Изохора (генетика)
В генетике изохора — это большая область геномной ДНК (более 300 килобаз ) с высокой степенью единообразия по содержанию GC ; то есть основания гуанина (G) и цитозина (C). Распределение оснований внутри генома неслучайно: разные регионы генома имеют разное количество пар оснований GC, так что регионы можно классифицировать и идентифицировать по доле содержащихся в них пар оснований GC.
Бернарди и его коллеги впервые заметили неоднородность состава геномов позвоночных с помощью термического плавления и центрифугирования в градиенте плотности . [1] [2] [3] Фрагменты ДНК, выделенные градиентным центрифугированием, позже были названы «изохорами». [4] который впоследствии был определен как «очень длинные (намного более 200 КБ) сегменты ДНК», которые «достаточно однородны по базовому составу и принадлежат к небольшому числу основных классов, отличающихся различиями в содержании гуанина-цитозина (GC)». [3] Впоследствии изохоры «выросли» и, как утверждалось, имели размер «> 300 КБ». [5] [6] Теория предполагала, что изохорный состав геномов заметно различается у «теплокровных» ( гомеотермных ) позвоночных и «хладнокровных» ( пойкилотермных ) позвоночных. [3] и позже стала известна как теория изохоры.
Гипотеза термодинамической стабильности
[ редактировать ]Теория изохоры утверждала, что геном «теплокровных» позвоночных (млекопитающих и птиц) представляет собой мозаику длинных изохорных областей чередующегося состава с низким и высоким содержанием GC, в отличие от генома «хладнокровных» позвоночных (рыб и рыб). и земноводные), у которых, как предполагалось, отсутствовали изохоры, богатые GC. [3] [7] [8] [9] [10] [11] Эти результаты были объяснены гипотезой термодинамической стабильности, объясняющей структуру генома температурой тела. Предполагалось, что изохоры, богатые GC, являются формой адаптации к давлению окружающей среды, поскольку увеличение геномного содержания GC может защитить ДНК, РНК и белки от деградации под воздействием тепла. [3] [4] Несмотря на свою привлекательную простоту, гипотеза термодинамической стабильности неоднократно доказывала свою ошибочность. [12] [13] [14] . [15] [16] [17] [18] [19] Многие авторы показали отсутствие связи между температурой и содержанием GC у позвоночных, [17] [18] в то время как другие показали существование доменов, богатых GC, у «хладнокровных» позвоночных, таких как крокодилы, амфибии и рыбы. [14] [20] [21] [22]
Принципы теории изохоры
[ редактировать ]Теория изохор была первой, кто выявил неоднородность нуклеотидного состава в геномах позвоночных и предсказал, что геном «теплокровных» позвоночных, таких как млекопитающие и птицы, представляет собой мозаику изохор (Бернарди и др., 1985). Геном человека, например, был описан как мозаика чередующихся изохор с низким и высоким содержанием GC, принадлежащих пяти композиционным семействам: L1, L2, H1, H2 и H3, соответствующие диапазоны содержания GC которых, как сообщалось, составляли <38%. , 38%-42%, 42%-47%, 47%-52% и >52% соответственно. [23]
Основные предсказания теории изохоры заключаются в следующем:
- Содержание GC в третьем положении кодона (GC3) генов, кодирующих белок, коррелирует с содержанием GC в изохорах, в которые встроены соответствующие гены. [23]
- Организация генома теплокровных позвоночных представляет собой мозаику, состоящую преимущественно из изохор, богатых GC. [24] [25]
- Организация генома хладнокровных позвоночных характеризуется низким содержанием GC и меньшей композиционной гетерогенностью, чем у теплокровных позвоночных. Гомогенные домены не достигают высоких уровней GC, достигаемых геномами теплокровных позвоночных. [24] [25]
Споры нейтралистов и селекционистов
[ редактировать ]Два противоположных объяснения, пытавшихся объяснить образование изохор, активно обсуждались в рамках спора нейтралистов и селекционистов. Первая точка зрения заключалась в том, что изохоры отражают переменные мутационные процессы среди геномных регионов, соответствующие нейтральной модели. [26] [27] Альтернативно, изохоры были постулированы как результат естественного отбора для определенного композиционного окружения, необходимого для определенных генов. [28] Несколько гипотез вытекают из селекционистской точки зрения, например, гипотеза термодинамической стабильности. [6] [29] и гипотеза предвзятой конверсии генов. [27] Пока ни одна из теорий не дает исчерпывающего объяснения структуры генома, и эта тема все еще дискутируется.
