Тиобациллы

Тиобациллы
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадота
Сорт:	Бетапротеобактерии
Заказ:	Нитросомонадалесы
Семья:	Тиобациллаки
Род:	Тиобациллы
Разновидность
	Тиобацилла тиопарус ; Тиобациллы денитрифицанс ; Тиобацилла тиофилус

Thiobacillus — род грамотрицательных бетапротеобактерий . Thiobacillus thioparus является типовым видом рода, а его типовым штаммом является штамм Starkey. ^Т Штамм, выделенный Робертом Старки в 1930-х годах на поле Университета Рутгерса в Соединенных Штатах Америки . в 1904 году в этом роде было названо более 30 «видов» Хотя с момента его определения Мартинусом Бейеринком . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} (первый штамм был обнаружен биологическим океанографом Александром Натансоном в 1902 году — вероятно, это тот штамм, который мы сейчас назвали бы Halothiobacillus neapolitanus. ^{[ 3 ]}), большинство имен никогда не были достоверно и эффективно опубликованы. Остальные были либо переклассифицированы в Paracoccus , Starkeya (оба в Alphaproteobacteria ); Sulfuriferula , Annwoodia , Thiomonas (в составе Betaproteobacteria ); Halothiobacillus , Guyparkeria (в группе Gammaproteobacteria ), или Thermithiobacillus , или Acidithiobacillus (в группе Acidithiobacillia ). К очень расплывчатому «виду» Thiobacillus trautweinii и хемолитогетеротрофы, окисляющие серу гетеротрофы в эпоху 1910-1960-х годов были отнесены Pseudomonas . , большинство из которых, вероятно, были видами ^{[ 4 ]} Многие виды, относящиеся к этому роду, никогда не попадали в служебные коллекции и утеряны. ^{[ 4 ]}^{[ 3 ]}

Все виды являются облигатными автотрофами. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} (с использованием трансальдолазы формы цикла Кальвина-Бенсона-Бэсшама ^{[ 4 ]}) с использованием элементарной серы, тиосульфата или политионатов в качестве источников энергии — бывший Thiobacillus aquaesulis может слабо расти на сложных средах как гетеротроф, но был переклассифицирован в Annwoodia aquaesulis . Некоторые штаммы (E6 и Tk-m) типового вида Thiobacillus thioparus могут использовать серу из диметилсульфида , диметилдисульфида или сероуглерода для поддержки автотрофного роста — они окисляют углерод этих видов в углекислый газ и ассимилируют его. Окисление серы достигается по пути Келли-Трудингера.

Реклассификации

В результате анализа последовательности 16S рибосомальной РНК многие представители Thiobacillus были переназначены. ^{[ 5 ]}^{[ 4 ]}^{[ 6 ]}

