Галоаркулезные

Галоаркулезные
Научная классификация
Домен:	Архея
Тип:	Эвриархеота
Сорт:	Галобактерии
Заказ:	Галобактерии
Семья:	Галоаркулезные ; Гупта и др. 2016 год
Роды
	я счастлив ; Галоаркула ; Галококкоидес ; Галогломус ; Галомикроаркула ; Галомикробий ; Халлорхабдус ; Галориенталис ; Знак ореола ; Галосиккатус ; Галосимплекс ; Салинирусс ;

Haloarculaceae — семейство галофильных и преимущественно хемоорганотрофных архей отряда Halobacteriales . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Типовой род этого семейства — Haloarcula . ^{[ 4 ]} Его биохимические характеристики такие же, как у отряда Halobacteriales .

Название Haloarculaceae происходит от латинского термина Haloarcula, обозначающего типовой род семейства, и суффикса «-ceae», окончания, используемого для обозначения семейства. Вместе Haloarculaceae относится к семейству, номенклатурным типом которого является род Haloarcula .

Текущая таксономия и молекулярные сигнатуры

По состоянию на 2021 год Haloarculaceae содержит 10 действительно опубликованных родов. ^{[ 4 ]} Это семейство можно на молекулярном уровне отличить от других галобактерий по наличию 19 консервативных сигнатурных белков (CSP) и семи консервативных сигнатурных инделей (CSI), присутствующих в следующих белках: ацетилглутаматкиназы , рибонуклеазы R, металло-бета-лактамазы , фермента, модифицирующего тРНК, Большая субъединица карбамоилфосфатсинтазы и гипотетические белки. ^{[ 1 ]}

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^{[ 4 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 5 ]}

на основе 16S рРНК ДП _06_2022 ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Галобактерии

Галобактерии 2 *

Галомарин *

	Салинирубеллус *

	Знак ореола

Галогломус

	Халокатена *

	Натрономон *

Галобактериевые 3 *

Галосимплекс

Галориенталис

Салинибакулум *

	Салинирусс

	Хэллоуин *

я счастлив

	Галококкоидес

	Халлорхабдус

Галоаркулезные

Галомикробий чжоуи

Галомикробий мукохатаеи

	Галомикроаркула

	Галоаркула

Галобактерии *

« Халадаптовые » *

Халостелла {QS-9-68-17} *

	Halalkalicoccus {"Halalkalicoccaceae"} *

	Галококк { Halococcaceae }

Галобактериевые 4 *

	Natronoarchaeum {"Натроноархеевые"} *

	Salinarchaeum {"Salinarchaeaceae"}

Натриальбовые

	красная соль *

	Haloferacaceae (в т.ч. Halorubraceae )

Галобактерии

	« Халадаптовые » *

	Галобактерии *

Salinarchaeum {"Salinarchaeaceae"}

	Халостелла {QS-9-68-17} *

	Natronoarchaeum {"Натроноархеевые"} *

Натриальбовые

Галококк { Halococcaceae }

Галоаркулезные

	Халокатена *

	Галомарин *

	Haloglomus Duran-Viseras, Sanchez-Porro и Ventosa 2020

	Halosegnis Duran-Viseras et al. 2022 год

Натрономон *

Halorientalis Cui et al. 2011 год

Халаприкум Сонг и др. 2014 год

	Halococcoides Сорокин и др. 2019 год

	Халорхабдус Вайно и др. 2000 г.

Halosiplex Vreeland et al. 2003 г.

Salinirussus Cui et al. 2017 год

	Салинибакулум *

	Хэллоуин *

Галомикробий Орен и др. 2002 г. [вкл. Halosiccatus Mehrshad et al. 2016 ]

	Halomicroarcula Echigo et al. 2013 год

	Haloarcula Torreblanca et al. 1986 год

	Halalkalicoccus {"Halalkalicoccaceae"} *

	Haloferacaceae (в т.ч. Halorubraceae )

Примечание: * парафилетические Halobacteriaceae.

См. также

Список родов архей

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Гупта, Рэдхи С.; Наушад, Сохаил; Фаброс, Рина; Адеолу, Моболаджи (2 февраля 2016 г.). «Филогеномная переоценка подразделений на уровне семейства внутри класса Halobacteria: предложение разделить порядок Halobacteriales на семейства Halobacteriaceae, Haloarculaceae семейства nov. и Halococcaceae семейства nov.." nov " Антони ван Левенгук . 109 (4): 565–587. дои : 10.1007/ s10482-016-0660-2 ISSN 0003-6072 . ПМИД 26837779 . S2CID 254231068 .
^ Грант, Уильям Д.; Камекура, Масахиро; МакДженити, Терри Дж.; Вентоза, Антонио (14 сентября 2015 г.). «Класс галобактерий. ноябрь» . Руководство Берджи по систематике архей и бактерий : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 . ISBN 9781118960608 .
^ Орен, Аарон (01 февраля 2012 г.). «Таксономия семейства Halobacteriaceae: парадигма изменения концепций в систематике прокариот» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 62 (2): 263–271. дои : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 22155757 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ж. П. Эзеби. «Галоаркуловые» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 15 августа 2023 г.
^ Сэйерс; и др. «Галоаркуловые» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 15 августа 2023 г.
^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[:0-1] Перейти обратно: ^а ^б Гупта, Рэдхи С.; Наушад, Сохаил; Фаброс, Рина; Адеолу, Моболаджи (2 февраля 2016 г.). «Филогеномная переоценка подразделений на уровне семейства внутри класса Halobacteria: предложение разделить порядок Halobacteriales на семейства Halobacteriaceae, Haloarculaceae семейства nov. и Halococcaceae семейства nov.." nov " Антони ван Левенгук . 109 (4): 565–587. дои : 10.1007/ s10482-016-0660-2 ISSN 0003-6072 . ПМИД 26837779 . S2CID 254231068 .

[2] Грант, Уильям Д.; Камекура, Масахиро; МакДженити, Терри Дж.; Вентоза, Антонио (14 сентября 2015 г.). «Класс галобактерий. ноябрь» . Руководство Берджи по систематике архей и бактерий : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 . ISBN 9781118960608 .

[3] Орен, Аарон (01 февраля 2012 г.). «Таксономия семейства Halobacteriaceae: парадигма изменения концепций в систематике прокариот» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 62 (2): 263–271. дои : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 22155757 .

[LPSN-4] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ж. П. Эзеби. «Галоаркуловые» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 15 августа 2023 г.

[NCBI-5] Сэйерс; и др. «Галоаркуловые» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 15 августа 2023 г.

[6] «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.

[7] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.

[8] «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.

[about-9] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-10] "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-11] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]