Метилотроф
Метилотрофы — это разнообразная группа микроорганизмов , которые могут использовать восстановленные одноуглеродные соединения, такие как метанол или метан , в качестве источника углерода для своего роста; и многоуглеродные соединения, не содержащие углерод-углеродных связей, такие как диметиловый эфир и диметиламин . В эту группу микроорганизмов входят также микроорганизмы, способные усваивать восстановленные одноуглеродные соединения посредством углекислого газа по рибулозо-бифосфатному пути. [1] Эти организмы не следует путать с метаногенами, которые, наоборот, производят метан как побочный продукт из различных одноуглеродных соединений, таких как углекислый газ. Некоторые метилотрофы могут разлагать , вызывающий парниковый эффект метан , и в этом случае их называют метанотрофами . Обилие, чистота и низкая цена метанола по сравнению с обычно используемыми сахарами делают метилотрофов компетентными организмами для производства аминокислот , витаминов, рекомбинантных белков, одноклеточных белков , коферментов и цитохромов .
Метаболизм
[ редактировать ]Ключевым промежуточным продуктом метилотрофного метаболизма является формальдегид, который может направляться либо по ассимиляционным, либо по диссимиляционным путям. [2] Метилотрофы производят формальдегид путем окисления метанола и/или метана. Для окисления метана необходим фермент метанмонооксигеназа ( ММО ). [3] [4] Метилотрофы с этим ферментом получили название метанотрофы . Окисление метана (или метанола) может носить ассимиляционный или диссимиляционный характер (см. рисунок). В случае диссимиляции промежуточный формальдегид полностью окисляется до для производства восстановителя и энергии. [5] [6] В случае ассимиляции формальдегидный промежуточный продукт используется для синтеза 3-углерода ( ) соединение для производства биомассы. [2] [7] Многие метилотрофы используют многоуглеродные соединения для анаболизма, тем самым ограничивая использование формальдегида диссимиляционными процессами, однако метанотрофы обычно ограничиваются только метаболизм. [2] [5]
Одноуглеродные соединения | Химическая формула | Многоуглеродные соединения | Химическая формула |
---|---|---|---|
Окись углерода | Диметиловый эфир | ||
Формальдегид | Диметиламин | ||
формамид | Диметилсульфид | ||
Муравьиная кислота | Тетраметиламмоний | ||
Метан | Триметиламин | ||
Метанол | Триметиламин N -оксид | ||
Метиламин | Триметилсуфоний | ||
Метилгалогенид |
Катаболизм
[ редактировать ]Метилотрофы используют цепь переноса электронов для сохранения энергии, получаемой в результате окисления соединения. В метанотрофном метаболизме необходим дополнительный этап активации, чтобы обеспечить разложение химически стабильного метана. Это окисление до метанола катализируется ММО, в состав которого входит один атом кислорода из в метан и восстанавливает другой атом кислорода до воды, что требует двух эквивалентов восстановительной мощности. [4] [5] Затем метанол окисляется до формальдегида под действием метанолдегидрогеназы ( МДГ ) в бактериях. [12] или неспецифическая алкогольоксидаза у дрожжей. [13] Электроны от окисления метанола передаются мембраносвязанному хинону цепи переноса электронов с образованием . [14]
В диссимиляционных процессах формальдегид полностью окисляется до и выводится. Формальдегид окисляется до формиата под действием формальдегиддегидрогеназы ( FALDH ), которая доставляет электроны непосредственно к связанному с мембраной хинону цепи переноса электронов, обычно цитохрому b или c. [2] [5] В случае ассоциированные дегидрогеназы, производится. [7]
Наконец, формиат окисляется до цитоплазматической или мембраносвязанной формиатдегидрогеназой ( ФДГ ), производящей [15] и .
