Галоаркула

Галоаркула
	СЭМ- изображение квадратного галоаркулы .
Научная классификация
Домен:	Архея
Королевство:	Эвриархеота
Тип:	Эвриархеота
Сорт:	Галобактерии
Заказ:	Галобактерии
Семья:	Галоаркулезные
Род:	Галоаркула ; Торребланка и др. Редакция 1986 года . Орен и др. 2009 год
Типовой вид
	Haloarcula валлисмортис ; (Гонсалес, Гутьеррес и Рамирес, 1979) Торребланка и др. 1986 год
Разновидность
	" Х. аидиненсис " ; " Х. алжирский " ; Х. амилолитика ; Х. аргентинский ; Испанский Н ; Х. японская ; Х. маннанилитика ; Х. марисмортуи ; « Х. морруаэ » ; Х. квадрат ; « Х. рубрипромонтори » ; Х. Салария ; Х. Салина ; Х. таракан ; " Х. сиамский " ; " Х. тайваньский " ; Х. торговый ; Х. валлисмортис ;

Haloarcula (распространенное сокращение Har. ) — род чрезвычайно галофильных архей класса Halobactaria . ^{[ 2 ]}

Клеточная структура

Виды Haloarcula можно отличить от других родов семейства Halobacteriaceae по наличию специфических производных полярных липидов TGD-2. H.quadrata имеет преимущественно плоские, квадратные, несколько плеоморфные клетки. ^{[ 3 ]}

Метаболизм

H.quadrata была впервые выделена, когда исследователи пытались культивировать Haloquadratum walsbyi , галоархею, которую до 2004 года считали некультивируемой. Как и другие галофильные археи, виды Haloarcula оптимально растут при 40–45 °C. Рост проявляется в виде пластинок, насчитывающих до 65 клеток, часто имеющих форму квадрата или треугольника.

Таксономия

Род Haloarcula долгое время группировался с другими галофильными архей, такими как Halobacterium, пока геномный анализ не побудил переупорядочить этот род в новое семейство Haloarculaceae .

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^{[ 4 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 1 ]}

на основе 16S рРНК ДП _06_2022 ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Галоаркула

	Х. маннанилитика

	Х. таракан

H. tradensis Namwong et al. 2011 год

H. salaria Namwong et al. 2011 год

	Х. амилолитика

	Х. японская

Испанский Н

Х. аргентинский

Х. марисмортуи

	H.quadata Oren et al. 1999 год

	Х. валлисмортис

Halomicroarcula salinisoli

Halomicroarcula salina

Halomicroarcula amylolytica

	Галомикроаркула лимикола

	Halomicroarcula nitrareducens

Галомикробий катесии

	Галомикробий урмианус

	Халаприкум десульфуриканс

Галомикробий

Галомикроаркула

Галоаркула

H. salina (Zhang & Cui 2015) Ma et al. 2023 год

	« H. Rubripromontorii » Sanchez-Nieves et al. 2016 год

	« H. taiwanensis » Chen et al. 2018 год

H. vallismortis (Гонсалес, Гутьеррес и Рамирес, 1979) Torreblanca et al. 1986 год

H. mannanilytica Enomoto et al. 2020 год

	H. amylolytica Yang et al. 2007 год

	H. hispanica Judge et al. 1986 год

H. japonica Takashina et al. 1991 год

H. marismortui Elazari-Volcani 1940 ex Oren et al. 1990 год

	H. argentinensis Ihara et al. 1997 год

	H. sebkhae Barreteau et al. 2019 год

Экология

Виды Haloarcula встречаются в нейтрально-соленой среде, такой как соленые озера , морские солеварни и засоленные почвы. Как и другим членам семейства Halobacteriaceae, Haloarcula для роста требуется не менее 1,5 М NaCl, но оптимально расти в концентрации от 2,0 до 4,5 М NaCl. ^{[ 1 ]}

См. также

Список родов архей

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Сэйерс; и др. «Халоаркула» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 10 октября 2023 г.
^ Орен, Аарон (2014), Розенберг, Юджин; Делонг, Эдвард Ф.; Лори, Стивен; Штакебрандт, Эрко (ред.), «Семейство Halobacteriaceae» , «Прокариоты: другие основные линии бактерий и архей » , Берлин, Гейдельберг: Springer, стр. 41–121, Bibcode : 2014prok.book...41O , doi : 10.1007/978-3-642-38954-2_313 , ISBN 978-3-642-38954-2 , получено 17 ноября 2021 г.
^ Орен, А.; Вентоза, А.; Гутьеррес, MC; Камекура, М. (1999). « Haloarcula Quadata sp. nov., квадратный подвижный архей, выделенный из соляного бассейна на Синае (Египет)» . Международный журнал систематической бактериологии . 49 (3): 1149–1155. дои : 10.1099/00207713-49-3-1149 . ПМИД 10425773 .
^ Ж. П. Эзеби. «Халоаркула» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 10 октября 2023 г.
^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

Дальнейшее чтение

Торребланка М., Родригес-Валера Ф., Хуэс Г., Вентоса А., Камекура М., Кейтс М. (1986). «Классификация неалкалифильных галобактерий на основе числовой систематики и полярного липидного состава, а также описание Haloarcula gen. nov. и Haloferax gen.nov ». Сист. Прил. Микробиол . 8 (1–2): 89–99. дои : 10.1016/s0723-2020(86)80155-2 .
Орен А., Вентоза А. (2000). «Подкомитет Международного комитета по систематической бактериологии по таксономии Halobacteriaceae. Протоколы заседаний, 16 августа 1999 г., Сидней, Австралия» . Межд. Дж. Сист. Эвол. Микробиол . 50 (3): 1405–1407. дои : 10.1099/00207713-50-3-1405 . ПМИД 10843089 .
Явор Б., Рекуадт С., Стокениус В. (1982). «Галофильные бактерии коробчатой формы» . Дж. Бактериол . 151 (3): 1532–1542. дои : 10.1128/jb.151.3.1532-1542.1982 . ПМК 220435 . ПМИД 6286602 .

Внешние ссылки

Haloarcula at Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию

Эта археям статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[NCBI-1] Jump up to: ^а ^б ^с Сэйерс; и др. «Халоаркула» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 10 октября 2023 г.

[:0-2] Орен, Аарон (2014), Розенберг, Юджин; Делонг, Эдвард Ф.; Лори, Стивен; Штакебрандт, Эрко (ред.), «Семейство Halobacteriaceae» , «Прокариоты: другие основные линии бактерий и архей » , Берлин, Гейдельберг: Springer, стр. 41–121, Bibcode : 2014prok.book...41O , doi : 10.1007/978-3-642-38954-2_313 , ISBN 978-3-642-38954-2 , получено 17 ноября 2021 г.

[3] Орен, А.; Вентоза, А.; Гутьеррес, MC; Камекура, М. (1999). « Haloarcula Quadata sp. nov., квадратный подвижный архей, выделенный из соляного бассейна на Синае (Египет)» . Международный журнал систематической бактериологии . 49 (3): 1149–1155. дои : 10.1099/00207713-49-3-1149 . ПМИД 10425773 .

[LPSN-4] Ж. П. Эзеби. «Халоаркула» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 10 октября 2023 г.

[5] «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.

[6] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.

[7] «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.

[about-8] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-9] "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-10] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]