Р. Шанкарарамакришнан

Р. Шанкарарамакришнан
Р. Шанкарарамакришнан
Рожденный	Мелмангалам, Тени, Тамил Наду, Индия
Национальность	Индийский
Альма-матер	Университет Мадурая Камараджа ; Индийский институт науки ; Оксфордский университет ; Университет Иллинойса, Урбана-Шампейн ;
Известный	Компьютерные исследования мембранных белков функции
Награды	2008 г. Премия N-BIOS ;
	Научная карьера
Поля	Вычислительная биология ;
Учреждения	Медицинская школа Икана на горе Синай ; ИИТ Канпур ;

Рамасуббу Шанкарарамакришнан — индийский компьютерный биолог, биоинформатик и профессор кафедры биологических наук и биоинженерии Индийского технологического института в Канпуре . Он известен своими вычислительными исследованиями функции мембранных белков . Департамент биотехнологии правительства Индии наградил его Национальной премией в области бионаук за развитие карьеры , одной из самых высоких научных наград Индии, за вклад в биологические науки в 2008 году.

Биография

Р. Шанкарарамакришнан, который закончил свое начальное образование в Университете Мадурай Камарадж в 1986 году, получил докторантуру в Индийском институте науки , а после получения степени доктора философии в 1992 году он переехал в Великобританию, где провел постдокторскую исследовательскую работу в области вычислительной биологии в Оксфордском университете . ^[1] Он еще раз работал после получения докторской степени в Университете Иллинойса, Урбана-Шампейн, и начал свою карьеру в 1996 году в качестве инструктора (позже доцента по исследованиям) в Медицинской школе Икан на горе Синай . В апреле 2002 года он вернулся в Индию, чтобы поступить в Индийский технологический институт Канпура (IITK) в качестве доцента и работать профессором на кафедре биологических наук и биоинженерии (BSBE). ^[2] Впоследствии он основал Лабораторию биоинформатики и биомолекулярного моделирования в ИИТК, где принимает нескольких ученых-исследователей. ^[3] Он также является консультантом Центра математической биологии Департамента науки и технологий . ^[4]

Наследие

Исследования Шанкарамакришнана сосредоточены на механизме функционирования мембранных белков с использованием вычислительных подходов . ^[2] Известно, что он проводил исследования генов аквапоринов в растениях, поворотов Asx , молекулярно-динамического моделирования белок-белковых взаимодействий GPCR, , пептидных гормонов а также стартовых кодонов, отличных от AUG, и кодонов AUG . ^[5] Его исследования были задокументированы в ряде статей. ^[6]^{[примечание 1]} и ResearchGate , онлайн-хранилище научных статей, перечислило 98 из них. ^[7] Кроме того, он также написал главы в книгах, изданных другими. ^[8] и его статьи вызвали множество цитирований. ^[9]^[10]^[11] Он является соавтором MIPModDB , базы данных структурных моделей основных внутренних белков . ^[12] Он также выступал с приглашенными или программными речами на различных национальных и международных семинарах. ^[13]^[14]^[15]

Шанкарарамакришнан является членом Национальной сети математической и вычислительной биологии. ^[16] агентство, финансируемое Советом по науке и инженерным исследованиям при правительстве Индии, для содействия научным исследованиям и повышению квалификации в этой дисциплине. ^[17] Он также является пожизненным членом Национальной академии наук Индии , одной из трех крупнейших индийских академий наук. ^[18]

Награды и почести

Департамент биотехнологии правительства Индии наградил его Национальной премией в области бионаук за развитие карьеры , одной из самых высоких научных наград Индии в 2008 году. ^[19] Он также занимал должность профессора кафедры Джой Гилл для молодых преподавателей и должность профессора кафедры USV Индийского технологического института в Канпуре в 2007–2010 и 2011–2014 годах соответственно. ^[2]

Избранная библиография

Главы

Международное биометрическое общество. Индийский регион. Конференция; Р. Шанкарарамакришнан (автор главы) (2006). «Поиск закономерностей в последовательностях белков и ДНК» . Статистические достижения в области биологических наук и биоинформатики . Союзные издательства. стр. 106–. ISBN 978-81-7764-968-0 . {{cite book}}: |author2= имеет общее имя ( справка )

