Эпихлоя овсяница
| Эпихлоя овсяница | |
|---|---|
| |
Научная классификация 
| |
| Домен: | Эукариоты |
| Королевство: | Грибы |
| Разделение: | Аскомикота |
| Сорт: | Сордариомицеты |
| Заказ: | Гипокреалес |
| Семья: | Клавиципитовые |
| Род: | Эпихлоя |
| Разновидность: | Э. овсяница
|
| Биномиальное имя | |
| Эпихлоя овсяница Leuchtm., печать Schardl и MR
| |
| Синонимы | |
| |
Epichloë festucae — системный эндофитный гриб трав прохладного сезона, передающийся с семенами. [ 1 ]
Впервые описан в 1994 г. [ 2 ] Epichloë festucae является сестринской линией Epichloë amarillans , Epichloë baconii , Epichloë mollis и Epichloë stromatolonga . Epichloë festucae встречается по всей Северной Америке, где обитает в травах видов Bromus kalmii и Elymus spp. (включая Elymus patula ).
Геном
[ редактировать ]Полная генома последовательность Epichloë festucae , первая полная последовательность генома любого вида рода Epichloë , была опубликована в 2018 году. Геном размером 35 МБ включает 7 хромосом размером от 3,2 до 7,8 МБ, включая примерно 9000 генов. [ 3 ]
Центромеры
[ редактировать ]По состоянию на 2020 год [update], хотя некоторые данные о последовательности центромер доступны, полной аннотации всех открытых рамок считывания нет. В результате полный таксономический анализ до сих пор невозможен. [ 4 ]
Разновидности
[ редактировать ]Штаммы Epichloë festucae могут иметь как половую репродуктивную морфу ( телеоморф ), так и бесполую репродуктивную морфу ( анаморф ). Для этой группы анаморфные формы долгое время классифицировались отдельно: первоначально в род Acremonium , [ 5 ] а после 1996 г. — в новый род Neotyphodium . [ 6 ] С 2011 года номенклатурный код требует, чтобы для всех стадий развития вида грибов использовалось одно название, а после таксономического пересмотра рода Epichloë в 2014 году бесполые формы Epichloë festucae теперь классифицируются как Epichloë festucae var. лоли . [ 1 ]
встречается в Европе, Азии и Северной Африке, а также интродуцирован в Новую Зеландию , Австралию и другие страны. Epichloë festucae var. lolii связан с видом травы Lolium perenne subsp. Перенн .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Лейхтманн, А.; Бэкон, CW; Шардл, CL; Уайт, Дж. Ф.; Тадыч, М. (2014). «Номенклатурное приведение видов Neotyphodium к роду Epichloë ». Микология . 106 (2): 202–215. дои : 10.3852/13-251 . ПМИД 24459125 . S2CID 25222557 .
- ^ Лейхтманн, Адриан; Шардл, Кристофер Л.; Сигел, Малкольм Р. (1994). «Сексуальная совместимость и систематика нового вида Epichloë, симбиотического с мелкой овсяницей». Микология . 86 (6): 802–812. дои : 10.1080/00275514.1994.12026487 . ISSN 0027-5514 .
- ^ Винтер, Дэвид Дж.; Гэнли, Остин РД; Янг, Кэролайн А.; Лячко Иван; Шардл, Кристофер Л.; Дюпон, Пьер-Ив; Берри, Дэниел; Рам, Арвина; Скотт, Барри; Кокс, Мюррей П. (2018). «Повторяющиеся элементы организуют трехмерную структуру генома и опосредуют транскрипцию у нитчатого гриба Epichloë festucae » . ПЛОС Генетика . 14 (10): e1007467. дои : 10.1371/journal.pgen.1007467 . ISSN 1553-7404 . ПМК 6218096 . ПМИД 30356280 .
- ^ Гуин, Кришненду; Шрикумар, Лакшми; Саньял, Каустув (08 сентября 2020 г.). «Последствия эволюционной траектории центромер в грибном царстве» . Ежегодный обзор микробиологии . 74 (1). Годовые обзоры : 835–853. doi : 10.1146/annurev-micro-011720-122512 . ISSN 0066-4227 . ПМИД 32706633 . S2CID 225320859 .
- ^ Морган-Джонс, Дж.; Гамс, В. (1982). «Заметки о гифомицетах. XLI. Эндофит Festuca arundinacea и анаморфа Epichloe typhina , новые таксоны в одном из двух новых отделов Acremonium ». Микотаксон . 15 : 311–318.
- ^ Гленн А.Э., Бэкон К.В., Прайс Р., Ханлин Р.Т. (1996). «Молекулярная филогения Acremonium и ее таксономические значения» . Микология . 88 (3). Микологическое общество Америки: 369–383. дои : 10.2307/3760878 . JSTOR 3760878 .