Марк Уилкинс (генетик)
Марк Р. Уилкинс | |
|---|---|
| Национальность | австралийский |
| Альма-матер | Университет Маккуори |
| Известный | протеом |
| Научная карьера | |
| Учреждения | Университет Нового Южного Уэльса |
| Докторантура | Кейт Уильямс |
Марк Р. Уилкинс — австралийский учёный, которому приписывают определение концепции протеома . [1] Уилкинс — профессор Школы биотехнологии и биомолекулярных наук Университета Нового Южного Уэльса в Сиднее.
Уилкинс ввел термин «протеом» в 1994 году, когда разрабатывал эту концепцию, будучи аспирантом Университета Маккуори в Сиднее, Австралия, описывая его как «протеиновый комплемент, выраженный геномом». [2] Этот термин представляет собой обобщение концепции генома, охватывающее набор всех белков, которые могут быть произведены в геноме посредством альтернативного сплайсинга и посттранскрипционной модификации информационной РНК . [3]
Карьера
[ редактировать ]В 1995–1997 годах Уилкинс проходил постдокторскую стажировку в Женевском университете , Швейцария , работая с профессором Денисом Хохштрассером и доктором Амосом Байрохом . Он был соавтором многих инструментов анализа белков, доступных на веб-сервере ExPASy . Впоследствии он работал старшим научным сотрудником в Австралийском центре анализа протеома, который был создан правительством Австралии в 1995 году как первый в мире специализированный исследовательский центр протеома. [4]
В 1997 году он был соредактором первой книги по протеомике «Исследование протеома: новые рубежи функциональной геномики» (Wilkins et al. (eds), Springer Verlag ), которая была продана тиражом более 4000 экземпляров. [5]
Он был соучредителем протеомной компании Proteome Systems Ltd. Она была основана в январе 1999 года и зарегистрирована на Австралийской фондовой бирже в 2004 году. Доктор Уилкинс проработал в Proteome Systems полный рабочий день в течение 6 лет в качестве руководителя отдела биоинформатических исследований и исследований. Команда разработчиков тогда была главой отдела протеомики. В 2003 году он был удостоен награды IBM «Новичок года» для компаний Азиатско-Тихоокеанского региона. Proteome Systems была переименована в Tyrian Diagnostics. [6] и в конечном итоге продала свою интеллектуальную собственность. В 2007 году Уилкинс стал соучредителем компании регенеративной медицины Regeneus. [7] Эта компания разработала методы лечения остеоартрита с использованием взрослых стволовых клеток, которые сейчас проходят клинические испытания.
Уилкинс в настоящее время является профессором системной биологии в Университете Нового Южного Уэльса . [8] и является директором Инициативы системной биологии. [9] и Центр геномики Рамачиотти. [10] Он опубликовал более 200 научных статей и глав книг. [11] Его текущие исследования касаются роли метилирования белка в эукариотической клетке, использования сшивающей масс-спектрометрии (XL-MS) для анализа сетей взаимодействия белков в масштабе протеома ( интерактома ) и биоинформатического анализа данных секвенирования следующего поколения. В составе консорциума генома коалы его команда провела полное секвенирование PacBio, а затем сборку на основе Falcon, чтобы создать наиболее полный и непрерывный геном сумчатых на сегодняшний день. [12]
В 2012 году Уилкинс был удостоен научной премии Бекмана Коултера за открытие Австралийского общества биохимии и молекулярной биологии. [13] Эта премия присуждается участнику за выдающийся вклад в область биохимии и молекулярной биологии. В 2018 году Университет Нового Южного Уэльса присвоил Уилкинсу степень доктора наук.
