Розеобактер
| Розеобактер | |
|---|---|
| |
| Штамм розеобактера HIMB11 [ 1 ] | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Розеобактер Шиба 1991 г.
|
| Разновидность | |
| |
В систематике . Roseobacter — род Rhodobacteraceae Клада Roseobacter относится к подклассу {альфа}-3 класса Alphaproteobacteria. Первые описания штаммов появились в 1991 году, в которых описывались представители и Roseobacterlitoralis Roseobacter denitrificans , оба штамма, продуцирующие бактериохлорофилл а с розовым пигментом, выделенные из морских водорослей. Роль представителей линии Roseobacter в морских биогеохимических циклах и изменении климата невозможно переоценить. Розеобактерии составляют 25% прибрежных морских бактерий , и представители этой линии перерабатывают значительную часть общего углерода в морской среде. [ 3 ] Клада Roseobacter играет важную роль в глобальных циклах углерода и серы. Он также может разлагать ароматические соединения, поглощать следы металлов и образовывать симбиотические отношения. Что касается применения, клада Roseobacter производит биологически активные соединения, которые широко используются в аквакультуре и определении кворума.
Описание
[ редактировать ]Розеобактер — один из самых распространенных и универсальных микроорганизмов в океане. Они разнообразны в разных типах морской среды обитания: от прибрежных до открытых океанов и от морского льда до морского дна. Они составляют около 25% морских сообществ. Во время цветения водорослей 20-30% сообщества прокариот составляют Roseobacter. [ 4 ]
Члены клады Roseobacter демонстрируют разнообразную физиологию и обычно оказываются либо свободноживущими, связанными с частицами, либо находящимися в комменсальных отношениях с морским фитопланктоном, беспозвоночными и позвоночными. [ 5 ] Roseobacter похожи на фитопланктон в том, что оба они колонизируют поверхности, поглощают железо и производят биологически активные вторичные метаболиты. [ 4 ]
Общие кластеры
[ редактировать ]| Имя | Места обитания | Распределение |
|---|---|---|
| ОКТ-кластер | 90% неизбыточных клонов из полярного региона. | 55% последовательностей клонов; 45% последовательностей изолята |
| Кластер CHAB-I-5 | 56% неизбыточных клонов происходят из прибрежной морской воды. | 100% клонированные последовательности |
| Кластер DC5-80-3 | 79% происходят из планктонных местообитаний (поверхностных и глубоководных). | 86% последовательностей клонов |
| Кластер РГАЛЛ | Симбиотические отношения с эукариотическими морскими организмами | 68% культивируемых штаммов |
| ОБУЛБ и СПОН Кластеры | 32% неизбыточных клонов происходят из прибрежной морской воды;
29% неизбыточных клонов происходят из среды морского дна. |
70% последовательностей клонов |
| Кластер NAC11-7 | 60% неизбыточных клонов получены из прибрежной морской воды. | 88% последовательностей клонов |
| Кластер DG1128 | Из макроводорослей и фитопланктона | |
| Кластер АС-21 | Из прибрежной морской воды или отложений | |
| Кластер TM1040 | ||
| Кластер АС-26 | ||
| Кластер ANT9093 | Из полярного морского льда, губок, отложений, |
Геномные особенности
[ редактировать ]Размер
[ редактировать ] |
Большинство проанализированных на данный момент Roseobacters имеют большие геномы: от 3,5 до 5,0 Мбит/с. Самый маленький из обнаруженных — это геном Loktanella Westfoldensis SKA53 (3,06 МБП), самый большой — Roseovarius sp. HTCC2601 с 5,4 Мбит/с. В Jannaschia sp. CCS1, Silicibacter pomeroyi DSS-3 и Silicibacter sp. TM1040, фракция неортологичных генов составляет 1/3 геномов. [ 6 ]
Плазмиды
[ редактировать ] |
Плазмиды часто встречаются у Roseobacters. Размер плазмид варьируется от 4,3 до 821,7 Кб. [ 6 ] Они могут составлять 20% содержимого генома. [ 6 ] Экологически значимые гены можно найти закодированными в плазмидах. Пластичность генома может быть причиной, объясняющей разнообразие и адаптивность Roseobacters, что подтверждается большим количеством, вероятно, конъюгативных плазмид. [ 6 ]
Плазмиды могут иметь линейную конформацию, характерную для Roseobacters. У некоторых штаммов плазмиды занимают значительную долю в составе генома. Хотя подвижность плазмид в штаммах еще не исследована, они могут способствовать физиологическому разнообразию Roseobacter. [ 6 ]
Важность изучения генома