Взлет и падение теории изохоры
[ редактировать ]Теория изохоры на многие годы стала одной из самых полезных теорий молекулярной эволюции . Это была первая и наиболее полная попытка объяснить долгосрочную композиционную гетерогенность геномов позвоночных в эволюционных рамках. Несмотря на интерес к модели изохоры в первые годы, в последние годы методология, терминология и прогнозы теории подверглись сомнению.
Поскольку эта теория была предложена в 20 веке до того, как были секвенированы полные геномы, ее не могли полностью проверить в течение почти 30 лет. В начале 21 века, когда стали доступны первые геномы, стало ясно, что изохоры не существуют в геноме человека. [30] ни в геномах других млекопитающих. [31] Когда изохоры найти не удалось, многие подвергли критике само существование изохор. [30] [32] [33] [34] [35] Было показано, что самый важный предиктор изохор, GC3, не имеет предсказуемой силы. [36] [37] к содержанию GC в близлежащих геномных регионах, опровергая результаты более чем 30-летних исследований, которые легли в основу многих исследований изохор. Создатели изохоры ответили, что этот термин был неправильно истолкован. [23] [38] [39] поскольку изохоры - это не «однородные», а скорее довольно однородные области с неоднородной природой (особенно) богатых GC областей в масштабе 5 кб , [40] что только усугубило и без того растущую путаницу. Причиной этого продолжающегося разочарования было неоднозначное определение изохор как длинных и однородных , позволившее одним исследователям обнаружить «изохоры», а другим — отвергнуть их, хотя оба лагеря использовали одни и те же данные.
Неприятным побочным эффектом этого противоречия стала «гонка вооружений», в ходе которой изохоры часто переопределяются и переименовываются после противоречивых результатов, которые не смогли выявить «мозаику изохор». [23] [32] [34] Неудачным итогом этой полемики и последовавшей за ней терминологической-методологической грязи стала потеря интереса к изохорам со стороны научного сообщества. Когда самая важная основная концепция изохорной литературы — гипотеза термодинамической стабильности — была отвергнута, теория потеряла свою привлекательность. Даже сегодня не существует четкого определения изохор и алгоритма обнаружения изохор. [41] Изохоры обнаруживаются вручную путем визуального контроля кривых содержания GC. [42] однако, поскольку этому подходу не хватает научной ценности и его трудно воспроизвести независимыми группами, результаты остаются спорными.
Композиционная модель предметной области
[ редактировать ]отказались от изучения изохор Поскольку большинство ученых де-факто , была предложена альтернативная теория для описания композиционной организации геномов в соответствии с новейшими геномными исследованиями. Композиционная модель домена изображает геномы как смесь коротких и длинных однородных и неоднородных доменов. [35] Теория определяет «композиционные домены» как области генома с различным содержанием GC, определенным алгоритмом вычислительной сегментации. [35] Однородность композиционных доменов сравнивается с гомогенностью хромосомы, на которой они расположены, с помощью F-теста, который разделяет их на композиционно однородные домены и композиционно неоднородные домены на основе результатов теста. Однородные по составу домены достаточной длины (≥ 300 т.п.н.) называются изохорами или изохорными доменами. Эти термины соответствуют литературным данным, поскольку они обеспечивают четкое различие между изохорными и неизохорными доменами.
Комплексное исследование человеческого генома выявило геномную организацию, в которой две трети генома представляют собой смесь множества коротких по составу однородных доменов и относительно небольшого числа длинных. Оставшаяся часть генома состоит из неоднородных доменов. С точки зрения охвата только 1% от общего числа композиционно однородных доменов можно считать «изохорами», покрывающими менее 20% генома. [35]
С момента своего создания теория привлекла широкое внимание и широко использовалась для объяснения результатов, полученных в результате более чем дюжины новых исследований по секвенированию генома. [31] [43] [44] [45] [46] [47] [48] [49] [50] Однако многие важные вопросы остаются открытыми, например, какие эволюционные силы сформировали структуру композиционных доменов и как они различаются у разных видов.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Макайя, Тьери и Бернарди (1976). «Подход к организации геномов эукариот на макромолекулярном уровне». Журнал молекулярной биологии . 108 (1): 237–254. дои : 10.1016/S0022-2836(76)80105-2 . ПМИД 826644 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Тьери, Макайя и Бернарди (1976). «Анализ геномов эукариот методом центрифугирования в градиенте плотности». Журнал молекулярной биологии . 108 (1): 219–235. дои : 10.1016/S0022-2836(76)80104-0 . ПМИД 826643 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б с д и Бернарди; Олофссон, Биргитта; Филипски, Ян; Зериал, Марино; Салинас, Хулио; Куни, Жерар; Менье-Ротиваль, Мишель; Родье, Фрэнсис; и др. (1985). «Мозаичный геном теплокровных позвоночных». Наука . 228 (4702): 953–958. Бибкод : 1985Sci...228..953B . дои : 10.1126/science.4001930 . ПМИД 4001930 .
