Сахаромицеты парадоксальные
| Сахаромицеты парадоксальные | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Эукариоты |
| Королевство: | Грибы |
| Разделение: | Аскомикота |
| Сорт: | Сахаромицеты |
| Заказ: | Сахаромицеталы |
| Семья: | Сахаромицетовые |
| Род: | Сахаромицеты |
| Разновидность: | С. парадокс
|
| Биномиальное имя | |
| Сахаромицеты парадоксальные Бах.-Райх., 1914 г.
| |
Saccharomyces paradoxus — дикие дрожжи и наиболее близкий из известных видов пекарских дрожжей Saccharomyces cerevisiae . Он используется в популяционной геномике и филогенетических исследованиях для сравнения его диких характеристик с лабораторными дрожжами. [ 1 ]
Экология
[ редактировать ]Saccharomyces paradoxus чаще всего выделяют на лиственных деревьях (дуб, клен, береза), а в некоторых редких случаях — на насекомых и плодах. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Он часто встречается в симпатии к другим видам Saccharomyces . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Как и Saccharomyces cerevisiae , он распространен по всему миру и является мезофильным , что ограничивает его естественное распространение низкими широтами. Однако Saccharomyces paradoxus обычно растет при более низких температурах, чем Saccharomyces cerevisiae , что приводит к небольшому сдвигу в его распространении в сторону более прохладных регионов, таких как Британские острова и Восточная Канада. [ 2 ] [ 8 ] [ 9 ]
Биогеография
[ редактировать ]
В отличие от большинства других видов Saccharomyces , нет никаких доказательств того, что Saccharomyces paradoxus был одомашнен человеком. [ 3 ] [ 11 ] Соответственно, его биогеография в основном отмечена естественными процессами, такими как ограниченная миграция, [ 3 ] ледниковое убежище [ 12 ] и адаптация к климату. [ 10 ] по крайней мере четыре генетически и фенотипически различные популяции Saccharomyces paradoxus Были идентифицированы , соответствующие основным географическим подразделениям: Европа (включая Западную Сибирь), Дальний Восток Азии (Япония, Восточная Сибирь), Северная Америка (восточное и западное побережья Северной Америки, Великие озера). регион) и Северо-Восточной Америки (полуостров Гаспе, долина Святого Лаврентия и Аппалачи) соответственно. [ 3 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] Репрезентативные штаммы этих популяций демонстрируют частичную постзиготическую изоляцию . [ 12 ] [ 13 ] Пятая популяция представлена изолятом-одиночкой с Гавайских островов. [ 3 ] [ 11 ] Некоторые штаммы европейской популяции обнаружены в Северной Америке и Новой Зеландии и, вероятно, являются результатом недавних событий колонизации. [ 14 ] [ 15 ] Два изолята из Южной Америки, описанные как Saccharomyces cariocanus , [ 16 ] генетически неотличимы, но демонстрируют постзиготическую изоляцию при скрещивании со штаммами американской популяции из-за хромосомных транслокаций . [ 13 ]
Воспроизведение
[ редактировать ]Saccharomyces paradoxus по своей природе гомоталличны чаще всего встречаются как диплоидные и в окружающей среде . Размножение преимущественно клональное , 99% полового размножения происходит между спорами из одной аски . [ 17 ] Это удаляет рецессивные вредные мутации, накопившиеся во время клональной экспансии, в процессе, известном как «обновление генома». [ 18 ] [ 19 ] Постзиготическая изоляция между штаммами Saccharomyces paradoxus наблюдается обычно и может быть связана либо с генетическими различиями между популяциями, либо с хромосомными изменениями внутри популяций. [ 12 ] [ 13 ]
Как и у других видов Saccharomyces , гетероталлизм можно восстановить с помощью стандартных генетических инструментов для получения стабильных гаплоидных штаммов для экспериментальных целей.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Данэм, MJ; Луи, ЭД (2011). «Эволюция дрожжей и экология соответствуют геномике» . Отчеты ЭМБО . 12 (1): 8–10. дои : 10.1038/embor.2010.204 . ПМК 3024138 . ПМИД 21151040 .
- ^ Перейти обратно: а б Чаррон, Дж; Ледюк, Дж.Б.; Бертен, К. (2014). «Изучение северной границы распространения Saccharomyces cerevisiae и Saccharomyces paradoxus в Северной Америке» . Исследование дрожжей FEMS . 14 (2): 281–8. дои : 10.1111/1567-1364.12100 . ПМИД 24119009 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Хима, Кентукки; Джей, Джей Си (2013). «Смешение экотипов виноградников и дубов Saccharomyces cerevisiae на виноградниках Северной Америки» . Молекулярная экология . 22 (11): 2917–30. дои : 10.1111/mec.12155 . ПМК 3620907 . ПМИД 23286354 .
- ^ Маганти, Х; Бартфаи, Д; Сюй, Дж (2012). «Экологическое структурирование дрожжей, связанных с деревьями вокруг Гамильтона, Онтарио, Канада» . Исследование дрожжей FEMS . 12 (1): 9–19. дои : 10.1111/j.1567-1364.2011.00756.x . ПМИД 22029478 .
- ^ Снеговский, П. Д.; Домбровский, П.Г.; Фингерман, Э (2002). «Saccharomyces cerevisiae и Saccharomyces paradoxus сосуществуют в естественном лесном массиве Северной Америки и демонстрируют разные уровни репродуктивной изоляции от европейских сородичей» . Исследование дрожжей FEMS . 1 (4): 299–306. дои : 10.1111/j.1567-1364.2002.tb00048.x . ПМИД 12702333 .