[ редактировать ]Сравнение и анализ геномов организмов клады Roseobacter важны, поскольку могут дать представление о горизонтальном переносе генов и специфических процессах адаптации. Поскольку популяция Roseobacter широко распространена по всему миру и имеет различные типы местообитаний, успех клады Roseobacter нельзя объяснить исследованием только одной популяции. Следовательно, ключом к пониманию того, почему эта клада так многочисленна, является изучение генетического, а также метаболического разнообразия организмов всей клады. [ 7 ]
Экология
[ редактировать ]Клада Roseobacter в основном встречается в морской среде. Каждый из различных видов Roseobacter имеет свою экологическую нишу. Несколько изолятов были пойманы из огромного количества экосистем прибрежных районов и открытого океана. [ 7 ] Розеобактерии составляют значительную часть бактериальных сообществ, связанных с фитопланктоном , макроводорослями и некоторыми морскими животными. различные образы жизни, такие как мутуалистический и патогенный Были предложены . Члены клады распространены по всему умеренному и полярному океанам, а также занимают значительную часть экосистем морского льда. Предполагается, что они широко распространены в прибрежных отложениях, глубоководных пелагических океанах и глубоководных отложениях. Клада Roseobacter обладает огромным разнообразием метаболических навыков и регуляторных схем, что может быть связано с их процветанием в огромном количестве морских экосистем. [ 8 ]
Эволюция
[ редактировать ]Кладу Roseobacter можно найти в прибрежных районах, свободно обитая в морской воде или в прибрежных отложениях. В этих прибрежных экосистемах клада Roseobacter взаимодействует с фитопланктоном, макроводорослями и различными морскими животными, ведущими как мутуалистический, так и патогенный образ жизни. Кладу Rosebacter также можно найти в глубокой пелагиали океана, глубоководных отложениях и даже в полярном океане. Причина, по которой они широко распространены в различных морских средах обитания, заключается в том, что они обладают разнообразными метаболическими возможностями и регуляторными схемами.
Культивированные розеобактеры
[ редактировать ]Предполагается, что предок Roseobacter появился примерно 260 миллионов лет назад. Они подверглись чистой редукции генома из большого общего предкового генома, за которым последовали два эпизода инновации и расширения генома посредством латерального переноса генов (LGT). [ 8 ]
Согласно прогнозам, первый предсказанный эпизод расширения генома произошел около 250 миллионов лет назад. Было высказано предположение, что расширение генома, скорее всего, произошло за счет новых экологических сред обитания, возникших в результате появления эукариотических групп фитопланктона, таких как динофлагелляты и кокколитофориды. [ 8 ] Эта теория подтверждается тем фактом, что современные линии Roseobacters являются многочисленными компонентами фисферы этих двух групп фитопланктона. Гены, связанные с подвижностью и хемотаксисом у предка клады Roseobacter, потенциально позволяли Roseobacter чувствовать этот фитопланктон и плыть к нему. Позднее выяснилось, что некоторые линии Roseobacter также связаны с диатомовыми водорослями. Все динофлагелляты, кокколитофориды и диатомеи представляют собой фитопланктон красной пластидной линии, и совпадение радиации красных пластид и инноваций генома Roseobacter согласуется с адаптивной эволюцией. [ 8 ] Однако механизм изменения генома до сих пор не идентифицирован. Предлагаются две теории: что в изменении генома доминирует либо экзаптация, когда изменение произошло до изменения окружающей среды, либо положительный отбор, когда за изменением окружающей среды следует событие латерального переноса генов, которому затем избирательно отдается предпочтение.
Считается, что второе нововведение в области генома появилось позднее. Прогнозируется, что базальная линия с редуцированными геномами избежала обоих эпизодов геномных инноваций и стала прямой линией от общего предка. [ 8 ] Следовательно, не все Roseobacter являются потомками линий, геном которых подвергся инновациям. Предполагается, что усиление генов происходит в пользу таких генов, как гены транскрипции, гены репарации и гены защитных механизмов, чтобы помочь Roseobacter конкурировать с конкурирующими микробными популяциями на частицах и живых поверхностях в морской среде.