Анаболизм
[ редактировать ]Основной метаболической проблемой метилотрофов является ассимиляция отдельных углеродных единиц в биомассу. Посредством синтеза de novo метилотрофы должны образовывать углерод-углеродные связи между 1-углеродом ( ) молекулы. Это энергоемкий процесс, которого факультативные метилотрофы избегают, используя ряд более крупных органических соединений. [16] Однако облигатные метилотрофы должны ассимилировать молекулы. [2] [5] Существует четыре различных пути ассимиляции, объединенных общей темой: создание одного. молекула. [2] Бактерии используют три из этих путей. [7] [11] в то время как грибы используют один. [17] Все четыре пути включают в себя 3 молекулы на многоуглеродные промежуточные соединения, а затем расщепляют одно промежуточное соединение на новое молекула. Остальные промежуточные соединения перегруппировываются для регенерации исходных многоуглеродных промежуточных продуктов.
Бактерии
[ редактировать ]Каждый вид метилотрофных бактерий имеет один доминирующий путь ассимиляции. [5] Тремя охарактеризованными путями ассимиляции углерода являются рибулозо-монофосфатный (RuMP) и сериновый пути ассимиляции формальдегида, а также рибулозо-бисфосфатный (RuBP) путь ассимиляции CO 2 . [2] [7] [11] [18]
Цикл рибулозо-бисфосфата (RuBP)
[ редактировать ]В отличие от других путей ассимиляции, бактерии, использующие путь RuBP, получают весь органический углерод из ассимиляция. [5] [19] Этот путь был впервые обнаружен у фотосинтезирующих автотрофов и более известен как цикл Кальвина. [19] [20] Вскоре после этого метилотрофные бактерии, которые могли расти на пониженной соединения были обнаружены с помощью этого пути. [21]
Сначала 3 молекулы рибулозо-5-фосфата фосфорилируются до рибулозо-1,5-бисфосфата ( РБФ ). Фермент рибулозобисфосфаткарбоксилаза ( RuBisCO ) карбоксилирует эти молекулы RuBP, в результате чего образуется 6 молекул 3-фосфоглицерата ( PGA ). Фермент фосфоглицераткиназа фосфорилирует PGA в 1,3-дифосфоглицерат (DPGA). Восстановление 6 DPGA ферментом глицеральдегидфосфатдегидрогеназой приводит к образованию 6 молекул соединение глицеральдегид-3-фосфат ( ГАП ). Одна молекула GAP направляется в биомассу, а остальные 5 молекул регенерируют 3 молекулы рибулозо-5-фосфата. [7] [20]
Цикл рибулозомонофосфата (РуМП)
[ редактировать ]Новый путь был заподозрен, когда RuBisCO не был обнаружен у метанотрофа Mmethylmonas methanica . [22] В ходе экспериментов по радиомечению было показано, что M. methanica использует путь монофата рибулозы (RuMP). Это побудило исследователей предположить, что цикл RuMP мог предшествовать циклу RuBP. [5]
Как и цикл RuBP, этот цикл начинается с 3 молекул рибулозо-5-фосфата. Однако вместо фосфорилирования рибулозо-5-фосфата 3 молекулы формальдегида образуют связь CC посредством альдольной конденсации, образуя 3 молекулы 3-гексулозо-6-фосфата (гексулозофосфата). Одна из этих молекул фосфата гексулозы превращается в GAP и либо пируват , либо дигидроксиацетонфосфат ( DHAP ). Пируват или DHAP используется для получения биомассы, в то время как две другие молекулы гексулозофосфата и молекула GAP используются для регенерации трех молекул рибулозо-5-фосфата. [6] [22]
Сериновый цикл
[ редактировать ]В отличие от других путей ассимиляции, сериновый цикл использует в качестве промежуточных продуктов карбоновые кислоты и аминокислоты вместо углеводов. [5] [23] Сначала к 2 молекулам аминокислоты глицина добавляются 2 молекулы формальдегида . В результате образуются две молекулы аминокислоты серина , ключевого промежуточного продукта этого пути. Эти молекулы серина в конечном итоге производят 2 молекулы 2-фосфоглицерата , причем одна молекула движется к биомассе, а другая используется для регенерации глицина. Примечательно, что для регенерации глицина требуется молекула кроме того, поэтому сериновый путь также отличается от трех других путей тем, что ему требуется как формальдегид, так и . [22] [23]
Дрожжи
[ редактировать ]Метилотрофный метаболизм дрожжей отличается от метаболизма бактерий прежде всего на основе используемых ферментов и пути ассимиляции углерода. В отличие от бактерий, использующих бактериальную МДГ, метилотрофные дрожжи окисляют метанол в своих пероксисомах неспецифической алкогольоксидазой. При этом образуется формальдегид, а также перекись водорода. [24] [25] Компартментализация этой реакции в пероксисомах, вероятно, изолирует образующуюся перекись водорода. Каталаза вырабатывается в пероксисомах для борьбы с этим вредным побочным продуктом. [17] [24]
Цикл дигидроксиактеона (ДГК)
[ редактировать ]Путь дигидроксиацетона (DHA), также известный как путь ксилулозомонофосфата (XuMP), обнаружен исключительно у дрожжей. [24] [26] Этот путь ассимилирует три молекулы формальдегида в 1 молекулу DHAP с использованием 3 молекул ксилулозо-5-фосфата в качестве ключевого промежуточного продукта.
