Стивен Ковальчиковски

Стивен С. Ковальчиковски
Стивен С. Ковальчиковски
Национальность	Американский
Альма-матер	Политехнический институт Ренсселера , Джорджтаунский университет , Орегонский университет
Известный	репарация ДНК , гомологичная рекомбинация , RecA , BRCA2 , RecBCD , хеликазы , биофизика одиночных молекул
Награды	Лектор Общества Харви (2012 г.) ; Американская академия искусств и наук (2005) ; Национальная академия наук (2007 г.)
	Научная карьера
Поля	«Визуальная биохимия », Молекулярная биология , Биофизика
Учреждения	Калифорнийский университет в Дэвисе
Докторантура	Хасинто Штайнхардт , Петер фон Хиппель

Стивен Чарльз Ковальчиковски («Стив К») — заслуженный профессор микробиологии и молекулярной генетики Дэвисе Калифорнийского университета в . Его исследования сосредоточены на биохимии и молекулярной биологии репарации ДНК и гомологичной рекомбинации . Его лаборатория сочетает в себе флуоресцентную микроскопию, оптический захват и микрофлюидику для манипулирования и визуализации отдельных молекул ДНК и ферментов , участвующих в обработке и восстановлении ДНК . Он называет этот научный подход «визуальной биохимией». ^{[ 1 ]} Стивен Ковальчиковски был избран членом Американского общества искусств и науки в 2005 году, Национальной академии наук в 2007 году и был преподавателем Общества Харви в Университете Рокфеллера в 2012 году. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Образование и карьера

Стивен Ковальчиковски изучал химию (бакалавр) в Политехническом институте Ренсселера в 1972 году и получил докторскую степень. Степень бакалавра химии и биохимии получил в Джорджтаунском университете в 1976 году. Его диссертация называлась «Физико-химические исследования серповидноклеточного гемоглобина». Затем он работал научным сотрудником с доктором Питером фон Хиппелем в Институте медицинских наук Университета Орегона , где начал изучать физическую химию белково-нуклеиновых взаимодействий. Он начал свою академическую исследовательскую карьеру в Медицинской школе Северо-Западного университета в 1981 году, а затем в 1991 году перешел в Калифорнийский университет в Дэвисе. Он является одним из ведущих мировых экспертов по RecA , определяющему члену повсеместного класса белков, обменивающихся цепями ДНК. которые необходимы для гомологичной рекомбинации, пути, который поддерживает целостность генома путем восстановления поврежденной ДНК . Его лаборатория внесла значительный вклад в области репарации ДНК , гомологичной рекомбинации и биофизики ДНК-хеликаз.

Научный вклад

Некоторые из выдающихся научных достижений его лаборатории включают структурный и молекулярный механизм резекции концов ДНК с помощью RecBCD. ^{[ 4 ]} ( E. coli ) и DNA2-Sgs1-RPA и регуляторная стимуляция Top3-Rmi1 и Mre11-Rad50-Xrs2 ^{[ 5 ]} ( S. cerevisiae ), кинетика RecA зарождения и роста филаментов ^{[ 6 ]} и регулирование RecFOR ^{[ 7 ]} ( E. coli ), очистка и молекулярный механизм гена предрасположенности к раку молочной железы человека BRCA2 ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} (человек), механизм соединения Холлидея растворения гомологом геликазы синдрома Блума (BLM), Sgs1 ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} ( S. cerevisiae ) и механизм трехмерного поиска гомологии, катализируемый RecA ^{[ 12 ]} ( Э. палочка ).

Публикации

Публикации исследований на Pubmed .