Некультивированные розеобактеры
[ редактировать ]Сборка de novo из глубоко секвенированных метагеномов и секвенирование одноклеточного генома — два лучших способа изучения некультивируемых розеобактерий без получения неприемлемого уровня ложноположительных результатов. Обнаружено, что геномный анализ, сосредоточенный на культивируемых Roseobacters, потенциально может исказить наше представление об экологии этой линии. В ходе недавнего исследования были получены четыре некультивируемых розеобактерий из поверхностных вод северной части Тихого океана, Южной Атлантики и залива Мэн. Эта клада, по-видимому, представляет до 35% последовательностей Roseobacter в образцах поверхностных вод океана. Эти розеобактеры имеют низкое содержание G+C, уменьшенный процент некодирующей ДНК и, по прогнозам, имеют оптимизированные геномы.
Разнообразие
[ редактировать ]Клада Roseobacter демонстрирует успех во многих морских средах обитания благодаря своим обширным метаболическим возможностям. существует огромное геномное и физиологическое В основных кладах разнообразие, которое относится к разным размерам, содержанию генов, содержанию GC , экологической стратегии и трофической стратегии. Разнообразие оказывает влияние на экологию из-за роли, которую бактериальные линии играют в океанических элементарных циклах, и их связей с морскими эукариотами . [ 8 ] Клада Roseobacter составляет до 20% бактериальных клеток в некоторых прибрежных районах и от 3 до 5% в поверхностных водах открытого океана. [ 9 ]
Значительное увеличение количества характеристик родов и видов в кладе показывает физиологическое и генетическое разнообразие этих организмов. Обозначение новых штаммов исключительно на основе последовательностей генов 16s рРНК вызывает все большую трудность. Некоторые виды считаются включенными в один род, но другие утверждают, что разные характеристики должны привести к разделению этих двух видов. В кладе Roseobacter было обнаружено несколько групп клонов и неопределенных штаммов. Эта клада примечательна потенциальными корреляциями геномов близкородственных штаммов. [ 7 ]
Функции
[ редактировать ]Члены клады Roseobacter играют важную роль в экосистеме. [ 5 ]
Глобальный цикл углерода/серы
[ редактировать ]Розеобактерии играют важную роль в глобальных циклах углерода и серы, а также в климате. Из-за своей большой доли в общем микробном сообществе клада Roseobacter вносит основной вклад в глобальную фиксацию CO 2 . Предыдущие исследования показали, что некоторые представители клады Roseobacter принадлежат к группе аэробных аноксигенных фототрофов (AAP), в то время как другие представители нефототрофны. AAP — единственные известные организмы, которым для фотосинтеза требуется кислород, но которые не производят его. Нефототрофные представители могут использоваться для окисления CO, тогда как AAP могут проводить фиксацию CO 2 , поскольку Roseobacters могут генерировать энергию посредством аэробного аноксигенного фотосинтеза . [ 10 ] Roseobacter обладает способностью разлагать диметилсульфониопропионат (DMSP), органическое соединение серы, в изобилии вырабатываемое морскими водорослями. В результате разложения осмолитов водорослей они также могут производить климатически важный газ диметилсульфид (ДМС). [ 11 ]
Разложение ароматических соединений
[ редактировать ]Roseobacter может разлагать ароматические соединения и использовать ароматические соединения в качестве основных субстратов роста. Предыдущие исследования показали, что Roseobacter разлагает родственные лигнину соединения таким же образом. У изолятов Roseobacter наличие диоксигеназ расщепления кольца и связанных с ними генов β-кетоадипатного пути может иметь важное значение для сравнительных исследований экологии деградации ароматических соединений. [ 12 ]
Следовое поглощение металлов
[ редактировать ]Клада Roseobacter поглощает следы металлов . Как правило, более крупные геномы Roseobacter обладают большей универсальностью поглощения микроэлементов и большей пластичностью, что может привести к филогенетически сходным геномам, имеющим сильно различающиеся возможности. [ 13 ] Приобретение штаммами Roseobacter как органических, так и неорганических металлов может происходить множеством различных путей, что указывает на то, что розеобактеры способны адаптироваться и занимать ряд ниш микроэлементов в морской среде. Это также означает, что наличие ресурсов микроэлементов может влиять на диверсификацию генома Roseobacter. Для некоторых представителей клады Roseobacter оптимизация содержания микроэлементов также является ценной экологической стратегией. [ 13 ]
