Галофераковые
Галофераковые | |
---|---|
Халоквадратум Уолсби | |
Научная классификация | |
Домен: | |
Тип: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | Галофераковые Гупта и др. 2015 год
|
Роды | |
Haloferacaceae — семейство галофильных , хемоорганотрофных или гетеротрофных архей отряда Haloferacales . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Типовой род этого семейства — Haloferax . [ 4 ] Его биохимические характеристики такие же, как у отряда Haloferacales .
Название Haloferacaceae происходит от латинского термина Haloferax, обозначающего типовой род семейства, и суффикса «-ceae», окончания, используемого для обозначения семейства. В совокупности Haloferacaceae относится к семейству, номенклатурным типом которого является род Haloferax .
Таксономия и молекулярные подписи
[ редактировать ]По состоянию на 2021 год Haloferacaceae содержит 10 действительно опубликованных родов. [ 4 ] Это семейство можно на молекулярном уровне отличить от других галобактерий по наличию пяти консервативных сигнатурных белков (CSP) и четырех консервативных сигнатурных инделей (CSI), присутствующих в следующих белках: термосомах , рибонуклеазе BN и гипотетических белках. [ 1 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [ 5 ] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [ 6 ]
на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] | 53 маркерных белка на основе GTDB 07-RS207 [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Гупта, Рэдхи С.; Наушад, Сохаил; Бейкер, Шеридан (01 марта 2015 г.). «Филогеномный анализ и молекулярные признаки класса Halobacteria и двух его основных клад: предложение о разделении класса Halobacteria на исправленный порядок Halobacteriales и два новых порядка: Haloferacales ord. nov. и Natrialbales ord. nov Haloferacaceae nov . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (Pt_3): 1050–1069. дои : 10.1099/ ijs.0.070136-0 ISSN 1466-5026 . ПМИД 25428416 .
- ^ Грант, Уильям Д.; Камекура, Масахиро; МакДженити, Терри Дж.; Вентоза, Антонио (14 сентября 2015 г.). «Класс галобактерий. ноябрь» . Руководство Берджи по систематике архей и бактерий : 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 . ISBN 9781118960608 .
- ^ Орен, Аарон (01 февраля 2012 г.). «Таксономия семейства Halobacteriaceae: парадигма изменения концепций в систематике прокариот» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 62 (2): 263–271. дои : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 22155757 .
- ^ Jump up to: а б «Семейство: Haloferacaceae» . lpsn.dsmz.de. Проверено 27 июня 2021 г.
- ^ Ж. П. Эзеби. «Галофераковые» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 17 ноября 2021 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Галофераковые» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2022 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
- ^ "ar53_r207.sp_labels" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.