Брайан Д. Рэй
Брайан Дэвид Рэй | |
---|---|
Рожденный | 1970 |
Национальность | Американский |
Известный | Гипотеза гистонового кода и исследование модификаций гистонов |
Научная карьера | |
Поля | Эпигенетика |
Учреждения | Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл |
Научные консультанты | К. Дэвид Эллис |
Веб-сайт | https://www.med.unc.edu/~bstrahl/ |
Брайан Дэвид Страл (1970 г.р.) — американский биохимик и молекулярный биолог. [ 1 ] В настоящее время является профессором кафедры биохимии и биофизики. [ 2 ] в Университете Северной Каролины в Чапел-Хилл . [ 3 ] Штраль известен своими исследованиями в области биологии хроматина и модификаций гистонов. Страл вместе с К. Дэвидом Эллисом предложили « гипотезу гистонового кода ». [ 4 ]
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Страл родился в Буффало , штат Нью-Йорк, и вырос в Альбукерке , штат Нью-Мексико. Он переехал в Чапел-Хилл, Северная Каролина, в 1980 году, когда его отец учился в медицинской школе Университета Северной Каролины в Чапел-Хилл. Страл поступил в Университет Северной Каролины в Гринсборо. [ 5 ] в 1988 году, где он дважды специализировался в области химии и биологии. Страл поступил на факультет биохимии Университета штата Северная Каролина. [ 6 ] и получил докторскую степень в 1998 году под руководством доктора Уильяма Л. Миллера. [ 7 ] В Университете штата Северная Каролина Страл определил механизмы регулирования гена фолликулостимулирующего гормона-бета (ФСГβ) на уровне транскрипции. [ 8 ] [ 9 ] В 1998 году Страл провел постдокторантуру под руководством доктора К. Дэвида Эллиса на Университета Вирджинии факультете биохимии и молекулярной генетики .
Карьера
[ редактировать ]В 2001 году Страл поступил на работу в Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл в качестве доцента кафедры биохимии и биофизики. В 2008 году он получил звание доцента, а в 2014 году — профессора. Он также работает в Комплексном онкологическом центре Линебергера Университета Северной Каролины. [ 10 ] и является преподавателем учебной программы по генетике и молекулярной биологии. [ 11 ] Кроме того, Страл также является директором факультета Центра высокопроизводительного синтеза пептидов и массивов UNC. [ 12 ] С 2016 по 2020 год он занимал должность заместителя заведующего кафедрой биохимии и биофизики Университета Северной Каролины. [ 13 ] С 2020 по 2022 год он исполнял обязанности временного заведующего кафедрой биохимии и биофизики. [ 14 ] С 2023 года Страл занимает должность помощника декана по исследованиям в исследовательском отделе Медицинской школы Университета Северной Каролины. [ 15 ] Основная задача Управления исследований — разработать и реализовать стратегический план исследований в медицинской школе (ссылка). Медицинская школа Университета Северной Каролины выбрала Страла исследователем Оливера Смитиса в знак признания его исследовательского вклада. [ 16 ] Эта ежегодная награда присуждается старшим преподавателям, получившим международное признание за свою работу. С 2015 года Страл руководит программой UNC по хроматину и эпигенетике. [ 17 ] стремясь понять сложный язык эпигенетической регуляции. Программа направлена на улучшение здоровья человека и борьбу с болезнями. [ 18 ] Шталь также является соучредителем EpiCypher. [ 19 ] Инк. [ 20 ] – компания, известная услугами по исследованиям биологии хроматина и эпигенетики.
