Haloarcula marismortui

Haloarcula marismortui
Научная классификация
Домен:	Архея
Королевство:	Эвриархеота
Тип:	Эвриархеота
Сорт:	Галобактерии
Заказ:	Галобактерии
Семья:	Галоаркулезные
Род:	Галоаркула
Разновидность:	Х. марисмортуи
Биномиальное имя
	Haloarcula marismortui ; (из Volcani 1940) Oren et al. 1990 год

Haloarcula marismortui — галофильный архей , выделенный из Мертвого моря .

Морфология

Haloarcula marismortui — грамотрицательные археи с размером клеток 1,0–2,x 2,0–3,0 мкм (диаметр х длина). Клетки плеоморфны и имеют форму коротких палочек или прямоугольников. H. marismortui подвижен посредством археллума и обладает клеточной мембраной, состоящей из тригликозила, диэфирных липидов и гликопротеинов. ^{[ 2 ]}

Метаболизм

H. marismortui представляет собой аэробный хемоорганотроф , который использует гликолиз и модифицированный путь Энтнера-Дударова для расщепления питательных веществ. H. marismortui использует источники энергии, такие как глюкоза, сахароза, фруктоза, глицерин, малат, ацетат и сукцинат, производя при этом азот, метаболический углерод и кислоту в качестве побочных продуктов. Также может расти анаэробно, используя нитрат в качестве акцептора электронов. ^{[ 2 ]}

Геномные свойства

Геном H. marismortui организован в девять кольцевых репликонов , в которых содержание индивидуального G+C варьируется от 54 до 62%. ^{[ 3 ]} H. marismortui содержит 4366 генов и 4274642 пары оснований (штамм ATCC 43049). ^{[ 4 ]}

H. marismortui имеет одну из двух прокариотических крупных рибосомальных субъединиц, которые к настоящему времени кристаллизованы. Другой — Deinococcus radiodurans .

Экология

среда обитания

Haloarcula marismortui считается крайним галофилом и был выделен из Мертвого моря. ^{[ 3 ]} H. marismortui имеет оптимальную температуру от 40 до 50 ° C и диапазон pH 5,5–8,0. Рост может происходить в широком диапазоне концентраций NaCl, от 5 до 35%, при оптимальном росте от 15 до 25%. ^{[ 2 ]} Необычно большое количество генов, регулирующих окружающую среду, обнаруженных в геноме H. marismortui, предполагает более высокую приспособленность к экстремальным условиям по сравнению с другими видами Halobacterium . ^{[ 3 ]}

Адаптивность

H. marismortui кодирует большое семейство мультидоменных белков (49), которые действуют как сенсоры и регуляторы, включая белки опсина «Sop I & II, Hop и Bop». Эти белки помогают поддерживать физиологические концентрации ионов, облегчают фототаксис и генерируют химическую энергию посредством протонного градиента . ^{[ 3 ]} H. marismortui Считается, что обладает более чем 100 экопаралогами, генами, которые выполняют одну и ту же функцию в условиях стресса окружающей среды, что помогает поддерживать его систему адаптации к окружающей среде. Было обнаружено, что несколько генов влияют на контроль температуры (rrnA/B/C) и подвижность клеток (FlaA2 и FlaB). ^{[ 5 ]} H. marismortui кодирует большое семейство мультидоменных белков (49), которые действуют как регуляторы и сенсоры окружающей среды. ^{[ 3 ]} Это позволяет H. marimortui выживать в весьма изменчивых условиях окружающей среды.

Высокая адаптивность к окружающей среде делает H. marismortui идеальным кандидатом для будущих исследований в области биоремедиации с возможностью использования его сенсорных генов окружающей среды для очистки окружающей среды. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ «ЛПСН - Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре» . Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур . Проверено 12 июля 2022 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Орен, Аарон (2014), Розенберг, Юджин; Делонг, Эдвард Ф.; Лори, Стивен; Штакебрандт, Эрко (ред.), «Семейство Halobacteriaceae» , «Прокариоты: другие основные линии бактерий и архей » , Берлин, Гейдельберг: Springer, стр. 41–121, Bibcode : 2014prok.book...41O , doi : 10.1007/978-3-642-38954-2_313 , ISBN 978-3-642-38954-2 , получено 17 ноября 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Балига, Нитин С.; Бонно, Ричард; Фаччиотти, Марк Т.; Пан, Мин; Глусман, Густаво; Дойч, Эрик В.; Шеннон, Пол; Чиу, Юлун; Вэн, Рюйхунг Стинг; Ган, Руичи Ричи; Хун, Пинлян (1 ноября 2004 г.). «Последовательность генома Haloarcula marismortui: галофильного архея из Мертвого моря» . Геномные исследования . 14 (11): 2221–2234. дои : 10.1101/гр.2700304 . ISSN 1088-9051 . ПМК 525680 . ПМИД 15520287 .
^ «Haloarcula marismortui» . НКБИ . Проверено 22 ноября 2021 г.
^ Syutkin, Alexey S.; Pyatibratov, Mikhail G.; Galzitskaya, Oxana V.; Rodríguez-Valera, Francisco; Fedorov, Oleg V. (2014-03-01). "Haloarcula marismortui archaellin genes as ecoparalogs" . Extremophiles . 18 (2): 341–349. doi : 10.1007/s00792-013-0619-4 . ISSN 1433-4909 . PMID 24368632 . S2CID 254084670 .

Эта археям статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[LPSN-1] «ЛПСН - Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре» . Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур . Проверено 12 июля 2022 г.

[:02-2] Jump up to: ^а ^б ^с Орен, Аарон (2014), Розенберг, Юджин; Делонг, Эдвард Ф.; Лори, Стивен; Штакебрандт, Эрко (ред.), «Семейство Halobacteriaceae» , «Прокариоты: другие основные линии бактерий и архей » , Берлин, Гейдельберг: Springer, стр. 41–121, Bibcode : 2014prok.book...41O , doi : 10.1007/978-3-642-38954-2_313 , ISBN 978-3-642-38954-2 , получено 17 ноября 2021 г.

[:1-3] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Балига, Нитин С.; Бонно, Ричард; Фаччиотти, Марк Т.; Пан, Мин; Глусман, Густаво; Дойч, Эрик В.; Шеннон, Пол; Чиу, Юлун; Вэн, Рюйхунг Стинг; Ган, Руичи Ричи; Хун, Пинлян (1 ноября 2004 г.). «Последовательность генома Haloarcula marismortui: галофильного архея из Мертвого моря» . Геномные исследования . 14 (11): 2221–2234. дои : 10.1101/гр.2700304 . ISSN 1088-9051 . ПМК 525680 . ПМИД 15520287 .

[4] «Haloarcula marismortui» . НКБИ . Проверено 22 ноября 2021 г.

[5] Syutkin, Alexey S.; Pyatibratov, Mikhail G.; Galzitskaya, Oxana V.; Rodríguez-Valera, Francisco; Fedorov, Oleg V. (2014-03-01). "Haloarcula marismortui archaellin genes as ecoparalogs" . Extremophiles . 18 (2): 341–349. doi : 10.1007/s00792-013-0619-4 . ISSN 1433-4909 . PMID 24368632 . S2CID 254084670 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]