Статьи

Айер, Абхишек Харихаран; Кришна Дипак, Рама Нагеш Венката; Шанкарарамакришнан, Рамасуббу (27 декабря 2017 г.). «Имидазольные азоты двух остатков гистидина, участвующих в водородных связях NH…N в белковых структурах: подход структурной биоинформатики в сочетании с квантово-химическими расчетами». Журнал физической химии Б. 122 (3): 1205–1212. дои : 10.1021/acs.jpcb.7b11737 . ISSN 1520-6106 . ПМИД 29278913 .
Кришна Дипак, RNV; Чандракар, Бриджеш; Шанкарарамакришнан, Рамасуббу (2017). «Сравнение силы связывания металлов между остатками метионина и цистеина: значение для создания мотивов связывания металлов в белках». Биофизическая химия . 224 : 32–39. дои : 10.1016/j.bpc.2017.02.007 . ПМИД 28363089 .
Кришна Дипак, RNV; Шанкарарамакришнан, Рамасуббу (12 июля 2016 г.). «Водородные связи N – H···N с участием атомов азота гистидина имидазола: новая структурная роль остатков гистидина в белках» . Биохимия . 55 (27): 3774–3783. doi : 10.1021/acs.biochem.6b00253 . ISSN 0006-2960 . ПМИД 27305350 .

См. также

Примечания

^ См «Избранная библиография». . раздел

Ссылки

^ «Факультет БГБЭ – Р.Санкарарамакришнан» . ИИТ Канпур . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Вишвас (11 января 2018 г.). «Профессор кафедры биологических наук и биоинженерии (BSBE)» . www.iitk.ac.in. Проверено 11 января 2018 г.
^ «Лаборатория биоинформатики и биомолекулярного моделирования» . home.iitk.ac.in. 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.
^ «Ресурсы — MathBio — Центр математической биологии DST» . www.math.iisc.ac.in. 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.
^ «Текущие исследования BSBE» (PDF) . ИИТ Канпур . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.
^ «В Академии Google» . Google Академик. 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.
^ «На ResearchGate» . 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.
^ Международное биометрическое общество. Индийский регион. Конференция; Р. Шанкарарамакришнан (автор главы) (2006). «Поиск закономерностей в последовательностях белков и ДНК» . Статистические достижения в области биологических наук и биоинформатики . Союзные издательства. стр. 106–. ISBN 978-81-7764-968-0 . {{cite book}}: |author2= имеет общее имя ( справка )
^ Клаудио Тониоло; Ганс Брюкнер (26 мая 2009 г.). Пептаибиотики . Джон Уайли и сыновья. стр. 53–. ISBN 978-3-906390-52-9 .
^ Джакомо Мессина; Саверия Сантанджело (2002). GNSR 2001: Современное состояние и будущее развитие рамановской спектроскопии и связанных с ней методов . ИОС Пресс. стр. 216–. ISBN 978-1-58603-262-3 .
^ Манджу Бансал; Н. Шринивасан (2013). Биомолекулярные формы и функции: празднование 50-летия карты Рамачандрана . Всемирная научная. стр. 480–. ISBN 978-981-4449-14-4 .
^ Гупта, Анджали Бансал; Верма, Рави Кумар; Агарвал, Ватсал; Ваджпаи, Ману; Бансал, Вивек; Шанкарарамакришнан, Рамасуббу (1 января 2012 г.). «MIPModDB: центральный ресурс для суперсемейства основных внутренних белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Д1): Д362–Д369. CiteSeerX 10.1.1.1033.8361 . дои : 10.1093/nar/gkr914 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 3245135 . ПМИД 22080560 .
^ «Пленарные и приглашенные докладчики - ICMSEE 2018» . www.icmsee.in . Проверено 9 января 2018 г.
^ «Кислородно-ароматические контакты в биомолекулах: новая нековалентная интеграция» . IICT, Хайдарабад . 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.
^ «Спикеры Международной конференции по биоинформатике и системной биологии-2018» . wbsb.iiita.ac.in . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.
^ «Р. Шанкарарамакришнан - Национальная сеть математической и вычислительной биологии» . www.iiserpune.ac.in . 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.
^ «Национальная сеть математической и вычислительной биологии» . www.iiserpune.ac.in . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.
^ «Национальная академия наук Индии — пожизненные члены» . www.nasi.org.in. Проверено 11 января 2018 г.
^ «Лауреаты Национальной премии в области биологических наук за развитие карьеры» (PDF) . Кафедра биотехнологии. 2016. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2018 года . Проверено 20 ноября 2017 г.

