Амира (программное обеспечение)
Разработчик(и) | Институт Цузе в Берлине Термо Фишер Сайентифик |
---|---|
Первоначальный выпуск | октябрь 1999 г |
Стабильная версия | 2020.3 / февраль 2021 г |
Операционная система | Windows XP SP3 , Windows Vista , Windows 7 ОС Х 10.5 , ОС Х 10.6 , ОС Х 10.7 РЭЛ 5.5 |
Платформа | ИА-32 , х64 |
Доступно в | Английский |
Тип | 3D визуализация и обработка данных |
Лицензия | Пробная версия |
Веб-сайт | thermofisher.com/amira-avizo |
Amira (произносится: Ah-meer-ah) — программная платформа для визуализации, обработки и анализа 3D- и 4D-данных. Он активно разрабатывается компанией Thermo Fisher Scientific в сотрудничестве с Институтом Цузе в Берлине (ZIB) и коммерчески распространяется компанией Thermo Fisher Scientific — вместе с родственным программным обеспечением Avizo .
Обзор
[ редактировать ]Амира [1] — это расширяемая программная система для научной визуализации , анализа данных и представления 3D и 4D данных. Его используют тысячи исследователей и инженеров в научных кругах и промышленности по всему миру.Гибкий пользовательский интерфейс и модульная архитектура делают его универсальным инструментом для обработки и анализа данных различных модальностей; например микро-КТ , [2] ДОМАШНИЙ ПИТОМЕЦ , [3] Ультразвук . [4] Его постоянно расширяющаяся функциональность сделала его универсальным решением для анализа и визуализации данных, применимым и используемым во многих областях, таких как микроскопия в биологии. [5] и материаловедение , [6] молекулярная биология , [7] квантовая физика , [8] астрофизика , [9] вычислительная гидродинамика (CFD) , [10] моделирование методом конечных элементов (МКЭ) , [11] неразрушающий контроль (НК) , [12] и многое другое.Одной из ключевых особенностей, помимо визуализации данных, является набор инструментов Amira для сегментации изображений. [13] и реконструкция геометрии . [14] Это позволяет пользователю отмечать (или сегментировать) структуры и области интереса на трехмерных изображениях, используя автоматические, полуавтоматические и ручные инструменты. Затем сегментацию можно использовать для множества последующих задач, таких как объемный анализ, [4] анализ плотности, [15] анализ формы , [16] или создание компьютерных 3D-моделей для визуализации , [17] численное моделирование , [18] или быстрое прототипирование [19] или 3D-печать , и это лишь некоторые из них.Другими ключевыми функциями Amira являются многоплоскостная и объемная визуализация, регистрация изображений , [20] трассировка нити, [21] разделение и анализ клеток, [16] генерация тетраэдрической сетки , [22] отслеживание волокон по данным диффузионно-тензорной визуализации (DTI) , [23] скелетонизация , [24] пространственный анализ графов и стереоскопический рендеринг [25] 3D-данных на нескольких дисплеях и в иммерсивных средах виртуальной реальности, включая CAVE . [26] В качестве коммерческого продукта Amira требует приобретения лицензии или академической подписки. Ограниченная по времени, но полнофункциональная ознакомительная версия доступна для бесплатного скачивания.
История
[ редактировать ]1993–1998: Исследовательское программное обеспечение.
[ редактировать ]Корни Амиры уходят в 1993 год и в отдел научной визуализации, возглавляемый Хансом-Кристианом Хеге в Институте Цузе в Берлине (ZIB) . ЗИБ — научно-исследовательский институт математики и информатики . Миссия отдела научной визуализации — помогать решать сложные вычислительные и научные задачи в медицине , биологии , инженерии и материаловедении . С этой целью компания разрабатывает алгоритмы и программное обеспечение для 2D, 3D и 4D визуализации данных, а также визуально поддерживаемого исследования и анализа. В то время молодая группа визуализации в ЗИБе имела опыт работы с расширяемыми, ориентированными на потоки данных средами визуализации apE, [27] ИРИС Эксплорер, [28] и Advanced Visualization Studio (AVS) этих продуктов , но не был удовлетворен интерактивностью , гибкостью и простотой использования для специалистов, не занимающихся информатикой.