- ^ Наумов, Г.И.; Наумова, Е.С.; Снеговский, П.Д. (1998). «Saccharomyces paradoxus и Saccharomyces cerevisiae связаны с экссудатами североамериканских дубов». Канадский журнал микробиологии . 44 (11): 1045–50. дои : 10.1139/w98-104 . ПМИД 10029999 .
- ^ Сампайо, Япония; Гонсалвес, П. (2008). «Естественные популяции Saccharomyces kudriavzevii в Португалии связаны с корой дуба и симпатичны S. cerevisiae и S. paradoxus» (PDF) . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (7): 2144–52. Бибкод : 2008ApEnM..74.2144S . дои : 10.1128/АЕМ.02396-07 . ПМК 2292605 . ПМИД 18281431 .
- ^ Перейти обратно: а б Суини, JY; Кюне, штат Ха; Снеговский, П.Д. (2004). «Симпатрические природные популяции Saccharomyces cerevisiae и S. paradoxus имеют разные профили термического роста» . Исследование дрожжей FEMS . 4 (4–5): 521–5. дои : 10.1016/s1567-1356(03)00171-5 . ПМИД 14734033 .
- ^ Перейти обратно: а б Джонсон, LJ; Куфопану, В; Годдард, MR (2004). «Популяционная генетика диких дрожжей Saccharomyces paradoxus» . Генетика . 166 (1): 43–52. дои : 10.1534/генетика.166.1.43 . ПМЦ 1470673 . ПМИД 15020405 .
- ^ Перейти обратно: а б с Ледюк, Дж.Б.; Чаррон, Дж; Самани, П. (2014). «Локальная климатическая адаптация широко распространенного микроорганизма» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 281 (1777): 20132472. doi : 10.1098/rspb.2013.2472 . ПМК 3896012 . ПМИД 24403328 .
- ^ Перейти обратно: а б с Лити, Г; Картер, DM; Моисей, AM (2009). «Популяционная геномика домашних и диких дрожжей» . Природа . 458 (7236): 337–41. Бибкод : 2009Natur.458..337L . дои : 10.1038/nature07743 . ПМЦ 2659681 . ПМИД 19212322 .
- ^ Перейти обратно: а б с Чаррон, Дж; Ледюк, Дж.Б.; Лэндри, ЧР (2014). «Хромосомные вариации разделяются внутри зарождающихся видов и коррелируют с репродуктивной изоляцией». Молекулярная экология . 23 (17): 4362–4372. дои : 10.1111/mec.12864 . ПМИД 25039979 . S2CID 43071397 .
- ^ Перейти обратно: а б с Лити, Г; Бартон, Д.Б.; Луи, Э.Дж. (2006). «Разнообразие последовательностей, репродуктивная изоляция и концепции видов у Saccharomyces» . Генетика . 174 (2): 839–850. doi : 10.1534/genetics.106.062166 . ПМК 1602076 . ПМИД 16951060 .
- ^ Кюне, штат Ха; Мерфи, штат Ха; Фрэнсис, Калифорния (2007). «Аллопатрическая дивергенция, вторичный контакт и генетическая изоляция в популяциях диких дрожжей» . Современная биология . 17 (5): 407–11. дои : 10.1016/j.cub.2006.12.047 . ПМИД 17306538 . S2CID 18301950 .
- ^ Чжан, Ха; Скелтон, А; Гарднер, Р.К. (2010). «Saccharomyces paradoxus и Saccharomyces cerevisiae обитают на дубах в Новой Зеландии: свидетельства миграции из Европы и межвидовых гибридов» . Исследование дрожжей FEMS . 10 (7): 941–7. дои : 10.1111/j.1567-1364.2010.00681.x . ПМИД 20868381 .
- ^ Наумов, Г.И.; Джеймс, ЮАР; Наумова, Е.С. (2000). «Три новых вида в комплексе Saccharomyces sensu stricto: Saccharomyces cariocanus, Saccharomyces kudriavzevii и Saccharomyces mikatae» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (5): 1931–42. дои : 10.1099/00207713-50-5-1931 . ПМИД 11034507 .
- ^ Цай, Эй Джей; Бенсассон, Д; Берт, А. (2008). «Популяционная геномика диких дрожжей Saccharomyces paradoxus: количественная оценка жизненного цикла» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (12): 4957–62. Бибкод : 2008PNAS..105.4957T . дои : 10.1073/pnas.0707314105 . ПМК 2290798 . ПМИД 18344325 .
- ^ Мортимер, Роберт К.; Романо, Патриция; Суззи, Джованна; Полсинелли, Марио (декабрь 1994 г.). «Обновление генома: новое явление, выявленное в результате генетического исследования 43 штаммов Saccharomyces cerevisiae, полученных в результате естественного брожения виноградного сусла». Дрожжи . 10 (12): 1543–1552. дои : 10.1002/да.320101203 . ПМИД 7725789 . S2CID 11989104 .
- ^ Мазель, Джоанна ; Литтл, Дэвид Н. (декабрь 2011 г.). «Последствия редкого полового размножения посредством самоопыления у видов, воспроизводящихся иначе клонально» . Теоретическая популяционная биология . 80 (4): 317–322. дои : 10.1016/j.tpb.2011.08.004 . ПМК 3218209 . ПМИД 21888925 .