Х.Эфсун Арда

Х.Эфсун Арда
Х.Эфсун Арда
Рожденный	Хатидже Эфсун Арда
Национальность	турецкий
Альма-матер	Университет Богазичи (BS) ; Медицинская школа Массачусетского университета (доктор философии)
	Научная карьера
Поля	Биология развития ; системная биология
Учреждения	Национальный институт рака
Диссертация	К. Элеганс Сети регуляции метаболических генов (2010)
Докторантура	Мэриан Уолхаут [ Викиданные ]

Хатидже Эфсун Арда — турецкий биолог, занимающийся вопросами развития и систем, исследующий клеточные линии , которые дают начало поджелудочной железе человека, с использованием секвенирования отдельных клеток . Штадтмана Она является главным исследователем и главой группы геномики развития в Национальном институте рака .

Ранняя жизнь и образование

Хатидже Эфсун Арда проводила время со своей матерью, практикующей медсестрой , в больнице и в клинических лабораториях. Это раннее знакомство побудило ее изучать биологию и медицину. Арда получил степень бакалавра в области молекулярной биологии и генетики в Университете Богазичи . ^{[ 1 ]}

Арда получил докторскую степень. Получил степень бакалавра системной биологии в Медицинской школе Массачусетского университета . Во время учебы в докторантуре в лаборатории Мэриан Уолхаут [ Викиданные ] она изучала сети регуляции генов , которые имеют отношение к метаболизму модельного организма C. elegans . Она обнаружила набор метаболических генов , которые чувствительны к содержанию питательных веществ в C. elegans . бактериальной диете ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Постдокторские исследования

Заинтересовавшись сетями регуляции генов и биологией развития , Арда поступила в лабораторию Сына К. Кима [ Викиданные ] в Стэнфордском университете для прохождения постдокторской подготовки. Будучи научным сотрудником JDRF , она разработала сортировки клеток методы для очистки первичных клеток поджелудочной железы у детей и взрослых, а также использовала секвенирование РНК, чтобы выявить сотни генов, которые по-разному регулируются в течение первых 10 лет жизни человека , некоторые из которых связаны ассоциативными исследованиями. к риску диабета . , специфичные для типа клеток поджелудочной железы, Чтобы понять, как программы экспрессии генов контролируются на геномном уровне, она затем объединила сортировку клеток с геномными методами, такими как ATAC-Seq, чтобы очертить регуляторный ландшафт хроматина типов клеток поджелудочной железы человека. Эта работа выявила тысячи предполагаемых энхансерных областей, которые объясняют экспрессию генов, специфичных для типа клеток, в поджелудочной железе человека. ^{[ 2 ]}

В 2016 году исследование Арды показало, что бета-клетки поджелудочной железы человека продолжают созревать после рождения. Арда и его коллеги изучили экспрессию генов и профили хроматина клеток поджелудочной железы, изолированных от детей и взрослых, и обнаружили специфические программы экспрессии генов, которые активируются после 10 лет. Исследование было первым, продемонстрировавшим эти различия на глобальном уровне. команда обнаружила новые факторы, потенциально опосредующие этот процесс. ^{[ 1 ]}^{[ 4 ]}

Чтобы изучить регуляцию генома, Арда продолжил исследование элементов ДНК, которые контролируют спецификацию, идентичность и функцию клеток поджелудочной железы. Арда и соавторы создали атлас геномных элементов, специфичных для основных типов клеток поджелудочной железы человека. Она определила уникальные области в наших геномах, которые контролируют экспрессию генов, специфичных для определенного типа клеток, в клетках поджелудочной железы человека. Также выяснилось, что в этих регионах содержится больше вариантов риска заболеваний, связанных с диабетом или раком поджелудочной железы, чем в других частях человеческого генома . ^{[ 1 ]}^{[ 5 ]}

Карьера и исследования

Арда присоединился к Национальным институтам здравоохранения в 2017 году в качестве главного исследователя Штадтмана в лаборатории биологии рецепторов и экспрессии генов Национального института рака . Она возглавляет группу геномики развития. ^{[ 2 ]}