Исследования и открытия
[ редактировать ]Страл — пионер в области эпигенетики , внесший вклад в изучение биологии хроматина . В качестве постдокторанта в лаборатории К. Дэвида Аллиса помог установить идентичность первых лизин- и аргинин- гистон-метилтрансфераз и то, как они способствуют активации транскрипции и образованию гетерохроматина . Некоторые примеры включают открытие первых гистоновых метилтрансфераз, нацеленных на лизин 4 ( Set1 ), [ 21 ] лизин 9 ( SUV39H1 ), [ 22 ] и лизин 36 гистона H3 (Set2/ SETD2 ) [ 23 ] и аргинин 3 гистона H4 ( PRMT1 ). [ 24 ] Страл также помог разработать первые антитела к метилированным гистонам в лаборатории Эллиса. В 2000 году Страл и Эллис выдвинули идею « гипотезы гистонового кода », целью которой было объяснить, как множественные модификации гистонов функционируют вместе, контролируя структуру и функцию хроматина. [ 4 ] В первые годы существования лаборатории Штраля исследования были сосредоточены на роли метилирования гистонов и убиквитилирования гистонов в транскрипции генов. Он связал убиквитилирование гистона H2B с регуляцией метилирования лизина 79 H3 и элонгацией транскрипции. [ 25 ] [ 26 ] и определили, как метилирование лизина 36 H3 связано с РНК-полимеразой II. [ 27 ] и репрессивный хроматин во время элонгации транскрипции. [ 28 ] Его группа также определила ключевые роли нескольких гистоновых шаперонов (например, Spt6 ), которые участвуют в транскрипции. [ 29 ] [ 30 ] В последние годы Штраль обратил внимание на то, как белки, ассоциированные с хроматином, взаимодействуют с гистонами и их модификациями. Благодаря разработке платформы пептидных микрочипов , [ 31 ] его группа открыла механизмы поддержания метилирования ДНК. [ 32 ] [ 33 ] и определили способы взаимодействия с хроматином с помощью различных семейств эффекторных доменов, связывающих гистоны. [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] Недавняя работа также обратилась к тому, как недавно определенные эффекторные домены, включая домен YEATS , способствуют функции хроматина и метаболической транскрипции. [ 37 ] [ 38 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Брайан Д. Страл» . Биохимия и биофизика .
- ^ «Кафедра биохимии и биофизики UNC» . Биохимия и биофизика .
- ^ «Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл» . Университет Северной Каролины в Чапел-Хилл . 27 марта 2024 г.
- ^ Jump up to: а б Страл, Брайан Д.; Эллис, К. Дэвид (26 января 2000 г.). «Язык ковалентных модификаций гистонов» . Природа . 403 (6765): 41–45. Бибкод : 2000Natur.403...41S . дои : 10.1038/47412 . PMID 10638745 – через www.nature.com.
- ^ «Главная страница» . UNC Гринсборо .
- ^ «Университет штата Северная Каролина» . Государственный университет Северной Каролины .
- ^ «Уильям Миллер» . Молекулярная и структурная биохимия .
- ^ https://academic.oup.com/endo/article/139/11/4455/2986812?login=true
- ^ https://academic.oup.com/endo/article/138/6/2621/2987988.
- ^ «Брайан Д. Страл» . UNC Линебергер .
- ^ «Факультет GMB | Учебная программа по генетике и молекулярной биологии» . gmb.unc.edu .
- ^ «Контакт | Центр высокопроизводительного пептидного синтеза и массивов UNC» . www.med.unc.edu .
- ^ «Эпигенетика: Брайан Страл, доктор философии, в центре внимания факультета» . Октябрь 2018.
- ^ «Штраль назначен временным заведующим кафедрой биохимии и биофизики» . 9 апреля 2020 г.
- ^ «Штрал назначен временным помощником декана по научной работе» . Интранет медицинского факультета . 7 июня 2023 г.
- ^ Клэбо, Кэролайн (31 января 2018 г.). «Штрал назначен следователем кузни» . Биохимия и биофизика .
- ^ «Факультет | Программа хроматина и эпигенетики» . www.med.unc.edu .
- ^ «Программа хроматина и эпигенетики» . www.med.unc.edu .
- ^ «Научные основатели EpiCypher» . www.epicypher.com .
- ^ «EpiCypher | Оживление эпигенетики | Для ученых. От ученых» . www.epicypher.com .
- ^ Бриггс, SD; Брик, М.; Страл, Б.Д.; Чунг, WL; Дэви, Дж. К.; Дент, С.Ю.; Уинстон, Ф.; Эллис, компакт-диск (2001). «Метилирование лизина 4 гистона H3 опосредовано Set1 и необходимо для роста клеток и подавления рДНК у Saccharomyces cerevisiae» . Гены и развитие . 15 (24): 3286–3295. дои : 10.1101/gad.940201 . ПМК 312847 . ПМИД 11751634 .