Поэтому разработка новой программной системы была начата в рамках исследовательского проекта. [29] в рамках медицинского многопрофильного совместного исследовательского центра. [30] Основываясь на опыте, полученном Тобиасом Хёллерером в конце 1993 года при работе с новой графической библиотекой IRIS Inventor , [31] было решено использовать эту библиотеку. Разработку системы медицинского планирования выполнил Детлев Столлинг, который впоследствии стал главным архитектором программного обеспечения Amira. Новое программное обеспечение получило название «HyperPlan», что указывает на его первоначальное целевое применение — систему планирования гипертермического лечения рака . Система разрабатывалась на компьютерах Silicon Graphics (SGI) , которые в то время были стандартными рабочими станциями, используемыми для высокопроизводительных графических вычислений. Программное обеспечение было основано на таких библиотеках, как OpenGL (первоначально IRIS GL ), Open Inventor (первоначально IRIS Inventor ), а также графического интерфейса пользователя библиотеках X11 , Motif (программное обеспечение) и ViewKit . В 1998 году X11/Motif/Viewkit были заменены набором инструментов Qt .
Структура HyperPlan служила основой для все большего количества проектов в ZIB и использовалась все большим числом исследователей в сотрудничающих учреждениях. Проекты включали приложения в области вычислений медицинских изображений, медицинской визуализации , нейробиологии , конфокальной микроскопии , визуализации потоков , молекулярного анализа и вычислительной астрофизики .
1998 – сегодня: Коммерчески поддерживаемый продукт.
[ редактировать ]Растущее число пользователей системы начало превышать возможности, которые ZIB мог выделить для распространения и поддержки программного обеспечения, поскольку основной задачей ZIB были алгоритмические исследования. Таким образом, дочернюю компанию Ханс-Кристиан Хеге, Детлев Сталлинг и Малте Вестерхофф основали Indeed – Visual Concepts GmbH.
В феврале 1998 года программному обеспечению HyperPlan было присвоено новое, нейтральное для приложений название « Amira ». Это имя не является аббревиатурой, оно было выбрано из-за того, что его можно произносить на разных языках и оно дает подходящую коннотацию, а именно «смотреть» или «удивляться», от латинского глагола «admirare» (восхищаться), что отражает основная ситуация в визуализации данных. [ нужна ссылка ]
Детлев Столлинг и Малте Вестерхофф провели серьезную переработку программного обеспечения, чтобы сделать его коммерчески поддерживаемым продуктом, а также сделать его доступным на компьютерах, отличных от SGI. В марте 1999 года первая версия коммерческого Amira была представлена на выставке CeBIT в Ганновере , Германия, на стендах SGI IRIX и Hewlett-Packard UniX (HP-UX) . Версии для Linux и Microsoft Windows последовали в течение следующих двенадцати месяцев. Позже была добавлена поддержка Mac OS X.Действительно, компания Visual Concepts GmbH выбрала компанию TGS, Inc., базирующуюся в Бордо , Франция, и Сан-Диего , США, в качестве мирового дистрибьютора Amira и за последующие четыре года выпустила пять основных выпусков (вплоть до версии 3.1).
В 2003 году компании Indeed – Visual Concepts GmbH и TGS, Inc. были приобретены базирующейся в Массачусетсе компанией Mercury Computer Systems, Inc. (NASDAQ:MRCY) и стали частью недавно созданного Mercury в области медико-биологических наук подразделения , позже получившего название Visage Imaging. В 2009 году компания Mercury Computer Systems, Inc. снова выделила Visage Imaging и продала ее компании Promedicus Ltd (ASX:PME), расположенной в Мельбурне , Австралия, ведущему поставщику радиологических информационных систем и медицинских ИТ-решений. В это время разработка Amira продолжалась в Берлине , Германия, в тесном сотрудничестве с ZIB, который по-прежнему возглавляли первоначальные создатели Amira. Компания TGS, расположенная в Бордо, Франция, была продана компанией Mercury Computer Systems французскому инвестору и переименована в Visualization Sciences Group (VSG). VSG продолжила работу над дополнительным продуктом под названием Avizo , основанным на том же исходном коде, но адаптированным для материаловедения.
