Домен вилочной головки

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1d5v, 1e17, 1jxs, 1kq8, 2a3s, 2c6y, 2d2w, 2hdc, 2hfh

Домен вилочной головки
Домен вилочной головки
	Структура белка крылатой спирали Генезис.
Идентификаторы
Символ	Fork_head
Пфам	PF00250
ИнтерПро	ИПР001766
УМНЫЙ	SM00339
PROSITE	PDOC00564
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	2чч / СКОПе / СУПФАМ
CDD	cd00059
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1d5v, 1e17, 1jxs, 1kq8, 2a3s, 2c6y, 2d2w, 2hdc, 2hfh

Домен вилочной головки — это тип белкового домена , который часто встречается в факторах транскрипции и целью которого является связывание ДНК . ^{[ 2 ]}

Функция

Белок вилочной головки Drosophila melanogaster , фактор транскрипции, который способствует терминальному, а не сегментарному развитию, не содержит ни гомеодоменов , ни цинковых пальцев, характерных для других факторов транскрипции. ^{[ 3 ]} Вместо этого он содержит особый тип ДНК-связывающей области , содержащий около 100 аминокислот, который с тех пор был идентифицирован в ряде факторов транскрипции (включая D. melanogaster FD1-5, HNF3 человека млекопитающих, HTLF , Saccharomyces cerevisiae HCM1 и т. д.). .). Это называется областью головки вилки, но также известно как « крылатая спираль ». ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Домен вилочной головки связывает B-ДНК как мономер, ^{[ 4 ]} но не обнаруживает сходства с ранее идентифицированными ДНК-связывающими мотивами . Хотя этот домен обнаружен в нескольких различных факторах транскрипции, общей функцией является их участие в ранних онтогенетических решениях о судьбах клеток во время эмбриогенеза . ^{[ 5 ]} Члены класса O транскрипционных факторов forkhead box (FoxO) играют важную роль в метаболизме, клеточной пролиферации, стрессоустойчивости и, возможно, продолжительности жизни. ^{[ 6 ]}

См. также

FOX-белки

Ссылки

^ Марсден I, Цзинь С., Ляо X (май 1998 г.). «Структурные изменения в области, непосредственно прилегающей к ДНК-связывающей спирали, подчеркивают возможный механизм, объясняющий наблюдаемые изменения в специфичном для последовательности связывании белков крылатой спирали». Дж. Мол. Биол . 278 (2): 293–9. дои : 10.1006/jmbi.1998.1703 . ПМИД 9571051 .
^ Кауфманн Э., Кнехель В. (июнь 1996 г.). «Пять лет на крыльях вилочной головы» . Мех. Дев . 57 (1): 3–20. дои : 10.1016/0925-4773(96)00539-4 . ПМИД 8817449 . S2CID 18056224 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Вайгель Д., Юргенс Г., Кюттнер Ф., Зайферт Э., Джекле Х. (май 1989 г.). «Гомеозисная генная вилка кодирует ядерный белок и экспрессируется в терминальных областях эмбриона дрозофилы» . Клетка . 57 (4): 645–58. дои : 10.1016/0092-8674(89)90133-5 . ПМИД 2566386 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Кларк К.Л., Халай Э.Д., Лай Э., Берли С.К. (июль 1993 г.). «Сокристаллическая структура мотива распознавания ДНК HNF-3/головки вилки напоминает гистон H5». Природа . 364 (6436): 412–20. дои : 10.1038/364412a0 . ПМИД 8332212 . S2CID 4363526 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Хакер У., Гроссниклаус У., Геринг В.Дж., Джекль Х. (сентябрь 1992 г.). «Семейство генов дрозофилы, регулируемое развитием, кодирующее домен головки вилки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (18): 8754–8. дои : 10.1073/pnas.89.18.8754 . ПМК 49999 . ПМИД 1356269 .
^ ван дер Хорст А., Бургеринг Б.М. (июнь 2007 г.). «Подчеркивая роль белков FoxO в продолжительности жизни и заболеваниях». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 8 (6): 440–50. дои : 10.1038/nrm2190 . ПМИД 17522590 . S2CID 31546098 .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001766.

[pmid9571051-1] Марсден I, Цзинь С., Ляо X (май 1998 г.). «Структурные изменения в области, непосредственно прилегающей к ДНК-связывающей спирали, подчеркивают возможный механизм, объясняющий наблюдаемые изменения в специфичном для последовательности связывании белков крылатой спирали». Дж. Мол. Биол . 278 (2): 293–9. дои : 10.1006/jmbi.1998.1703 . ПМИД 9571051 .

[pmid8817449-2] Кауфманн Э., Кнехель В. (июнь 1996 г.). «Пять лет на крыльях вилочной головы» . Мех. Дев . 57 (1): 3–20. дои : 10.1016/0925-4773(96)00539-4 . ПМИД 8817449 . S2CID 18056224 .

[pmid2566386-3] Перейти обратно: ^а ^б Вайгель Д., Юргенс Г., Кюттнер Ф., Зайферт Э., Джекле Х. (май 1989 г.). «Гомеозисная генная вилка кодирует ядерный белок и экспрессируется в терминальных областях эмбриона дрозофилы» . Клетка . 57 (4): 645–58. дои : 10.1016/0092-8674(89)90133-5 . ПМИД 2566386 .

[pmid8332212-4] Перейти обратно: ^а ^б Кларк К.Л., Халай Э.Д., Лай Э., Берли С.К. (июль 1993 г.). «Сокристаллическая структура мотива распознавания ДНК HNF-3/головки вилки напоминает гистон H5». Природа . 364 (6436): 412–20. дои : 10.1038/364412a0 . ПМИД 8332212 . S2CID 4363526 .

[pmid1356269-5] Перейти обратно: ^а ^б Хакер У., Гроссниклаус У., Геринг В.Дж., Джекль Х. (сентябрь 1992 г.). «Семейство генов дрозофилы, регулируемое развитием, кодирующее домен головки вилки» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (18): 8754–8. дои : 10.1073/pnas.89.18.8754 . ПМК 49999 . ПМИД 1356269 .

[pmid17522590-6] ван дер Хорст А., Бургеринг Б.М. (июнь 2007 г.). «Подчеркивая роль белков FoxO в продолжительности жизни и заболеваниях». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 8 (6): 440–50. дои : 10.1038/nrm2190 . ПМИД 17522590 . S2CID 31546098 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]