Брадирризобиум японский

Брадирризобиум японский
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадота
Сорт:	Альфапротеобактерии
Заказ:	Гифомикробиалы
Семья:	Нитробактерии
Род:	Брадирризобий
Разновидность:	Б. японский
Биномиальное имя
	Брадирризобиум японский ; ( Киршнер , 1896 г. ) Иордания , 1982 г.
Синонимы
	Rhizobium japonicum Бьюкенен, 1926 г. ; Rhizobacterium japonicum Киршнера 1896 г. ;

Bradyrhizobium japonicum — вид бобово - корневых клубеньковых микросимбиотических азотфиксирующих бактерий . Этот вид является одним из многих грамотрицательных бактерий , палочковидных обычно называемых ризобиями . ^{[ нужна ссылка ]} В рамках этой широкой классификации, состоящей из трех групп, таксономические исследования с использованием секвенирования ДНК показывают, что B. japonicum принадлежит к группе гомологии II. ^{[ 2 ]}

Использование

Сельское хозяйство

B. japonicum добавляют в семена бобовых для повышения урожайности . ^{[ 3 ]} особенно в районах, где бактерия не является родной (например, почвы Арканзаса ). ^{[ 4 ]} Часто прививку приклеивают . к семенам перед посадкой с помощью раствора сахара ^{[ 5 ]}

Исследовать

Штамм B. japonicum , USDA110, используется в качестве модельного организма с 1957 года. ^{[ нужна ссылка ]} Он широко используется для изучения молекулярной генетики , физиологии и экологии растений из-за его относительно превосходной симбиотической активности азотфиксации с соей (т.е. по сравнению с другими видами ризобий). Весь его геном был секвенирован в 2002 году, и выяснилось, что этот вид имеет одну кольцевую хромосому с 9 105 828 парами оснований . ^{[ 6 ]}

Метаболизм

B. japonicum способен расщеплять катехин с образованием флороглюцинкарбоновой кислоты , которая далее декарбоксилируется до флороглюцина , который дегидроксилируется до резорцина и гидроксихинола . ^{[ нужна ссылка ]}

B. japonicum обладает геном nosRZDFYLX , который способствует денитрификации и имеет две каталитические субъединицы - Cu-a и Cu-z (с несколькими остатками гистидина). Он управляет каскадом экспрессии, который может воспринимать градиенты кислорода, называемый «FixJ-FixK2-FixK1». FixJ положительно регулирует FixK2, который активирует гены азотного дыхания, а также FixK1. Мутанты FixK1 не могут дышать азотом из-за дефектной кататильной субъединицы меди (Cu-z) в nosRZDFYLX . ^{[ 7 ]}

Генетическая трансформация

Естественная генетическая трансформация бактерий представляет собой половой процесс, включающий перенос ДНК из одной клетки в другую через промежуточную среду и интеграцию донорной последовательности в геном реципиента путем гомологичной рекомбинации . Клетки B. japonicum способны подвергаться трансформации. ^{[ 8 ]} Они становятся компетентными к поглощению ДНК на поздней лог-фазе.

Ссылки

^ Джордан, округ Колумбия (1982). «Перенос Rhizobium japonicum Buchanan 1980 в Bradyrhizobium gen. nov., род медленно растущих корневых клубеньковых бактерий бобовых растений» . Международный журнал систематической бактериологии . 32 : 136–139. дои : 10.1099/00207713-32-1-136 .
^ Холлис, AB; Клоос, МЫ; Элкан, GE (1981). «Исследования гибридизации ДНК: ДНК Rhizobium japonicum и родственных Rhizobiaceae» . Журнал общей микробиологии . 123 : 215–222. дои : 10.1099/00221287-123-2-215 .
^ Перселл, Ларри К.; Салмерон, Монтсеррат; Эшлок, Лэнни (2013). «Глава 5» . Справочник по производству сои в Арканзасе — MP197 . Литл-Рок, Арканзас: Служба кооперативного распространения знаний Университета Арканзаса. п. 5. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года . Проверено 21 февраля 2016 г.
^ Перселл, Ларри К.; Салмерон, Монтсеррат; Эшлок, Лэнни (2000). «Глава 7» . Справочник по производству сои в Арканзасе — MP197 . Литл-Рок, Арканзас: Служба кооперативного распространения знаний Университета Арканзаса. стр. 2–3. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года . Проверено 21 февраля 2016 г.
^ Беннетт, Дж. Майкл; Риторика, почетный; Хикс, Дейл Р.; Наив, Сет Л.; Беннетт, Нэнси Буш (2014). Полевая книга соевых бобов Миннесоты (PDF) . Сент-Пол, Миннесота: Расширение Университета Миннесоты. п. 79. Архивировано из оригинала (PDF) 30 сентября 2013 г. Проверено 21 февраля 2016 г.
^ Канеко, Т; Накамура, Ю; Сато, С; Минамисава, К; Утиуми, Т; Сасамото, С; Ватанабэ, А; Идесава, К; Иригучи, М; Кавасима, К; Кохара, М; Мацумото, М; Симпо, С; Цуруока, Х; Вада, Т; Ямада, М; Табата, С (2002). «Полная геномная последовательность азотфиксирующей симбиотической бактерии Bradyrhizobium japonicum USDA110» . Исследование ДНК . 9 (6): 189–197. дои : 10.1093/dnares/9.6.189 . ПМИД 12597275 .
^ Неллен-Антаматтен, Д.; Росси, П.; Прейсиг, О.; Куллик И.; Бабст, М.; Фишер, Х.М.; Хеннеке, Х. (1998). «Bradyrhizobium japonicum FixK 2, важнейший дистрибьютор в зависимом от FixLJ регуляторном каскаде контроля генов, индуцируемых низким уровнем кислорода» . Журнал бактериологии . 180 (19): 5251–5255. дои : 10.1128/JB.180.19.5251-5255.1998 . ISSN 0021-9193 . ПМК 107567 . ПМИД 9748464 .
^ Райна, Дж.Л.; Моди, В.В. (1972). «Связывание и трансформация дезоксирибонуклеата у Rhizobium japonicum» . Журнал бактериологии . 111 (2): 356–360. дои : 10.1128/jb.111.2.356-360.1972 . ISSN 0021-9193 . ПМК 251290 . ПМИД 4538250 .