В августе 2012 года FEI , на тот момент крупнейший реселлер OEM Amira, приобрела VSG и бизнес Amira у Promedicus. Это вернуло двух сестер-программистов Амиру и Авизо в одни руки. В августе 2013 года Группа исследований визуализации (VSG) стала бизнес-подразделением FEI. В 2016 году FEI была куплена компанией Thermo Fisher Scientific и в начале 2017 года стала частью ее подразделения материалов и структурного анализа.
Amira и Avizo по-прежнему продаются как два разных продукта; Амира занимается науками о жизни и Авизо — наукой о материалах, но сейчас усилия по развитию снова объединены. Между тем, количество научных статей, использующих программное обеспечение Amira/Avizo, составляет порядка 10 тысяч. [ нужна ссылка ]
Варианты Амиры
[ редактировать ]Опция микроскопии
[ редактировать ]- Специальные считыватели данных микроскопии
- Деконволюция изображения
- Исследование 3D-изображений, полученных практически с любого микроскопа.
- Извлечение и редактирование сетей нитей из микроскопических изображений.
DICOM-ридер
[ редактировать ]- Импорт клинических и доклинических данных в формате DICOM.
Вариант сетки
[ редактировать ]- Создание 3D-сеток конечных элементов (FE) на основе сегментированных данных изображения.
- Поддержка многих современных форматов решателей FE.
- Высококачественная визуализация результатов моделирования на основе сетки с использованием модулей отображения скалярных, векторных и тензорных полей.
Вариант скелетонизации
[ редактировать ]- Реконструкция и анализ нервных и сосудистых сетей
- Визуализация скелетонизированных сетей
- Количественная оценка длины и диаметра сегментов сети
- Упорядочение сегментов в древовидном графе
- Скелетизация очень больших стеков изображений
Молекулярный вариант
[ редактировать ]- Передовые инструменты для визуализации моделей молекул
- Аппаратное ускорение объемного рендеринга
- Мощный редактор молекул
- Специальные инструменты для сложной молекулярной визуализации
Вариант разработчика
[ редактировать ]- Создание новых пользовательских компонентов для визуализации или обработки данных
- Реализация новых устройств чтения или записи файлов.
- язык программирования С++
- Мастер разработки для быстрого начала работы
Нейро вариант
[ редактировать ]- Анализ медицинских изображений для определения DTI и перфузии головного мозга
- Отслеживание волокон с поддержкой нескольких алгоритмов, основанных на потоковых линиях.
- Разделение волокон на пучки волокон на основе заданных пользователем регионов источника и назначения.
- Вычисление тензорных полей, диффузионно-взвешенных карт
- Разложение по собственным значениям тензорных полей
- Расчет среднего времени прохождения, мозгового кровотока и объема мозговой крови.
VR-опция
[ редактировать ]- Визуализация данных на больших плиточных дисплеях или в иммерсивных средах виртуальной реальности (VR).
- Поддержка устройств 3D-навигации
- Быстрый многопоточный и распределенный рендеринг
Очень большой вариант данных
[ редактировать ]- Поддержка визуализации данных изображения, превышающих доступную основную память, с использованием эффективного управления внешними данными.
- Расширения многих стандартных модулей, таких как ортогональные и наклонные срезы, объемный рендеринг и рендеринг изоповерхностей, для работы с внешними данными.
Области применения
[ редактировать ]- Анатомия [32] [33]
- Биохимия [34]
- Биофизика [34]
- Клеточная микробиология [35] [36]
- Вычислительная гидродинамика [37]
- Криоэлектронная томография [35]
- Диффузионная МРТ / Трактография [38]
- Эмбриология [32]
- Эндокринология [39]
- Моделирование методом конечных элементов [40]
- Гистология [32] [34] [41]
- Материаловедение [42]
- Медицинская визуализация [43]
- Микроскопия в жизни и материаловедении
- Молекулярная биология [44]
- Нейронаука [41] [45]
- Ортопедия [40] [46] [47]
- Отоларингология [48]
- Доклиническая визуализация [44]
- Урология [49]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Столлинг, Д.; Вестерхофф, М.; Хеге, Х.-К. (2005). CD Хансен и CR Джонсон (ред.). «Амира: высокоинтерактивная система визуального анализа данных». Справочник по визуализации : 749–767. CiteSeerX 10.1.1.129.6785 . дои : 10.1016/B978-012387582-2/50040-X . ISBN 9780123875822 .
