Лидер триптофанового оперона

Лидер триптофанового оперона
Лидер триптофанового оперона
	Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности Trp_leader
Идентификаторы
Символ	Trp_leader
Рфам	RF00513
Другие данные
РНК Тип	Цис-рег ; лидер
Домен(ы)	Бактерии
ТАК	ТАК: 0000233
PDB Структуры	ПДБе

Лидер триптофанового оперона представляет собой элемент РНК, обнаруженный на 5'-конце некоторых бактериальных триптофановых оперонов . Лидерная последовательность может образовывать две разные структуры, известные как терминатор и антитерминатор, в зависимости от количества триптофана в клетке. Лидер также кодирует очень короткую пептидную последовательность, богатую триптофаном . Структура терминатора распознается как сигнал терминации для РНК-полимеразы , и оперон не транскрибируется. Эта структура формируется, когда в клетке имеется избыток триптофана и движение рибосомы над лидерным транскриптом не затруднено. ^{[ 1 ]} При дефиците заряженной триптофанил -тРНК рибосома, транслирующая лидерный пептид, останавливается и может сформироваться антитерминаторная структура. Это позволяет РНК-полимеразе транскрибировать оперон.

Известно, что по крайней мере 6 различных аминокислотных оперонов регулируются этим ослаблением.

Trp-РНК-связывающий аттенуационный белок

Додекамер TRAP 3, Geobacillus stearothermophilus.

Для формирования терминатора необходим аттенуационный белок , связывающий trp РНК (белок TRAP) у видов Bacillus и родственных бактерий . Этот белок кодируется геном MtrB. ^{[ 2 ]} Белок TRAP образует олигомер из 11 субъединиц, который в присутствии триптофана связывается с участком РНК, содержащим 11 повторов (G/U)AG. Эта последовательность перекрывает петлю антитерминатора, таким образом, связывание TRAP предотвращает образование петли антитерминатора. Когда TRAP связывается, образуется терминаторная петля, и оперон не транскрибируется. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Белок-аттенюатор, связывающий триптофан с РНК, ингибирующий белок

Белок, ингибирующий белок-аттенюатор, связывающий РНК триптофана (белок Anti-TRAP или AT), представляет собой короткий белок, кодируемый rtpA в Bacillus. Синтез анти-TRAP индуцируется незаряженной тРНК триптофана . Анти-TRAP связывается с TRAP и ингибирует его связывание с лидером оператора триптофана. Это приводит к образованию антитерминаторной петли и транскрипции триптофанового оперона. ^{[ 3 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Колтер, Р; Янофски С (1982). «Аттенуация оперонов биосинтеза аминокислот». Анну преподобный Жене . 16 : 113–134. дои : 10.1146/annurev.ge.16.120182.000553 . ПМИД 6186194 .
^ Бабицке П., Голлник П., Янофски С. (1992). «Оперон mtrAB Bacillus subtilis кодирует GTP-циклогидролазу I (MtrA), фермент, участвующий в биосинтезе фолиевой кислоты, и MtrB, регулятор биосинтеза триптофана» . J Бактериол . 174 (7): 2059–2064. дои : 10.1128/jb.174.7.2059-2064.1992 . ПМК 205820 . ПМИД 1551827 .
^ Jump up to: ^а ^б Бабицке П., Голлник П. (2001). «Посттранскрипционный контроль метаболизма триптофана в Bacillus subtilis с помощью белка аттенуации, связывающего trp РНК (TRAP), анти-TRAP и структуры РНК» . J Бактериол . 183 (20): 5795–5802. дои : 10.1128/JB.183.20.5795-5802.2001 . ПМК 99655 . ПМИД 11566976 .
^ Бабицке П., Шаак Дж., Яхнин А.В., Бевилаква ПК (2003). «Роль структуры РНК в ослаблении транскрипции у Bacillus subtilis: оперон trpEDCFBA как модельная система». РНК-полимеразы и ассоциированные факторы, Часть D. Методы энзимологии. Том. 371. С. 392–404. дои : 10.1016/S0076-6879(03)71030-1 . ISBN 9780121822743 . ПМИД 14712717 .
^ Вальбуцци А., Янофски С. (2001). «Ингибирование регуляторного белка TRAP B. subtilis белком, ингибирующим TRAP, AT». Наука . 293 (5537): 2057–2059. Бибкод : 2001Sci...293.2057V . дои : 10.1126/science.1062187 . ПМИД 11557884 . S2CID 37923482 .
^ Вальбуцци А., Голник П., Бабицке П., Янофски С. (2002). «Аттенуационный белок, связывающий РНК-trp (Anti-TRAP), AT, распознает активируемый триптофаном РНК-связывающий домен регуляторного белка TRAP» . J Биол Хим . 277 (12): 10608–10613. дои : 10.1074/jbc.M111813200 . ПМИД 11786553 .

Внешние ссылки

Страница лидера оперона триптофана в Rfam

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Колтер, Р; Янофски С (1982). «Аттенуация оперонов биосинтеза аминокислот». Анну преподобный Жене . 16 : 113–134. дои : 10.1146/annurev.ge.16.120182.000553 . ПМИД 6186194 .

[pmid1551827-2] Бабицке П., Голлник П., Янофски С. (1992). «Оперон mtrAB Bacillus subtilis кодирует GTP-циклогидролазу I (MtrA), фермент, участвующий в биосинтезе фолиевой кислоты, и MtrB, регулятор биосинтеза триптофана» . J Бактериол . 174 (7): 2059–2064. дои : 10.1128/jb.174.7.2059-2064.1992 . ПМК 205820 . ПМИД 1551827 .

[pmid11566976-3] Jump up to: ^а ^б Бабицке П., Голлник П. (2001). «Посттранскрипционный контроль метаболизма триптофана в Bacillus subtilis с помощью белка аттенуации, связывающего trp РНК (TRAP), анти-TRAP и структуры РНК» . J Бактериол . 183 (20): 5795–5802. дои : 10.1128/JB.183.20.5795-5802.2001 . ПМК 99655 . ПМИД 11566976 .

[pmid14712717-4] Бабицке П., Шаак Дж., Яхнин А.В., Бевилаква ПК (2003). «Роль структуры РНК в ослаблении транскрипции у Bacillus subtilis: оперон trpEDCFBA как модельная система». РНК-полимеразы и ассоциированные факторы, Часть D. Методы энзимологии. Том. 371. С. 392–404. дои : 10.1016/S0076-6879(03)71030-1 . ISBN 9780121822743 . ПМИД 14712717 .

[pmid11557884-5] Вальбуцци А., Янофски С. (2001). «Ингибирование регуляторного белка TRAP B. subtilis белком, ингибирующим TRAP, AT». Наука . 293 (5537): 2057–2059. Бибкод : 2001Sci...293.2057V . дои : 10.1126/science.1062187 . ПМИД 11557884 . S2CID 37923482 .

[pmid11786553-6] Вальбуцци А., Голник П., Бабицке П., Янофски С. (2002). «Аттенуационный белок, связывающий РНК-trp (Anti-TRAP), AT, распознает активируемый триптофаном РНК-связывающий домен регуляторного белка TRAP» . J Биол Хим . 277 (12): 10608–10613. дои : 10.1074/jbc.M111813200 . ПМИД 11786553 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]