родобактерии
| родобактерии | |
|---|---|
| |
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Псевдомонадота |
| Сорт: | Альфапротеобактерии |
| Заказ: | Родобактерии |
| Семья: | родобактерии Гаррити и др . 2006 г. |
| Роды | |
|
Посмотреть текст | |
| Синонимы [ нужна ссылка ] | |
| |
Rhodobacteraceae — семейство Pseudomonadota порядка Rhodobacterales . подгруппы альфа [ 1 ] Как и все псевдомонадоты, они грамотрицательны . Содержит бактерии хемоорганотрофы и фотогетеротрофы . Многие из них встречаются в водной среде обитания.
Роды
[ редактировать ]Принятые роды
[ редактировать ]Следующие роды были эффективно и достоверно опубликованы: [ 2 ] [ 3 ]
- Ацидимангровимонас Рен и др . 2019 год
- Actibacterium Lucena et al . 2012 год
- Эстуарибиус Парк и др . 2018 год
- Эстуариококк Фэн и др . 2018 год
- Обитающий в устье реки Юн и др . 2014 год
- Эстуариивита Парк и др . 2014 год
- Эстуарий Ю и др . 2019 год
- Агарицикола Чу и др . 2010 год
- Albibacillus Hördt и др . 2020 год
- Альбукерке Альбукерке и др . 2003 г.
- Альбимонас Лим и др . 2008 год
- Альбирходобактер Нупур и др . 2015 год
- Aliiroseovarius Park и др . 2015 год
- Он похвалил Кима и др . 2019 год
- Alkalilacustris Zhang et al . 2019 год
- Аллгайера Хёрдт и др . 2020 год
- Allosediminivita Hördt et al . 2020 год
- Амарикоккус Масзенан и др . 1997 год
- Амилибактерия Терамото и Нисидзима, 2014 г.
- Антарктикимикробий Чжан и др . 2020 год
- Антарктобактерии Лабренц и др . 1998 год
- Aquicoccus Feng и др . 2018 год
- Акмимикстикола Парк и др . 2015 год
- Аренибацилла Ким и др . 2019 год
- Arenibacterium Baek et al . 2020 год
- Обитатель асцидии Ким и др . 2014 год
- Босонгикола Парк и др . 2014 год
- Бревирхабдус Ву и др . 2015 год
- Caridecomes Wang et al . 2020 год
- Целерибактер Иванова и др . 2010 год
- Цереибактер Суреш и др . 2015 год
- Чачежания Юань и др . 2020 год
- Читреимонас Чой и Чо 2006 г.
- Когнатишимия Вирт и Уитмен 2018
- Когнатийония Вирт и Уитмен 2018
- Скрининг Chen et al . 2014 год
- Ципионкелла Хёрдт и др . 2020 год
- Defluviimonas Foesel et al . 2013 год
- Динорозеобактерия Библ и др . 2005 г.
- Донгикола Юн и др . 2007 год
- Эпибактерия Пенесян и др . 2013 год
- Фальсиродобактер Субхаш и др . 2013 год
- Fertoeibacter Szuroczki et al . 2021 год
- Флавимарикола Вирт и Уитмен 2018
- Fluviibacterium Sun и др . 2020 год
- Фригидибактерии Ли и Чжоу, 2015 г.
- Геммобактерии Роте и др . 1988 год
- Гематобактер Хелсель и др . 2007 год
- Хахёнчилелла Ким и Ли 2020
- Halocynthiibacter Kim и др . 2014 год
- Halodurantibacterium Lv и др . 2015 год
- Halovulum Sun и др . 2015 год
- Хасллибактер Ким и др . 2012 год
- Гистидинибактерии Ванга и др . 2019 год
- Хванхайкола Ким и др . 2010 год
- Яннашиа Вагнер-Дёблер и др . 2003 г.
- Джаорихелла Рекха и др . 2011 год
- Kandeliimicrobium Wang et al . 2018 год
- Кансаукелла Ли и др . 2020 год
- Лацимонас Чжун и др . 2015 год
- Лейзингера Шефер и др . 2002 г.
- Лентибактер Ли и др . 2012 год
- Лимибакулум Шин и др . 2017 год
- Лимимарикола Вирт и Уитмен 2018
- Литорейбактерин Романенко и др . 2011 год
- Литорисемиминикола Юн и др . 2013 год
- Litorizedimivivens Park и др . 2016 год
- Литоривита Хетхаруа и др . 2018 год
- Локтанелла Ван Траппен и др . 2004 г.
- Лютимарибактерин Юн и др . 2009 год
- Малипония Юнг и др . 2016 год
- Мамелиелла Чжэн и др . 2010 год
- Mangrovicoccus Yu и др . 2018 год
- Марибиус Чой и др . 2007 год
- Маримонас Тонгпром и др . 2017 год
- Маринибактерия Ли и др . 2015 год
- Мариновум Мартенс и др . 2006 г.