- ^ Адам, Р.; Смит, Арканзас; Сирен, JC; Эгглстон, Т.; МакЛеннан, Г. (2010). «Характеристика дыхательных путей и легких мыши с нокаутом FABP / CFTR с использованием микрокомпьютерной томографии и массива микроскопов с большим изображением» (PDF) . Американский журнал респираторной медицины и медицины интенсивной терапии . 181 : А6264. doi : 10.1164/ajrccm-conference.2010.181.1_meetingabstracts.a6264 .
- ^ Авасти, В.; Холтер, Дж.; Торп, К.; Андерсон, С.; Эпштейн, Р. (2010). «Оценка F-18-фтортимидина-ПЭТ трансплантата костного мозга на модели крысы». Коммуникации по ядерной медицине . 31 (2): 152–158. дои : 10.1097/mnm.0b013e3283339f92 . ПМИД 19966596 . S2CID 44923538 .
- ^ Jump up to: а б Айерс, Джорджия; МакКинли, ET; Чжао, П.; Фриц, Дж. М.; Метри, РЭ; Дил, Британская Колумбия; Адлерц, КМ; Коффи, Р.Дж.; Мэннинг, ХК (2010). «Объем доклинических ксенотрансплантатных опухолей более точно оценивается с помощью ультразвуковой визуализации, чем измерения ручным штангенциркулем» . Журнал ультразвука в медицине . 29 (6): 891–901. дои : 10.7863/jum.2010.29.6.891 . ПМЦ 2925269 . ПМИД 20498463 .
- ^ Дласкова, А.; Спейсек, Т.; Санторова, Дж.; Плечита-Главата, Л.; Беркова, З.; Саудек, Ф.; Лессард, М.; Беверсдорф, Дж.; Езек, П. (2010). «Микроскопия 4Pi выявляет нарушенную трехмерную митохондриальную сеть бета-клеток островков поджелудочной железы, экспериментальную модель диабета 2 типа» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 1797 (6–7): 1327–1341. дои : 10.1016/j.bbabio.2010.02.003 . ПМИД 20144584 .
- ^ Кларк, НДЛ; Дейли., К. (2010). «Использование конфокальной лазерной сканирующей микроскопии для изображения включений трихом в янтаре» (PDF) . Журнал палеонтологических методов . 8 .
- ^ Амстальден ван Хоув, ER; Блэквелл, TR; Клинкерт, И.; Эйкель, Великобритания; Хирен, Р.; Гланде, К. (2010). «Мультимодальная масс-спектрометрическая визуализация малых молекул выявляет отчетливые пространственно-молекулярные характеристики в дифференциально-метастатических моделях опухолей молочной железы» . Исследования рака . 70 (22): 9012–9021. дои : 10.1158/0008-5472.can-10-0360 . ПМЦ 5555163 . ПМИД 21045154 .
- ^ Шерман, DM (2010). «Комплексообразование металлов и ассоциация ионов в гидротермальных жидкостях: идеи квантовой химии и молекулярной динамики». Границы в геофлюидах . Том. 10. С. 41–57. дои : 10.1002/9781444394900.ch4 . ISBN 9781444394900 . Архивировано из оригинала 6 января 2013 г.
- ^ О'Нил, С.М.; Джонс, Т.В. (2010). «Трехмерное моделирование двунаправленных магнитогидродинамических струй, взаимодействующих с кластерной средой». Астрофизический журнал . 710 (1): 180–196. arXiv : 1001.1747 . Бибкод : 2010ApJ...710..180O . дои : 10.1088/0004-637x/710/1/180 . S2CID 118617883 .
- ^ Бахароглу, Мичиган; Ширмер, CM; Хойт, Д.А.; Гао, БЛ; Малек, AM (2010). «Угол притока аневризмы как дискриминант разрыва аневризмы боковой стенки головного мозга» . Морфометрический и вычислительный гидродинамический анализ . Архивировано из оригинала 22 июня 2010 г. Проверено 17 мая 2012 г.
