МАТР3

МАТР3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1X4D, 1X4F
Идентификаторы
Псевдонимы	MATR3 , ALS21, MPD2, VCPDM, матрин 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 164015 ; МГИ : 1298379 ; Гомологен : 7830 ; GeneCards : MATR3 ; OMA : MATR3 — ортологи
showГенная онтология
Molecular function	zinc ion binding; protein binding; structural molecule activity; metal ion binding; nucleic acid binding; RNA binding; identical protein binding; miRNA binding;
Cellular component	nuclear matrix; nuclear inner membrane; membrane; nucleus;
Biological process	posttranscriptional regulation of gene expression; activation of innate immune response; immune system process; innate immune response; heart valve development; ventricular septum development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9782
	17184
	ENSG00000015479 ; ENSG00000280987
	ENSMUSG00000037236
	P43243
	Q8K310
showНМ_001194954 ; НМ_001194955 ; НМ_001194956 ; НМ_001282278 ; НМ_018834 ;
	NM_199189
	НМ_010771
showНП_001181883 ; НП_001181884 ; НП_001181885 ; НП_001269207 ; НП_061322 ;
	NP_954659
showНП_034901 ; НП_001386912 ; НП_001386913 ; НП_001386914 ; НП_001386915 ;
	NP_001386917; NP_001386918; NP_001386919; NP_001386920; NP_001386921; NP_001386922
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Матрин-3 — это белок , который у человека кодируется MATR3 геном . ^[3]^[4]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, локализован в ядерном матриксе . Он может играть роль в транскрипции или может взаимодействовать с другими белками ядерного матрикса, образуя внутреннюю фиброгранулярную сеть. Для этого гена идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. ^[4]

Патология

Мутации в гене Matrin 3 связаны с семейным боковым амиотрофическим склерозом . ^[5]

Ссылки

^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Белградер П., Дей Р., Березней Р. (июнь 1991 г.). «Молекулярное клонирование матрина 3. Белок ядерного матрикса массой 125 килодальтон содержит обширный кислый домен» . J Биол Хим . 266 (15): 9893–9. дои : 10.1016/S0021-9258(18)92902-9 . ПМИД 2033075 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: MATR3 матрин 3» .
^ Джонсон Дж.О., Пиоро Э.П., Берингер А., Чиа Р., Фейт Х., Рентон А.Э., Плинер Х.А., Абрамзон Ю., Маранги Дж., Уинборн Б.Дж., Гиббс Дж.Р., Ноллс М.А., Морган С., Шоаи М., Харди Дж., Питтман А., Оррелл Р.В. , Маласпина А, Сидле К.С., Фратта П., Хармс М.Б., Балох Р.Х., Пестронк А., Вейль С.С., Рогаева Е., Зинман Л., Дрори В.Е., Боргеро Г., Мора Г., Кальво А., Ротштейн Дж.Д., Дреппер С., Сендтнер М., Синглтон А.Б., Тейлор Дж.П., Куксон М.Р., Рестаньо Дж., Сабателли М., Баузер Р., Чио А., Трейнор Б.Дж. (2014). «Мутации в гене Matrin 3 вызывают семейный боковой амиотрофический склероз» . Нат. Нейроски . 17 (5): 664–6. дои : 10.1038/nn.3688 . ПМЦ 4000579 . ПМИД 24686783 .