- ^ Jump up to: а б Куни; Сориано, П; Макайя, Дж; Бернарди, Дж; и др. (1981). «Основные компоненты геномов мыши и человека: получение, основные свойства и неоднородность состава» . Европейский журнал биохимии . 115 (2): 227–233. дои : 10.1111/j.1432-1033.1981.tb05227.x . ПМИД 7238506 .
- ^ Салинас; Зериал, М; Филипски, Дж; Крепен, М; Бернарди, Дж; и др. (1987). «Неслучайное распределение провирусных последовательностей MMTV в геноме мыши» . Нуклеиновые кислоты Рез . 15 (7): 3009–3022. дои : 10.1093/нар/15.7.3009 . ПМК 340712 . ПМИД 3031617 .
- ^ Jump up to: а б Бернарди (1993). «Геном позвоночных: изохоры и эволюция» . Молекулярная биология и эволюция . 10 (1): 186–204. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a039994 . ПМИД 8450755 .
- ^ Бернарди (1995). «Геном человека: организация и эволюционная история». Ежегодный обзор генетики . 29 : 445–476. дои : 10.1146/annurev.ge.29.120195.002305 . ПМИД 8825483 .
- ^ Бернарди, Хьюз и Муширу (1997). «Основные композиционные переходы в геноме позвоночных». Журнал молекулярной эволюции . 44 Приложение 1 (S1): S44–51. Бибкод : 1997JMolE..44S..44B . дои : 10.1007/PL00000051 . ПМИД 9071011 . S2CID 25234820 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Робинсон, Готье и Муширу (1997). «Эволюция изохор у грызунов» . Молекулярная биология и эволюция . 14 (8): 823–828. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025823 . ПМИД 9254920 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Гальтье и Муширу; Муширу, Д. (1998). «Эволюция изохор у млекопитающих: наследственная структура, подобная человеку» . Генетика . 150 (4): 1577–1584. дои : 10.1093/генетика/150.4.1577 . ПМК 1460440 . ПМИД 9832533 .
- ^ Оливер; Бернаола-Гальван, П; Карпена, П; Роман-Рольдан, Р.; и др. (2001). «Карты изохорных хромосом геномов эукариот». Джин . 276 (1–2): 47–56. CiteSeerX 10.1.1.14.1712 . дои : 10.1016/S0378-1119(01)00641-2 . ПМИД 11591471 .
- ^ Аота и Икемура; Икемура, Т. (1986). «Разнообразие содержания G+C в третьем положении кодонов в генах позвоночных и его причины» . Нуклеиновые кислоты Рез . 14 (16): 6345–6355. дои : 10.1093/нар/14.16.6345 . ПМК 311650 . ПМИД 3748815 .
- ^ Гальтье и Лобри; Лобри, младший (1997). «Связь между содержанием G+C в геноме, вторичными структурами РНК и оптимальной температурой роста у прокариот». Журнал молекулярной эволюции . 44 (6): 632–636. Бибкод : 1997JMolE..44..632G . дои : 10.1007/PL00006186 . ПМИД 9169555 . S2CID 19054315 .
- ^ Jump up to: а б Хьюз, Зелус и Муширу (1999). «Теплокровная изохорная структура нильских крокодилов и черепах» . Молекулярная биология и эволюция . 16 (11): 1521–1527. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a026064 . ПМИД 10555283 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Эйр-Уокер и Херст; Херст, Л.Д. (2001). «Эволюция изохор». Нат преподобный Жене . 2 (7): 549–555. дои : 10.1038/35080577 . ПМИД 11433361 . S2CID 2203093 .