- ^ Бардин, Т.; Жедет, П.; Халлерманн, В.; Бюхлер., П. (2010). «Прогнозирование крутящего момента зубного имплантата с помощью быстрого и автоматического анализа методом конечных элементов: пилотное исследование». Хирургия полости рта, оральная медицина, патология полости рта, радиология полости рта и эндодонтия . 109 (4): 594–603. дои : 10.1016/j.tripleo.2009.11.010 . ПМИД 20163974 .
- ^ Ширинг, PR; Гелб, Дж.; Йи, Дж.; Ли, ВК; Дракополус, М.; Брэндон, НП (2010). «Анализ тройного фазового контакта в микроструктурах Ni-YSZ с использованием неразрушающей рентгеновской томографии с синхротронным излучением» . Электрохимические коммуникации . 12 (8): 1021–1024. дои : 10.1016/j.elecom.2010.05.014 .
- ^ Ярлинг, Н.; Беккер, К.; Шенбауэр, К.; Шноррер, Ф.; Додт, Ху (2010). «Трехмерная реконструкция и сегментация интактной дрозофилы с помощью ультрамикроскопии» . Границы системной нейронауки . 4 :1. дои : 10.3389/нейро.06.001.2010 . ПМЦ 2831709 . ПМИД 20204156 .
- ^ Чжэн, Г. (2010). «Реконструкция на основе статистической модели формы масштабированной, индивидуальной для пациента модели поверхности таза на основе одной стандартной рентгенограммы в прямой проекции» . Медицинская физика . 37 (4): 1424–1439. Бибкод : 2010MedPh..37.1424Z . дои : 10.1118/1.3327453 . ПМИД 20443464 . Архивировано из оригинала 11 июля 2012 г. Проверено 15 мая 2019 г.
- ^ Родригес-Сото, А.Е.; Фричер, К.Д.; Шулер, Б.; Иссевер, А.С.; Рот, Т.; Камельгер, Ф.; Каммерландер, К.; Блаут, М.; Шуберт, Р.; Линк, ТМ (2010). «Анализ текстуры, минеральная плотность кости и толщина кортикального слоя проксимального отдела бедренной кости: прогнозирование риска перелома». Журнал компьютерной томографии . 34 (6): 949–957. дои : 10.1097/rct.0b013e3181ec05e4 . ПМИД 21084915 . S2CID 21196403 .
- ^ Jump up to: а б Лейшнер, У.; Ширло, А.; Зигльгенсбергер, В.; Додт, Ху (2010). «Индуцированная формалином флуоресценция выявляет форму и морфологию клеток в образцах биологических тканей» . ПЛОС ОДИН . 5 (4): е10391. Бибкод : 2010PLoSO...510391L . дои : 10.1371/journal.pone.0010391 . ПМК 2861007 . ПМИД 20436930 .
- ^ Фелтс, РЛ; Нараян, К.; Эстес, доктор медицинских наук; Ши, Д.; Трубей, CM; Фу, Дж.; Хартнелл, Л.М.; Рутель, GT; Шнайдер, ДК; Нагашима, К. (2010). «3D-визуализация переноса ВИЧ в вирусологическом синапсе между дендритными клетками и Т-клетками» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (30): 13336–13341. Бибкод : 2010PNAS..10713336F . дои : 10.1073/pnas.1003040107 . ПМЦ 2922156 . ПМИД 20624966 .
- ^ Тейлор, диджей; Дурли, диджей; Шретер, Р.К. (2010). «Рецепт профиля границы притока для численного моделирования потока воздуха в носу» . Журнал интерфейса Королевского общества . 7 (44): 515–527. дои : 10.1098/rsif.2009.0306 . ПМЦ 2842801 . ПМИД 19740920 .
- ^ Лукас, Британская Колумбия; Богович, Дж. А.; Карасс, А.; Базен, Польша; Принс, Дж.Л.; Фам, ДЛ; Ландман, бакалавр (2010). «Набор инструментов Java Image Science (JIST) для быстрого прототипирования и публикации программного обеспечения для нейровизуализации» . Нейроинформатика . 8 (1): 5–17. дои : 10.1007/s12021-009-9061-2 . ПМЦ 2860951 . ПМИД 20077162 .
