Домен холодного шока
| ЦДЦД | |||
|---|---|---|---|
 Структура раствора одноцепочечного ДНК-связывающего домена холодового шока (csd) человеческого белка 1 y-box (yb1), определенная методом ЯМР (10 структур с самой низкой энергией) | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ЦДЦД | ||
| Пфам | PF00313 | ||
| Пфам Клан | CL0021 | ||
| ИнтерПро | ИПР002059 | ||
| PROSITE | PDOC00304 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1mjc / SCOPe / СУПФАМ | ||
| CDD | cd04458 | ||
| |||
В молекулярной биологии домен холодового шока ( CSD ) представляет собой белковый домен , состоящий примерно из 70 аминокислот , который был обнаружен в прокариотических и эукариотических ДНК -связывающих белках . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Часть этого домена очень похожа на РНК связывания мотив RNP-1 . [ 4 ]
При Escherichia coli воздействии на понижения температуры от 37 до 10 градусов Цельсия наступает 4–5-часовая лаг-фаза, после чего рост возобновляется с пониженной скоростью . [ 5 ] Во время лаг-фазы экспрессия около 13 белков, содержащих домены холодового шока, увеличивается в 2–10 раз. [ 6 ] Считается, что эти так называемые белки холодового шока, индуцируемые в ответ на холодовой шок, помогают клетке выживать при температурах ниже оптимальной температуры роста, в отличие от белков теплового шока, индуцируемых в ответ на тепловой шок , которые помогают клетке выживать при температурах. больше оптимального, возможно, за счет конденсации хромосомы и организации прокариотического нуклеоида . [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Донигер Дж., Ландсман Д., Гонда М.А., Вистоу Дж. (апрель 1992 г.). «Продукт unr, высококонсервативного гена, расположенного выше N-ras, содержит множественные повторы, подобные домену холодного шока (CSD), предполагаемому ДНК-связывающему мотиву». Новая Биол . 4 (4): 389–95. ПМИД 1622933 .
- ^ Вистов Дж. (апрель 1990 г.). «Холодовой шок и связывание ДНК» . Природа . 344 (6269): 823–4. дои : 10.1038/344823c0 . ПМИД 2184368 . S2CID 4307500 .
- ^ Джонс П.Г., Иноуе М. (март 1994 г.). «Реакция холодного шока — горячая тема». Мол. Микробиол . 11 (5): 811–8. дои : 10.1111/j.1365-2958.1994.tb00359.x . ПМИД 8022259 .
- ^ Ландсман Д. (июнь 1992 г.). «RNP-1, РНК-связывающий мотив, консервативен в ДНК-связывающем домене холодового шока» . Нуклеиновые кислоты Рез . 20 (11): 2861–4. дои : 10.1093/нар/20.11.2861 . ПМЦ 336933 . ПМИД 1614871 .
- ^ Jump up to: а б Обоката Дж., Оме М., Хаяшида Н. (октябрь 1991 г.). «Нуклеотидная последовательность клона кДНК, кодирующего предполагаемый богатый глицином белок массой 19,7 кДа в Nicotiana sylvestris». Завод Мол. Биол . 17 (4): 953–5. дои : 10.1007/bf00037080 . ПМИД 1912512 . S2CID 11927654 .
- ^ Тафури С.Р., Вольф А.П. (ноябрь 1990 г.). «Факторы транскрипции Y-box Xenopus: молекулярное клонирование, функциональный анализ и регуляция развития» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (22): 9028–32. дои : 10.1073/pnas.87.22.9028 . ПМЦ 55094 . ПМИД 2247479 .