Внешние ссылки

[1] Джордан, округ Колумбия (1982). «Перенос Rhizobium japonicum Buchanan 1980 в Bradyrhizobium gen. nov., род медленно растущих корневых клубеньковых бактерий бобовых растений» . Международный журнал систематической бактериологии . 32 : 136–139. дои : 10.1099/00207713-32-1-136 .

[2] Холлис, AB; Клоос, МЫ; Элкан, GE (1981). «Исследования гибридизации ДНК: ДНК Rhizobium japonicum и родственных Rhizobiaceae» . Журнал общей микробиологии . 123 : 215–222. дои : 10.1099/00221287-123-2-215 .

[Chapter5-3] Перселл, Ларри К.; Салмерон, Монтсеррат; Эшлок, Лэнни (2013). «Глава 5» . Справочник по производству сои в Арканзасе — MP197 . Литл-Рок, Арканзас: Служба кооперативного распространения знаний Университета Арканзаса. п. 5. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года . Проверено 21 февраля 2016 г.

[Chapter7-4] Перселл, Ларри К.; Салмерон, Монтсеррат; Эшлок, Лэнни (2000). «Глава 7» . Справочник по производству сои в Арканзасе — MP197 . Литл-Рок, Арканзас: Служба кооперативного распространения знаний Университета Арканзаса. стр. 2–3. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 года . Проверено 21 февраля 2016 г.

[5] Беннетт, Дж. Майкл; Риторика, почетный; Хикс, Дейл Р.; Наив, Сет Л.; Беннетт, Нэнси Буш (2014). Полевая книга соевых бобов Миннесоты (PDF) . Сент-Пол, Миннесота: Расширение Университета Миннесоты. п. 79. Архивировано из оригинала (PDF) 30 сентября 2013 г. Проверено 21 февраля 2016 г.

[6] Канеко, Т; Накамура, Ю; Сато, С; Минамисава, К; Утиуми, Т; Сасамото, С; Ватанабэ, А; Идесава, К; Иригучи, М; Кавасима, К; Кохара, М; Мацумото, М; Симпо, С; Цуруока, Х; Вада, Т; Ямада, М; Табата, С (2002). «Полная геномная последовательность азотфиксирующей симбиотической бактерии Bradyrhizobium japonicum USDA110» . Исследование ДНК . 9 (6): 189–197. дои : 10.1093/dnares/9.6.189 . ПМИД 12597275 .

[7] Неллен-Антаматтен, Д.; Росси, П.; Прейсиг, О.; Куллик И.; Бабст, М.; Фишер, Х.М.; Хеннеке, Х. (1998). «Bradyrhizobium japonicum FixK 2, важнейший дистрибьютор в зависимом от FixLJ регуляторном каскаде контроля генов, индуцируемых низким уровнем кислорода» . Журнал бактериологии . 180 (19): 5251–5255. дои : 10.1128/JB.180.19.5251-5255.1998 . ISSN 0021-9193 . ПМК 107567 . ПМИД 9748464 .

[8] Райна, Дж.Л.; Моди, В.В. (1972). «Связывание и трансформация дезоксирибонуклеата у Rhizobium japonicum» . Журнал бактериологии . 111 (2): 356–360. дои : 10.1128/jb.111.2.356-360.1972 . ISSN 0021-9193 . ПМК 251290 . ПМИД 4538250 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]