Симбиотические и патогенные взаимоотношения
[ редактировать ]Клада Roseobacter может устанавливать симбиотические и патогенные отношения. [ 14 ] Штаммы Roseobacter могут образовывать симбиотические отношения с различными эукариотическими морскими организмами. Филотипы Roseobacter идентифицированы у вида морской красной водоросли Prionitis . [ 15 ] Кроме того, Roseobacters могут вступать в тесную связь с Pfiesteria , когда они обнаруживаются внутри этих динофлагеллят или прикрепляются к ним. [ 16 ]
Патогенные взаимоотношения, хотя и малоизученные и гораздо менее распространенные, чем симбиотические отношения, также обнаружены у штаммов Roseobacter. Например, было показано, что члены и филотипы клады Roseobacter являются одной из причин ювенильной устричной болезни у восточных устриц, а также болезни черной полосы у склерактиновых кораллов. [ 5 ]
Приложения
[ редактировать ]Биоактивные соединения
[ редактировать ]Клада Roseobacter может производить различные типы биологически активных соединений . Эти соединения включают стимуляторы роста водорослей (т.е. ауксины ) и альгицидные соединения (т.е. розеобактиды). [ 17 ] Существуют также противомикробные соединения, токсины и альгицидные соединения. Эти соединения потенциально могут быть использованы в фармацевтических или других промышленных целях. Кроме того, после исследования генома Roseobacter считалось, что Roseobacter также способны продуцировать другие соединения, которые можно использовать в качестве источника новых биологически активных соединений (например, новых антибиотиков).
Ларвикультура
[ редактировать ]Хотя молодь и взрослые рыбы имеют зрелую иммунную систему и могут быть вакцинированы, личинки морских рыб и беспозвоночных склонны к бактериальным инфекциям. Морские бактерии из клады Roseobacter (альфа-протеобактерии) продемонстрировали потенциал пробиотических бактерий, которые могут стать альтернативой использованию антибиотиков для предотвращения бактериальных заболеваний. [ 18 ] Roseobactor можно использовать не только для борьбы с рыбами и личинками беспозвоночных, но и для борьбы с патогенными для рыб бактериями, не причиняя вреда рыбам или их живому корму. [ 19 ] Поскольку Roseobacter имеет такую высокую численность, составляющую от 15 до 20% океанических бактериопланктонных сообществ, их можно использовать для создания синтетической биологической основы для биогеоинженерной деятельности, такой как биоремедиация океанических пластиковых отходов. [ 20 ]
Определение кворума
[ редактировать ]У большинства бактерий есть системы химической связи. Ощущение кворума (QS) — это процесс, с помощью которого бактерии чувствуют и воспринимают плотность своей популяции посредством распространяющихся сигналов. У представителей клады Roseobacter широко распространено чувство кворума на основе ацил-гомосерин-лактона (AHL): более 80% доступных геномов розеобактерий кодируют по крайней мере один гомолог luxI. [ 21 ] Это показывает важную роль регуляторных путей, контролируемых QS, в адаптации к соответствующей морской среде. Среди всех имеющихся КС на основе розеобактерий АГЛ наиболее хорошо изучены три: Phaeobacter inhibens DSM17395 , симбионт морской губки Ruegeria sp. KLH11 и симбионт динофлагеллят Dinoroseobacter shibae . [ 21 ] Однако, чтобы более полно понять экологическую роль механизмов QS, необходимы дальнейшие исследования QS и сигнального процесса у большего разнообразия Roseobacters. [ 21 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дарем, Б.П., Гроте, Дж., Уиттакер, К.А., Бендер, С.Дж., Луо, Х., Грим, С.Л., Браун, Дж.М., Кейси, Дж.Р., Дрон, А., Флорес-Лейва, Л. и Крупке, А. (2014) «Проект последовательности генома морского альфапротеобактериального штамма HIMB11, первого культивируемого представителя уникальной линии внутри клады Roseobacter, обладающего необычно маленьким геномом». Стандарты геномных наук , 9 (3): 632. дои : 10.4056/sig.4998989 .
- ^ Перейти обратно: а б Кепке, Беате (2007). Распределение, состав и активность микробных сообществ в приливных отмелях от поверхности до глубины метров ] нескольких . (PDF) (PhD) Университет Ольденбурга.