ДГК-синтаза действует как трансфераза (транскетолаза), перенося часть ксилулозо-5-фосфата в ДГК. Затем эти три молекулы DHA фосфорилируются до DHAP триокиназой . Как и другие циклы, 3 молекулы производятся, причем 1 молекула направляется для использования в качестве клеточного материала. Остальные 2 молекулы используются для регенерации ксилулозо-5-фосфата. [27]
Экологические последствия
[ редактировать ]Будучи ключевыми игроками в углеродном цикле , метилотрофы работают над снижением глобального потепления, прежде всего за счет поглощения метана и других парниковых газов. В водной среде метаногенные археи производят 40-50% мирового метана. Симбиоз метаногенов и метанотрофных бактерий значительно снижает количество метана, выбрасываемого в атмосферу. [28]
Этот симбиоз важен и в морской среде. Морские бактерии очень важны для пищевых сетей и биогеохимических циклов , особенно в прибрежных поверхностных водах, а также в других ключевых экосистемах, таких как гидротермальные источники . Имеются данные о широко распространенных и разнообразных группах метилотрофов в океане, которые потенциально могут оказать существенное воздействие на морские и устьевые экосистемы. [29] Одноуглеродные соединения, используемые метилотрофами в качестве источника углерода и энергии, встречаются по всему океану. Эти соединения включают метан , метанол , метилированные амины , метилгалогениды и соединения метилированной серы, такие как диметилсульфид (ДМС) и диметилсульфоксид ( ДМСО ). [30] Некоторые из этих соединений производятся фитопланктоном , а некоторые поступают из атмосферы. Исследования, включающие более широкий спектр одноуглеродных субстратов, обнаружили увеличение разнообразия метилотрофов, что позволяет предположить, что разнообразие этой группы бактерий еще не полностью изучено. [30]
Поскольку эти соединения летучие и влияют на климат и атмосферу, исследования взаимодействия этих бактерий с одноуглеродными соединениями также могут помочь понять потоки этих соединений из воздуха в море, которые влияют на прогнозы климата. [31] [29] Например, неясно, действует ли океан как чистый источник или поглотитель атмосферного метанола, но разнообразные метилотрофы используют метанол в качестве основного источника энергии. Было обнаружено, что в некоторых регионах метилотрофы являются чистым поглотителем метанола. [32] в то время как в других было обнаружено, что продукт деятельности метилотрофов, метиламин , выделяется из океана и образует аэрозоли. [29] Чистое направление этих потоков зависит от использования метилотрофами.