Дальнейшее чтение

«Институт биоинформатики» . www.bii.a-star.edu.sg . Проверено 9 января 2018 г.
«Применение молекулярного моделирования в биологии. Структура биомолекул: обзор» (видео на YouTube) . Показ слайдов. 27 декабря 2017 года . Проверено 11 января 2018 г.

Внешние ссылки

Рудольф Вернер (1998). Gap Junctions: Материалы 8-й Международной конференции Gap Junctions, Ки Ларго, Флорида . ИОС Пресс. стр. 71–. ISBN 978-90-5199-374-5 .
Рецепторная молекулярная биология . Эльзевир. 22 марта 1995 г., стр. 427–. ISBN 978-0-08-053644-6 .

[7] См «Избранная библиография». . раздел

[BSBE_Faculty_-_R.Sankararamakrishnan-1] «Факультет БГБЭ – Р.Санкарарамакришнан» . ИИТ Канпур . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.

[Professor,_Department_of_Biological_Sciences_&_Bioengineering_(BSBE)-2] Jump up to: ^а ^б ^с Вишвас (11 января 2018 г.). «Профессор кафедры биологических наук и биоинженерии (BSBE)» . www.iitk.ac.in. Проверено 11 января 2018 г.

[Bioinformatics_and_Biomolecular_Simulation_Laboratory-3] «Лаборатория биоинформатики и биомолекулярного моделирования» . home.iitk.ac.in. 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.

[Resource_Persons_-_MathBio_-_DST_Centre_for_Mathematical_Biology-4] «Ресурсы — MathBio — Центр математической биологии DST» . www.math.iisc.ac.in. 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.

[Current_Research_at_BSBE-5] «Текущие исследования BSBE» (PDF) . ИИТ Канпур . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.

[On_Google_Scholar-6] «В Академии Google» . Google Академик. 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.

[On_ResearchGate-8] «На ResearchGate» . 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.

[Conference2006-9] Международное биометрическое общество. Индийский регион. Конференция; Р. Шанкарарамакришнан (автор главы) (2006). «Поиск закономерностей в последовательностях белков и ДНК» . Статистические достижения в области биологических наук и биоинформатики . Союзные издательства. стр. 106–. ISBN 978-81-7764-968-0 . {{cite book}}: |author2= имеет общее имя ( справка )

[TonioloBrückner2009-10] Клаудио Тониоло; Ганс Брюкнер (26 мая 2009 г.). Пептаибиотики . Джон Уайли и сыновья. стр. 53–. ISBN 978-3-906390-52-9 .

[MessinaSantangelo2002-11] Джакомо Мессина; Саверия Сантанджело (2002). GNSR 2001: Современное состояние и будущее развитие рамановской спектроскопии и связанных с ней методов . ИОС Пресс. стр. 216–. ISBN 978-1-58603-262-3 .

[BansalSrinivasan2013-12] Манджу Бансал; Н. Шринивасан (2013). Биомолекулярные формы и функции: празднование 50-летия карты Рамачандрана . Всемирная научная. стр. 480–. ISBN 978-981-4449-14-4 .

[13] Гупта, Анджали Бансал; Верма, Рави Кумар; Агарвал, Ватсал; Ваджпаи, Ману; Бансал, Вивек; Шанкарарамакришнан, Рамасуббу (1 января 2012 г.). «MIPModDB: центральный ресурс для суперсемейства основных внутренних белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (Д1): Д362–Д369. CiteSeerX 10.1.1.1033.8361 . дои : 10.1093/nar/gkr914 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 3245135 . ПМИД 22080560 .

