Плеоморфный вирус Haloarcula hispanica 1
| Альфаплеолиповирус ВПЧ1 | |
|---|---|
| |
| альфаплеолиповируса Вирион | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Моноднавирия |
| Королевство: | Трапавира |
| Тип: | Салевирикота |
| Сорт: | Беспокоиться о тебе |
| Заказ: | Галорувиралес |
| Семья: | Плеолиповирусиды |
| Род: | Альфаплеолиповирус |
| Разновидность: | Альфаплеолиповирус ВПЧ1
|
| Синонимы | |
| |
Альфаплеолиповирус HHPV1 , также известный как плеоморфный вирус 1 Haloarcula hispanica (HHPV-1), представляет собой вирус семейства Pleolipoviridae . Это двухцепочечный ДНК-вирус, поражающий галофильную архею Haloarcula hispanica . [ 1 ] Он обладает рядом уникальных особенностей, в отличие от любого ранее описанного вируса. [ 2 ] [ 3 ]
Вирусология
[ редактировать ]Вирионы имеют оболочку и плеоморфную форму. Оболочка содержит различные липиды, включая кардиолипины , фосфатидилглицерины , метиловые эфиры фосфатидилглицерофосфата и фосфатидилглицеросульфаты. В оболочке находятся два основных белка — VP3 ( 12 килодальтон ) и VP4 (вес 60 килодальтон). вес [ 1 ]
Вирионы покидают хозяина без лизиса, что указывает на механизм почкования . [ 1 ]
Геном
[ редактировать ]Геном представляет собой одну молекулу двухцепочечной ДНК, кольцевую, длиной 8082 пары оснований с содержанием G+C 55,8%. Он имеет восемь открытых рамок считывания (ORF). VP3 и VP4 кодируются ORF3 и ORF4 соответственно. [ нужна ссылка ]
ORF1, вероятно, является белком инициации репликации. ORF3 кодирует интегральный мембранный белок с сигнальной последовательностью из 50 аминокислот и двумя трансмембранными областями. Перед С-концевым трансмембранным доменом находится спирально-спиральная область. ORF7 содержит домен NTPase, но его функция не ясна. [ нужна ссылка ]
Таксономия
[ редактировать ]Изучение белков и организации генома этого вируса позволяет предположить, что он связан с одноцепочечной ДНК вируса плеоморфного вируса Halorubrum 1 , плазмидой pHK2 и областью внутри археона Haloferax volcanii . Кажется вероятным, что плазмида pHK2 может быть вирусом, который может образовывать кольцевые плазмиды, и что область внутри Haloferax volcanii является профагом . [ нужна ссылка ]
Сходство между этими двухцепочечными элементами ДНК и одноцепочечным плеоморфным вирусом 1 Halorubrum в настоящее время уникально. Если эта связь может быть подтверждена для других вирусов, это означает, что используемая в настоящее время Балтиморская система классификации может нуждаться в пересмотре. [ нужна ссылка ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с Ройне Э., Куккаро П., Полин Л., Лауринавичиус С., Доманска А., Сомерхарью П., Бэмфорд Д.Х. (2010)Новые, тесно связанные галоархейные вирусные элементы с разными типами нуклеиновых кислот. Дж Вирол 84(7):3682–89
- ^ Пиетиля М.К., Атанасова Н.С., Маноле В., Лильджероос Л., Батчер С.Дж., Оксанен Х.М., Бэмфорд Д.Х. (2012). «Вирионная архитектура объединяет глобально распространенные плеолиповирусы, заражающие галофильные археи» . Журнал вирусологии . 86 (9): 5067–79. дои : 10.1128/JVI.06915-11 . ПМЦ 3347350 . ПМИД 22357279 .
- ^ Пиетиля М.К., Лауринавичиус С., Сунд Дж., Ройн Э., Бэмфорд Д.Х. (2010). «Одноцепочечный ДНК-геном нового плеоморфного вируса 1 архейного вируса Halorubrum заключен в оболочку, украшенную гликопротеиновыми шипами» . Дж Вирол . 84 (2): 788–798. дои : 10.1128/JVI.01347-09 . ПМЦ 2798366 . ПМИД 19864380 .