SR1 РНК

В молекулярной биологии РНК SR1 представляет собой малую РНК (мРНК), продуцируемую видами Bacillus и близкородственными бактериями . ^{[ 1 ]} Это РНК с двойной функцией , которая действует как РНК, кодирующая белок , и как регуляторная мРНК.

РНК SR1 участвует в регуляции аргинина катаболизма . РНК SR1 связывается с комплементарными участками мРНК ahrC (также известными как argR) и ингибирует трансляцию . ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} AhrC эндодирует белок -репрессор аргинина аргинина биосинтеза , который подавляет синтез ферментов и активирует катаболические rocABC и rocDEF ферменты аргинина посредством регуляции оперонов . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Помимо того, что SR1 действует как мРНК, он также кодирует небольшой пептид SR1P. SR1P связывается с глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназой (GapA) и стабилизирует мРНК оперона GapA. ^{[ 7 ]}

Экспрессия SR1 регулируется CcpA и CcpN. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

См. также

Бактериальная малая РНК

Ссылки

^ Гимпель М., Прейс Х., Барт Э., Грамцов Л., Брантл С. (13 октября 2012 г.). «SR1 — небольшая РНК с двумя удивительно консервативными функциями» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (22): 11659–11672. дои : 10.1093/nar/gks895 . ПМЦ 3526287 . ПМИД 23034808 .
^ Гейдрих Н., Молл И., Брантл С. (2007). «Анализ in vitro взаимодействия между малой РНК SR1 и мРНК ее основной мишени ahrC» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (13): 4331–4346. дои : 10.1093/нар/gkm439 . ЧВК 1935000 . ПМИД 17576690 .
^ Гейдрих Н., Чинали А., Герт У., Брантл С. (октябрь 2006 г.). «Маленькая нетранслируемая РНК SR1 из генома Bacillus subtilis участвует в регуляции катаболизма аргинина» . Молекулярная микробиология . 62 (2): 520–536. дои : 10.1111/j.1365-2958.2006.05384.x . ПМИД 17020585 .
^ Норт А.К., Смит М.К., Баумберг С. (1 августа 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность регуляторного гена аргинина Bacillus subtilis и гомология его продукта с репрессором аргинина Escherichia coli». Джин . 80 (1): 29–38. дои : 10.1016/0378-1119(89)90247-3 . ПМИД 2507400 .
^ Чаплевски Л.Г., Норт А.К., Смит М.К., Баумберг С., Стокли П.Г. (январь 1992 г.). «Очистка и первоначальная характеристика AhrC: регулятора генов метаболизма аргинина в Bacillus subtilis». Мол. Микробиол . 6 (2): 267–275. дои : 10.1111/j.1365-2958.1992.tb02008.x . ПМИД 1312212 . S2CID 3219261 .
^ Деннис К.А., Гликос Н.М., Парсонс М.Р., Филлипс С.Е. (март 2002 г.). «Структура AhrC, белка-репрессора/активатора аргинина из Bacillus subtilis». Acta Crystallographica Раздел D. 58 (Часть 3): 421–430. дои : 10.1107/s0907444901021692 . ПМИД 11856827 .
^ Гимпель М., Хайдрих Н., Мэдер У., Крюгель Х., Брантл С. (май 2010 г.). «МРНК с двойной функцией из B. subtilis: SR1 действует как пептид, кодирующий мРНК оперона GapA» (PDF) . Молекулярная микробиология . 76 (4): 990–1009. дои : 10.1111/j.1365-2958.2010.07158.x . ПМИД 20444087 .
^ Лихт А., Прейс С., Брантл С. (октябрь 2005 г.). «Роль CcpN в регуляции новой нетранслируемой РНК (SR1) у Bacillus subtilis». Молекулярная микробиология . 58 (1): 189–206. дои : 10.1111/j.1365-2958.2005.04810.x . ПМИД 16164558 . S2CID 29961832 .
^ Лихт А., Брантл С. (октябрь 2009 г.). «Репрессор транскрипции CcpN из Bacillus subtilis использует разные механизмы репрессии на разных промоторах» . Журнал биологической химии . 284 (44): 30032–30038. дои : 10.1074/jbc.M109.033076 . ПМЦ 2781557 . ПМИД 19726675 .

Эта по молекулярной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Гимпель М., Прейс Х., Барт Э., Грамцов Л., Брантл С. (13 октября 2012 г.). «SR1 — небольшая РНК с двумя удивительно консервативными функциями» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (22): 11659–11672. дои : 10.1093/nar/gks895 . ПМЦ 3526287 . ПМИД 23034808 .

[2] Гейдрих Н., Молл И., Брантл С. (2007). «Анализ in vitro взаимодействия между малой РНК SR1 и мРНК ее основной мишени ahrC» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (13): 4331–4346. дои : 10.1093/нар/gkm439 . ЧВК 1935000 . ПМИД 17576690 .

[3] Гейдрих Н., Чинали А., Герт У., Брантл С. (октябрь 2006 г.). «Маленькая нетранслируемая РНК SR1 из генома Bacillus subtilis участвует в регуляции катаболизма аргинина» . Молекулярная микробиология . 62 (2): 520–536. дои : 10.1111/j.1365-2958.2006.05384.x . ПМИД 17020585 .

[4] Норт А.К., Смит М.К., Баумберг С. (1 августа 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность регуляторного гена аргинина Bacillus subtilis и гомология его продукта с репрессором аргинина Escherichia coli». Джин . 80 (1): 29–38. дои : 10.1016/0378-1119(89)90247-3 . ПМИД 2507400 .

[5] Чаплевски Л.Г., Норт А.К., Смит М.К., Баумберг С., Стокли П.Г. (январь 1992 г.). «Очистка и первоначальная характеристика AhrC: регулятора генов метаболизма аргинина в Bacillus subtilis». Мол. Микробиол . 6 (2): 267–275. дои : 10.1111/j.1365-2958.1992.tb02008.x . ПМИД 1312212 . S2CID 3219261 .

[6] Деннис К.А., Гликос Н.М., Парсонс М.Р., Филлипс С.Е. (март 2002 г.). «Структура AhrC, белка-репрессора/активатора аргинина из Bacillus subtilis». Acta Crystallographica Раздел D. 58 (Часть 3): 421–430. дои : 10.1107/s0907444901021692 . ПМИД 11856827 .

[7] Гимпель М., Хайдрих Н., Мэдер У., Крюгель Х., Брантл С. (май 2010 г.). «МРНК с двойной функцией из B. subtilis: SR1 действует как пептид, кодирующий мРНК оперона GapA» (PDF) . Молекулярная микробиология . 76 (4): 990–1009. дои : 10.1111/j.1365-2958.2010.07158.x . ПМИД 20444087 .

[8] Лихт А., Прейс С., Брантл С. (октябрь 2005 г.). «Роль CcpN в регуляции новой нетранслируемой РНК (SR1) у Bacillus subtilis». Молекулярная микробиология . 58 (1): 189–206. дои : 10.1111/j.1365-2958.2005.04810.x . ПМИД 16164558 . S2CID 29961832 .

[9] Лихт А., Брантл С. (октябрь 2009 г.). «Репрессор транскрипции CcpN из Bacillus subtilis использует разные механизмы репрессии на разных промоторах» . Журнал биологической химии . 284 (44): 30032–30038. дои : 10.1074/jbc.M109.033076 . ПМЦ 2781557 . ПМИД 19726675 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]