[Plenary_&_Invited_Speakers_-_ICMSEE_2018-14] «Пленарные и приглашенные докладчики - ICMSEE 2018» . www.icmsee.in . Проверено 9 января 2018 г.

[Oxygen_-_aromatic_contacts_in_biomolecules:_a_novel_non-covalent_integration-15] «Кислородно-ароматические контакты в биомолекулах: новая нековалентная интеграция» . IICT, Хайдарабад . 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.

[Speakers_i_International_Conference_on_Bioinformatics_and_Systems_Biology_-2018-16] «Спикеры Международной конференции по биоинформатике и системной биологии-2018» . wbsb.iiita.ac.in . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.

[R._Sankararamakrishnan_-_National_Network_for_Mathematical_and_Computational_Biology-17] «Р. Шанкарарамакришнан - Национальная сеть математической и вычислительной биологии» . www.iiserpune.ac.in . 9 января 2018 года . Проверено 9 января 2018 г.

[National_Network_for_Mathematical_and_Computational_Biology-18] «Национальная сеть математической и вычислительной биологии» . www.iiserpune.ac.in . 11 января 2018 года . Проверено 11 января 2018 г.

[The_National_Academy_of_Sciences,_India_-_Life_Members-19] «Национальная академия наук Индии — пожизненные члены» . www.nasi.org.in. Проверено 11 января 2018 г.

[Awardees_of_National_Bioscience_Awards_for_Career_Development-20] «Лауреаты Национальной премии в области биологических наук за развитие карьеры» (PDF) . Кафедра биотехнологии. 2016. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2018 года . Проверено 20 ноября 2017 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[примечание 1]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

v т и N-BIOS 1999–2009 гг. Лауреаты
1999	Умеш Варшней Канури Венката Субба Рао Динакар Машну Салунке Бирендра Нат Маллик Ахилеш Кумар Тьяги
2000	П. Пардха Сарадхи П. Ананда Кумар КП Моханакумар Мадху Дикшит Ананд Кумар Баххават Амитабха Мукхопадхьяй
2001	Нагендра Кумар Сингх Рам Раджасекхаран Рам Раджасекхаран Прадип К. Чакраборти Ахил Чандра Банерджиа Винод Бхакуни
2002	М. Радхакришна Пиллаи Мохаммад Ислам Хан Ракеш Кумар Джайн Анил Гровер Сантану Бхаттачарья Джойоти Басу Ракеш Аггарвал
2003	Уша Виджаярагаван Трилочан Мохапатра Судханшу Врати Сония Нитьянанда Рамеш Венката Сон Гопал Кунду Чинмой Санкар Дей
2004	Джьоти Пракаш Таманг Банвари Лал К.Секар Нараянасвами Шринивасан Тапас Кумар Кунду Амита Аггарвал Гита Кашьяп Вемуганти
2005	Раджендра Прасад Рой Судип Чаттопадхьяй Гаджендра Пал Сингх Рагхава Апурва Сарин Дулал Панда Саумитра Дас
2006	Дж. Прадип Кумар Аджай Кумар Парида Прамод П. Вангикар Дж. Тару Шарма Джавед Н. Агревала Кумаравел Сомасундарам Санджив Галанде
2007	Т. Р. Шарма Снехасикта Сварнакар Шринивасан Рамачандран Р. Соудхамини Ранджан Сен Овайс Мохаммад Г. Дхинакар Радж Бхаскар Саха Амит Пракаш Шарма
2008	Раджан Шанкаранараянан Тату Утпал Шашикант Нихар Ранджан Джана Р. Шанкарарамакришнан Анураджан Ананд Самит Кумар Нанди С. Ганеш Нагасума Чандра Сангита Мукхопадхьяй Пушкар Шарма
2009	Раджеш Судхир Гокхале Мохан Р. Вани Гарикапати Нарахари Шастри Ашок М. Райчур Баладжи Пракаш К. Нараянасвами Баладжи Дебасиса Моханти Сунил Кумар Манна К.Кешавадас

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ
академики	ДБЛП ОРЦИД
Другой	ИдРеф