- ^ Дасгупта, С.; Фелеппа, Э.; Рамачандран, С.; Кеттерлинг, Дж.; Калиш, А.; Хакер, С.; Темпани, К.; Портер, К.; Лакрамп, М.; Исаксон, К. (2007). «8A-4 Пространственная совместная регистрация магнитно-резонансных и ультразвуковых изображений простаты как основа мультимодальной визуализации тканевого типа». Материалы симпозиума IEEE по ультразвуку 2007 г. стр. 641–643. дои : 10.1109/ULTSYM.2007.166 . ISBN 978-1-4244-1383-6 . S2CID 23656040 .
- ^ Оберлендер, М.; Бруно, РМ; Сакманн, Б.; Брозер, П.Дж. (2007). «Мозаичная микроскопия в проходящем свете в светлом поле для трехмерного отслеживания морфологии одиночных нейронов» . Журнал биомедицинской оптики . 12 (6): 064029. Бибкод : 2007JBO....12f4029O . дои : 10.1117/1.2815693 . ПМИД 18163845 .
- ^ Ламекер, Х.; Манси, Т.; Релан, Дж.; Биллет, Ф.; Сермесант, М.; Аяче, Н.; Делингетт., Х. (2009). «Адаптивная тетраэдральная сетка для персонализированного сердечного моделирования». CiteSeerX 10.1.1.698.4292 .
{{cite journal}}
: Для цитирования журнала требуется|journal=
( помощь ) - ^ Бореций, С.; Михаэлис, Т.; Таммер, Р.; Эшери-Падан, Р. ; Фрам, Дж.; Стойкова, А. (2009). «МРТ in vivo измененной анатомии мозга и связности волокон у взрослых мышей с дефицитом pax6» . Кора головного мозга . 19 (12): 2838–2847. дои : 10.1093/cercor/bhp057 . ПМИД 19329571 .
- ^ Коджия, С.; Като, А.; Суда, Т.; Шимануки, Дж.; Икеда, Ю. (2006). «Визуализация сетей технического углерода в эластичной матрице путем скелетонирования изображения 3D-TEM». Полимер . 47 (10): 3298–3301. doi : 10.1016/j.polymer.2006.03.008 .
- ^ Клементс, Р.Дж.; Минц, Э.М.; Бланк, Дж.Л. (2009). «Стереоскопическая объемная визуализация аргинин-вазопрессиновой системы мыши с высоким разрешением». Журнал методов нейробиологии . 187 (1): 41–45. дои : 10.1016/j.jneumeth.2009.12.011 . ПМИД 20036282 . S2CID 25746441 .
- ^ Оно, Н.; Кагеяма., А. (2009). «Визуализация области интереса с помощью системы CAVE VR с автоматическим контролем уровня детализации». Компьютерная физика. Коммуникации . 181 (4): 720–725. Бибкод : 2010CoPhC.181..720O . дои : 10.1016/j.cpc.2009.12.002 .
- ^ Дайер, Д.С. (1990). «Набор инструментов для визуализации потоков данных». IEEE Компьютерная графика и приложения . 10 (4): 60–69. дои : 10.1109/38.56300 . S2CID 14426676 .
- ^ Фулсер, Д. (1995). «IRIS Explorer: основа для расследования». ACM SIGGRAPH Компьютерная графика . 29 (2): 13–16. дои : 10.1145/204362.204365 . S2CID 16324076 .
- ^ «Проект DFG: Алгоритмы планирования и контроля лечения гипертермией» . Немецкий исследовательский фонд DFG . Проверено 28 января 2015 г.
- ^ «Проект DFG SFB 273: Гипертермия: Методика и клиника» . DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft . Проверено 28 января 2015 г.
- ^ Штраус, PS (1993). «IRIS Inventor, набор инструментов для 3D-графики» . Уведомления ACM SIGPLAN . 28 (10): 192–200. дои : 10.1145/167962.165889 .
- ^ Jump up to: а б с де Бур, бакалавр; Суфан, АТ; Хагоорт, Дж.; Мохун, Ти Джей; ван ден Хофф, MJB; Хасман, А.; Ворбраак, FPJM; Мурман, AFM; Руйтер, Дж. М. (2011). «Интерактивное представление 3D-информации, полученной из реконструированных наборов данных, и 3D-размещение отдельных гистологических срезов в формате портативного 3D-документа» . Разработка . 138 (1): 159–167. дои : 10.1242/dev.051086 . ПМК 2998169 . ПМИД 21138978 .