Thiobacillus в сравнении с Paracoccus
Thiobacillus acidophilus в Acidiphilium
Thiobacillus intermedius , Thiobacillus perometabolis , Thiobacillus thermosulfatus и Thiobacilus cuprinus до Thiomonas
Thiobacillus thiooxydans , Thiobacillus Ferrooxydans , Thiobacillus Caldus и Thiobacillus albertensis в Acidithiobacillus
Thiobacillus aquaesulis — Annwoodia aquaesulis . ^{[ 4 ]}
Thiobacillus neapolitanus в Halothiobacillus
Thiobacillus thyasiris до Thiomicrospira thiasirae ^{[ 7 ]}
Thiobacillus Hydrothermalis и Thiobacillus halophilus сначала к Halothiobacillus , а затем к Guyparkeria. ^{[ 6 ]}
Thiobacillus tepidarius в Thermithiobacillus ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Бейеринк М.В. (1904). «Редукционные явления, производимые микробами» . Arch Neel Sci Exact Nat (раздел 2) . 9 : 131–157.
^ Jump up to: ^а ^б Бейеринк М.В. (1904). «О бактериях, которые могут питаться в темноте, используя угольную кислоту в качестве источника углерода». Centralbl Бактериальная Паразитарная Инфекция Kd Cr Hyg Abt II . 11 :592-599.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Боден Р. (2017). «115 лет обмена серы» . Письма FEMS по микробиологии . 364 (6): fnx043. doi : 10.1093/femsle/fnx043 . ПМИД 28333223 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Боден Р., Хатт Л.П., Рэй А.В. (2017). «Реклассификация Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) в Annwoodia aquaesulis gen. nov.,comb. nov., переход Thiobacillus (Beijerinck, 1904) из Hydrogenophilales в Nitrosomonadales , предложение класса Hydrogenophilalia nov. в составе Proteobacteria. и четыре новых семейства в отрядах Nitrosomonadales и Rhodocyclales » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 67 (5): 1191–1205. дои : 10.1099/ijsem.0.001927 . hdl : 10026.1/8740 . ПМИД 28581923 .
^ Jump up to: ^а ^б Келли Д.П.; Вуд АП (2000). «Реклассификация некоторых видов Thiobacillus в новые роды Acidithiobacillus gen. nov., Halothiobacillus gen. nov. и Thermithiobacillus gen. nov.» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (2): 511–516. дои : 10.1099/00207713-50-2-511 . PMID 10758854 .
^ Jump up to: ^а ^б Боден Р. (2017). «Реклассификация Halothiobacillus Hydrothermalis и Halothiobacillus halophilus в Guyparkeria gen. nov. в семействе Thioalkalibacteraceae nov., с исправленными описаниями рода Halothiobacillus и семейства Halothiobacillaceae » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 67 (10): 3919–3928. дои : 10.1099/ijsem.0.002222 . hdl : 10026.1/9982 . ПМИД 28884673 .
^ Келли Д.П.; ВудАП (1993). «Реклассификация Thiobacillus thyasiris в Thiomicrospira thasirae, новая комбинация, организм, проявляющий плеоморфизм в ответ на условия окружающей среды». Архив микробиологии . 159 : 45–47. дои : 10.1007/BF00244262 . S2CID 23406498 .

[Beijerinck1904a-1] Jump up to: ^а ^б Бейеринк М.В. (1904). «Редукционные явления, производимые микробами» . Arch Neel Sci Exact Nat (раздел 2) . 9 : 131–157.

[Beijerinck1904b-2] Jump up to: ^а ^б Бейеринк М.В. (1904). «О бактериях, которые могут питаться в темноте, используя угольную кислоту в качестве источника углерода». Centralbl Бактериальная Паразитарная Инфекция Kd Cr Hyg Abt II . 11 :592-599.

[boden2017ed-3] Jump up to: ^а ^б ^с Боден Р. (2017). «115 лет обмена серы» . Письма FEMS по микробиологии . 364 (6): fnx043. doi : 10.1093/femsle/fnx043 . ПМИД 28333223 .

[Bodenetal2017-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Боден Р., Хатт Л.П., Рэй А.В. (2017). «Реклассификация Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) в Annwoodia aquaesulis gen. nov.,comb. nov., переход Thiobacillus (Beijerinck, 1904) из Hydrogenophilales в Nitrosomonadales , предложение класса Hydrogenophilalia nov. в составе Proteobacteria. и четыре новых семейства в отрядах Nitrosomonadales и Rhodocyclales » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 67 (5): 1191–1205. дои : 10.1099/ijsem.0.001927 . hdl : 10026.1/8740 . ПМИД 28581923 .

[Kelly2000-5] Jump up to: ^а ^б Келли Д.П.; Вуд АП (2000). «Реклассификация некоторых видов Thiobacillus в новые роды Acidithiobacillus gen. nov., Halothiobacillus gen. nov. и Thermithiobacillus gen. nov.» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (2): 511–516. дои : 10.1099/00207713-50-2-511 . PMID 10758854 .

[Boden2017-6] Jump up to: ^а ^б Боден Р. (2017). «Реклассификация Halothiobacillus Hydrothermalis и Halothiobacillus halophilus в Guyparkeria gen. nov. в семействе Thioalkalibacteraceae nov., с исправленными описаниями рода Halothiobacillus и семейства Halothiobacillaceae » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 67 (10): 3919–3928. дои : 10.1099/ijsem.0.002222 . hdl : 10026.1/9982 . ПМИД 28884673 .

[WoodKelly1993-7] Келли Д.П.; ВудАП (1993). «Реклассификация Thiobacillus thyasiris в Thiomicrospira thasirae, новая комбинация, организм, проявляющий плеоморфизм в ответ на условия окружающей среды». Архив микробиологии . 159 : 45–47. дои : 10.1007/BF00244262 . S2CID 23406498 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]