УРА3

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Оротидин-5'-фосфатдекарбоксилаза
Оротидин-5'-фосфатдекарбоксилаза
Идентификаторы
Организм	Сахаромицеты cerevisiae
Символ	УРА3
Альт. символы	YEL021W, ODCase
Входить	856692
гомологен	136914
RefSeq (мРНК)	НМ_001178836
RefSeq (защита)	НП_010893
ЮниПрот	P03962
Другие данные
Номер ЕС	4.1.1.23
хромосома	В: 0,12 - 0,12 Мб
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

URA3 — это ген на хромосоме V Saccharomyces cerevisiae (дрожжи). Его систематическое название — YEL021W . URA3 часто используется в исследованиях дрожжей в качестве «гена-маркера», то есть гена для маркировки хромосом или плазмид . URA3 кодирует оротидин-5'-фосфатдекарбоксилазу (ODCase) которая представляет собой фермент , катализирующий одну реакцию синтеза пиримидинрибонуклеотидов , (компонент РНК ). ^{[ 1 ]}

Использование в исследованиях дрожжей

Потеря активности ODCase приводит к отсутствию роста клеток, если урацил или уридин в среду не добавляют . Присутствие гена URA3 в дрожжах восстанавливает активность ODCase, облегчая рост на средах, не дополненных урацилом или уридином, тем самым позволяя отбирать дрожжи, несущие этот ген. Напротив, если 5-FOA (5-фтороротиновую кислоту) в среду добавить , активная ODCase преобразует 5-FOA в токсичное соединение ( ингибитор суицида ) 5-фторурацил, вызывающий гибель клеток, что позволяет проводить селекцию против дрожжей, несущих ген.

Поскольку URA3 допускает как положительный, так и отрицательный отбор, он был разработан в качестве генетического маркера для трансформаций ДНК и других генетических методов у бактерий и многих видов грибов. Это один из наиболее важных генетических маркеров генетической модификации дрожжей . Хотя URA3 является мощным выбираемым маркером, он имеет высокий фон. Это связано с тем, что клетки, которые улавливают мутации в URA3, также могут расти на 5-FOA. Колонии следует проверить с помощью второго анализа, такого как ПЦР, чтобы подтвердить создание нужного штамма.

Ссылки

^ Флинн П.Дж., Рис Р.Дж. (январь 1999 г.). «Активация транскрипции метаболическими интермедиатами пути биосинтеза пиримидинов» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (1): 882–8. дои : 10.1128/mcb.19.1.882 . ПМЦ 83945 . ПМИД 9858611 .

Внешние ссылки

«Ген URA3» . База данных S. cerevisiae . 2018.

[Reece-1] Флинн П.Дж., Рис Р.Дж. (январь 1999 г.). «Активация транскрипции метаболическими интермедиатами пути биосинтеза пиримидинов» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (1): 882–8. дои : 10.1128/mcb.19.1.882 . ПМЦ 83945 . ПМИД 9858611 .

[ 1 ]