Белковый домен Tbf5
| ТБФ5 | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура TFIIH человека. | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ТБФ5 | ||
| Пфам | PF06331 | ||
| ИнтерПро | ИПР009400 | ||
| |||
В молекулярной биологии этот белковый домен представляет собой Tbf5 , который обозначает TTDA субъединицу TFIIH базальных факторов транскрипции комплекса (также известную как субъединица 5 транскрипционного фактора B РНК-полимеразы II ), и Rex1 - тип белков эксцизионной репарации нуклеотидов (NER). Эксцизионная репарация нуклеотидов является основным путем восстановления повреждений ДНК, вызванных ультрафиолетовым излучением, у большинства организмов . Функция этого белка заключается в содействии транскрипции .
Структура
[ редактировать ]Эти белки имеют структурный мотив , состоящий из двухслойной сэндвич- структуры альфа/бета-жгута с топологией .
ТФИИХ
[ редактировать ]Фактор транскрипции/репарации IIH (TFIIH) необходим для транскрипции РНК-полимеразы II и эксцизионной репарации нуклеотидов. Комплекс TFIIH состоит из десяти субъединиц:
- ЭРСС2,
- ЭРКЦ3,
- ГТФ2Н1,
- ГТФ2Н2,
- ГТФ2Н3,
- ГТФ2Н4,
- ГТФ2Н5,
- МНАТ1,
- CDK7 и
- ККНХ.
TTDA также необходим для стабильности комплекса TFIIH и наличия нормальных уровней TFIIH в клетке . TFIIH является одним из пяти общих факторов транскрипции (GTF), которые собираются с РНК-полимеразой II в промоторном сайте до начала транскрипции. Это одна из десяти субъединиц, составляющих часть белкового комплекса из 10 субъединиц (holoTFIIH) и часть комплекса из шести субъединиц Rad3, Tfb1, Tfb2, Tfb4, Tfb5 и Ssl1 (называемого ядром). [ 1 ]
Функция
[ редактировать ]У человека функция Tbf5 ясна, поскольку его потеря приводит к трихотиоситропии . Дефекты GTF2H5 вызывают заболевание трихотиодистрофию (TTD), поэтому GTF2H5 (субъединица 5 общего транскрипционного фактора 2H) также известен как субъединица группы A TTD (TTDA) (и как Tfb5). [ 2 ] Субъединица TTDA отвечает за функцию репарации ДНК комплекса. ТТДА присутствует как связанный с TFIIH, так и в виде свободной фракции, которая перемещается между цитоплазмой и ядром; индукция повреждений ДНК типа NER смещает баланс в сторону более стабильной ассоциации TTDA с TFIIH. [ 3 ]
REX1, сокращение от «required for excision 1», необходим для репарации ДНК у одноклеточных фотосинтезирующих водорослей Chlamydomonas Reinhardtii . [ 4 ] и имеет гомологи у других эукариот .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гиббонс Б.Дж., Бриньоль Э.Дж., Азубель М., Мураками К., Восс Н.Р., Бушнелл Д.А. и др. (2012). «Субъединичная архитектура общего фактора транскрипции TFIIH» . Proc Natl Acad Sci США . 109 (6): 1949–54. Бибкод : 2012ПНАС..109.1949Г . дои : 10.1073/pnas.1105266109 . ПМЦ 3277522 . ПМИД 22308316 .
- ^ Джилья-Мари Дж., Коин Ф., Раниш Дж.А., Хугстратен Д., Тейл А., Вигерс Н., Ясперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., ван дер Спек П.Дж., Ботта Е., Стефанини М., Эгли Дж.М., Эберсолд Р., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен W (июль 2004 г.). «Новая, десятая субъединица TFIIH отвечает за синдром репарации ДНК трихотиодистрофии группы А» . Нат. Жене . 36 (7): 714–9. дои : 10.1038/ng1387 . ПМИД 15220921 .
- ^ Джилья-Мари Дж., Микель С., Тейл А.Ф., Мари П.О., Хугстратен Д., Нг Дж.М., Динант С., Хоймейкерс Дж.Х., Вермюлен В. (июнь 2006 г.). «Динамическое взаимодействие TTDA с TFIIH стабилизируется путем эксцизионной репарации нуклеотидов в живых клетках» . ПЛОС Биол . 4 (6): е156. дои : 10.1371/journal.pbio.0040156 . ПМК 1457016 . ПМИД 16669699 .
- ^ Ченкчи Б., Петерсен Дж.Л., Small GD (июнь 2003 г.). «REX1, новый ген, необходимый для восстановления ДНК» . Ж. Биол. Хим . 278 (25): 22574–7. дои : 10.1074/jbc.M303249200 . ПМИД 12697762 .