- ^ Ри, С.; Эйзенхабер, Ф.; О'Кэрролл, Д.; Страл, Б.Д.; Солнце, ZW; Шмид, М.; Оправиль, С.; Мехтлер, К.; Понтинг, КП; Эллис, компакт-диск; Дженувейн, Т. (2000). «Регуляция структуры хроматина сайт-специфическими метилтрансферазами гистона H3» . Природа . 406 (6796): 593–599. дои : 10.1038/35020506 . ПМИД 10949293 .
- ^ Страл, Б.Д.; Грант, Пенсильвания; Бриггс, SD; Солнце, ZW; Боун, младший; Колдуэлл, Дж.А.; Молла, С.; Кук, Р.Г.; Шабановиц, Дж.; Хант, DF; Эллис, компакт-диск (2002). «Set2 представляет собой нуклеосомную гистон-H3-селективную метилтрансферазу, которая опосредует репрессию транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (5): 1298–1506. дои : 10.1128/MCB.22.5.1298-1306.2002 . ПМК 134702 . ПМИД 11839797 .
- ^ Страл, Б.Д.; Бриггс, SD; Брэйм, CJ; Колдуэлл, Дж.А.; Кох, СС; Ма, Х.; Кук, Р.Г.; Шабановиц, Дж.; Хант, DF; Столлкап, MR; Эллис, компакт-диск (2001). «Метилирование гистона H4 по аргинину 3 происходит in vivo и опосредуется коактиватором ядерного рецептора PRMT1» . Современная биология . 11 (12): 996–1000. Бибкод : 2001CBio...11..996S . дои : 10.1016/s0960-9822(01)00294-9 . ПМИД 11448779 .
- ^ Бриггс, Скотт Д.; Сяо, Тяоцзян; Сунь, Цзу-Вэнь; Колдуэлл, Дженнифер А.; Шабановиц, Джеффри; Хант, Дональд Ф.; Эллис, К. Дэвид; Страл, Брайан Д. (26 августа 2002 г.). «Путь регуляции трансгистонов в хроматине» . Природа . 418 (6897): 498. doi : 10.1038/nature00970 . PMID 12152067 – через www.nature.com.
- ^ Сяо, Т.; Као, CF; Кроган, Нью-Джерси; Солнце, ZW; Гринблатт, Дж. Ф.; Осли, Массачусетс; Страл, Б.Д. (2005). «Убиквитилирование гистона H2B связано с удлинением РНК-полимеразы II» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (2): 637–651. doi : 10.1128/MCB.25.2.637-651.2005 . ПМК 543430 . ПМИД 15632065 .
- ^ Сяо, Т.; Холл, Х.; Кайзер, КО; Сибата, Ю.; Холл, MC; Борчерс, Швейцария; Страл, Б.Д. (2003). «Фосфорилирование РНК-полимеразы II CTD регулирует метилирование H3 у дрожжей» . Гены и развитие . 17 (5): 654–663. дои : 10.1101/gad.1055503 . ПМК 196010 . ПМИД 12629047 .
- ^ Кио, MC; Курдистан, Словакия; Моррис, ЮАР; Ан, Ш.; Подольный, В.; Коллинз, СР; Шульдинер, М.; Чин, К.; Пунна, Т.; Томпсон, Нью-Джерси; Бун, К.; Эмили, А.; Вайсман, Дж. С.; Хьюз, TR; Страл, Б.Д.; Грунштейн, М.; Гринблатт, Дж. Ф.; Буратовский С.; Кроган, Нью-Джерси (2005). «Котранскрипционное метилирование Set2 гистона H3 лизина 36 рекрутирует репрессивный комплекс Rpd3 - ScienceDirect» . Клетка . 123 (4): 593–605. дои : 10.1016/j.cell.2005.10.025 . ПМИД 16286008 .
- ^ Дронамраджу, Р.; Страл, Б.Д. (2014). «Цепь прямой связи, включающая Spt6, Ctk1 и PAF, регулирует фосфорилирование Pol II CTD и элонгацию транскрипции» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (2): 870–881. дои : 10.1093/нар/gkt1003 . ПМЦ 3902893 . ПМИД 24163256 .
- ^ «Ассоциация Spt6 с РНК-полимеразой II управляет обменом мРНК во время транскрипции - ScienceDirect» . doi : 10.1016/j.molcel.2018.05.020 . ПМИД 29932900 .
