Стивен Альтшул
Стивен Альтшул | |
---|---|
Рожденный | Стивен Фрэнк Альтшул 28 февраля 1957 г. |
Гражданство | Соединенные Штаты |
Альма-матер | Гарвардский университет (AB, математика) Массачусетский технологический институт (доктор философии, математика) |
Известный | ВЗРЫВ |
Супруг | Кэролайн Кершоу Джеймс (м. 1994) |
Научная карьера | |
Поля | Биоинформатика |
Учреждения | NCBI |
Диссертация | Аспекты сравнения биологических последовательностей (1987) |
Докторантура | Дэниел Клейтман [1] |
Веб-сайт | www |
Стивен Франк Альтшул (родился 28 февраля 1957 г.) - американский математик , разработавший алгоритмы , используемые в области биоинформатики (алгоритм Карлина – Альтшула). [2] и его преемники [3] ). Альтшул — соавтор алгоритма BLAST используемого для анализа последовательностей белков , и нуклеотидов . [4] [5]
Образование [ править ]
Альтшуль окончил с отличием [6] из Гарвардского университета , где он был избран в Фи Бета Каппа по математике и имеет степень доктора философии. в той же области из Массачусетского технологического института . [7]
Исследования [ править ]
Его исследовательские интересы сосредоточены вокруг алгоритмов выравнивания последовательностей, статистики сравнения последовательностей и измерения сходства последовательностей. [4] [5]
Предыстория [ править ]
Он сын Стефани Розмари (урожденной Вагнер) и Артура Альтшуля , бывшего партнера Goldman Sachs . [8] [9] В 1994 году он женился на Кэролайн Кершоу Джеймс, дочери Кэролайн Джеймс-Притц из Цинциннати и Гарри Кейтана Джеймса из Дейтона, штат Огайо . Преподобный Лютер Д. Миллер-младший провел церемонию в епископальной церкви Св. Давида в Вашингтоне. [6]
Его сводная сестра — журналистка Серена Альтшул , известная своей работой на MTV . По отцовской линии он является членом семьи Леман .
У него двое сыновей, Джеймс и Уильям Альтшул. Уильям Альтшул — бывший игрок колледжа Ultimate в Вашингтонском университете в Сент-Луисе . [10]
От математики к биоинформатике [ править ]
Во время учебы в бакалавриате Альтшуль проявил интерес к биологии. В результате он начал читать книги о ДНК. Одной из книг, которые он прочитал, была «Двойная спираль» Уотсона. [ нужна ссылка ] Кроме того, он также прошел курс эволюционной биологии. [ нужна ссылка ] Альтшул также провел два лета, работая в лабораториях Рокфеллеровского университета, где помогал писать компьютерные коды для проекта рентгеновской кристаллографии. [ нужна ссылка ]
Из-за своего интереса Альтшуль подумывал о том, чтобы подать заявление в аспирантуру по биологии. [ нужна ссылка ] Вместо этого он решил подать заявку на участие в программах по прикладной математике в надежде найти некоторые приложения математики в биологии, над которыми можно будет работать.
Известные назначения/должности [ править ]
После окончания учебы Стивен Франк Альтшул работал в отделе математических исследований Национального института диабета, заболеваний органов пищеварения и почек в качестве постдокторанта IRTA. С 1990 года по настоящее время работал в отделе вычислительной биологии NCBI, занимая должность старшего научного сотрудника.
Ссылки [ править ]
- ^ Стивен Альтшул в проекте «Математическая генеалогия»
- ^ Альтшул, С. ; Гиш, В .; Миллер, В .; Майерс, Э .; Липман, Д. (1990). «Базовый инструмент поиска локального выравнивания». Журнал молекулярной биологии . 215 (3): 403–410. дои : 10.1016/S0022-2836(05)80360-2 . ПМИД 2231712 . S2CID 14441902 .
- ^ Альтшул, С. ; Мэдден, TL; Шеффер, А.А.; Чжан, Дж.; Чжан, З.; Миллер, В .; Липман, диджей (1997). «Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска по базам данных белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (17): 3389–3402. дои : 10.1093/нар/25.17.3389 . ПМК 146917 . ПМИД 9254694 .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Публикации Стивена Альтшула, индексируемые Microsoft Academic
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Стивен Ф. Альтшул на DBLP библиографическом сервере
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б New York Times: «Свадьбы; Кэролайн Джеймс, Стивен Альтшул», 17 апреля 1994 г.
- ^ Альтшул, Стивен Франк (1987). Аспекты сравнения биологических последовательностей (кандидатская диссертация). Массачусетский технологический институт.
- ^ Уведомление о смерти Артура Гудхарта Альтшула
- ^ «ТРОТА ОБЪЯВЛЯЕТСЯ О МИСС ВАГНЕР; свадьба состоится в мае - The New York Times» . Нью-Йорк Таймс . 18 марта 1956 года.
- ^ «Команда мероприятия | Играй в USA Ultimate» .