Исследования показали, что метилотрофная способность варьируется в зависимости от продуктивности системы, поэтому воздействие метилотрофии, вероятно, носит сезонный характер. Поскольку некоторые из одноуглеродных соединений, используемых метилотрофами, такие как метанол и ТМАО , производятся фитопланктоном, их доступность будет меняться во времени и сезонно в зависимости от цветения фитопланктона , погодных явлений и других факторов воздействия экосистемы. [33] Это означает, что метилотрофный метаболизм, как ожидается, будет следовать аналогичной динамике, что затем повлияет на биогеохимические циклы и потоки углерода. [29]
Воздействия метилотрофов были также обнаружены в глубоководных гидротермальных источниках . Метилотрофы, наряду с окислителями серы и окислителями железа, экспрессируют ключевые белки, связанные с фиксацией углерода . [34] Подобные исследования будут способствовать дальнейшему пониманию глубоководного круговорота углерода и связи между глубоководным и поверхностным круговоротом углерода. Распространение технологий омики ускорило исследования разнообразия метилотрофов, их численности и активности в различных экологических нишах , а также их межвидовых взаимодействий. [35] Необходимо провести дальнейшие исследования этих бактерий и общего эффекта сокращения численности бактерий и трансформации одноуглеродных соединений в океане. Имеющиеся данные указывают на потенциально существенную роль метилотрофов в океане в круговороте углерода, а также потенциально в глобальных циклах азота, серы и фосфора, а также в потоке соединений углерода из воздуха в море, что может иметь глобальные климатические последствия. [31]
Использование метилотрофов в сельскохозяйственном секторе — еще один способ потенциального воздействия на окружающую среду. Традиционные химические удобрения поставляют питательные вещества, которые трудно получить из почвы, но они могут оказывать негативное воздействие на окружающую среду, а их производство обходится дорого. [36] Метилотрофы обладают высоким потенциалом в качестве альтернативных биоудобрений и биоинокулянтов благодаря их способности формировать мутуалистические отношения с несколькими видами растений. [37] Метилотрофы снабжают растения питательными веществами, такими как растворимый фосфор и фиксированный азот, а также играют роль в поглощении указанных питательных веществ. [36] [37] Кроме того, они могут помочь растениям реагировать на стрессовые факторы окружающей среды посредством производства фитогормонов . [36] Метилотрофный рост также подавляет рост вредных патогенов растений и вызывает системную устойчивость. [37] Было показано, что метилотрофные биоудобрения, используемые отдельно или вместе с химическими удобрениями, повышают как урожайность, так и качество сельскохозяйственных культур без потери питательных веществ. [36]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Энтони, К. «Биохимия метилотрофов». Академическая пресса, 1982, с. 2-3
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Юримото, Хироя; Като, Нобуо; Сакаи, Ясуёси (1 января 2005 г.). «Ассимиляция, диссимиляция и детоксикация формальдегида, центрального промежуточного продукта метилотрофного метаболизма». Химическая запись . 5 (6): 367–375. дои : 10.1002/tcr.20056 . ISSN 1528-0691 . ПМИД 16278835 .
- ^ Нгуен, Нгок-Лой; Ю, Вун Чон; Ян, Хе Ён; Ким, Чен Гёль; Юнг, Человек-Янг; Пак, Су-Дже; Ро, Сон Вун; Ри, Сон Гын (28 сентября 2017 г.). «Новый метанотроф рода Mmethylomonas, который содержит отдельную кладу растворимой метанмонооксигеназы». Журнал микробиологии . 55 (10): 775–782. дои : 10.1007/s12275-017-7317-3 . ПМИД 28956349 . S2CID 5004714 .
- ^ Перейти обратно: а б Росс, Мэтью О.; Розенцвейг, Эми К. (01 апреля 2017 г.). «Сказка о двух метанмонооксигеназах» . Журнал биологической неорганической химии . 22 (2–3): 307–319. дои : 10.1007/s00775-016-1419-y . ISSN 0949-8257 . ПМЦ 5352483 . ПМИД 27878395 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я Хэнсон, РС; Хэнсон, TE (1 июня 1996 г.). «Метанотрофные бактерии» . Микробиологические обзоры . 60 (2): 439–471. дои : 10.1128/мр.60.2.439-471.1996 . ISSN 1092-2172 . ПМК 239451 . ПМИД 8801441 .