- ^ Херст и Мерчант; Купец, Арканзас (2001). «Высокое содержание гуанина-цитозина не является адаптацией к высокой температуре: сравнительный анализ среди прокариот» . Труды Королевского общества Б. 268 (1466): 493–497. дои : 10.1098/rspb.2000.1397 . ПМЦ 1088632 . ПМИД 11296861 .
- ^ Jump up to: а б Белль, Смит и Эйр-Уокер (2002). «Анализ филогенетического распределения изохор у позвоночных и проверка гипотезы термостабильности». Журнал молекулярной эволюции . 55 (3): 356–363. Бибкод : 2002JMolE..55..356B . дои : 10.1007/s00239-002-2333-1 . ПМИД 12187388 . S2CID 16596135 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б Рим, Джонс и Сомеро (2003). «Базовые композиции генов, кодирующих {альфа}-актин и лактатдегидрогеназу-A от по-разному адаптированных позвоночных, не обнаруживают температурно-адаптивных изменений в содержании G + C» . Молекулярная биология и эволюция . 20 (1): 105–110. дои : 10.1093/molbev/msg008 . ПМИД 12519912 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Белль; Дюре, Л; Галтье, Н.; Эйр-Уокер, А; и др. (2004). «Снижение количества изохор у млекопитающих: оценка вариаций содержания GC в филогении млекопитающих». Журнал молекулярной эволюции . 58 (6): 653–660. Бибкод : 2004JMolE..58..653B . CiteSeerX 10.1.1.333.2159 . дои : 10.1007/s00239-004-2587-x . ПМИД 15461422 . S2CID 18281444 .
- ^ Хьюз, Фридман и Мюррей (2002). «Общегеномная картина синонимичных нуклеотидных замен в двух полных геномах микобактерии туберкулеза» . Новые инфекционные заболевания . 8 (11): 1342–1346. дои : 10.3201/eid0811.020064 . ПМЦ 2738538 . ПМИД 12453367 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Константини, Аулетта и Бернарди (2007). «Схемы изохор и распределение генов в геномах рыб» . Геномика . 90 (3): 364–371. дои : 10.1016/j.ygeno.2007.05.006 . ПМИД 17590311 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Симонова, Майтанова, Ариас-Родригес, Моржковский, Коржинкова, Кэвин, Джонсон Покорна, Долежалкова, Флайшханс, Нормандо, Раб, Мейер и Бернатчес (2016). «Композиционная организация генома гарса больше похожа на млекопитающих, чем на других лучепёрых рыб» . Журнал экспериментальной зоологии . 328 (7): 607–619. дои : 10.1002/jez.b.22719 . ПМИД 28035749 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б с д Бернарди (2001). «Недоразумения об изохорах. Часть 1». Джин . 276 (1–2): 3–13. дои : 10.1016/S0378-1119(01)00644-8 . ПМИД 11591466 .
- ^ Jump up to: а б Бернарди (2000). «Изохоры и эволюционная геномика позвоночных». Джин . 241 (1): 3–17. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00485-0 . ПМИД 10607893 .
- ^ Jump up to: а б Бернарди (2000). «Композиционная эволюция геномов позвоночных». Джин . 259 (1–2): 31–43. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00441-8 . ПМИД 11163959 .
- ^ Вулф, Шарп и Ли; Острый; Ли (1989). «Скорость мутаций различается в зависимости от региона генома млекопитающих». Природа . 337 (6204): 283–285. Бибкод : 1989Natur.337..283W . дои : 10.1038/337283a0 . ПМИД 2911369 . S2CID 4336541 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б Галтье; Пигано, Дж; Муширу, Д; Дюре, Л; и др. (2001). «Эволюция содержания GC в геномах млекопитающих: гипотеза предвзятой конверсии генов» . Генетика . 159 (2): 907–911. дои : 10.1093/генетика/159.2.907 . ПМК 1461818 . ПМИД 11693127 .
- ^ Матасси, Шарп и Готье (1999). «Влияние хромосомного расположения на эволюцию последовательности генов у млекопитающих» . Современная биология . 9 (15): 786–791. дои : 10.1016/S0960-9822(99)80361-3 . ПМИД 10469563 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Бернарди и Бернарди; Бернарди, Дж. (1986). «Композиционные ограничения и эволюция генома». Журнал молекулярной эволюции . 24 (1–2): 1–11. Бибкод : 1986JMolE..24....1B . дои : 10.1007/BF02099946 . ПМИД 3104608 . S2CID 26783774 .
