус Ф. (2006). «Молекулярные основы измерения температуры РНК-термометром» . ЭМБО Дж. 25 (11): 2487–2497. дои : 10.1038/sj.emboj.7601128 . ПМЦ 1478195 . ПМИД 16710302 .
^ Нокер, А; Хаушерр Т; Балсигер С; Крстулович Н.П.; Хеннеке Х; Нарберхаус Ф (2001). «Термосенсор на основе мРНК контролирует экспрессию ризобиальных генов теплового шока» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (23): 4800–4807. дои : 10.1093/нар/29.23.4800 . ПМК 96696 . ПМИД 11726689 .
^ Балсигер, С; Рагаз С; барон С; Нарберхаус Ф (2004). «Репликон-специфическая регуляция генов малого теплового шока у Agrobacterium tumefaciens» . J Бактериол . 186 (20): 6824–6829. дои : 10.1128/JB.186.20.6824-6829.2004 . ПМК 522190 . ПМИД 15466035 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Нарберхаус Ф, Вальдмингхаус Т, Чоудхури С (январь 2006 г.). «РНК-термометры». ФЭМС Микробиол. Преподобный . 30 (1): 3–16. дои : 10.1111/j.1574-6976.2005.004.x . ПМИД 16438677 .
^ Нокер А., Хаушерр Т., Бальсигер С., Крстулович Н.П., Хеннеке Х., Нарберхаус Ф. (декабрь 2001 г.). «Термосенсор на основе мРНК контролирует экспрессию ризобиальных генов теплового шока» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (23): 4800–4807. дои : 10.1093/нар/29.23.4800 . ПМК 96696 . ПМИД 11726689 .
^ Краевский, СС; Нагель, М; Нарберхаус, Ф (2013). «Короткие розоподобные РНК-термометры контролируют синтез IbpA у видов Pseudomonas» . ПЛОС ОДИН . 8 (5): e65168. Бибкод : 2013PLoSO...865168K . дои : 10.1371/journal.pone.0065168 . ПМЦ 3669281 . ПМИД 23741480 .
^ Гроссо-Бесерра, Мария Виктория; Крода-Гарсия, Херардо; Мерино, Энрике; Сервин-Гонсалес, Луис; Мохика-Эспиноза, Рауль; Соберон-Чавес, Глория (28 октября 2014 г.). «Регулирование факторов вирулентности Pseudomonas aeruginosa с помощью двух новых РНК-термометров» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (43): 15562–15567. Бибкод : 2014PNAS..11115562G . дои : 10.1073/pnas.1402536111 . ISSN 1091-6490 . ПМЦ 4217398 . ПМИД 25313031 .

Дальнейшее чтение

Де Ла Фуэнте, М.; Валера С.; Мартинес-Гитарте, JL (2012). «НкРНК и терморегуляция: взгляд на прокариотов и эукариотов» . Письма ФЭБС . 586 (23): 4061–4069. дои : 10.1016/j.febslet.2012.10.018 . ПМИД 23098758 .

Внешние ссылки

Страница с элементом подавления экспрессии гена теплового шока (ROSE) в Rfam

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid16710302-1] Перейти обратно: ^а ^б Чоудхури С., Марис С., Аллен Ф.Х., Нарберхаус Ф. (2006). «Молекулярные основы измерения температуры РНК-термометром» . ЭМБО Дж. 25 (11): 2487–2497. дои : 10.1038/sj.emboj.7601128 . ПМЦ 1478195 . ПМИД 16710302 .

[2] Нокер, А; Хаушерр Т; Балсигер С; Крстулович Н.П.; Хеннеке Х; Нарберхаус Ф (2001). «Термосенсор на основе мРНК контролирует экспрессию ризобиальных генов теплового шока» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (23): 4800–4807. дои : 10.1093/нар/29.23.4800 . ПМК 96696 . ПМИД 11726689 .

[3] Балсигер, С; Рагаз С; барон С; Нарберхаус Ф (2004). «Репликон-специфическая регуляция генов малого теплового шока у Agrobacterium tumefaciens» . J Бактериол . 186 (20): 6824–6829. дои : 10.1128/JB.186.20.6824-6829.2004 . ПМК 522190 . ПМИД 15466035 .

[Narb06-4] Перейти обратно: ^а ^б Нарберхаус Ф, Вальдмингхаус Т, Чоудхури С (январь 2006 г.). «РНК-термометры». ФЭМС Микробиол. Преподобный . 30 (1): 3–16. дои : 10.1111/j.1574-6976.2005.004.x . ПМИД 16438677 .

[5] Нокер А., Хаушерр Т., Бальсигер С., Крстулович Н.П., Хеннеке Х., Нарберхаус Ф. (декабрь 2001 г.). «Термосенсор на основе мРНК контролирует экспрессию ризобиальных генов теплового шока» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (23): 4800–4807. дои : 10.1093/нар/29.23.4800 . ПМК 96696 . ПМИД 11726689 .

[6] Краевский, СС; Нагель, М; Нарберхаус, Ф (2013). «Короткие розоподобные РНК-термометры контролируют синтез IbpA у видов Pseudomonas» . ПЛОС ОДИН . 8 (5): e65168. Бибкод : 2013PLoSO...865168K . дои : 10.1371/journal.pone.0065168 . ПМЦ 3669281 . ПМИД 23741480 .

[7] Гроссо-Бесерра, Мария Виктория; Крода-Гарсия, Херардо; Мерино, Энрике; Сервин-Гонсалес, Луис; Мохика-Эспиноза, Рауль; Соберон-Чавес, Глория (28 октября 2014 г.). «Регулирование факторов вирулентности Pseudomonas aeruginosa с помощью двух новых РНК-термометров» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (43): 15562–15567. Бибкод : 2014PNAS..11115562G . дои : 10.1073/pnas.1402536111 . ISSN 1091-6490 . ПМЦ 4217398 . ПМИД 25313031 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

РОЗА 1 и РОЗА АТ2