Jump to content

Джеймс Дж. Коллинз

Джеймс Дж. Коллинз
Рожденный ( 1965-06-26 ) 26 июня 1965 г. (59 лет)
Образование Колледж Святого Креста ( бакалавр )
Оксфордский университет ( доктор философии )
Известный Синтетическая биология ,
Открытие халицина и абаоцина
Супруг
Мэри МакНотон Коллинз
( м. 1990 г.)
Награды Стипендия Макартура (2003)
Премия пионера директора НИЗ (2007)
Премия Лагранжа (2010).
Премия HFSP Накасоне (2015)
Премия Габбая (2017)
Премия Диксона в области медицины (2020)
Премия Макса Дельбрюка (2020)
Премия Фейнмана (2023 г.)
Научная карьера
Поля Биологическая инженерия
Биомедицинская инженерия
Системная биология
Синтетическая биология
Учреждения Массачусетский технологический институт
Гарвардский университет
Бостонский университет
Институт Рагона
Институт Висса
Броуд Институт
Диссертация Механика суставов: моделирование нижней конечности   (1990)
Докторантура Джон О'Коннор

Джеймс Джозеф Коллинз (родился 26 июня 1965 г.) - американский биомедицинский инженер и биоинженер , который работает профессором медицинской инженерии и науки Термеера в Массачусетском технологическом институте (MIT), где он также является директором Массачусетского технологического института Абдула Латифа Джамиля. Клиника машинного обучения в здравоохранении .

Коллинз провел исследование, показавшее, что подходы искусственного интеллекта (ИИ) можно использовать для открытия новых антибиотиков, таких как галицин и абауцин . [1] Он является директором проекта «Антибиотики-ИИ» в Массачусетском технологическом институте, который поддерживается The Audacious Project , и является членом программы Гарварда-MIT в области медицинских наук и технологий . Он также является ведущим преподавателем Института биологической инженерии Висса при Гарвардском университете и членом Института Броуда . [2]

Коллинз является одним из основателей области синтетической биологии , и его работа над синтетическими генными цепями и программируемыми клетками привела к разработке новых классов диагностики и терапии, которые повлияли на исследования по обнаружению и лечению инфекций, вызванных новыми патогенами, такими как такие как Эбола, Зика, SARS-CoV-2 и устойчивые к антибиотикам бактерии. Он также является исследователем в области системной биологии , сделавшим открытия, касающиеся действия антибиотиков и возникновения устойчивости к антибиотикам . [3]

Коллинз является членом Национальной инженерной академии , Национальной медицинской академии и Национальной академии наук за вклад в синтетическую биологию и создание генных сетей. В 2023 году он был награжден Clarivate Citation за исследования, которые, скорее всего, получат Нобелевскую премию .

Ранняя жизнь и образование

[ редактировать ]

Коллинз родился 26 июня 1965 года в Бронксе , затем переехал в Беллероуз, штат Нью-Йорк . [4] Его отец был авиационным инженером, работавшим над проектами НАСА и вооруженных сил. [5] В 10 лет Коллинз переехал со своей семьей в Нью-Гэмпшир после окончания начальной школы. [6] вырос в Нашуа . [7] Впервые у него появился интерес к медицинской технике, когда один из его дедушек ослеп , а другой перенес множественные инсульты . [5]

Первоначально Коллинз намеревался изучать электротехнику на бакалавриате и был принят в Массачусетский технологический институт (MIT) и Политехнический институт Ренсселера (RPI). Вместо этого он решил поступить в Колледж Святого Креста , посчитав атмосферу в колледже более дружелюбной. Позже Коллинз вспоминал: «Я влюбился в это место. Я хотел много работать и получить хорошее образование, но я также хотел развлечься. Я хотел получить обширный опыт и чувствовал, что могу получить его в Holy Cross. ". [3]

В Holy Cross Коллинз был классным руководителем и членом команд по легкой атлетике и кроссу , где он пробежал милю с результатом 4:17. [8] Он также писал для школьной газеты и преподавал в рамках Братства христианской доктрины (CCD). Будучи студентом, он был награжден президентской наградой за волонтерскую службу и в 1986 году был удостоен звания стипендиата Фенвика, что является одной из высших наград колледжа. [9] Коллинз окончил Holy Cross в 1987 году с прощальным словом , получив степень бакалавра искусств (BA) по физике с отличием . [3] Его дипломная работа называлась «Функциональная нервно-мышечная стимуляция: анализ биомеханических и нервно-мышечных основ ходьбы». [10]

После окончания университета Коллинз получил стипендию Родса для изучения медицинской инженерии в Англии в Оксфордском университете , где он был членом Бэллиол-колледжа и получил степень доктора философии (D.Phil.) в 1990 году. [11] Его диссертация называлась «Механика суставов: моделирование нижней конечности» и проводилась под руководством Джона Дж. О'Коннора. [12]