- ^ Ротбарт, SB; Краевский, К.; Страл, Б.Д.; Фукс, С.М. (2012). «Пептидные микроматрицы для исследования «гистонового кода» ». Нуклеосомы, гистоны и хроматин . Часть А. Методы энзимологии. Том. 512. стр. 107–135. дои : 10.1016/B978-0-12-391940-3.00006-8 . ISBN 978-0-12-391940-3 . ПМК 3741997 . ПМИД 22910205 .
- ^ Ротбарт, SB; Краевский, К.; Нади, Н.; Темпель, В.; Сюэ, С.; Бадо, А.И.; Барсайт-Лавджой, Д.; Мартинес, JY; Бедфорд, Монтана; Фукс, С.М.; Эрроусмит, Швейцария; Страл, Б.Д. (2012). «Ассоциация UHRF1 с метилированным H3K9 управляет поддержанием метилирования ДНК» . Структурная и молекулярная биология природы . 19 (11): 1155–1160. дои : 10.1038/nsmb.2391 . ПМЦ 3492551 . ПМИД 23022729 .
- ^ Ротбарт, SB; Диксон, Б.М.; Онг, MS; Краевский, К.; Хоулистон, С.; Киреев, Д.Б.; Эрроусмит, Швейцария; Страл, Б.Д. (2013). «Мультивалентное взаимодействие гистонов со связанными тандемными доменами Tudor и PhD UHRF1 необходимо для эпигенетического наследования метилирования ДНК» . Гены и развитие . 27 (11): 1288–1298. дои : 10.1101/gad.220467.113 . ПМК 3690401 . ПМИД 23752590 .
- ^ Шанле, ЕК; Шинский, С.А.; Бриджерс, Дж. Б.; Бэ, Н.; Сагум, К.; Краевский, К.; Ротбарт, SB; Бедфорд, Монтана; Страл, Б.Д. (2017). «Скрининг гистоновых пептидов на микроматрице хромо- и тюдоровских доменов определяет новые взаимодействия метилирования лизина гистонов» . Эпигенетика и хроматин . 10:12 . дои : 10.1186/s13072-017-0117-5 . ПМК 5348760 . ПМИД 28293301 .
- ^ Джайн, К.; Фрейзер, CS; Марунде, MR; Паркер, ММ; Сагум, К.; Бург, Дж. М.; Холл, Н.; Попова И.К.; Родригес, КЛ; Вайдья, А.; Краевский, К.; Кио, MC; Бедфорд, Монтана; Страл, Б.Д. (2020). «Характеристика семейства ридеров растительного гомеодомена (PHD) на предмет их взаимодействия с хвостом гистонов» . Эпигенетика и хроматин . 13 (1): 3. дои : 10.1186/s13072-020-0328-z . ПМК 6979384 . ПМИД 31980037 .
- ^ Джайн, К.; Марунде, MR; Бург, Дж. М.; Глор, СЛ; Джозеф, FM; Понча, КФ; Гиллеспи, ЗБ; Родригес, КЛ; Попова И.К.; Холл, Северо-Запад; Вайдья, А.; Ховард, ЮАР; Тейлор, Х.Ф.; Мухсинова Л.; Онуоха, Калифорнийский университет; Паттесон, EF; Кук, Юго-Запад; Тейлор, Британская Колумбия; Вайнцапфель, EN; Чик, Массачусетс; Майнерс, MJ; Фокс, GC; Намиц Кью; Коулз, Миссури; Краевский, К.; Солнце, ZW; Косгроув, штат Массачусетс; Янг, Нидерланды; Кио, MC; Страл, Б.Д. (2023). «Переключение хроматина, опосредованное ацетилированием, управляет способностью чтения-записи метилирования H3K4» . электронная жизнь . 12 . doi : 10.7554/eLife.82596 . ПМЦ 10229121 . ПМИД 37204295 .
- ^ «Распознавание кротонилирования гистонов с помощью Taf14 связывает метаболическое состояние с экспрессией генов - ScienceDirect» . doi : 10.1016/j.molcel.2019.09.029 .
- ^ Чжан, Дж.; Гунду, А.; Страл, Б.Д. (2021). «Узнавание ацетилированного гистона Yaf9 регулирует метаболический цикл инициации транскрипции и регуляторных факторов хроматина» . Гены и развитие . 35 (23–24): 1678–1692. дои : 10.1101/gad.348904.121 . ПМЦ 8653784 . ПМИД 34819351 .