Целью лаборатории Арды является определение сетей регуляции генов, которые контролируют развитие, расширение и функционирование клеток поджелудочной железы человека. Ее исследовательская группа сочетает геномные подходы с использованием первичных клеток человека , стволовых клеток и технологий редактирования генома для создания карт регуляторных геномов, управляющих возникновением и ростом линий клеток поджелудочной железы человека . Арда характеризует клеточные линии, которые дают начало поджелудочной железе человека, используя секвенирование отдельных клеток . ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Картер, Лора Стивенсон (19 декабря 2019 г.). «Знакомство с 11 штатманами» . Программа внутренних исследований НИЗ . Проверено 5 мая 2020 г. В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Х. Эфсун Арда, доктор философии». Центр исследований рака . 25 сентября 2017 г. Проверено 5 мая 2020 г. В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
^ Арда, Х. (30 июля 2010 г.). К. Элеганс Регуляторные сети метаболических генов: Диссертация . Диссертации и диссертации ВШБН (Thesis). Медицинская школа Массачусетского университета. дои : 10.13028/9v59-hc11 .
^ Арда, Х. Эфсун; Ли, Линъюй; Цай, Дженнифер; Торре, Эдуардо А.; Росли, Йенни; Пейрис, Хешан; Спитале, Роберт С.; Дай, Чуньхуа; Гу, Сюэин; Цюй, Кун; Ван, Пей (2016). «Возрастная регуляция генов поджелудочной железы раскрывает механизмы, регулирующие функцию β-клеток человека» . Клеточный метаболизм . 23 (5): 909–920. дои : 10.1016/j.cmet.2016.04.002 . ПМЦ 4864151 . ПМИД 27133132 .
^ Арда, Х. Эфсун; Цай, Дженнифер; Росли, Йенни Р.; Гирези, Пол; Боттино, Рита; Гринлиф, Уильям Дж.; Чанг, Ховард Ю.; Ким, Сын К. (2018). «Хроматиновая основа клеточного происхождения и риска заболеваний поджелудочной железы человека» . Клеточные системы . 7 (3): 310–322.e4. дои : 10.1016/j.cels.2018.07.007 . ПМК 6347013 . ПМИД 30145115 .

Внешние ссылки

Публикации Х. Эфсуна Арды , проиндексированные Google Scholar
Публикации Х. Эфсуна Арды индексируются в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)

Эта статья включает общедоступные материалы с веб-сайтов или документов Национальных институтов здравоохранения .

[:0-1] Jump up to: ^а ^б ^с Картер, Лора Стивенсон (19 декабря 2019 г.). «Знакомство с 11 штатманами» . Программа внутренних исследований НИЗ . Проверено 5 мая 2020 г. В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .

[:1-2] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Х. Эфсун Арда, доктор философии». Центр исследований рака . 25 сентября 2017 г. Проверено 5 мая 2020 г. В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .

[3] Арда, Х. (30 июля 2010 г.). К. Элеганс Регуляторные сети метаболических генов: Диссертация . Диссертации и диссертации ВШБН (Thesis). Медицинская школа Массачусетского университета. дои : 10.13028/9v59-hc11 .

[4] Арда, Х. Эфсун; Ли, Линъюй; Цай, Дженнифер; Торре, Эдуардо А.; Росли, Йенни; Пейрис, Хешан; Спитале, Роберт С.; Дай, Чуньхуа; Гу, Сюэин; Цюй, Кун; Ван, Пей (2016). «Возрастная регуляция генов поджелудочной железы раскрывает механизмы, регулирующие функцию β-клеток человека» . Клеточный метаболизм . 23 (5): 909–920. дои : 10.1016/j.cmet.2016.04.002 . ПМЦ 4864151 . ПМИД 27133132 .

[5] Арда, Х. Эфсун; Цай, Дженнифер; Росли, Йенни Р.; Гирези, Пол; Боттино, Рита; Гринлиф, Уильям Дж.; Чанг, Ховард Ю.; Ким, Сын К. (2018). «Хроматиновая основа клеточного происхождения и риска заболеваний поджелудочной железы человека» . Клеточные системы . 7 (3): 310–322.e4. дои : 10.1016/j.cels.2018.07.007 . ПМК 6347013 . ПМИД 30145115 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]