- ^ См . веб-страницу NCBI , посвященную Roseobacter . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
- ^ Перейти обратно: а б Бентзон-Тилиа М., Грам Л. (2017). «Биотехнологическое применение группы Roseobacter». Биоразведка . Темы биоразнообразия и охраны природы. Том. 16. Спрингер, Чам. стр. 137–166. дои : 10.1007/978-3-319-47935-4_7 . ISBN 978-3-319-47933-0 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Бьюкен А., Гонсалес Х.М., Моран М.А. (октябрь 2005 г.). «Обзор линии морских розеобактеров» . Прикладная и экологическая микробиология . 71 (10): 5665–77. Бибкод : 2005ApEnM..71.5665B . дои : 10.1128/АЕМ.71.10.5665-5677.2005 . ПМЦ 1265941 . ПМИД 16204474 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Бринкхофф, Торстен; Гибель, Хельге-Ансгар; Саймон, Мейнхард (01 июня 2008 г.). «Разнообразие, экология и геномика клады Roseobacter: краткий обзор» . Архив микробиологии . 189 (6): 531–539. дои : 10.1007/s00203-008-0353-y . ISSN 1432-072X . ПМИД 18253713 . S2CID 206894192 .
- ^ Перейти обратно: а б с Бринкхофф Т., Гибель Х.А., Саймон М. (июнь 2008 г.). «Разнообразие, экология и геномика клады Roseobacter: краткий обзор». Архив микробиологии . 189 (6): 531–9. дои : 10.1007/s00203-008-0353-y . ПМИД 18253713 . S2CID 206894192 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Луо Х, Моран М.А. (декабрь 2014 г.). «Эволюционная экология морской клады Roseobacter» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 78 (4): 573–87. дои : 10.1128/MMBR.00020-14 . ПМК 4248658 . ПМИД 25428935 .
- ^ Моран М.А., Белас Р., Шелл М.А., Гонсалес Дж.М., Сан Ф., Сан С., Биндер Б.Дж., Эдмондс Дж., Й.В., Оркатт Б., Ховард Э.К., Мейле С., Палефски В., Гоесманн А., Рен К., Полсен И., Ульрих Л.Е. , Томпсон Л.С., Сондерс Э., Бьюкен А. (июль 2007 г.). «Экологическая геномика морских розеобактерий» . Прикладная и экологическая микробиология . 73 (14): 4559–69. Бибкод : 2007ApEnM..73.4559M . дои : 10.1128/АЕМ.02580-06 . ЧВК 1932822 . ПМИД 17526795 .
- ^ Моран М.А., Гонсалес Х.М., Киене Р.П. (июль 2003 г.). «Связь бактериального таксона с круговоротом серы в море: исследования группы морских розеобактерий». Геомикробиологический журнал . 20 (4): 375–388. дои : 10.1080/01490450303901 . S2CID 85208716 .
- ^ Вагнер-Дёблер I, Библ Х (2006). «Экологическая биология морской линии Roseobacter». Ежегодный обзор микробиологии . 60 : 255–80. дои : 10.1146/annurev.micro.60.080805.142115 . hdl : 10033/15373 . ПМИД 16719716 .
- ^ Бьюкен А., Коллиер Л.С., Нейдл Э.Л., Моран М.А. (ноябрь 2000 г.). «Ключевой фермент, расщепляющий ароматические кольца, протокатехоат 3,4-диоксигеназа, в экологически важной морской линии Roseobacter» . Прикладная и экологическая микробиология . 66 (11): 4662–72. Бибкод : 2000ApEnM..66.4662B . дои : 10.1128/АЕМ.66.11.4662-4672.2000 . ПМК 92364 . ПМИД 11055908 .
- ^ Перейти обратно: а б Хогл С.Л., Трэш Дж.К., Дюпон КЛ, Барбо К.А. (январь 2016 г.). «Приобретение следов металлов морским гетеротрофным бактериопланктоном с контрастирующими трофическими стратегиями» . Прикладная и экологическая микробиология . 82 (5): 1613–24. Бибкод : 2016ApEnM..82.1613H . дои : 10.1128/АЕМ.03128-15 . ПМЦ 4771312 . ПМИД 26729720 .
- ^ Пикарски Т., Бухгольц И., Дреппер Т., Шоберт М., Вагнер-Дёблер И., Тилен П., Ян Д. (декабрь 2009 г.). «Генетические инструменты для исследования бактерий клады Roseobacter» . БМК Микробиология . 9 : 265. дои : 10.1186/1471-2180-9-265 . ПМК 2811117 . ПМИД 20021642 .