Коллинз вернулся в Соединенные Штаты, чтобы поступить на факультет Бостонского университета . Там он основал лабораторию и стал заслуженным профессором университета Уильяма Ф. Уоррена, профессором университета , профессором биомедицинской инженерии, профессором медицины, а также содиректором Центра биодинамики и директором Центра синтетической биологии. В 2008 году Коллинз был назначен исследователем Медицинского института Говарда Хьюза , став первым исследователем из Бостонского университета. [7]

В 2014 году Коллинз стал профессором Массачусетского технологического института. [13] В настоящее время Коллинз является профессором медицинской инженерии и науки Термеера и профессором биологической инженерии в Массачусетском технологическом институте . Коллинз также является одним из основных преподавателей Института биологической инженерии Висса при Гарвардском университете и членом Института Броуда . Коллинз также является руководителем факультета биологических наук в клинике Джамиля Массачусетского технологического института с 2018 года. [14] [15]

Коллинз работал с рядом начинающих компаний, а его изобретения и технологии были лицензированы более чем 25 компаниями, занимающимися биотехнологиями и медицинским оборудованием. Коллинз является научным сооснователем нескольких биотехнологических компаний и некоммерческих организаций.

В 2010 году Коллинз был назначен президентом Бараком Обамой членом Президентской комиссии по изучению вопросов биоэтики . [16]

Синтетическая биология

[ редактировать ]

Работа Коллинза над синтетическими генными цепями положила начало области синтетической биологии . [17] Он был первым (вместе с Майклом Эловицем и Станисласом Лейблером ), кто показал, что можно использовать биофизические свойства нуклеиновых кислот и белков для создания биологических цепей, которые можно использовать для переподключения и перепрограммирования живых клеток.

В статье, опубликованной в журнале Nature , [18] Коллинз спроектировал и сконструировал генетический тумблер – синтетическую бистабильную сеть регуляции генов – в E. coli. Тумблер образует синтетическую адресную единицу клеточной памяти, имеющую широкие возможности для биофизики, биомедицины и биотехнологии. В том же выпуске журнала Nature Эловиц и Лейблер показали, что можно построить синтетический генетический осциллятор (называемый репрессилятором) в E. coli. [19] Статья Коллинза Nature о генетическом переключателе [18] и статья Еловица и Лейблера в Nature. [19] на репрессиляторе считаются знаковыми произведениями, положившими начало синтетической биологии. [17]

Основываясь на этой работе, Коллинз показал, что синтетические генные сети могут использоваться в качестве регуляторных модулей и взаимодействовать с генетическими схемами микроба для создания программируемых клеток для различных применений. [20] например, синтетические пробиотики, которые будут служить живой диагностикой и живыми терапевтическими средствами для обнаружения, лечения и профилактики таких инфекций, как холера и C. difficile. [21] [22] Он также разработал и сконструировал риборегуляторы (РНК-переключатели) для восприятия и контроля. [23] [24] [25] [26] [27] [28] микробные аварийные выключатели и генетические счетчики для биосдерживания, [29] [30] [31] синтетический бактериофаг для борьбы с устойчивыми бактериальными инфекциями, [32] [33] генетические коммутаторы для метаболической инженерии, [34] и настраиваемые генетические переключатели для генной и клеточной терапии. [35] [36] [37] Недавно Коллинз разработал лиофилизированные бесклеточные синтетические генные схемы — инновационную платформу, которая составляет основу для недорогих бумажных диагностических тестов на новые патогены (например, Зика, Эбола, SARS-CoV-2, устойчивые к антибиотикам бактерии). ), [38] [39] [40] [41] носимые биосенсоры, [42] и портативное биомолекулярное производство (например, для производства вакцинных антигенов) в развивающихся странах. [43]

В контексте синтетической биологии и регенеративной медицины Коллинз сотрудничал с Дерриком Росси и Джорджем К. Дейли в исследовании с использованием технологии синтетической мРНК для биомедицинских приложений. Команда показала, что синтетическую мРНК можно использовать для высокоэффективного перепрограммирования и редифференцировки стволовых клеток. Эта работа была опубликована в журнале Cell Stem Cell в 2010 году. [44] и Росси использовал эту технологическую платформу синтетической биологии, чтобы основать компанию Moderna . [45]

Коллинз также использовал подходы синтетической биологии (вычислительные и экспериментальные) для выявления и решения важных вопросов биологической физики, касающихся регуляции экспрессии генов и динамики клеток. Коллинз, например, использовал синтетические генные сети для изучения эффектов положительной обратной связи в генетических модулях. [46] [47] роль и происхождение стохастических колебаний в экспрессии генов эукариот, [48] и фенотипические последствия шума экспрессии генов и его влияние на судьбу клеток и стратегии выживания микробов в стрессовых условиях. [49] Важно отметить, что Коллинз также продемонстрировал, как синтетические генные цепи можно использовать для тестирования, проверки и улучшения качественных и количественных моделей регуляции генов. [50] и показали, что биофизическая теория и эксперимент могут быть объединены в восходящие подходы, чтобы получить биологическое понимание сложных процессов регуляции генов. [51]

Антибиотики и устойчивость к антибиотикам

[ редактировать ]

Коллинз также является одним из ведущих исследователей в области системной биологии, используя экспериментально-вычислительные биофизические методы для обратного проектирования и анализа эндогенных сетей регуляции генов. [52] Коллинз и его коллеги показали, что реверс-инжиниринг генных сетей можно использовать для идентификации мишеней лекарств, биологических медиаторов и биомаркеров заболеваний. [53]

Коллинз и его коллеги обнаружили, используя подходы системной биологии, что все классы бактерицидных антибиотиков вызывают общий путь гибели клеток при окислительном повреждении. [54] Это открытие указывает на то, что воздействие на бактериальные системы, которые устраняют окислительные повреждения, включая реакцию SOS-повреждения ДНК, является жизнеспособным средством повышения эффективности всех основных классов антибиотиков и ограничения возникновения устойчивости к антибиотикам. Эта работа установила механистическую связь между бактериальным метаболизмом и эффективностью антибиотиков, которая была далее развита и подтверждена Коллинзом и его командой в серии последующих исследований. [55]

Коллинз показал, что определенные метаболиты можно использовать, чтобы бактерицидные антибиотики могли искоренить стойкие, толерантные инфекции. [56] Кроме того, Коллинз и его коллеги обнаружили, что сублетальные дозы антибиотиков активируют мутагенез, стимулируя выработку активных форм кислорода, что приводит к множественной лекарственной устойчивости. [57] Коллинз и его коллеги, используя свои системные подходы, также обнаружили механизм популяционной резистентности, представляющий собой форму родственного отбора, посредством которого небольшое количество устойчивых бактериальных мутантов перед лицом антибиотического стресса может, с некоторыми затратами для себя, обеспечить защиту другие, более уязвимые клетки, повышая способность выживания всего населения в стрессовых условиях. [58]

В 2020 году Коллинз был частью команды — вместе с руководителем факультета клиники Джамиль Массачусетского технологического института профессором Региной Барзилай — которая объявила об открытии посредством глубокого изучения галицина , первого нового антибиотика за 30 лет, который убивает более 35 мощных бактерий , в том числе противомикробных. устойчивый туберкулез , супербактерия C. difficile и две Всемирной организации здравоохранения . бактерии, входящие в тройку самых смертоносных бактерий [59] В 2020 году Коллинз, Барзилай и клиника Джамиля Массачусетского технологического института также получили финансирование в рамках проекта Audacious для создания проекта «Антибиотики-ИИ» и расширения возможностей открытия галицина при использовании ИИ для реагирования на кризис устойчивости к антибиотикам посредством разработки новых классов антибиотики. [60]

Нелинейная динамика в биологических системах

[ редактировать ]

Коллинз также был пионером в разработке и использовании нелинейных динамических подходов для изучения, имитации и улучшения биологических функций. [61] расширение нашей способности понимать и использовать физику живых систем. Коллинз, например, предположил, что входной шум можно использовать для улучшения сенсорных функций и моторного контроля у людей. [62] [63] Он и его коллеги показали, что ощущение прикосновения и контроль равновесия у молодых и пожилых людей, пациентов с инсультом и пациентов с диабетической нейропатией можно улучшить с помощью субсенсорного механического шума. [64] например, через вибрирующие стельки. [65] Эта работа привела к созданию нового класса медицинских устройств для лечения осложнений, возникающих в результате диабетической нейропатии, восстановления функций мозга после инсульта и улучшения равновесия у пожилых людей.

Научные достижения Коллинза были отмечены многочисленными наградами, в том числе премией Диксона в области медицины , премией Санофи-Института Пастера , премией HFSP Накасоне , премией Макса Дельбрука , премией Габбая , премией директора НИЗ , премией Медицинского фонда Эллисона для старших Научная премия в области старения , первая премия Энтони Дж. Дрекселя за выдающиеся достижения , премия Лагранжа от Фонда CRT в Италии, премия Роберта А. Притцкера BMES, премия Promega за исследования в области биотехнологий и участие в премии Technology Review первой TR100 100 молодые новаторы, которые будут формировать будущее технологий [66] – и Scientific American 50 – 50 лучших выдающихся лидеров в области науки и технологий. [67]

Коллинз является членом Американского физического общества , Института физики и Американского института медицинской и биологической инженерии. В 2003 году он получил премию Фонда Макартуров « Genius Award ». [68] стал первым биоинженером, удостоенным этой чести. [69] В цитате о награде Коллинза отмечалось: «На протяжении своих исследований Коллинз демонстрирует склонность к выявлению абстрактных принципов, лежащих в основе сложных биологических явлений, и к использованию этих концепций для решения конкретных практических проблем». Он также был удостоен звания Матча всех звезд медицины от команды Boston Red Sox и сделал первую подачу на игре Red Sox в Фенуэй-парке. В 2016 году группа Пола Г. Аллена Frontiers Group назвала Коллинза выдающимся следователем Аллена. [70] Коллинз является избранным членом всех трех национальных академий США — Национальной академии наук , Национальной инженерной академии и Национальной медицинской академии . Он также является избранным членом Американской академии искусств и наук , а также членом Национальной академии изобретателей .

Коллинз получил преподавательские награды в Бостонском университете, в том числе премию «Учитель года по биомедицинской инженерии», премию «Профессор года инженерного колледжа», а также Кубок Меткалфа и премию за выдающиеся достижения в преподавании, что является высшей преподавательской наградой, присуждаемой Бостонским университетом. . [71]

В 2023 году Коллинз был назван лауреатом премии Clarivate Citation вместе с Майклом Еловицем и Станисласом Лейблером «за новаторскую работу над синтетическими генными цепями, положившую начало области синтетической биологии». [72]

Личная жизнь

[ редактировать ]

Жена Коллинза - Мэри Макнотон Коллинз; они познакомились, когда учились в колледже Святого Креста, и поженились в 1990 году. Она профессор Гарвардской медицинской школы и врач Массачусетской больницы общего профиля . [3] У них двое детей: Кэти, стипендиат Маршалла в Кембриджском университете , и Дэнни, стипендиат Рэйчел Карсон в Университете Дьюка . [73] [74]

  1. ^ Трафтон, Энн (20 декабря 2023 г.). «Используя искусственный интеллект, исследователи Массачусетского технологического института идентифицируют новый класс кандидатов на антибиотики» . Новости МТИ . Массачусетский технологический институт . Проверено 6 мая 2024 г.
  2. ^ Сондерс, Фенелла (6 февраля 2023 г.). «Синтез инженерии и биологии» . Американский учёный . Сигма Си . Проверено 19 декабря 2023 г.
  3. ^ Jump up to: а б с д Рирдон, Майкл (зима 2007 г.). «Профиль: Джеймс Дж. Коллинз-младший '87» . Журнал «Святой Крест» . Том. 41, нет. 1. Колледж Святого Креста . п. 80. Архивировано из оригинала 22 августа 2016 года . Проверено 15 апреля 2007 г.
  4. ^ Хан, Фирдос Алам (8 мая 2014 г.). Биотехнология в медицинских науках . ЦРК Пресс. ISBN  978-1-4822-2367-5 .
  5. ^ Jump up to: а б Трафтон, Энн (14 ноября 2015 г.). «Перепрограммирование биологии: инженер-биолог Джеймс Коллинз проектирует генетические схемы с новыми функциями» . Новости МТИ . Массачусетский технологический институт . Проверено 19 декабря 2023 г.
  6. ^ «Джеймс Коллинз, доктор философии | Выпуск стипендиального колледжа AIMBE 2000 года» . Американский институт медицинской и биологической инженерии . Получено 19 декабря 2023 г. - через Xconomy .
  7. ^ Jump up to: а б Бейкер, Билли (24 ноября 2008 г.). «Работа мечты дает ему свободу исследовать» . Бостон Глобус . п. 16 . Проверено 20 декабря 2023 г.
  8. ^ Заман, Мухаммед (20 апреля 2020 г.). Биография Сопротивления . Харпер. ISBN  978-0062862976 .
  9. ^ Брэди 2012 , с. 184.
  10. ^ «Бывшие ученые, проекты и консультанты Фенвика» . Колледж Святого Креста . Проверено 19 декабря 2023 г.
  11. ^ «Премия Диксона в области медицины вручена выпускнику Баллиола» . Баллиол-колледж, Оксфорд . Оксфордский университет . 28 октября 2020 г. Проверено 4 сентября 2023 г.
  12. ^ «Диссертация: Механика суставов – моделирование нижней конечности» . Информационная система Оксфордских библиотек . Оксфордский университет . Проверено 19 декабря 2023 г.
  13. ^ «Коллинз удостоен чести Сигмы Си; Марнетт уходит с поста декана» . www.asbmb.org . Проверено 20 декабря 2023 г.
  14. ^ «Регина Барзилай, Джеймс Коллинз и Фил Шарп присоединяются к руководству новыми усилиями по машинному обучению в здравоохранении» . Новости МТИ . Массачусетский технологический институт . 3 октября 2018 г. . Проверено 13 ноября 2020 г.
  15. ^ "Люди" . J-Клиника . Архивировано из оригинала 30 ноября 2021 года . Проверено 13 ноября 2020 г.
  16. ^ «Джим Дж. Коллинз, доктор философии | Catalio Capital Management» . www.cataliocapital.com . Проверено 19 декабря 2023 г.
  17. ^ Jump up to: а б От редакции: Десять лет синергии , Nature 463, 269-270 (21 января 2010 г.), doi:10.1038/463269b
  18. ^ Jump up to: а б Гарднер, Т.С.; Кантор ЧР; Коллинз Джей-Джей (20 января 2000 г.). «Создание генетического тумблера в Escherichia coli». Природа . 403 (6767): 339–342. Бибкод : 2000Natur.403..339G . дои : 10.1038/35002131 . ПМИД   10659857 . S2CID   345059 .
  19. ^ Jump up to: а б Еловиц М.Б., Лейблер С. (2000). «Синтетическая колебательная сеть регуляторов транскрипции» . Природа . 403 (6767): 335–8. Бибкод : 2000Natur.403..335E . дои : 10.1038/35002125 . ПМИД   10659856 . S2CID   41632754 .
  20. ^ Кобаяши Х., Каэрн М., Араки М., Чунг К., Гарднер Т.С., Кантор Ч.Р.; и др. (2004). «Программируемые клетки: взаимодействие природных и инженерных генных сетей» . Proc Natl Acad Sci США . 101 (22): 8414–9. Бибкод : 2004PNAS..101.8414K . дои : 10.1073/pnas.0402940101 . ПМК   420408 . ПМИД   15159530 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  21. ^ Мао Н., Кубильос-Руис А., Кэмерон Д.Э., Коллинз Дж.Дж. (2018). «Пробиотические штаммы обнаруживают и подавляют холеру у мышей» . Научный перевод Мед . 10 (445). doi : 10.1126/scitranslmed.aao2586 . ПМК   7821980 . ПМИД   29899022 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  22. ^ Кубильос-Руис А., Алькантар М.А., Донгиа Н.М., Карденас П., Авила-Пачеко Дж., Коллинз Дж.Дж. (2022). «Разработанное живое биотерапевтическое средство для профилактики дисбиоза, вызванного антибиотиками» . Нат Биомед Инж . 6 (7): 910–921. дои : 10.1038/s41551-022-00871-9 . ПМИД   35411114 . S2CID   248100868 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  23. ^ Айзекс, Ф.Дж.; Дуайер, диджей; Дин, К; Первоушин, Д.Д.; Кантор, ЧР; Коллинз, Джей-Джей (2004). «Сконструированные риборегуляторы обеспечивают посттранскрипционный контроль экспрессии генов». Нат Биотехнология . 22 (7): 823–4 2004. doi : 10.1038/nbt986 . ПМИД   15208640 . S2CID   7289450 .
  24. ^ Грин А.А., Сильвер П.А., Коллинз Дж.Дж., Инь П. (2014). «Пульсовые переключатели: регуляторы экспрессии генов, разработанные заново» . Клетка . 159 (4): 925–39. дои : 10.1016/j.cell.2014.10.002 . ПМЦ   4265554 . ПМИД   25417166 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  25. ^ Грин А.А., Ким Дж., Ма Д., Сильвер П.А., Коллинз Дж.Дж., Инь П. (2017). «Сложные вычисления клеточной логики с использованием рибокомпьютерных устройств» . Природа . 548 (7665): 117–121. Бибкод : 2017Natur.548..117G . дои : 10.1038/nature23271 . ПМК   6078203 . ПМИД   28746304 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  26. ^ Ангенент-Мари Н.М., Гаррусс А.С., Соенксен Л.Р., Чёрч Дж., Коллинз Дж.Дж. (2020). «Подход глубокого обучения к программируемым переключателям РНК» . Нат Коммун . 11 (1): 5057. Бибкод : 2020NatCo..11.5057A . дои : 10.1038/s41467-020-18677-1 . ПМЦ   7541447 . ПМИД   33028812 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  27. ^ Чжао Э.М., Мао А.С., де Пуч Х., Чжан К., Типпенс Н.Д., Тан X; и др. (2022). «РНК-зависимые элементы для эукариотического контроля трансляции» . Нат Биотехнология . 40 (4): 539–545. дои : 10.1038/s41587-021-01068-2 . ПМИД   34711989 . S2CID   240153815 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  28. ^ Гайет Р.В., Илия К., Разави С., Типпенс Н.Д., Лалвани М.А., Чжан К.; и др. (2023). «Автокаталитическое редактирование оснований для РНК-зависимого контроля трансляции» . Нат Коммун . 14 (1): 1339. Бибкод : 2023NatCo..14.1339G . дои : 10.1038/s41467-023-36851-z . ПМЦ   10008589 . ПМИД   36906659 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  29. ^ Фридланд А.Е., Лу Т.К., Ван X, Ши Д., Черч Дж., Коллинз Дж.Дж. (2009). «Синтетические генные сети, которые имеют значение» . Наука . 324 (5931): 1199–202. Бибкод : 2009Sci...324.1199F . дои : 10.1126/science.1172005 . ПМК   2690711 . ПМИД   19478183 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  30. ^ Каллура Дж.М., Дуайер DJ, Исаакс Ф.Дж., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2010). «Отслеживание, настройка и прекращение микробной физиологии с помощью синтетических риборегуляторов» . Proc Natl Acad Sci США . 107 (36): 15898–903. Бибкод : 2010PNAS..10715898C . дои : 10.1073/pnas.1009747107 . ПМЦ   2936621 . ПМИД   20713708 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  31. ^ Чан КТ, Ли Дж.В., Кэмерон Д.Э., Башор С.Дж., Коллинз Дж.Дж. (2016). « Микробные выключатели «Deadman» и «Passcode» для сдерживания бактерий» . Nat Chem Biol . 12 (2): 82–6. doi : 10.1038/nchembio.1979 . ПМЦ   4718764 . ПМИД   26641934 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  32. ^ Лу Т.К., Коллинз Дж.Дж. (2007). «Диспергирование биопленок с помощью сконструированного ферментативного бактериофага» . Proc Natl Acad Sci США . 104 (27): 11197–202. Бибкод : 2007PNAS..10411197L . дои : 10.1073/pnas.0704624104 . ЧВК   1899193 . ПМИД   17592147 .
  33. ^ Лу Т.К., Коллинз Дж.Дж. (2009). «Спроектированные бактериофаги, нацеленные на генные сети, в качестве адъювантов для антибиотикотерапии» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (12): 4629–34. Бибкод : 2009PNAS..106.4629L . дои : 10.1073/pnas.0800442106 . ПМК   2649960 . ПМИД   19255432 .
  34. ^ Каллура Дж. М., Кантор Ч. Р., Коллинз Дж. Дж. (2012). «Генетический коммутатор для приложений синтетической биологии» . Proc Natl Acad Sci США . 109 (15): 5850–5. Бибкод : 2012PNAS..109.5850C . дои : 10.1073/pnas.1203808109 . ПМЦ   3326468 . ПМИД   22454498 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  35. ^ Динс Т.Л., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2007). «Настраиваемый генетический переключатель на основе РНКи и белков-репрессоров для регулирования экспрессии генов в клетках млекопитающих» . Клетка . 130 (2): 363–72. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.045 . ПМИД   17662949 . S2CID   7960766 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  36. ^ Чо Дж.Х., Коллинз Дж.Дж., Вонг В.В. (2018). «Универсальные химерные антигенные рецепторы для мультиплексного и логического контроля ответов Т-клеток» . Клетка . 173 (6): 1426–1438.e11. дои : 10.1016/j.cell.2018.03.038 . ПМЦ   5984158 . ПМИД   29706540 ​​. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  37. ^ Чо Дж.Х., Окума А., Софьян К., Ли С., Коллинз Дж.Дж., Вонг В.В. (2021). «Разработка передовой логики и распределенных вычислений в иммунных клетках CAR человека» . Нат Коммун . 12 (1): 792. Бибкод : 2021NatCo..12..792C . дои : 10.1038/s41467-021-21078-7 . ПМЦ   7862674 . ПМИД   33542232 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  38. ^ Парди К., Грин А.А., Ферранте Т., Кэмерон Д.Е., ДейлиКейзер А., Инь П.; и др. (2014). «Синтетические генные сети на бумажной основе» . Клетка . 159 (4): 940–54. дои : 10.1016/j.cell.2014.10.004 . ПМК   4243060 . ПМИД   25417167 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  39. ^ Парди К., Грин А.А., Такахаши М.К., Брафф Д., Ламберт Дж., Ли Дж.В.; и др. (2016). «Быстрое и недорогое обнаружение вируса Зика с использованием программируемых биомолекулярных компонентов» . Клетка . 165 (5): 1255–1266. дои : 10.1016/j.cell.2016.04.059 . hdl : 1721.1/109241 . ПМИД   27160350 . S2CID   3278532 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  40. ^ де Пуч Х., Ли Р.А., Наджар Д., Тан Х., Соекнсен Л.Р., Ангенент-Мари Н.М.; и др. (2021). «Минимально оснащенный SHERLOCK (miSHERLOCK) для диагностики SARS-CoV-2 и его новых вариантов в местах оказания медицинской помощи на основе CRISPR» . Научный адв . 7 (32). Бибкод : 2021SciA....7.2944D . дои : 10.1126/sciadv.abh2944 . ПМЦ   8346217 . ПМИД   34362739 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  41. ^ Карликов М., да Силва С.Дж.Р., Го Ю., Чичек С., Кроковский Л., Хомм П.; и др. (2022). «Полевая валидация эффективности бумажных тестов на обнаружение вирусов Зика и чикунгунья в образцах сыворотки» . Нат Биомед Инж . 6 (3): 246–256. дои : 10.1038/s41551-022-00850-0 . ПМЦ   8940623 . PMID   35256758 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  42. ^ Нгуен П.К., Соенксен Л.Р., Донгиа Н.М., Ангенент-Мари Н.М., де Пуч Х., Хуанг А.; и др. (2021). «Носимые материалы со встроенными сенсорами синтетической биологии для обнаружения биомолекул» . Нат Биотехнология . 39 (11): 1366–1374. дои : 10.1038/s41587-021-00950-3 . hdl : 1721.1/131278 . ПМИД   34183860 . S2CID   235673261 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  43. ^ Парди К., Сломович С., Нгуен П.К., Ли Дж.В., Донгиа Н., Беррилл Д.; и др. (2016). «Портативное биомолекулярное производство по требованию» . Клетка . 167 (1): 248–259.e12. дои : 10.1016/j.cell.2016.09.013 . hdl : 1721.1/111574 . ПМИД   27662092 . S2CID   8481521 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  44. ^ Уоррен Л., Манос П.Д., Ахфельдт Т., Ло Й.Х., Ли Х., Лау Ф.; и др. (2010). «Высокоэффективное перепрограммирование к плюрипотентности и направленной дифференцировке клеток человека с помощью синтетической модифицированной мРНК» . Клеточная стволовая клетка . 7 (5): 618–30. дои : 10.1016/j.stem.2010.08.012 . ПМЦ   3656821 . ПМИД   20888316 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  45. ^ Куц, Эрин (4 октября 2010 г.). «ModeRNA, скрытый стартап, поддерживаемый флагманом, представляет новый способ создания стволовых клеток» . Xconomy, Inc.
  46. ^ Хэсти Дж., Прадинес Дж., Дольник М., Коллинз Дж.Дж. (2000). «Шумовые переключатели и усилители для экспрессии генов» . Proc Natl Acad Sci США . 97 (5): 2075–80. arXiv : физика/0003105 . Бибкод : 2000PNAS...97.2075H . дои : 10.1073/pnas.040411297 . ПМК   15756 . ПМИД   10681449 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  47. ^ Айзекс Ф.Дж., Хэсти Дж., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2003). «Прогнозирование и измерение ауторегуляторного генетического модуля» . Proc Natl Acad Sci США . 100 (13): 7714–9. Бибкод : 2003PNAS..100.7714I . дои : 10.1073/pnas.1332628100 . ПМК   164653 . ПМИД   12808135 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  48. ^ Блейк В.Дж., К.Эрн М., Кантор Ч.Р., Коллинз Дж.Дж. (2003). «Шум в экспрессии генов эукариот» . Природа . 422 (6932): 633–7. Бибкод : 2003Natur.422..633B . дои : 10.1038/nature01546 . ПМИД   12687005 . S2CID   4347106 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  49. ^ Блейк В.Дж., Балажи Дж., Кохански М.А., Исаакс Ф.Дж., Мерфи К.Ф., Куанг Й.; и др. (2006). «Фенотипические последствия транскрипционного шума, опосредованного промотором» . Мол Клетка . 24 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2006.11.003 . ПМИД   17189188 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  50. ^ Эллис Т., Ван Х, Коллинз Дж.Дж. (2009). «Построение синтетических генных сетей с предсказанными функциями на основе разнообразия и на основе моделей» . Нат Биотехнология . 27 (5): 465–71. дои : 10.1038/nbt.1536 . ПМК   2680460 . ПМИД   19377462 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  51. ^ Гвидо Нью-Джерси, Ван Х, Адалстейнссон Д., Макмиллен Д., Хэсти Дж., Кантор Ч.Р.; и др. (2006). «Восходящий подход к регуляции генов» . Природа . 439 (7078): 856–60. Бибкод : 2006Natur.439..856G . дои : 10.1038/nature04473 . ПМИД   16482159 . S2CID   4418558 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  52. ^ Юнг М.К., Тегнер Дж., Коллинз Дж.Дж. (2002). «Обратное проектирование генных сетей с использованием разложения по сингулярным значениям и устойчивой регрессии» . Proc Natl Acad Sci США . 99 (9): 6163–8. Бибкод : 2002PNAS...99.6163Y . дои : 10.1073/pnas.092576199 . ПМК   122920 . ПМИД   11983907 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  53. ^ Гарднер, Т.С.; ди Бернардо Д; Лоренц Д; Коллинз Джей-Джей (4 июля 2003 г.). «Вывод о генетических сетях и выявление комплекса действий посредством профилирования экспрессии». Наука . 301 (5629): 102–105. дои : 10.1126/science.1081900 . ПМИД   12843395 . S2CID   8356492 .
  54. ^ Кохански, Массачусетс; Дуайер диджей; Хаете Б; Лоуренс, Калифорния; Коллинз Дж.Дж. (2007). «Общий механизм гибели клеток, вызванной бактерицидными антибиотиками» . Клетка . 130 (5): 797–810. дои : 10.1016/j.cell.2007.06.049 . ПМИД   17803904 . S2CID   1103795 .
  55. ^ Кохански М.А., Дуайер Д.Д., Вежбовски Дж., Коттарел Дж., Коллинз Дж.Дж. (2008). «Неправильная трансляция мембранных белков и активация двухкомпонентной системы вызывают гибель клеток, опосредованную антибиотиками» . Клетка . 135 (4): 679–90. дои : 10.1016/j.cell.2008.09.038 . ПМК   2684502 . ПМИД   19013277 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  56. ^ Эллисон К.Р., член парламента Бринильдсена, Коллинз Дж.Дж. (2011 г.). «Уничтожение бактерий-персистеров с помощью метаболитов с помощью аминогликозидов» . Природа . 473 (7346): 216–20. Бибкод : 2011Natur.473..216A . дои : 10.1038/nature10069 . ПМЦ   3145328 . ПМИД   21562562 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  57. ^ Кохански, Массачусетс; ДеПристо Массачусетс; Коллинз Дж.Дж. (2010). «Сублетальное лечение антибиотиками приводит к множественной лекарственной устойчивости посредством радикально-индуцированного мутагенеза» . Молекулярная клетка . 37 (3): 311–320. doi : 10.1016/j.molcel.2010.01.003 . ПМК   2840266 . ПМИД   20159551 .
  58. ^ Ли, Х.Х.; Молла М.Н.; Кантор ЧР; Коллинз Дж.Дж. (2010). «Бактериальная благотворительность приводит к всеобщему сопротивлению» . Природа . 467 (7311): 82–85. Бибкод : 2010Natur.467...82L . дои : 10.1038/nature09354 . ПМЦ   2936489 . ПМИД   20811456 .
  59. ^ Стоукс, Джонатан М.; Ян, Кевин; Суонсон, Кайл; Цзинь, Венгун; Кубильос-Руис, Андрес; Донгия, Нина М.; Макнейр, Крейг Р.; Френч, Шон; Карфрэ, Линдси А.; Блум-Акерманн, Зохар; Тран, Виктория М. (20 февраля 2020 г.). «Подход глубокого обучения к открытию антибиотиков» . Клетка . 180 (4): 688–702.e13. дои : 10.1016/j.cell.2020.01.021 . ISSN   1097-4172 . ПМЦ   8349178 . ПМИД   32084340 .
  60. ^ «Джим Коллинз получает финансирование на использование искусственного интеллекта для открытия лекарств» . Новости Массачусетского технологического института | Массачусетский технологический институт . 23 апреля 2020 г. . Проверено 13 ноября 2020 г.
  61. ^ Коллинз Джей-Джей (1994). «Беспорядочная ходьба во время спокойного стояния» . Преподобный Летт по физике . 73 (5): 764–767. Бибкод : 1994PhRvL..73..764C . дои : 10.1103/PhysRevLett.73.764 . ПМИД   10057531 .
  62. ^ Коллинз Дж. Дж., Чоу CC, Имхофф Т.Т. (1995). «Стохастический резонанс без настройки» . Природа . 376 (6537): 236–8. Бибкод : 1995Natur.376..236C . дои : 10.1038/376236a0 . ПМИД   7617033 . S2CID   4314968 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  63. ^ Коллинз Дж.Дж., Имхофф Т.Т., Григг П. (1996). «Передача информации с усилением шума в кожных механорецепторах SA1 крысы посредством апериодического стохастического резонанса» . J Нейрофизиология . 76 (1): 642–5. дои : 10.1152/jn.1996.76.1.642 . ПМИД   8836253 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  64. ^ Коллинз Дж.Дж., Имхофф Т.Т., Григг П. (1996). «Тактильное ощущение, усиленное шумом» . Природа . 383 (6603): 770. Бибкод : 1996Natur.383..770C . дои : 10.1038/383770a0 . ПМИД   8893000 . S2CID   3660648 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  65. ^ Приплата, А; Ниеми Дж; Гарри Дж; Липсиц Л.А.; Коллинз Джей-Джей (4 октября 2003 г.). «Вибрирующие стельки и контроль равновесия у пожилых людей». Ланцет . 362 (9390): 1123–1124. дои : 10.1016/S0140-6736(03)14470-4 . ПМИД   14550702 . S2CID   33216209 .
  66. ^ «1999 Молодой новатор, Джеймс Коллинз» . Обзор технологий. Ноябрь – декабрь 1999 г. Проверено 15 апреля 2007 г.
  67. ^ «Scientific American 50: победители и участники SA 50» . Научный американец. 21 ноября 2005 года . Проверено 15 апреля 2007 г.
  68. ^ «Стипендиаты Макартура, октябрь 2003 г.» . Фонд Джона Д. и Кэтрин Т. Макартуров. Архивировано из оригинала 16 октября 2007 года . Проверено 15 апреля 2007 г.
  69. ^ Такер, Ян (21 мая 2011 г.). «Джеймс Коллинз: Ложка сахара помогает лекарству подействовать» . Хранитель . ISSN   0261-3077 . Проверено 22 апреля 2024 г.
  70. ^ Шанер, Карен (13 апреля 2016 г.). «Джеймс Коллинз назначен выдающимся следователем Аллена 2016 года» . Новости МТИ . Массачусетский технологический институт . Проверено 19 декабря 2023 г.
  71. ^ Брик, Триша (весна 2006 г.). «Гений за работой» . Бостония . стр. 20–25. Архивировано из оригинала 19 октября 2012 года . Проверено 12 июня 2009 г.
  72. ^ «Джеймс Дж. Коллинз удостоен звания лауреата премии» . Гарвард-МТИ, медицинские науки и технологии . 22 сентября 2023 г. . Проверено 19 декабря 2023 г.
  73. ^ «Здравоохранение и науки о жизни: Джеймс Коллинз» . Ирландская Америка . 5 октября 2022 г. . Проверено 19 декабря 2023 г.
  74. ^ «Герцог-старший стремится к большим вознаграждениям» . Герцог сегодня . 19 октября 2023 г. . Проверено 3 февраля 2024 г.

Дополнительные ссылки

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 36c6824810e90bf4f1b0608aa985b4ab__1722115380
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/36/ab/36c6824810e90bf4f1b0608aa985b4ab.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
James J. Collins - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)