- Маритимибактер Ли и др . 2007 год
- Маривита Хван и др . 2009 год
- Марививенс Парк и др . 2016 год
- Мейнхардсимония Хёрдт и др . 2020 год
- Meridianimarinicoccus Ren и др . 2019 год
- Метиларкула Доронина и др . 2000 г.
- Монаибактерии Черникова и др . 2017 год
- Нептуникококк Чжан и др . 2018 год
- Нереида Пухальте и др . 2005 г.
- Ниоэлла Раджасабапати и др . 2015 год
- Океанибиум Чанг и др . 2019 год
- Океаникелла Альбукерке и др . 2012 год
- Океаникола Чо и Джованнони, 2004 г.
- Oceaniglobus Li и др . 2017 год
- Октадекабактер Госинк и др . 1998 год
- Pacificibacter Романенко и др . 2011 год
- Pacificitalea Hördt et al . 2020 год
- Пенимарибиус Парк и др . 2019 год
- Paenirhodobacter Wang и др . 2014 год
- Паллерония Мартинес-Чека и др . 2005 г.
- Paracoccus Davis 1969 (утвержденные списки 1980 г.)
- Парадонгикола Ли и др . 2019 год
- Парафеобактер Цай и др . 2017 год
- Pararhodobacter Foesel и др . 2013 год
- Parasedimentitalea Ding et al . 2020 год
- Парокеаникелла корриг. Лю и др . 2020 год
- Пеладжикола Ким и др . 2008 год
- Пелагимонас Ханке и др . 2013 год
- Пелагивирга Джи и др . 2018 год
- Пелаговум Рен и др . 2020 год
- Phaeobacter Martens и др . 2006 г.
- Phycocomes Zhu et al . 2019 год
- Планктомарина Гибель и др . 2013 год
- Planktotalea Hahnke et al . 2012 год
- Понтибака Ким и др . 2010 год
- Понтикоккус Хван и Чо, 2008 г.
- Понтививенс Парк и др . 2015 год
- Посейдоноцелла Романенко и др . 2012 год
- Приморский бактерия Романенко и др . 2011 год
- Profundibacter Le Moine Bauer et al . 2019 год
- Profundibacterium Lai et al . 2013 год
- Псевдаэстуариивита Вирт и Уитмен 2018
- Pseudodonghicola Hameed et al . 2014 год
- Псевдогеммобактер Суман и др . 2019 год
- Pseudohalocynthiibacter Won et al . 2015 год
- Псевдомарибиус Парк и др . 2018 год
- Pseudooceanicola Lai et al . 2015 год
- Псевдооктадекабактерия Биллербек и др . 2015 год
- Псевдофаеобактер Брейдер и др . 2014 год
- Pseudoprimorskyibacter Hördt et al . 2020 год
- Pseudopuniceibacterium Zhang et al . 2019 год
- Псевдородобактер Учино и др . 2003 г.
- Pseudoroseicyclus Park и др . 2016 год
- Псевдоругерия Юн и др . 2007 год
- Pseudoseohaeicola Park и др . 2015 год
- Псевдотиоклава Ким и Ли 2020
- Психромаринибактерин Цяо и др . 2017 год
- Пукионгелла Ким и др . 2020 год
- Puniceibacterium Liu et al . 2014 год
- Циншэнфаниелла Ван и др . 2021 год
- Родобака Милфорд и др . 2001 г.
- Родобактер Имхофф и др . 1984 г.
- Rhodobaculum Брянцева и др . 2015 год
- Rhodophyticola Jung et al . 2019 год
- Rhodosalinus Guo et al . 2017 год
- Родовулум Хираиси и Уэда, 1994 г.
- Розейбака Лабренц и др . 2009 год
- Roseibacterium Suzuki et al . 2006 г.
- Розеицитреум Ю и др . 2011 год
- Roseicyclus Rathgeber et al . 2005 г.
- Розеинатронобактер Сорокин и др . 2000 г.
- Roseisalinus Labrenz и др . 2005 г.
- Roseivivax Suzuki и др . 1999 год
- Розеобактер Шиба 1991 г.
- Розеовариус Лабренц и др . 1999 год
- Рубеллимикробий Деннер и др . 2006 г.
- Рубрибактерии Болдаревой и др . 2010 год
- Рубриселла Янг и др . 2017 год
- Рубримонас Сузуки и др . 1999 год
- Ругерия Учино и др . 1999 год
- Сагиттула Гонсалес и др . 1997 год
- Salinihabitans Yoon et al . 2009 год
- Салиновум Ку и др . 2017 год
- Салипигер Мартинес-Кановас и др . 2004 г.
- Sedimentitalea Breider et al . 2014 год
- Седиминимонас Ван и др . 2009 год
- Сеохайкола Юн и др . 2009 год
- Шимиа Чой и Чо, 2006 г.
- Силисимонас Кренн и др . 2016 год
- Синирходобактер корриг. Ян и др . 2018 год
- Солирходобактер Чу и др . 2020 год
- Сульфитобактерия Сорокин 1996 г.