- ^ Перейти обратно: а б Ворхольт, Джулия А. (01 октября 2002 г.). «Кофактор-зависимые пути окисления формальдегида у метилотрофных бактерий». Архив микробиологии . 178 (4): 239–249. Бибкод : 2002ArMic.178..239В . дои : 10.1007/s00203-002-0450-2 . ISSN 0302-8933 . ПМИД 12209256 . S2CID 22031009 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Дж. Колби; Х. Далтон; Уиттенбери и Р. (1979). «Биологические и биохимические аспекты роста микроорганизмов на соединениях C1». Ежегодный обзор микробиологии . 33 (1): 481–517. дои : 10.1146/annurev.mi.33.100179.002405 . ПМИД 386931 .
- ^ Оремленд, Рональд С .; Киене, Рональд П.; Матрани, Индра; Уитакар, Майкл Дж.; Бун, Дэвид Р. (1 апреля 1989 г.). «Описание эстуарного метилотрофного метаногена, растущего на диметилсульфиде» . Прикладная и экологическая микробиология . 55 (4): 994–1002. Бибкод : 1989ApEnM..55..994O . дои : 10.1128/АЕМ.55.4.994-1002.1989 . ISSN 0099-2240 . ПМК 184236 . ПМИД 16347900 .
- ^ Холмс, Эндрю Дж.; Келли, ДП; Бейкер, Саймон К.; Томпсон, AS; Марко, Паоло Де; Кенна, Элизабет М.; Мюррелл, Дж. Колин (1 января 1997 г.). «Mmethylosulfonomonas methylovora gen. nov., sp. nov. и Marinosulfonomonas methylotropa gen. nov., sp. nov.: новые метилотрофы, способные расти на метансульфоновой кислоте». Архив микробиологии . 167 (1): 46–53. Бибкод : 1997ArMic.167...46H . дои : 10.1007/s002030050415 . ISSN 0302-8933 . ПМИД 9000341 . S2CID 7060466 .
- ^ Келли, Дон П.; Бейкер, Саймон К.; Трикетт, Джим; Дэйви, Маргарет; Мюррелл, Дж. Колин (1994). «Утилизация метансульфоната новой метилотрофной бактерией осуществляется с помощью необычной монооксигеназы» . Микробиология . 140 (6): 1419–1426. дои : 10.1099/00221287-140-6-1419 .
- ^ Перейти обратно: а б с Фирсова Юлия; Доронина, Нина; Ланг, Эльке; Спроер, Катрин; Вийомье, Стефан; Троценко, Юрий (2009). «Ancylobacter dichromethanicus sp. nov. - новая аэробная факультативно метилотрофная бактерия, утилизирующая дихлорметан». Систематическая и прикладная микробиология . 32 (4): 227–232. Бибкод : 2009СиАпМ..32..227F . дои : 10.1016/j.syapm.2009.02.002 . ПМИД 19346095 .
- ^ Дуин, Джа; Фрэнк, Дж.; Беркхаут, Mpj (26 марта 1984 г.). «НАД-зависимая, PQQ-содержащая метанолдегидрогеназа: бактериальная дегидрогеназа в мультиферментном комплексе» . Письма ФЭБС . 168 (2): 217–221. Бибкод : 1984FEBSL.168..217D . дои : 10.1016/0014-5793(84)80249-5 . ISSN 1873-3468 . ПМИД 6373362 .
- ^ Мюррей, Уильям Д.; Дафф, Шелдон Дж.Б.; Лантье, Патрисия Х. (1 ноября 1989 г.). «Индукция и стабильность алкогольоксидазы в метилотрофных дрожжах Pichia Pastoris». Прикладная микробиология и биотехнология . 32 (1): 95–100. дои : 10.1007/BF00164829 . ISSN 0175-7598 . S2CID 29012249 .
- ^ Версевельд, Х.В. Ван; Стаутхамер, АХ (1 июля 1978 г.). «Электронно-транспортная цепь и связанное окислительное фосфорилирование у Paracoccus denitrificans, выращенного в метаноле». Архив микробиологии . 118 (1): 13–20. Бибкод : 1978ArMic.118...13В . дои : 10.1007/BF00406068 . ISSN 0302-8933 . ПМИД 29587 . S2CID 20362810 .