- ^ Шпехт, М.; Лебрен, Р.; Золликофер, CPE (2007). «Визуализация трансформации формы черепа шимпанзе и человека» (PDF) . Визуальный компьютер . 23 (9): 743–751. CiteSeerX 10.1.1.108.7163 . дои : 10.1007/s00371-007-0156-1 . S2CID 17472003 .
- ^ Jump up to: а б с Геймерс, IC; Столлен, Дж. М.; Кунне, К.; Валлнер, К.; ван Вервен, Дж.; Недервин, А.; Ламерс, WH (2011). «Липотоксичность и стеатогепатит на модели неалкогольной жировой болезни печени на перекормленных мышах» (PDF) . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1812 (4): 447–458. дои : 10.1016/j.bbadis.2011.01.003 . ПМИД 21216282 .
- ^ Jump up to: а б Кудряшев М; Цирклафф, М.; Алекс, Б.; Лемгрубер, Л.; Баумайстер, В.; Уоллич, Р.; Фришкнехт, Ф. (2011). «Доказательства прямого слияния клеток боррелий с помощью криогенной электронной томографии» . Клеточная микробиология . 13 (5): 731–741. дои : 10.1111/j.1462-5822.2011.01571.x . ПМИД 21276171 . S2CID 34114766 .
- ^ Мейслитцер-Руппич, К.; Рёрль, К.; Ранфтлер, К.; Ноймюллер, Дж.; Веттерлейн, М.; Эллингер, А.; Павелка, М. (2011). «Обогащенные церамидами отсеки транс-Гольджи реорганизуются вместе с другими частями аппарата Гольджи в ответ на истощение АТФ». Гистохимия и клеточная биология . 135 (2): 159–171. дои : 10.1007/s00418-010-0773-z . ПМИД 21225431 . S2CID 30748663 .
- ^ Беван, RLT; Сазонов И.; Саксоно, штат Пенсильвания; Нитиарасу, П.; ван Лун, Р.; Лукраз, Х.; Ашрал, С. (2011). «Моделирование кровотока для конкретного пациента через аневризматическую грудную аорту со сложенной проксимальной шейкой». Численные методы в биомедицинской инженерии . 27 (8): 1167–1184. дои : 10.1002/cnm.1425 . S2CID 119410804 .
- ^ Цзян, Ю.; Джонсон, Джорджия (2010). «Микроскопическая диффузионно-тензорная визуализация мозга мыши» . НейроИмидж . 50 (2): 465–471. doi : 10.1016/j.neuroimage.2009.12.057 . ПМК 2826147 . ПМИД 20034583 .
- ^ Буйоцек, А.; Шан, М.; Хааг, Р.; Вебер, М. (2011). «На пути к рациональному дизайну спейсера для двухвалентного ингибирования рецептора эстрогена». Журнал компьютерного молекулярного дизайна . 25 (3): 253–262. Бибкод : 2011JCAMD..25..253B . дои : 10.1007/s10822-011-9417-1 . ПМИД 21331802 . S2CID 29015240 .
- ^ Jump up to: а б Кай, В.; Ли, EY; Видж, А.; Махмуд, ЮАР; Ёсида, Х. (2011). «MDCT для компьютерной волюметрии пневмоторакса у педиатрических пациентов» . Академическая радиология . 18 (3): 315–23. дои : 10.1016/j.acra.2010.11.008 . ПМК 3072076 . ПМИД 21216160 .
- ^ Jump up to: а б Ирвинг, С.; Мур, доктор медицинских наук; Либерман, MC; Самнер, CJ (2011). «Оливокохлеарный эфферентный контроль при локализации звука и обучении, зависящем от опыта» . Журнал неврологии . 31 (7): 2493–2501. doi : 10.1523/jneurosci.2679-10.2011 . ПМЦ 3292219 . ПМИД 21325517 .
