Список программного обеспечения для нейровизуализации

Программное обеспечение нейровизуализации используется для изучения структуры и функций мозга. Чтобы увидеть финансируемый NIH Blueprint for Neuroscience Research центр обмена информацией по многим из этих программных приложений, а также аппаратного обеспечения и т. д., посетите веб-сайт NITRC.

3D Slicer Расширяемое бесплатное многоцелевое программное обеспечение с открытым исходным кодом для визуализации и анализа.
Программное обеспечение Amira для 3D-визуализации и анализа
Анализ функциональных нейроизображений (AFNI)
Анализ разработан Ресурсом биомедицинской визуализации (BIR) клиники Мэйо .
Пакет анализа изображений мозга
КамБА
Лаборатория Карет Ван Эссен, Вашингтонский университет в Сент-Луисе
CONN (функциональный набор инструментов для подключения)
Диффузная визуализация в Python (DIPY) ^[1]
ДЛ+ДИРЕКТ ^[2]
ЭГЛАБ
Библиотека программного обеспечения FMRIB (FSL)
FreeSurfer
Имарис Имарис для нейробиологов
ISAS (иктально-интериктальный ОФЭКТ-анализ с помощью СЗМ)
LONI Pipeline , Лаборатория нейровизуализации, Университет Южной Калифорнии
манго ^[3]
NITRC Информационный центр по инструментам и ресурсам нейровизуализации. База Национальным институтом здравоохранения (NIH). данных инструментов нейровизуализации, финансируемая
NeuroKit , набор инструментов Python с открытым исходным кодом для обработки физиологических сигналов.
Набор инструментов нейрофизиологических биомаркеров
PyNets: воспроизводимый рабочий процесс для обучения структурному и функциональному ансамблю коннектома (PyNets)
D-картирование на основе начального числа (ранее обозначавшееся как дифференциальное картирование, SDM): метод проведения метаанализа исследований нейровизуализации на основе вокселей.
Spinal Cord Toolbox (SCT) — это первое комплексное программное обеспечение с открытым исходным кодом для обработки МР-изображений спинного мозга. ^[4]
Статистическое параметрическое картографирование (СПМ)

Ссылки

^ Гарифаллидис, Элефтериос; Бретт, Мэтью; Амирбекян, Баграт; Рокем, Ариэль; ван дер Вальт, Стефан; Деското, Максим; Ниммо-Смит, Ян; Дипи, Участники (2014). «Dipy, библиотека для анализа данных диффузной МРТ» . Границы нейроинформатики . 8 : 8. дои : 10.3389/fninf.2014.00008 . ISSN 1662-5196 . ПМЦ 3931231 . ПМИД 24600385 . {{cite journal}}: |first8= имеет общее имя ( справка )
^ Ребсамен, Майкл; Раммель, Кристиан; Рейес, Маурисио; Уист, Роланд; МакКинли, Ричард (декабрь 2020 г.). «Прямая оценка толщины коры с использованием анатомической сегментации и парцелляции коры на основе глубокого обучения» . Картирование человеческого мозга . 41 (17): 4804–4814. дои : 10.1002/hbm.25159 . ПМЦ 7643371 . ПМИД 32786059 .
^ Садиг-Этегад С., Мажди А., Фархуди М., Талеби М., Махмуди Дж. (2014). «Различные закономерности активации мозга при нормальном старении и болезни Альцгеймера с точки зрения когнитивного зрения: метаанализ с использованием оценки вероятности активации». Журнал неврологических наук . 343 (1): 159–66. дои : 10.1016/j.jns.2014.05.066 . ПМИД 24950901 . S2CID 24359894 .
^ Коэн-Адад Дж., Де Леенер Б., Бенаму М., Кадотт Д., Флит Д., Кадотт А., Фелингс М.Г., Пеллетье Пакетт Дж.П., Тонг В., Тасо М., Коллинз Д.Л., Калло В., Фонов В. Набор инструментов для спинного мозга: открытый - исходная структура для обработки данных МРТ спинного мозга. Материалы 20-го ежегодного собрания OHBM, Гамбург, Германия, 2014: 3633

[1] Гарифаллидис, Элефтериос; Бретт, Мэтью; Амирбекян, Баграт; Рокем, Ариэль; ван дер Вальт, Стефан; Деското, Максим; Ниммо-Смит, Ян; Дипи, Участники (2014). «Dipy, библиотека для анализа данных диффузной МРТ» . Границы нейроинформатики . 8 : 8. дои : 10.3389/fninf.2014.00008 . ISSN 1662-5196 . ПМЦ 3931231 . ПМИД 24600385 . {{cite journal}}: |first8= имеет общее имя ( справка )

[2] Ребсамен, Майкл; Раммель, Кристиан; Рейес, Маурисио; Уист, Роланд; МакКинли, Ричард (декабрь 2020 г.). «Прямая оценка толщины коры с использованием анатомической сегментации и парцелляции коры на основе глубокого обучения» . Картирование человеческого мозга . 41 (17): 4804–4814. дои : 10.1002/hbm.25159 . ПМЦ 7643371 . ПМИД 32786059 .

[3] Садиг-Этегад С., Мажди А., Фархуди М., Талеби М., Махмуди Дж. (2014). «Различные закономерности активации мозга при нормальном старении и болезни Альцгеймера с точки зрения когнитивного зрения: метаанализ с использованием оценки вероятности активации». Журнал неврологических наук . 343 (1): 159–66. дои : 10.1016/j.jns.2014.05.066 . ПМИД 24950901 . S2CID 24359894 .

[4] Коэн-Адад Дж., Де Леенер Б., Бенаму М., Кадотт Д., Флит Д., Кадотт А., Фелингс М.Г., Пеллетье Пакетт Дж.П., Тонг В., Тасо М., Коллинз Д.Л., Калло В., Фонов В. Набор инструментов для спинного мозга: открытый - исходная структура для обработки данных МРТ спинного мозга. Материалы 20-го ежегодного собрания OHBM, Гамбург, Германия, 2014: 3633

[1]

[2]

[3]

[4]