- ^ Чистосердова Людмила; Кроутер, Грегори Дж.; Ворхольт, Джулия А.; Сковран, Элизабет; Портэ, Жан-Шарль; Лидстрем, Мэри Э. (15 декабря 2007 г.). «Идентификация четвертой формиатдегидрогеназы в Mmethylobacterium extorquens AM1 и подтверждение существенной роли окисления формиата в метилотрофии» . Журнал бактериологии . 189 (24): 9076–9081. дои : 10.1128/jb.01229-07 . ISSN 0021-9193 . ПМК 2168636 . ПМИД 17921299 .
- ^ Рид, Уильям М.; Дуган, Патрик Р. (1987). «Выделение и характеристика факультативной метилотрофной микобактерии ID-Y» . Микробиология . 133 (5): 1389–1395. дои : 10.1099/00221287-133-5-1389 . ПМИД 3655742 .
- ^ Перейти обратно: а б ван дер Клей, Ида Дж.; Юримото, Хироя; Сакаи, Ясуёси; Винхейс, Мартен (2006). «Значение пероксисом в метаболизме метанола у метилотрофных дрожжей» (PDF) . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1763 (12): 1453–1462. дои : 10.1016/j.bbamcr.2006.07.016 . ПМИД 17023065 . S2CID 17710312 .
- ^ ТЕЙЛОР, СТИВЕН С.; ДАЛТОН, ГОВАРД; ДОУ, КРОУФОРД С. (1981). «Рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилаза/оксигеназа и ассимиляция углерода у Mmethylococcus capsulatus (Bath)» . Микробиология . 122 (1): 89–94. дои : 10.1099/00221287-122-1-89 .
- ^ Перейти обратно: а б Рейнс, Кристин А. (1 января 2003 г.). «Возвращение к циклу Кальвина». Исследования фотосинтеза . 75 (1): 1–10. дои : 10.1023/А:1022421515027 . ISSN 0166-8595 . ПМИД 16245089 . S2CID 21786477 .
- ^ Перейти обратно: а б Шампиньи, Мария-Луиза; Висмут, Эвелин (1 января 1976 г.). «Роль фотосинтетического переноса электронов в световой активации ферментов цикла Кальвина». Физиология Плантарум . 36 (1): 95–100. дои : 10.1111/j.1399-3054.1976.tb05034.x . ISSN 1399-3054 .
- ^ Тейлор, Стивен; Далтон, Ховард; Доу, Кроуфорд (1 июля 1980 г.). «Очистка и первоначальная характеристика рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилазы из Mmethylococcus capsulatus (Bath)» . Письма FEMS по микробиологии . 8 (3): 157–160. дои : 10.1016/0378-1097(80)90021-x .
- ^ Перейти обратно: а б с Куэйл, младший (1 февраля 1980 г.). «Микробная ассимиляция соединений C1». Труды Биохимического общества . 8 (1): 1–10. дои : 10.1042/bst0080001 . ISSN 0300-5127 . ПМИД 6768606 .
- ^ Перейти обратно: а б Чистосердова Л.В.; Лидстрем, Мэн (1 декабря 1994 г.). «Генетика серинового цикла у Mmethylobacterium extorquens AM1: идентификация, последовательность и мутация трех новых генов, участвующих в ассимиляции C1: orf4, mtkA и mtkB» . Журнал бактериологии . 176 (23): 7398–7404. дои : 10.1128/jb.176.23.7398-7404.1994 . ISSN 0021-9193 . ЧВК 197134 . ПМИД 7961516 .
- ^ Перейти обратно: а б с Юримото, Хироя; Оку, Масахидэ; Сакаи, Ясуёси (2011). «Метилотрофия дрожжей: метаболизм, регуляция генов и гомеостаз пероксисом» . Международный журнал микробиологии . 2011 : 101298. дои : 10.1155/2011/101298 . ISSN 1687-918X . ПМК 3132611 . ПМИД 21754936 .
