РоБТБ

Родственный Rho домен BTB, содержащий 2
Родственный Rho домен BTB, содержащий 2
Идентификаторы
Символ	РОБТБ2
ген NCBI	23221
HGNC	18756
МОЙ БОГ	607352
RefSeq	НМ_001160036
ЮниПрот	Q9BYZ6
Другие данные
Локус	Хр. 8 п21.2
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Родственный Rho домен BTB, содержащий 1
Родственный Rho домен BTB, содержащий 1
Идентификаторы
Символ	РОБТБ1
ген NCBI	9886
HGNC	18738
МОЙ БОГ	607351
RefSeq	НМ_014836
ЮниПрот	О94844
Другие данные
Локус	Хр. 10 q22.1
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Родственный Rho домен BTB, содержащий 3

Идентификаторы

Символ

Другие данные

Хр. 5 q15

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Семейство RhoBTB представляет собой подгруппу Rho семейства малых ГТФаз . Они представляют собой сильно отличающийся класс и все характеризуются N-концевым Rho-родственным доменом, за которым следует по крайней мере один C-концевой домен BTB .

Открытие

Семейство молекул RhoBTB было неосознанно обнаружено в 1993 году при анализе генома Dictyostelium в поисках членов суперсемейства GTPases Ras. Авторы начали с проведения Саузерн-блоттинга в поисках кДНК , которые перекрестно гибридизуются с очень консервативным зондом hRas. ^{[ 1 ]} Они идентифицировали 19 новых генов , принадлежащих к суперсемейству Ras , и секвенировали примерно 600 нуклеотидов от начала транскрипта. ^{[ 1 ]} Если бы они искали нормальную Ras-подобную ГТФазу, этого было бы достаточно. Один из их клонов, названный ими RacA, отличался сильнее, чем большинство остальных, и его транскрипт не оканчивался стоп-кодоном, как остальные. ^{[ 1 ]} Авторы, однако, не прокомментировали это, и RhoBTB оставался незамеченным еще восемь лет.

Последовал очень тщательный анализ, проведенный Франсиско Риверо и его коллегами, в ходе которого были обнаружены все Rho GTPases в Dictyostelium. В ходе своей работы они обнаружили, что открытая рамка считывания RacA на самом деле на 400 аминокислот длиннее, чем то, что опубликовал Буш 8 лет назад. ^{[ 2 ]} Вместо белка из 168 аминокислот RacA кодировал белок из 598 остатков с доменом Rho GTPase на N-конце и двумя доменами BTB по направлению к C-концу. Известно, что домены BTB (Broad-Complex, Tramtrack и Bric-a-Brac) включают гетеро- и гомоассоциации с другими белками, содержащими домен BTB. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Поскольку этот новый белок RhoBTB находился в Dictostelium, авторам было любопытно, существуют ли какие-либо гомологичные белки у людей. Они нашли три и назвали их RhoBTB1 , RhoBTB2 и RhoBTB3 . ^{[ 2 ]}

Локализация и выражение

RhoBTB1 и RhoBTB2 гораздо более гомологичны, чем RhoBTB3. ^{[ 2 ]} Дальнейший анализ показал, что интрон-экзонная структура RhoBTB1 и 2 также весьма схожа и имеет только один общий интрон с RhoBTB3. ^{[ 5 ]}

