Белковый домен SWAP
Сурп | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | Сурп | ||
Пфам | PF01805 | ||
ИнтерПро | IPR000061 | ||
|
В молекулярной биологии белковый домен SWAP происходит от термина Suppressor-of-White-APricot, регулятора сплайсинга модельного организма Drosophila melanogaster . Белковый домен находится в регуляторах, контролирующих сплайсинг . Он обнаруживается при сплайсинге регуляторных белков . [ 1 ] Когда ген экспрессируется, должна ДНК транскрибироваться в информационную РНК (мРНК). Однако иногда он содержит промежуточные или прерывающие последовательности, называемые интронами . Сплайсинг мРНК помогает удалить эти последовательности, оставив более благоприятную последовательность. Сплайсинг мРНК является важным событием в посттранскрипционной модификации процессе экспрессии генов . [ 2 ] SWAP помогает контролировать этот процесс во всех клетках, кроме гамет .
Функция
[ редактировать ]Роль белкового домена SWAP заключается в контроле независимого от пола пре- мРНК процессинга в соматических клетках, то есть в каждой клетке, кроме половых клеток. Это включает в себя ауторегуляцию, посредством которой он регулирует сплайсинг своей собственной пре-мРНК. [ 3 ] Гомолог SWAP у млекопитающих действует как ген, регулируемый гормонами щитовидной железы. Это означает, что он контролируется щитовидной железой. [ 4 ] [ 5 ]
Структура
[ редактировать ]SWAP Белки имеют коллинеарную серию новых мотивов последовательностей . [ 3 ] Это означает, что они сохранились с течением времени. Белок SWAP у разных организмов имеет некоторое сходство с точки зрения последовательности и, возможно, был связан в какой-то момент эволюционной истории.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Денхез Ф., Лафиатис Р. (июнь 1994 г.). «Сохранение регулируемого альтернативного сплайсинга и идентификация функциональных доменов у позвоночных, гомологов регулятора сплайсинга дрозофилы, супрессора белого абрикоса» . Журнал биологической химии . 269 (23): 16170–9. дои : 10.1016/S0021-9258(17)33989-3 . ПМИД 8206918 .
- ^ Клэнси, Сюзанна (2008). «Сплайсинг РНК: интроны, экзоны и сплайсосомы» . Природное образование . 1 (1) . Проверено 31 марта 2011 г.
- ^ Jump up to: а б Спайкс Д.А., Крамер Дж., Бингхэм П.М., Ван Дорен К. (октябрь 1994 г.). «Регуляторы сплайсинга пре-мРНК SWAP представляют собой новое древнее семейство белков, имеющее высококонсервативный мотив последовательности с семейством конститутивных белков сплайсинга prp21» . Исследования нуклеиновых кислот . 22 (21): 4510–9. дои : 10.1093/нар/22.21.4510 . ПМК 308487 . ПМИД 7971282 .
- ^ Куадрадо А., Берналь Дж., Муньос А. (август 1999 г.). «Идентификация гомолога регулятора сплайсинга супрессора белого абрикоса у млекопитающих как гена, регулируемого гормоном щитовидной железы». Исследования мозга. Молекулярные исследования мозга . 71 (2): 332–40. дои : 10.1016/s0169-328x(99)00212-0 . ПМИД 10521587 .
- ^ Хан А., Сулковски З.Л., Чен Т., Завацкий А.М., Сайдель-Сулковска Э.М. (июнь 2012 г.). «Пол-зависимые изменения в экспрессии генов, зависящих от гормона щитовидной железы в мозжечке, после перинатального воздействия тимеросала на крыс». Журнал физиологии и фармакологии . 63 (3): 277–83. ПМИД 22791642 .