Метилацидифилум ад

Метилацидифилум ад
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Verrucomicrobiota
Сорт:	Неклассифицированный
Заказ:	Метилацидифилалы
Семья:	Метилацидифилацеа
Род:	Метилацидифил
Разновидность:	Маркус, черт возьми
Биномиальное название
	Метилацидифилум ад ; Hou et al. 2008
Тип напряжения
	Изолят v4
Синонимы
	Methylokorus Infernorum Dunfield et al. 2007 ; Штамм V4 Dunfield et al. 2007 ; Кандидат Methylacidiphilum Hell Hou et al.

Methylacidiphilum infernorum является чрезвычайно ацидофильным метанотрофным аэробными бактериями, сначала изолированными и описанными в 2007 году, выращивая на почве и отложениях у ворот ада , Новая Зеландия . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Подобные организмы также были выделены из геотермальных мест в Италии и России .

Полиэкстримофил , эти немотильные стержни растут оптимально при pH между 2,0 и 2,5 и температурой 60 ° C. Это метанотрофные обязанные бактерии, которые растут на 25% (об./Об.) Метана в воздухе. Он также очень зависит от концентраций углекислого газа , оптимально при 8% (об./Об.) CO ₂ в воздухе. ^{[ 1 ]}

Благодаря своей классификации в филоме verrucomicrobiota и его экстремального ацидофильного фенотипа M. infernorum является уникальным между всеми известными метанотрофами . ^{[ 1 ]}

Биология

Геном

Он имеет единую круговую хромосому из 2287 145 пар оснований . При анализе генома было обнаружено, что M. infernorum может использовать новый метилотрофический путь , потому что он кодирует ферменты метана монооксигеназы , но не хватает известных генетических модулей для метанола и формальдегида окисления. ^{[ 1 ]}^{[ 4 ]}

Все ферменты, необходимые для цикла Кэлвина Бенсона Бассма, были идентифицированы с помощью генетического анализа. ^{[ 5 ]}

Метаболизм

Было предсказано, что M. infernorum обладает большинством ключевых метаболических путей для биосинтеза всех аминокислот, нуклеотидов и кофакторов, за исключением кофактора кобаламина . ^{[ 5 ]}

Генетические исследования показали, что ферменты, которые они используют в нескольких метаболических путях, различаются от тех, которые используются другими метилотрофами, как, например, в биосинтезе ароматических аминокислот, биосинтез липоечной кислоты, цикл мочевины и в количестве и разнообразии кодируемых транспортеров. ^{[ 5 ]}

Бактерии способны противодействовать экстремальным кислотным средам благодаря присутствию различных ферментов, таких как глутамат декарбоксилаза , глутамат/γ-аминобутират антипортер, аргинин декарбоксилаза и антипортер аргинина/агматина. ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Петр Д. и др. (2007). «Окисление метана чрезвычайно ацидофильной бактерией филома Verrucomicrobia». Природа . 450 (7171): 879–882. Bibcode : 2007natur.450..879d . doi : 10.1038/nature06411 . PMID 18004300 . S2CID 4305258 .
^ Ноэль Р. Криг; Вольфганг Людвиг; Уильям Уитмен; Брайан П. Хедлунд; Брюс Дж. Пастер; Джеймс Т. Стейли; Наоми Уорд; Даниэль Браун, ред. (2011). Руководство по систематической бактериологии Берджи: том 4: бактериоиды, спирочэты, тенерики (молликуты), ацидобактерии, фибробактер, фузобактерии, диктиогломи, гемматимонадеты, лентисфейра, веррук -эйфубия, и пленка . Springer Science & Business Media. С. 795–6. ISBN 978-0-387-68572-4 .
^ Malgorzata Pawlowska (22 апреля 2014 г.). Смягчение выбросов газа свалочка . CRC Press . п. 64. ISBN 978-0-415-63077-1 .
^ Хансон Р., Хансон Т. (1996). «Метанотрофные бактерии» . Микробиол. Преподобный 60 (2): 439–471. doi : 10.1128/mmbr.60.2.439-471.1996 . PMC 239451 . PMID 8801441 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Hou S, et al. (2008). «Полная последовательность генома чрезвычайно ацидофильной изоляции метанотрофа V4, метилацидифилум infernorum , представитель бактериальной филома Verrucomicrobia» . Биол. Прямой . 3 (26): 26. doi : 10.1186/1745-6150-3-26 . PMC 2474590 . PMID 18593465 .

Внешние ссылки

Methylacidiphilum infernorum на Hamat (высококачественная автоматизированная и ручная аннотация белков)

[((Dunfield1))-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Петр Д. и др. (2007). «Окисление метана чрезвычайно ацидофильной бактерией филома Verrucomicrobia». Природа . 450 (7171): 879–882. Bibcode : 2007natur.450..879d . doi : 10.1038/nature06411 . PMID 18004300 . S2CID 4305258 .

[KriegLudwig2011-2] Ноэль Р. Криг; Вольфганг Людвиг; Уильям Уитмен; Брайан П. Хедлунд; Брюс Дж. Пастер; Джеймс Т. Стейли; Наоми Уорд; Даниэль Браун, ред. (2011). Руководство по систематической бактериологии Берджи: том 4: бактериоиды, спирочэты, тенерики (молликуты), ацидобактерии, фибробактер, фузобактерии, диктиогломи, гемматимонадеты, лентисфейра, веррук -эйфубия, и пленка . Springer Science & Business Media. С. 795–6. ISBN 978-0-387-68572-4 .

[Pawlowska2014-3] Malgorzata Pawlowska (22 апреля 2014 г.). Смягчение выбросов газа свалочка . CRC Press . п. 64. ISBN 978-0-415-63077-1 .

[4] Хансон Р., Хансон Т. (1996). «Метанотрофные бактерии» . Микробиол. Преподобный 60 (2): 439–471. doi : 10.1128/mmbr.60.2.439-471.1996 . PMC 239451 . PMID 8801441 .

[((Hou1))-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Hou S, et al. (2008). «Полная последовательность генома чрезвычайно ацидофильной изоляции метанотрофа V4, метилацидифилум infernorum , представитель бактериальной филома Verrucomicrobia» . Биол. Прямой . 3 (26): 26. doi : 10.1186/1745-6150-3-26 . PMC 2474590 . PMID 18593465 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]