Ссылки

^ «Колледж биологических наук Калифорнийского университета в Дэвисе» . Проверено 22 февраля 2013 г.
^ «Два профессора избраны в престижные академии» . Калифорнийский университет в Дэвисе . 3 мая 2007 года. Архивировано из оригинала 8 июля 2007 года . Проверено 16 июля 2023 г. Стивен К. Ковальчиковски, изучающий молекулярные машины, копирующие и восстанавливающие ДНК, был избран членом Национальной академии наук.
^ «Химический факультет» . Джорджтаунский университет . 6 ноября 2007 года. Архивировано из оригинала 20 августа 2008 года . Проверено 16 июля 2023 г.
^ Синглтон М.Р., Диллингем М.С., Годье М., Ковальчиковски С.К., Вигли Д.Б. (11 ноября 2004 г.). «Кристаллическая структура фермента RecBCD раскрывает механизм обработки разрывов ДНК». Природа . 432 (7014): 187–93. Бибкод : 2004Natur.432..187S . дои : 10.1038/nature02988 . ПМИД 15538360 . S2CID 2916995 .
^ Цейка П., Каннаво Э., Полачек П., Масуда-Саса Т., Покхарел С., Кэмпбелл Дж.Л., Ковальчиковски С.К. (2 сентября 2010 г.). «Резекция концов ДНК с помощью Dna2-Sgs1-RPA и ее стимуляция с помощью Top3-Rmi1 и Mre11-Rad50-Xrs2» . Природа . 467 (7311): 112–6. Бибкод : 2010Natur.467..112C . дои : 10.1038/nature09355 . ПМК 3089589 . ПМИД 20811461 .
^ Галлетто Р., Амитани И., Баскин Р.Дж., Ковальчиковски СК (октябрь 2019 г.). «Прямое наблюдение за сборкой отдельных нитей RecA на отдельных молекулах ДНК». Природа . 443 (7113): 875–8. Бибкод : 2006Natur.443..875G . дои : 10.1038/nature05197 . ПМИД 16988658 . S2CID 4416295 .
^ Белл Дж.К., Планк Дж.Л., Домбровский К.С., Ковальчиковски С.К. (8 ноября 2012 г.). «Прямая визуализация зарождения и роста RecA на одиночных молекулах оцДНК, покрытых SSB» . Природа . 491 (7423): 274–8. Бибкод : 2012Natur.491..274B . дои : 10.1038/nature11598 . ПМК 4112059 . ПМИД 23103864 .
^ Йенсен Р.Б., Каррейра А., Ковальчиковски СК (7 октября 2010 г.). «Очищенный человеческий BRCA2 стимулирует рекомбинацию, опосредованную RAD51» . Природа . 467 (7316): 678–83. Бибкод : 2010Natur.467..678J . дои : 10.1038/nature09399 . ПМК 2952063 . ПМИД 20729832 .
^ «Новости природы» . Проверено 22 февраля 2013 г.
^ Чейка П., Планк Дж.Л., Бахрати Ч.З., Хиксон И.Д., Ковальчиковски С.К. (ноябрь 2010 г.). «Rmi1 стимулирует декатенацию двойных соединений Холлидея во время растворения с помощью Sgs1-Top3» . Nat Struct Мол Биол . 17 (11): 1377–82. дои : 10.1038/nsmb.1919 . ПМЦ 2988882 . ПМИД 20935631 .
^ Чейка П., Планк Дж.Л., Домбровский К.С., Ковальчиковски С.К. (28 сентября 2012 г.). «Декатенация ДНК комплексом S. cerevisiae Sgs1-Top3-Rmi1 и RPA: механизм распутывания хромосом» . Молекулярная клетка . 47 (6): 886–96. doi : 10.1016/j.molcel.2012.06.032 . ПМЦ 3462259 . ПМИД 22885009 .
^ Забудьте А.Л., Ковальчиковски СК (8 февраля 2012 г.). «Визуализация спаривания ДНК одной молекулы с помощью RecA обнаруживает трехмерный поиск гомологии» . Природа . 482 (7385): 423–7. Бибкод : 2012Natur.482..423F . дои : 10.1038/nature10782 . ПМК 3288143 . ПМИД 22318518 .

[1] «Колледж биологических наук Калифорнийского университета в Дэвисе» . Проверено 22 февраля 2013 г.