- ^ Jump up to: а б Жан; Линтон, Л.М.; Биррен, Б; Нусбаум, К; Зоди, MC; Болдуин, Дж; Девон, К; Дьюар, К; и др. (2001). «Первичное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Природа . 409 (6822): 860–921. Бибкод : 2001Natur.409..860L . дои : 10.1038/35057062 . ПМИД 11237011 .
- ^ Jump up to: а б Эльсик; Элсик, Кристина Г.; Теллам, Росс Л.; Уорли, Ким С.; Гиббс, Ричард А.; Элсик, Кристина Г.; Теллам, Росс Л.; Гиббс, Ричард А.; Музный, Донна М.; и др. (2009). «Последовательность генома тауринового крупного рогатого скота: окно в биологию и эволюцию жвачных животных» . Наука . 324 (5926): 522–528. Бибкод : 2009Sci...324..522A . дои : 10.1126/science.1169588 . ПМК 2943200 . ПМИД 19390049 .
- ^ Jump up to: а б Некрутенко и Ли; Ли, WH (2000). «Оценка композиционной гетерогенности внутри и между геномами эукариот» . Геномные исследования . 10 (12): 1986–1995. дои : 10.1101/гр.10.12.1986 . ПМК 313050 . ПМИД 11116093 .
- ^ Херинг и Кипр; Кипр, Дж (2001). «Нет изохор в хромосомах человека 21 и 22?». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 280 (2): 567–573. дои : 10.1006/bbrc.2000.4162 . ПМИД 11162557 .
- ^ Jump up to: а б Коэн; Даган, Т; Стоун, Л; Граур, Д; и др. (2005). «GC-состав генома человека: в поисках изохор» . Молекулярная биология и эволюция . 22 (5): 1260–1272. дои : 10.1093/molbev/msi115 . ПМИД 15728737 .
- ^ Jump up to: а б с д Эльхайк; Граур, Д; Йосич, К; Ландан, Дж; и др. (2010). «Идентификация композиционно однородных и неоднородных доменов в геноме человека с использованием нового алгоритма сегментации» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (15): е158. дои : 10.1093/nar/gkq532 . ПМЦ 2926622 . ПМИД 20571085 .
- ^ Эльхайк, Ландан и Граур (2009). «Может ли содержание GC в позициях третьих кодонов использоваться в качестве показателя состава изохор?» . Молекулярная биология и эволюция . 26 (8): 1829–1833. дои : 10.1093/molbev/msp100 . ПМИД 19443854 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Татаринова; Александров, Н.Н.; Бук, Дж. Б.; Фельдманн, Калифорния; и др. (2010). «Биология GC3 кукурузы, риса, сорго и других трав» . БМК Геномика . 11 :308. дои : 10.1186/1471-2164-11-308 . ПМЦ 2895627 . ПМИД 20470436 .
- ^ Ли; Бернаола-Гальван, Педро; Карпена, Педро; Оливер, Хосе Л; и др. (2003). «Изохоры заслуживают приставки «изо» ». Вычислительная биология и химия . 27 (1): 5–10. arXiv : физика/0209080 . Бибкод : 2002физика...9080L . дои : 10.1016/S1476-9271(02)00090-7 . ПМИД 12798034 . S2CID 53305489 .
- ^ Клэй и Бернарди (2005). «Как не искать изохоры: ответ Коэну и др.» . Молекулярная биология и эволюция . 22 (12): 23:15–23:17. дои : 10.1093/molbev/msi231 . ПМИД 16093569 .
- ^ Ромигье; Ранвез, В; Дузери, Э.Дж.; Галтье, Н.; и др. (2010). «Сопоставление динамики содержания GC в 33 геномах млекопитающих: связь с особенностями жизненного цикла и размерами хромосом» . Геномные исследования . 20 (8): 1001–1009. дои : 10.1101/гр.104372.109 . ПМЦ 2909565 . ПМИД 20530252 .
