Элемент ответа трансактивации
| Элемент ответа трансактивации (TAR) | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности mir-TAR | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-ТАР |
| Альт. Символы | ТАР |
| Рфам | RF00250 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Вирусы |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035068 ПОЙДИТЕ: 0035195 |
| ТАК | ТАК: 0000233 ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Элемент ВИЧ ответа трансактивации (TAR) представляет собой элемент РНК , который, как известно, необходим для трансактивации вирусного промотора и для репликации вируса. TAR Шпилька представляет собой динамическую структуру. [ 1 ] который действует как сайт связывания для белка Tat , и это взаимодействие стимулирует активность промотора длинного концевого повтора . [ 2 ]
Дальнейший анализ показал, что TAR представляет собой пре-микроРНК , которая продуцирует зрелые микроРНК из обеих цепей стволовой петли TAR. [ 3 ] Считается, что эти микроРНК предотвращают апоптоз инфицированных клеток путем подавления генов ERCC1 , IER3 , [ 4 ] CDK9 и Бим . [ 5 ]
Полиомавирус человека 2 ( вирус JC ) содержит гомологичную TAR последовательность в своем позднем промоторе. [ 6 ] который реагирует на Tat, полученный из ВИЧ-1. [ 7 ] [ 8 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Лу, Цзя; Кадаккужа, Бина М.; Чжао, Лян; и др. (2011). «Динамический ансамблевый взгляд на конформационный ландшафт РНК TAR ВИЧ-1 и аллостерическое распознавание». Биохимия . 50 (22): 5042–5057. дои : 10.1021/bi200495d . ПМИД 21553929 .
- ^ Кулински, Т; Олейничак М; Хатхофф Х; Белецкий Л; Пачульска-Вечорек К; Дас АТ; Берхаут Б; Адамяк Р.В. (2003). «Апикальная петля шпильки TAR РНК ВИЧ-1 стабилизируется парой оснований с перекрестной петлей» . J Биол Хим . 278 (40): 38892–38901. дои : 10.1074/jbc.M301939200 . ПМИД 12882959 .
- ^ Уэлле Д.Л., Плант И., Лэндри П. и др. (апрель 2008 г.). «Идентификация функциональных микроРНК, высвобождаемых в результате асимметричного процессинга элемента TAR ВИЧ-1» . Нуклеиновые кислоты Рез . 36 (7): 2353–2365. дои : 10.1093/нар/gkn076 . ПМК 2367715 . ПМИД 18299284 .
- ^ Клас З., Виноград Р., Дэвис Дж. и др. (2009). «МиРНК TAR ВИЧ-1 защищает от апоптоза, изменяя экспрессию клеточных генов» . Ретровирусология . 6:18 . дои : 10.1186/1742-4690-6-18 . ПМЦ 2654423 . ПМИД 19220914 .
- ^ Нарайанан, А; Иорданский, С; Дас, Р; Ван Дейн, Р; Сантос, С; Яворски, Э; Гендель, я; Сэмпи, Г; Далби, Э; Иглесиас-Юссель, М; Попратилов А; Хаками, Р; Кен-Холл, К; Янг, М; Субра, К; Гилберт, К; Бейли, К; Ромерио, Ф; Кашанчи, Ф (5 июля 2013 г.). «Экзосомы, полученные из клеток, инфицированных ВИЧ-1, содержат РНК элемента ответа на трансактивацию» . Журнал биологической химии . 288 (27): 20014–20033. дои : 10.1074/jbc.m112.438895 . ПМК 3707700 . ПМИД 23661700 .
- ^ Чоудхури, Машиул; Тейлор, Дж. Пол; Чанг, Чун-Фан; Раппапорт, Джей; Халили, Камель (1992). «Доказательства того, что последовательность, подобная TAR, важна для индукции позднего промотора вируса JC Tat вируса иммунодефицита человека типа 1» . Журнал вирусологии . 66 (12): 7355–7361. doi : 10.1128/jvi.66.12.7355-7361.1992 . ПМК 240440 . ПМИД 1331525 .
- ^ Нукудзума, Соичи; Камеока, Масанори; Сугиура, Сигеки; Накамичи, Кадзуо; Нукудзума, Тиёко; Миёси, Исао; Такегами, Цутому (2012). «Экзогенный белок вируса иммунодефицита человека-1, Tat, эффективно усиливает репликацию вируса JC в клеточных линиях нейробластомы». Журнал медицинской вирусологии . 84 (4): 555–561. дои : 10.1002/jmv.23239 . ПМИД 22337293 . S2CID 35625307 .
- ^ Крачмаров, Чавдар П.; Чепеник, Лара Г.; Барр-Вагель, Шэрон; Халили, Камель; Джонсон, Эдвард М. (1996). «Активация Tat-чувствительного элемента контроля транскрипции вируса JC путем ассоциации белка Tat вируса иммунодефицита человека 1 с клеточным белком Purα» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (24): 14112–14117. Бибкод : 1996PNAS...9314112K . дои : 10.1073/pnas.93.24.14112 . ПМК 34556 . ПМИД 8943069 .
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |