Немецкий ресурсный центр исследований генома
| Тип компании | сервисный центр |
|---|---|
| Штаб-квартира | Берлин-Шарлоттенбург Гейдельберг |
Обслуживаемая территория | Германия Лондон |
| Услуги |
|
Немецкий центр по исследованию генома (RZPD, Resourcen z — entrum Primär atenbank d ) был сервисным центром генных и геномных исследований в Берлине Шарлоттенбурге Гейдельберге и ресурсный .
История
[ редактировать ]В 1987 году Ханс Лерах и Гюнтер Цехетнер основали Справочную библиотеку/первичную базу данных (RLDB) при Имперском фонде исследования рака (ICRF) в Лондоне . [ 1 ] [ 2 ] RLDB, Распределенные макромассивы созданные в ICRF [ 3 ] исследовательским группам по всему миру. Макроматрицы состояли из клонов геномных библиотек и библиотек кДНК , перенесенных в нейлоновые фильтры размером 22 × 22 см с помощью роботов, разработанных Зехетнером в ICRF. Машины первого поколения достигли разрешения 1/100 мм, используя двухфазные шаговые двигатели в полушаговом режиме с 400 шагами на оборот. Эти роботы достигли плотности пятна более 400 точек на квадратный сантиметр, будучи запрограммированными на пространственное разрешение 0,015 мм на длине перемещения 600 мм. Второе поколение роботов, разработанных с 1991 по 1992 год, уже достигло плотности изображения до 2500 точек на квадратный сантиметр с использованием линейных двигателей . [ 4 ] Результаты экспериментов, проведенные со стандартизированными материалами, были сообщены исследователями и собраны в Первичной базе данных . [ 5 ] В январе 1990 года Зехетнер был назначен ассоциированным научным сотрудником ICRF под руководством тогдашнего генерального директора сэра Уолтера Бодмера .
В начале 1995 года RLDB переехала в Берлин в Институт молекулярной генетики Макса Планка , где продолжила свою работу. [ 6 ]
Летом 1995 года Ресурсный центр был создан в рамках Немецкого проекта генома человека (DHGP). [ 7 ] Ганс Лерах (Институт молекулярной генетики Макса Планка (MPIMG), Берлин-Далем ), Гюнтер Цехетнер (MPIMG, до июля 2000 г. научный директор Берлинского ресурсного центра) и Аннемари Пустка ( Немецкий онкологический исследовательский центр (DKFZ), Гейдельберг). В качестве Ресурсного центра/Основной базы данных (RZPD) он взял на себя работу RLDB. Он финансировался Федеральным министерством образования и исследований (BMBF) с целью бесплатного предоставления материалов членам DHGP, в то время как они были доступны другим исследователям за вознаграждение. RZPD стала крупнейшей базой данных генетических клонов в мире и была связана со многими крупными национальными и международными проектами по исследованию генов и геномов. RZPD был одним из двух дистрибьюторов в Европе клонов кДНК IMAGE , а также создал свои собственные плазмид , космид , YAC и кДНК библиотеки . Каждый клон хранили в лунке 96- или 384-луночного микротитровального планшета , который хранили, пока не использовали для нанесения проб, в морозильных камерах при -80°C.
1 июля 2000 года РЗПД было преобразовано в некоммерческое общество с ограниченной ответственностью (gGmbH). Эту компанию с ограниченной ответственностью поддерживали три наиболее важные исследовательские компании Германии: Общество Макса Планка , Немецкий центр исследования рака и Центр молекулярной медицины Макса Дельбрюка (MDC Berlin-Buch ). В качестве членов научной компании выступали Ханс Лерах (MPIMG), Аннемари Пустка (DKFZ), Йенс Райх (MDC), Маттиас Улен ( Каролинский институт , Стокгольм ) и Харальд цур Хаузен (DKFZ).
31 июля 2007 года некоммерческая организация была расформирована. Большая часть существующих услуг была передана двум новым компаниям. ImaGenes (стартап-компания, созданная бывшими управляющими директорами RZPD) и ATLAS Biolabs GmbH , соучредителем которой был Лерах вместе с бывшими руководителями отделов RZPD Уве Раделофом и Берндом Дрешером. [ 8 ]
Услуги
[ редактировать ]Объем услуг постоянно расширялся и включал предоставление клонов геномных клеток и баз данных кДНК, клеточных культур , микрочипов , экспрессии профилей Affymetrix , услуг и предложений ПЦР . Данные, собранные в первичной базе данных, были доступны для сравнения экспериментальных результатов исследований с использованием глобально стандартизированных материалов, предоставленных центром. [ 9 ]
Локации
[ редактировать ]Офис RLDB в Лондоне располагался в главном здании ICRF в Lincoln's Inn Fields , Холборн , а затем переехал в более просторное помещение в соседнем здании Королевского колледжа хирургов . Здание Lincoln's Inn Fields позже было продано Лондонской школе экономики и снесено в 2018 году, чтобы освободить место для нового здания Маршалл. [ 10 ]
В Берлине RZPD сначала располагался в Институте молекулярной генетики Макса Планка в Берлин-Далеме, а затем переехал в соседнее место на Гарнакской дороге (которая сегодня является местом расположения Института истории науки Макса Планка ) перед центром. переехал на свое окончательное место в бывшем здании императрицы Огюст Виктории детского дома в Хойбнервеге в Берлине-Шарлоттенбурге. Здание в стиле необарокко было построено в 1907–1909 годах под руководством архитектора и берлинского городского комиссара по городскому планированию Людвига Гофмана , при этом на планировку значительное влияние оказал архитектор Альфред Мессель . Небольшой гейдельбергский компонент центра располагался на территории DKFZ.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Справочная библиотечная система - обмен биологическим материалом и экспериментальными данными. Гюнтер Цехетнер и Ханс Лерах (3 февраля 1994 г.). Природа , т. 367, стр. 489-491.
- ^ Кан, Патрисия (16 июня 1995 г.). «Германия осторожно картирует проект генома» . Наука Том. 268, выпуск 5217, стр. 1556-1558 . Проверено 24 марта 2021 г.
- ^ Молекулярные подходы к генетике млекопитающих ( Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по квантовой биологии. 51), А. Пустка и др. (1986), стр. 131-139.
- ^ Разработка ДНК-чипов (Технологии DNA ARRAYS и экспериментальные стратегии, под редакцией Елены В. Григоренко, CRC Press ), Хольгер Эйкхофф и др. (2002), стр. 1–9.
- ^ Подготовка и скрининг массивов кДНК высокой плотности с геномными клонами ( Методы в молекулярной биологии , том 175: Протоколы геномики, под редакцией: М. П. Старки и Р. Эласварапу, Humana Press Inc., Тотова, Нью-Джерси), Гюнтер Цехетнер, Мария Пак и Катя Шефер (2001), стр. 169–188.
- ↑ Институт Макса Планка хочет создать банк генов , Die Welt , 31 мая 1995 г.
- ^ Германия запустит новую генную программу ... (18 мая 1995 г.) Nature , vol 375, p. 175
- ^ РЗПД становится ImaGenes - Экономический успех позволяет изменить правовую форму GenomXPress, 3/07, 2007 г.
- ^ Развитие и перспективы научных услуг, предлагаемых центрами геномных биологических ресурсов , Oxford Journals, брифинги по функциональной геномике и протеомике, 2007 г., том 6, номер 3, стр. 163-170.
- ^ " "Местоположение здания Маршалл" " . Архивировано из оригинала 30 марта 2022 г. Проверено 19 марта 2021 г.