В последнее время ему понравилось сотрудничать в проекте «Протеом человека» ( опубликовано в 2020 году ) и в проекте «Атлас РНК человека» ( опубликовано в 2021 году ).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Уилкинс, Марк Р.; Санчес, Жан-Шарль; Гули, Эндрю А.; Аппель, Рон Д.; Хамфери-Смит, Ян; Хохштрассер, Денис Ф.; Уильямс, Кейт Л. (1996). «Прогресс в реализации протеомных проектов: почему все белки, экспрессируемые геномом, должны быть идентифицированы и как это сделать» . Обзоры биотехнологии и генной инженерии . 13 (1): 19–50. дои : 10.1080/02648725.1996.10647923 . ПМИД 8948108 .
- ^ Уилкинс, Марк Р.; Паскуали, Кристиан; Аппель, Рон Д.; Оу, Кели; Голаз, Оливье; Санчес, Жан-Шарль; Ян, Цзюнь X.; Гули, Эндрю. А.; Хьюз, Грэм; Хамфери-Смит, Ян; Уильямс, Кейт Л.; Хохштрассер, Денис Ф. (1 января 1996 г.). «От белков к протеомам: крупномасштабная идентификация белков с помощью двумерного электрофореза и анализа арнинокислоты». Природная биотехнология . 14 (1): 61–65. дои : 10.1038/nbt0196-61 . ПМИД 9636313 . S2CID 25320181 .
- ^ Васингер и др. Прогресс в картировании генных продуктов Mollicutes: Mycoplasmagentium
- ^ APAF - Австралийский центр исследования протеома
- ^ Уилкинс и др. (ред.) Исследования протеома: новые рубежи функциональной геномики
- ^ " Тайриан Диагностика Pty Ltd "
- ^ Regeneus Pty Ltd.
- ^ Марк Уилкинс - профиль исследователя UNSW
- ^ Инициатива системной биологии
- ^ Центр геномики Рамачиотти
- ^ Марк Уилкинс - список публикаций UNSW
- ^ Джонсон, Р.Н.; О'Мили, Д; Чен, З; Этерингтон, Дж.Дж.; Хо, SYW; Нэш, WJ; Грюбер, CE; Ченг, Ю; Уиттингтон, CM; Деннисон, С; Пил, Э; Харти, В; О'Нил, Р.Дж.; Колган, Д; Рассел, ТЛ; Алькесар-Планас, Делавэр; Аттенброу, В.; Брэгг, Дж. Г.; Брэнди, Пенсильвания; Чонг, AY; Дикин, Дж. Э.; Ди Пальма, Ф; Дуда, З; Элдридж, MDB; Юарт, К.М.; Хогг, CJ; Франкхэм, Дж.Дж.; Жорж, А; Джиллетт, АК; Говендир, М; Гринвуд, AD; Хаякава, Т; Хелген, КМ; Хоббс, М; Холлели, CE; Хейдер, Теннесси; Джонс, Э.А.; Кинг, А; Мэдден, Д; Грейвс, ДЖЕМ; Моррис, КМ; Нивз, Ле; Патель, HR; Полкингхорн, А; Ренфри, МБ; Робин, К; Салинас, Р; Цангарас, К; Уотерс, Полицейский; Уотерс, ЮАР; Райт, Б; Уилкинс, MR; Тиммс, П; Белов, К (2018). «Адаптация и сохранение генома коалы» . Нат Жене . 50 (8): 1102–1111. дои : 10.1038/s41588-018-0153-5 . ПМК 6197426 . ПМИД 29967444 .
- ^ Награды ASBMB
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Биография Марка Уилкинса - Университет Нового Южного Уэльса
- Школа биотехнологии и биомолекулярных наук Университета Нового Южного Уэльса
- Кэрол Эззелл, « Правило белков », журнал Scientific American (апрель 2002 г.).
- Австралийский центр анализа протеома (APAF Ltd)
- Tyrian Diagnostics (ранее Proteome Systems Ltd, до 6 ноября 2008 г.)
- Инициатива системной биологии
- Описания наград ASBMB
| Международный | |
|---|---|
| Национальный | |
| академики | |
| Другой | |