Дальнейшее чтение

Стурман Н; Мейне А.М.; ван дер Пол А.Дж.; и др. (1990). «Ядерный матрикс из клеток различного происхождения. Доказательства общего набора белков матрикса» . Ж. Биол. Хим . 265 (10): 5460–5. дои : 10.1016/S0021-9258(19)39383-4 . ПМИД 2180926 .
Андерссон Б; Вентланд, Массачусетс; Рикафренте Ж.И.; и др. (1996). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В; Андерссон Б; Уорли К.С.; и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геном Рез . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Окумара К; Ногами М; Мацусима Ю; и др. (1998). «Картирование человеческого ДНК-связывающего ядерного белка (NP220) с полосой хромосом 2p13.1-p13.2 и его связь с матрином 3» . Биология. Биотехнология. Биохим . 62 (8): 1640–2. дои : 10.1271/bbb.62.1640 . ПМИД 9757574 .
Нагасе Т; Исикава К; Суяма М; и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (5): 277–86. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .
Ху РМ; Хан З.Г.; Песня HD; и др. (2000). «Профилирование экспрессии генов в системе гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и полноразмерное клонирование кДНК» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (17): 9543–8. Бибкод : 2000PNAS...97.9543H . дои : 10.1073/pnas.160270997 . ПМК 16901 . ПМИД 10931946 .
Чжан З, Кармайкл Г.Г. (2001). «Судьба дцРНК в ядре: комплекс, содержащий p54(nrb), опосредует удержание в ядре беспорядочно отредактированных РНК A-to-I» . Клетка . 106 (4): 465–75. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . ПМИД 11525732 . S2CID 18799711 .
Бернерт Г., Фунтулакис М., Любец Г. (2003). «Множественное снижение уровня белка матрина 3, снижение моторного белка HMP и hlark в мозге плода с синдромом Дауна». Протеомика . 2 (12): 1752–7. doi : 10.1002/1615-9861(200212)2:12<1752::AID-PROT1752>3.0.CO;2-Y . ПМИД 12469345 . S2CID 32160196 .
Штраусберг Р.Л.; Фейнгольд Э.А.; тетерев ЛХ; и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Чжан С; Дауд Д.Р.; Стаал А; и др. (2003). «Белок, взаимодействующий с ядерным коактиватором-62 кДа/Ski, представляет собой коактиватор, связанный с ядерным матриксом, который может сочетать транскрипцию, опосредованную рецептором витамина D, и сплайсинг РНК» . Ж. Биол. Хим . 278 (37): 35325–36. дои : 10.1074/jbc.M305191200 . ПМИД 12840015 .
Леонард Д., Аджу П., Ламонд А.И., Легерски Р.Дж. (2003). «hLodestar/HuF2 взаимодействует с CDC5L и участвует в сплайсинге пре-мРНК». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 308 (4): 793–801. CiteSeerX 10.1.1.539.8359 . дои : 10.1016/S0006-291X(03)01486-4 . ПМИД 12927788 .
Ота Т; Сузуки Ю; Нисикава Т; и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Босолей С.А.; Едриховский М; Шварц Д; и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Герхард Д.С.; Вагнер Л; Фейнгольд Э.А.; и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Руал Дж.Ф.; Венкатесан К; Хао Т; и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Лим Дж; Хао Т; Шоу С; и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
Олсен СП; Благоев Б; Гнад Ф; и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Юинг Р.М.; Чу П; Элизма Ф; и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Валенсия, Калифорния, Джу В, Лю Р (2007). «Матрин 3 представляет собой белок, связывающий Ca2+/кальмодулин, расщепляемый каспазами». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 361 (2): 281–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.06.156 . ПМИД 17658460 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[2] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2033075-3] Белградер П., Дей Р., Березней Р. (июнь 1991 г.). «Молекулярное клонирование матрина 3. Белок ядерного матрикса массой 125 килодальтон содержит обширный кислый домен» . J Биол Хим . 266 (15): 9893–9. дои : 10.1016/S0021-9258(18)92902-9 . ПМИД 2033075 .

[entrez-4] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: MATR3 матрин 3» .

[pmid24686783-5] Джонсон Дж.О., Пиоро Э.П., Берингер А., Чиа Р., Фейт Х., Рентон А.Э., Плинер Х.А., Абрамзон Ю., Маранги Дж., Уинборн Б.Дж., Гиббс Дж.Р., Ноллс М.А., Морган С., Шоаи М., Харди Дж., Питтман А., Оррелл Р.В. , Маласпина А, Сидле К.С., Фратта П., Хармс М.Б., Балох Р.Х., Пестронк А., Вейль С.С., Рогаева Е., Зинман Л., Дрори В.Е., Боргеро Г., Мора Г., Кальво А., Ротштейн Дж.Д., Дреппер С., Сендтнер М., Синглтон А.Б., Тейлор Дж.П., Куксон М.Р., Рестаньо Дж., Сабателли М., Баузер Р., Чио А., Трейнор Б.Дж. (2014). «Мутации в гене Matrin 3 вызывают семейный боковой амиотрофический склероз» . Нат. Нейроски . 17 (5): 664–6. дои : 10.1038/nn.3688 . ПМЦ 4000579 . ПМИД 24686783 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]