- ^ Эльхайк, Граур и Йосич (2010). «Сравнительное тестирование алгоритмов сегментации ДНК с использованием эталонного моделирования» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (5): 1015–1024. дои : 10.1093/molbev/msp307 . ПМИД 20018981 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Константини; Клэй, О; Аулетта, Ф; Бернарди, Дж; и др. (2006). «Изохорная карта хромосом человека» . Геномные исследования . 16 (4): 536–541. дои : 10.1101/гр.4910606 . ПМК 1457033 . ПМИД 16597586 .
- ^ Робинсон, Джин Э.; Гиббс, Ричард А.; Вайнсток, Джордж М.; Уорли, Ким С.; Эванс, Джей Д.; Малешка, Рышард (2006). «Изучение социальных насекомых на основе генома медоносной пчелы Apis mellifera» . Природа . 443 (7114): 931–949. Бибкод : 2006Natur.443..931T . дои : 10.1038/nature05260 . ПМК 2048586 . ПМИД 17073008 .
- ^ Содергрен; Вайнсток, Джордж М.; Дэвидсон, Эрик Х.; Кэмерон, Р. Эндрю; Гиббс, Ричард А.; Вайншток, Джордж М.; Ангерер, Роберт С.; Ангерер, Линн М.; Арноне, Мария Ина; и др. (2006). «Геном морского ежа Strongylocentrotus purpuratus» . Наука . 314 (5801): 941–952. Бибкод : 2006Sci...314..941S . дои : 10.1126/science.1133609 . ПМК 3159423 . ПМИД 17095691 .
- ^ Ричардс, С.; Гиббс, Ричард А.; Вайнсток, Джордж М.; Браун, Сьюзен Дж.; Денелл, Робин; Биман, Ричард В.; Гиббс, Ричард; Биман, Ричард В.; и др. (2008). «Геном модельного жука и вредителя Tribolium castaneum» . Природа . 452 (7190): 949–955. Бибкод : 2008Natur.452..949R . дои : 10.1038/nature06784 . ПМИД 18362917 .
- ^ Киркнесс; Хаас, Би Джей; Солнце, Вт; Брэйг, HR; Перотти, Массачусетс; Кларк, Дж. М.; Ли, Ш.; Робертсон, HM; Кеннеди, штат Колорадо; и др. (2010). «Последовательности генома человеческой вши и ее первичного эндосимбионта дают представление о постоянном паразитическом образе жизни» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (27): 12168–12173. Бибкод : 2010PNAS..10712168K . дои : 10.1073/pnas.1003379107 . ПМК 2901460 . ПМИД 20566863 .
- ^ Веррен; Ричардс, С; Дежарден, Калифорния; Нихуис, О; Гадау, Дж; Колбурн, Дж. К.; Группа по работе с геномом Насонии; Веррен, Дж. Х.; Ричардс, С; и др. (2010). «Функциональные и эволюционные данные из геномов трех паразитоидных видов Nasonia» . Наука . 327 (5963): 343–348. Бибкод : 2010Sci...327..343. . дои : 10.1126/science.1178028 . ПМЦ 2849982 . ПМИД 20075255 .
- ^ Смит; Зимин А.; Холт, К.; Абухейф, Э.; Бентон, Р.; Кэш, Э.; Кросет, В.; Карри, ЧР; Эльхайк, Э.; и др. (2011). «Проект генома широко распространенного и инвазивного аргентинского муравья (Linepithema humile)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (14): 5673–5678. Бибкод : 2011PNAS..108.5673S . дои : 10.1073/pnas.1008617108 . ПМК 3078359 . ПМИД 21282631 .
- ^ Смит; Смит, CD; Робертсон, HM; Хельмкампф, М.; Зимин А.; Янделл, М.; Холт, К.; Хм.; Абухейф, Э.; и др. (2011). «Проект генома красного муравья-жнеца Pogonomyrmex barbatus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (14): 5667–5672. Бибкод : 2011PNAS..108.5667S . дои : 10.1073/pnas.1007901108 . ПМК 3078412 . ПМИД 21282651 .
- ^ Суэн; Тейлинг, С; Ли, Л; Холт, К; Абухейф, Э; Борнберг-Бауэр, Э; Буффар, П; Кальдера, Э.Дж.; Наличные, Е; и др. (2011). Копенхейвер, Грегори (ред.). «Последовательность генома муравья-листореза Atta cephalotes позволяет понять его обязательный симбиотический образ жизни» . ПЛОС Генетика . 7 (2): e1002007. doi : 10.1371/journal.pgen.1002007 . ПМК 3037820 . ПМИД 21347285 .