- ^ Эшен Дж.Б., Гофф Л.Дж. (июль 2000 г.). «Молекулярные и экологические доказательства видовой специфичности и коэволюции в группе морских водорослево-бактериальных симбиозов» . Прикладная и экологическая микробиология . 66 (7): 3024–30. Бибкод : 2000ApEnM..66.3024A . дои : 10.1128/АЕМ.66.7.3024-3030.2000 . ПМК 92106 . ПМИД 10877801 .
- ^ Алави М., Миллер Т., Эрландсон К., Шнайдер Р., Белас Р. (01.06.2001). «Бактериальное сообщество, связанное с Pfiesteria-подобными культурами динофлагеллят». Экологическая микробиология . 3 (6): 380–396. дои : 10.1046/j.1462-2920.2001.00207.x . ПМИД 11472503 .
- ^ Бентзон-Тилиа М., Грам Л. (2017). «Биотехнологическое применение группы Roseobacter». Биоразведка . Темы биоразнообразия и охраны природы. Том. 16. Спрингер, Чам. стр. 137–166. дои : 10.1007/978-3-319-47935-4_7 . ISBN 978-3-319-47933-0 .
- ^ Д'Альвиз П. (2013). Применение в аквакультуре и экофизиология морских бактерий семейства Roseobacter . ДТУ Еда. ISBN 9788792763723 .
- ^ Зонненшайн Э.К., Нильсен К.Ф., Д'Альвис П., Порсби CH, Мельхиорсен Дж., Хайльманн Дж., Калацис П.Г., Лопес-Перес М., Банк Б., Шпроер С., Мидделбо М., Грам Л. (февраль 2017 г.). «Глобальное распространение и гетерогенность видов Ruegeria mobilis группы Roseobacter» . Журнал ISME . 11 (2): 569–583. дои : 10.1038/ismj.2016.111 . ПМК 5270555 . ПМИД 27552638 .
- ^ Борг И., Григонит А.М., Боинг П., Вулфенден Б., Смит П., Бофой В., Роуз С., Ратисай Т., Заикин А., Несбет Д.Н. (07.07.2016). «Подходы с открытым исходным кодом к созданию бактерий клады Roseobacter в качестве основы синтетической биологии для биогеоинженерии» . ПерДж . 4 : е2031. дои : 10.7717/peerj.2031 . ПМЦ 4941783 . ПМИД 27441104 .
- ^ Перейти обратно: а б с Зан Дж., Лю Ю., Фукуа С., Хилл RT (январь 2014 г.). «Ощущение кворума ацил-гомосерин-лактона в кладе Roseobacter» . Международный журнал молекулярных наук . 15 (1): 654–69. дои : 10.3390/ijms15010654 . ПМК 3907830 . ПМИД 24402124 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Бьюкен А., Хадден М., Suzuki MT (декабрь 2009 г.). «Разработка и применение инструментов количественной ПЦР для подгрупп клады Roseobacter» . Прикладная и экологическая микробиология . 75 (23): 7542–7. Бибкод : 2009ApEnM..75.7542B . дои : 10.1128/АЕМ.00814-09 . ПМК 2786420 . ПМИД 19801463 .
- Мартенс Т., Хайдорн Т., Пукалл Р., Саймон М., Тиндалл Б.Дж., Бринкхофф Т. (июнь 2006 г.). «Реклассификация Roseobacter Gallaeciensis Руис-Понте и др., 1998 г., как Phaeobacter Gallaeciensis gen. Nov., Comb. Nov., описание Phaeobacter inhibens sp. Nov., реклассификация Ruegeria algicola (Lafay et al., 1995) Uchino et al., 1999 г. как Marinovum algicola gen. nov., comb. nov., а также уточненные описания родов Roseobacter, Ruegeria и Leisingera» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 56 (Часть 6): 1293–304. дои : 10.1099/ijs.0.63724-0 . ПМИД 16738106 .
- Шиба, Т (1991). «Roseobacterlitoralis gen. nov., sp. nov. и Roseobacter dentrificans sp. nov., аэробные бактерии с розовым пигментом, содержащие бактериохлорофилл а». Сист. Прил. Микробиол . 14 (2): 140–145. дои : 10.1016/s0723-2020(11)80292-4 .
- Гэррити, Холт Дж.Г. (2001). «Таксономический очерк архей и бактерий» . В Д. Р. Буне, Р. В. Кастенхольце (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. стр. 155–166 . ISBN 978-0-387-98771-2 .