- ^ Кюбель, К.; Фойгт, А.; Шенмейкерс, Р.; Оттен, М.; Су, Д.; Ли, ТК; Карлссон, А.; Брэдли, Дж. (2005). «Последние достижения в области электронной томографии: томография TEM и HADF-STEM для материаловедения и полупроводниковых приложений». Микроск. Микроанал . 11 (5): 378–400. Бибкод : 2005MiMic..11..378K . дои : 10.1017/S1431927605050361 . ОСТИ 888597 . ПМИД 17481320 . S2CID 19979049 .
- ^ Чан, С.; Ли, П.; Локетц, Г.; Солсбери, К.; Блевинс, Нью-Хэмпшир (2016). «Высокоточная тактильная и визуальная визуализация для индивидуального моделирования операций на височной кости» . Компьютерная хирургия . 11 (1): 85–101. дои : 10.1080/24699322.2016.1189966 . ПМИД 2797394 . S2CID 4028626 .
- ^ Jump up to: а б Обенаус, А.; Хейс, П. (2011). «Дефекты просверленных отверстий: индукция, визуализация и анализ на грызунах». Терапия эмбриональными стволовыми клетками при остеодегенеративных заболеваниях . Методы молекулярной биологии. Том. 690. стр. 301–314. дои : 10.1007/978-1-60761-962-8_20 . ISBN 978-1-60761-961-1 . ПМИД 21043001 .
- ^ Эртюрк, А.; Маух, КП; Хеллал, Ф.; Фёрстнер, Ф.; Кек, Т.; Беккер, К.; Ярлинг, Н.; Стеффенс, Х.; Рихтер, М.; Хюбенер, М.; Крамер, Э.; Кирхгоф, Ф.; Додт; Брадке, Ф. (2011). «Трехмерная визуализация нерассеченного спинного мозга взрослого человека для оценки регенерации аксонов и глиальных реакций после травмы» . Природная медицина . 18 (1): 166–171. дои : 10.1038/нм.2600 . ПМИД 22198277 . S2CID 16100638 . Архивировано из оригинала 15 сентября 2020 г. Проверено 3 декабря 2019 г.
- ^ Карлсон, К.Дж.; Рэнгем, RW; Мюллер, Миннесота; Самнер, доктор медицинских наук; Морбек, Мэн; Нисида, Т.; Яманака, А.; Боеш, К. (2011). «Сравнение структурных свойств конечностей у свободно живущих шимпанзе из общин Кибале, Гомбе, Махале и Тай». Передвижение приматов . стр. 155–182. дои : 10.1007/978-1-4419-1420-0_9 . ISBN 978-1-4419-1419-4 . S2CID 12121244 .
- ^ Хартвиг, Т.; Стрейтпарт, Ф.; Гро, К.; Мюллер, М.; Перка, К.; Путциер, М.; Штрубе, П. (2011). «Цифровой трехмерный анализ паравертебральных поясничных мышц после циркулярного одноуровневого спондилодеза». Журнал заболеваний позвоночника и методов . 30 (6): Е702–Е706. дои : 10.1097/BSD.0000000000000249 . ПМИД 28632556 . S2CID 4401218 .
- ^ Ли, Дж.; Эддингтон, Дания; Надол, Дж. Б. (2011). «Гистопатология ревизионной кохлеарной имплантации» . Аудиология и нейротология . 16 (5): 336–346. дои : 10.1159/000322307 . ПМЦ 7265424 . ПМИД 21196725 .
- ^ Хан, М.; Ким, К.; Мозер, П.; Шафер, Ф.; Бадаан, С.; Вигару, Б.; Ценг, К.; Петрисор, Д.; Трок, Б.; Стоянович, Д. (2011). «Лапароскопическая радикальная простатэктомия с помощью тандемного робота для улучшения визуализации нервно-сосудистых пучков: технико-экономическое обоснование» (PDF) . Урология . 77 (2): 502–6. doi : 10.1016/j.urology.2010.06.064 . ПМК 3051397 . ПМИД 21067797 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Программное обеспечение для обработки изображений
- программное обеспечение для 3D-графики
- 3D визуализация
- Программное обеспечение для компьютерного зрения
- Компьютеры в медицинской визуализации
- Программное обеспечение для визуализации данных
- Графическое программное обеспечение
- Сегментация изображений
- Медицинское программное обеспечение
- Генераторы сетки
- Научное программное обеспечение
- Программное обеспечение, использующее Qt
- Виртуальная реальность