АТФ-зависимый адаптерный белок Clp-протеазы ClpS
| КлпС | |||
|---|---|---|---|
 clpns с фрагментами | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | КлпС | ||
| Пфам | PF02617 | ||
| ИнтерПро | ИПР003769 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1 МБх / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
ClpS представляет собой N-распознаватель в пути правила N-конца. [ 1 ] ClpS взаимодействует с белковыми субстратами, имеющими на N-конце объемный гидрофобный остаток (лейцин, фенилаланин, тирозин и триптофан). Белковый субстрат затем разрушается протеазой ClpAP. [ 2 ] [ 3 ]
В молекулярной биологии АТФ-зависимый адаптерный белок Clp-протеазы ClpS представляет собой бактериальный белок . В бактериальном цитозоле АТФ -зависимая деградация белков осуществляется несколькими различными парами шаперон - протеаза , включая ClpAP. влияет на машину ClpAP путем связывания с N-концевым доменом шаперона ClpS напрямую ClpA. Деградация субстратов ClpAP, как белков, меченных SsrA , так и самого ClpA, специфически ингибируется ClpS. ClpS модифицирует специфичность субстрата ClpA , потенциально перенаправляя деградацию ClpAP в сторону агрегированных белков . [ 4 ]
ClpS представляет собой небольшой альфа/бета-белок, состоящий из трех альфа-спиралей, соединенных с тремя антипараллельными бета-нитями. [ 5 ] Белок имеет глобулярную форму с изогнутым слоем из трех антипараллельных альфа-спиралей над скрученным антипараллельным бета-листом . Димеризация ClpS может происходить через его N-концевой домен. За этой короткой расширенной N-концевой областью в ClpS следует центральная бета-цепь из семи остатков, которая окружена двумя другими бета-цепями в небольшом бета-листе.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Варшавский А (август 2011 г.). «Путь правила N-конца и регуляция посредством протеолиза» . Белковая наука . 20 (8): 1298–345. дои : 10.1002/pro.666 . ПМК 3189519 . ПМИД 21633985 .
- ^ Тасаки Т., Шрирам С.М., Пак К.С., Квон Ю.Т. (10 апреля 2012 г.). «Путь правила N-конца» . Ежегодный обзор биохимии . 81 : 261–89. doi : 10.1146/annurev-biochem-051710-093308 . ПМЦ 3610525 . ПМИД 22524314 .
- ^ Эрбсе А., Шмидт Р., Борнеманн Т., Шнайдер-Мергенер Дж., Могк А., Зан Р. и др. (февраль 2006 г.). «ClpS является важным компонентом пути правила N-конца в Escherichia coli». Природа . 439 (7077): 753–6. Бибкод : 2006Natur.439..753E . дои : 10.1038/nature04412 . ПМИД 16467841 . S2CID 4406838 .
- ^ Дуган Д.А., Рид Б.Г., Хорвич А.Л., Букау Б. (март 2002 г.). «ClpS, субстратный модулятор машины ClpAP» . Молекулярная клетка . 9 (3): 673–83. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00485-9 . ПМИД 11931773 .
- ^ Зет К., Равелли Р.Б., Паал К., Кьюсак С., Букау Б., Дуган Д.А. (декабрь 2002 г.). «Структурный анализ адаптерного белка ClpS в комплексе с N-концевым доменом ClpA». Структурная биология природы . 9 (12): 906–11. дои : 10.1038/nsb869 . ПМИД 12426582 . S2CID 28459237 .