RhoBTB1 и 2 не были обнаружены во время развития мышей, но RhoBTB3 четко выявлялся между 11,5 и 17,5 днями эмбрионального развития. ^{[ 5 ]} Кроме того, RhoBTB1 и 2 локализуются в везикулярных структурах, ^{[ 6 ]} в то время как RhoBTB3 локализован в сети транс-Гольджи. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Буш Дж., Франек К., Карделли Дж. (декабрь 1993 г.). «Клонирование и характеристика семи новых генов, связанных с rac Dictyostelium discoideum, принадлежащих к семейству GTPases rho». Джин . 136 (1–2): 61–8. дои : 10.1016/0378-1119(93)90448-C . ПМИД 8294042 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Риверо Ф., Дислич Х., Глекнер Г., Ногель А.А. (март 2001 г.). «Семейство Rho-родственных белков Dictyostelium discoideum» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (5): 1068–79. дои : 10.1093/нар/29.5.1068 . ПМК 29714 . ПМИД 11222756 .
^ Золлман С., Годт Д., Приве Г.Г., Кудерк Дж.Л., Ласки Ф.А. (октябрь 1994 г.). «Домен BTB, обнаруженный в основном в белках цинковых пальцев, определяет эволюционно консервативное семейство, которое включает в себя несколько генов, регулируемых развитием у дрозофилы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (22): 10717–21. Бибкод : 1994PNAS...9110717Z . дои : 10.1073/pnas.91.22.10717 . ПМК 45093 . ПМИД 7938017 .
^ Ахмад К.Ф., Энгель К.К., Приве Г.Г. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура домена BTB из PLZF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (21): 12123–8. Бибкод : 1998PNAS...9512123A . дои : 10.1073/pnas.95.21.12123 . ПМК 22795 . ПМИД 9770450 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Рамос С., Хадеми Ф., Сомеш Б.П., Риверо Ф. (октябрь 2002 г.). «Геномная организация и профиль экспрессии малых ГТФаз семейства RhoBTB у человека и мыши». Джин . 298 (2): 147–57. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00980-0 . ПМИД 12426103 .
^ Аспенстрем П., Франссон А., Сарас Дж. (январь 2004 г.). «Rho GTPases оказывают разнообразное влияние на организацию системы актиновых филаментов» . Биохим. Дж . 377 (Часть 2): 327–37. дои : 10.1042/BJ20031041 . ПМЦ 1223866 . ПМИД 14521508 .
^ Эспиноза Э.Дж., Калеро М., Шридеви К., Пфеффер С.Р. (май 2009 г.). «RhoBTB3: АТФаза семейства Rho GTPase, необходимая для транспорта эндосомы в аппарат Гольджи» . Клетка . 137 (5): 938–48. дои : 10.1016/j.cell.2009.03.043 . ПМК 2801561 . ПМИД 19490898 .

[Bush_1993-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с Буш Дж., Франек К., Карделли Дж. (декабрь 1993 г.). «Клонирование и характеристика семи новых генов, связанных с rac Dictyostelium discoideum, принадлежащих к семейству GTPases rho». Джин . 136 (1–2): 61–8. дои : 10.1016/0378-1119(93)90448-C . ПМИД 8294042 .

[Rivero_2001-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с Риверо Ф., Дислич Х., Глекнер Г., Ногель А.А. (март 2001 г.). «Семейство Rho-родственных белков Dictyostelium discoideum» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (5): 1068–79. дои : 10.1093/нар/29.5.1068 . ПМК 29714 . ПМИД 11222756 .

[Zollman_1994-3] Золлман С., Годт Д., Приве Г.Г., Кудерк Дж.Л., Ласки Ф.А. (октябрь 1994 г.). «Домен BTB, обнаруженный в основном в белках цинковых пальцев, определяет эволюционно консервативное семейство, которое включает в себя несколько генов, регулируемых развитием у дрозофилы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (22): 10717–21. Бибкод : 1994PNAS...9110717Z . дои : 10.1073/pnas.91.22.10717 . ПМК 45093 . ПМИД 7938017 .

[Ahmad_1998-4] Ахмад К.Ф., Энгель К.К., Приве Г.Г. (октябрь 1998 г.). «Кристаллическая структура домена BTB из PLZF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (21): 12123–8. Бибкод : 1998PNAS...9512123A . дои : 10.1073/pnas.95.21.12123 . ПМК 22795 . ПМИД 9770450 .

[Ramos_2002-5] Перейти обратно: ^а ^б Рамос С., Хадеми Ф., Сомеш Б.П., Риверо Ф. (октябрь 2002 г.). «Геномная организация и профиль экспрессии малых ГТФаз семейства RhoBTB у человека и мыши». Джин . 298 (2): 147–57. дои : 10.1016/S0378-1119(02)00980-0 . ПМИД 12426103 .

[Aspenstrom_2004-6] Аспенстрем П., Франссон А., Сарас Дж. (январь 2004 г.). «Rho GTPases оказывают разнообразное влияние на организацию системы актиновых филаментов» . Биохим. Дж . 377 (Часть 2): 327–37. дои : 10.1042/BJ20031041 . ПМЦ 1223866 . ПМИД 14521508 .

[Espinosa_2009-7] Эспиноза Э.Дж., Калеро М., Шридеви К., Пфеффер С.Р. (май 2009 г.). «RhoBTB3: АТФаза семейства Rho GTPase, необходимая для транспорта эндосомы в аппарат Гольджи» . Клетка . 137 (5): 938–48. дои : 10.1016/j.cell.2009.03.043 . ПМК 2801561 . ПМИД 19490898 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]