- Табризикола Тарриз и др . 2014 год
- Татеямария Курахаши и Ёкота, 2008 г.
- Талассобиус Арахал и др . 2005 г.
- Thalassococcus Lee и др . 2007 год
- Тиоклава Сорокин и др . 2005 г.
- Транкилимонас Харвати и др . 2008 год
- Тритонибактер Клотц и др . 2018 год
- Тропицибактер Харвати и др . 2009 год
- Tropicimonas Harwati et al . 2009 год
- Ванниелия Хёрдт и др . 2020 год
- Вэньксиния Ин и др . 2007 г.
- Синьфанфангия Ху и др . 2018 г.
- Юния Вирт и Уитмен 2018
- Янгимонас Хамид и др . 2014 год
Временные Генералы
[ редактировать ]Следующие роды были опубликованы, но не утверждены в соответствии с Бактериологическим кодексом : [ 3 ]
- « Alisedimentitalea » Ким и др . 2015 год
- « Альтериниоелла » Конг и др . 2021 год
- « Фальсигеммобактер » Li et al . 2020 год
- « Джиндония » Парк и др . 2017 год
- « Кетогулоницигениум » корриг. Урбанс и др . 2001 г.
- « Нитропелаги » Чон и Ли 2016 г.
- « Oceaniovales » Лю и др . 2012 год
- « Океаномикробий » Дай и др . 2021 год
- « Пьезобактерия » Такай и др . 2009 год
- « Пикеэнуэлла » Парк и др . 2021 год
- « Plastorhodobacter » Xie et al . 2015 год
- « Полиморфум » Цай и др . 2011 год
- « Псевдопонтивенс » Парк и др . 2018 год
- « Розейбакула » Нуянзина-Болдарева и Горленко 2014 г.
- « Zongyanglinia » Сюй и др . 2021 г.
кандидатов Типы
[ редактировать ]следующие рода кандидатов : Опубликованы [ 3 ]
- « Кандидат Галихондриибактер» корриг. Кноблох и др . 2019 год
- « Кандидат Коприимонас » Куинн и др . 2012 год
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатурное значение. [ 3 ] а филогения основана на полногеномных последовательностях. [ 4 ] [ а ]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
См. также
[ редактировать ]Примечания
[ редактировать ]- ^ Acidimangrovimonas , Aestuariibius , Aestuariicoccus , Aestuariihabitans , Estuarium , Agaricicola , Albirhodobacter , Aliishimia , Alkalilacustris , Allgaiera , Amaricoccus , Antarctimicrobium , Aquicoccus , Arenibacillus , Arenibacterium , Carideicomes , Чачежания , Falsirhobacter , Fertoeibacter , Fluviibacterium Hahyoungchilella, Halodurantibacterium, Halovulum, Histidinibacterium, Kangsaoukella, Lacimonas, Limibaculum, Litorisediminicola, Litorisediminivivens, Litorivita, Marimonas, Meridianimarinicoccus, Methylarcula, Nioella, Oceanibium, Paenimaribius, Paradonghicola, Paraphaeobacter, Parasedimentitalea, Paroceanicella. Pelagivirga , Pelagovum , Phycocomes , Profundibacter , Profundibacterium , Pseudogemmobacter , Pseudohalocynthiibacter , Pseudomaribius , Pseudopuniceibacterium , Pseudoseohaeicola , Pseudothioclava , Psychromarinibacter , Pukyongiella , ella , Rhodobaculum , Rhodophyticola , Roseibaca , Roseibacterium , Roseicyclus , Rubribacterium , Rubricella , Salinovum , Seohaeicola , Sinirhodobacter , Solirhodobacter , Tateyamaria , Xinfangfangia и Youngimonas не включены в это филогенетическое древо.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ См . веб-страницу NCBI , посвященную Rhodobacteraceae . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
- ^ Паркер, Чарльз Томас; Вигли, Сара; Гаррити, Джордж М. (1 января 2003 г.). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Таксономическое резюме для семей». Резюме NamesforLife . doi : 10.1601/tx.1037 (неактивен 17 апреля 2024 г.).
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на апрель 2024 г. ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б с д Эузеби Ж.П., Парте AC. « Родобактерии » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 2 июня 2021 г.
- ^ Хёрдт А., Лопес М.Г., Мейер-Колтхофф Дж.П., Шлейнинг М., Вайнхольд Л.М., Тиндалл Б.Дж. и др. (2020). «Анализ более 1000 геномов типовых штаммов существенно улучшает таксономическую классификацию альфапротеобактерий » . Границы микробиологии . 11 : 468. дои : 10.3389/fmicb.2020.00468 . ПМЦ 7179689 . ПМИД 32373076 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Гэррити, Холт Дж.Г. (2001). «Таксономический очерк архей и бактерий» . В Д. Р. Буне, Р. В. Кастенхольце (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. стр. 155–166 . ISBN 978-0-387-98771-2 .