[2] «Два профессора избраны в престижные академии» . Калифорнийский университет в Дэвисе . 3 мая 2007 года. Архивировано из оригинала 8 июля 2007 года . Проверено 16 июля 2023 г. Стивен К. Ковальчиковски, изучающий молекулярные машины, копирующие и восстанавливающие ДНК, был избран членом Национальной академии наук.

[3] «Химический факультет» . Джорджтаунский университет . 6 ноября 2007 года. Архивировано из оригинала 20 августа 2008 года . Проверено 16 июля 2023 г.

[4] Синглтон М.Р., Диллингем М.С., Годье М., Ковальчиковски С.К., Вигли Д.Б. (11 ноября 2004 г.). «Кристаллическая структура фермента RecBCD раскрывает механизм обработки разрывов ДНК». Природа . 432 (7014): 187–93. Бибкод : 2004Natur.432..187S . дои : 10.1038/nature02988 . ПМИД 15538360 . S2CID 2916995 .

[5] Цейка П., Каннаво Э., Полачек П., Масуда-Саса Т., Покхарел С., Кэмпбелл Дж.Л., Ковальчиковски С.К. (2 сентября 2010 г.). «Резекция концов ДНК с помощью Dna2-Sgs1-RPA и ее стимуляция с помощью Top3-Rmi1 и Mre11-Rad50-Xrs2» . Природа . 467 (7311): 112–6. Бибкод : 2010Natur.467..112C . дои : 10.1038/nature09355 . ПМК 3089589 . ПМИД 20811461 .

[6] Галлетто Р., Амитани И., Баскин Р.Дж., Ковальчиковски СК (октябрь 2019 г.). «Прямое наблюдение за сборкой отдельных нитей RecA на отдельных молекулах ДНК». Природа . 443 (7113): 875–8. Бибкод : 2006Natur.443..875G . дои : 10.1038/nature05197 . ПМИД 16988658 . S2CID 4416295 .

[7] Белл Дж.К., Планк Дж.Л., Домбровский К.С., Ковальчиковски С.К. (8 ноября 2012 г.). «Прямая визуализация зарождения и роста RecA на одиночных молекулах оцДНК, покрытых SSB» . Природа . 491 (7423): 274–8. Бибкод : 2012Natur.491..274B . дои : 10.1038/nature11598 . ПМК 4112059 . ПМИД 23103864 .

[8] Йенсен Р.Б., Каррейра А., Ковальчиковски СК (7 октября 2010 г.). «Очищенный человеческий BRCA2 стимулирует рекомбинацию, опосредованную RAD51» . Природа . 467 (7316): 678–83. Бибкод : 2010Natur.467..678J . дои : 10.1038/nature09399 . ПМК 2952063 . ПМИД 20729832 .

[9] «Новости природы» . Проверено 22 февраля 2013 г.

[10] Чейка П., Планк Дж.Л., Бахрати Ч.З., Хиксон И.Д., Ковальчиковски С.К. (ноябрь 2010 г.). «Rmi1 стимулирует декатенацию двойных соединений Холлидея во время растворения с помощью Sgs1-Top3» . Nat Struct Мол Биол . 17 (11): 1377–82. дои : 10.1038/nsmb.1919 . ПМЦ 2988882 . ПМИД 20935631 .

[11] Чейка П., Планк Дж.Л., Домбровский К.С., Ковальчиковски С.К. (28 сентября 2012 г.). «Декатенация ДНК комплексом S. cerevisiae Sgs1-Top3-Rmi1 и RPA: механизм распутывания хромосом» . Молекулярная клетка . 47 (6): 886–96. doi : 10.1016/j.molcel.2012.06.032 . ПМЦ 3462259 . ПМИД 22885009 .

[12] Забудьте А.Л., Ковальчиковски СК (8 февраля 2012 г.). «Визуализация спаривания ДНК одной молекулы с помощью RecA обнаруживает трехмерный поиск гомологии» . Природа . 482 (7385): 423–7. Бибкод : 2012Natur.482..423F . дои : 10.1038/nature10782 . ПМК 3288143 . ПМИД 22318518 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]