- ^ Гончар, Михаил; Майдан, Николай; Корпан, Ярослав; Сибирский, Владимир; Котылак, Збигнев; Сибирский, Андрей (01 августа 2002 г.). «Метаболически сконструированные метилотрофные дрожжевые клетки и ферменты как сенсорные элементы биораспознавания» . Исследование дрожжей FEMS . 2 (3): 307–314. дои : 10.1016/s1567-1356(02)00124-1 . ISSN 1567-1356 . ПМИД 12702280 .
- ^ Глисон, Массачусетс; Садбери, ЧП (1 марта 1988 г.). «Метилотрофные дрожжи». Дрожжи . 4 (1): 1–15. дои : 10.1002/да.320040102 . ISSN 1097-0061 . S2CID 85256824 .
- ^ УЭЙТС, MJ; КУЭЙЛ-МЛАДШИЙ (1981). «Взаимосвязь между активностью транскетолазы и дигидроксиацетонсинтазы у метилотрофных дрожжей Candida boidinii» . Микробиология . 124 (2): 309–316. дои : 10.1099/00221287-124-2-309 . ПМИД 6276498 .
- ^ Гийом Боррель, Дидье Жезекель, Корин Бидер-Пти, Николь Морель-Дезрозье, Жан-Пьер Морель, Пьер Пейре, Жерар Фонти, Анн-Катрин Леур, Производство и потребление метана в экосистемах пресноводных озер, В исследованиях в области микробиологии, Том 16 , выпуск 9, 2011 г., страницы 832–847, ISSN 0923–2508, https://doi.org/10.1016/j.resmic.2011.06.004 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Динаске, Жюли; Тиирола, Марья; Азам, Фарук (2018). «Обогащение бактериопланктона, способного утилизировать одноуглеродные и метилированные соединения в прибрежной зоне Тихого океана» . Границы морской науки . 5 : 307. дои : 10.3389/fmars.2018.00307 . ISSN 2296-7745 .
- ^ Перейти обратно: а б Нойфельд, Джош Д.; Боден, Рич; Муссар, Элен; Шефер, Хендрик; Мюррелл, Дж. Колин (1 декабря 2008 г.). «Субстратно-специфичные клады активных морских метилотрофов, связанных с цветением фитопланктона в прибрежной среде с умеренным климатом» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (23): 7321–7328. Бибкод : 2008ApEnM..74.7321N . дои : 10.1128/АЕМ.01266-08 . ПМЦ 2592898 . ПМИД 18849453 .
- ^ Перейти обратно: а б Фария, Дафна; Бхарати, П.А. Лока (2006). «Морские и эстуарные метилотрофы: их численность, активность и идентичность» . Современная наука . 90 (7): 984–989. ISSN 0011-3891 . JSTOR 24091957 .
- ^ Ян, М.; Бил, Р.; Лисс, П.; Джонсон, М.; Бломквист, Б.; Найтингейл, П. (24 июля 2014 г.). «Воздухо-морские потоки кислородсодержащих летучих органических соединений через Атлантический океан» . Химия и физика атмосферы . 14 (14): 7499–7517. Бибкод : 2014ACP....14.7499Y . дои : 10.5194/acp-14-7499-2014 . hdl : 1969.1/184735 . ISSN 1680-7316 .
- ^ Бил, Рэйчел; Лисс, Питер С.; Диксон, Джоанна Л.; Найтингейл, Филип Д. (7 ноября 2011 г.). «Количественное определение кислородсодержащих летучих органических соединений в морской воде методом реакции переноса протона на входе в мембрану/масс-спектрометрии» . Аналитика Химика Акта . 706 (1): 128–134. Бибкод : 2011AcAC..706..128B . дои : 10.1016/j.aca.2011.08.023 . ISSN 0003-2670 . ПМИД 21995919 .
- ^ Мэттс, Тимоти Э.; Нанн, Брук Л.; Маршалл, Кэтрин Т.; Проскуровский, Гиора; Келли, Дебора С.; Кавка, Орест Э.; Гудлетт, Дэвид Р.; Ханселл, Деннис А.; Моррис, Роберт М. (декабрь 2013 г.). «Окислители серы доминируют в фиксации углерода в биогеохимической горячей точке темного океана» . Журнал ISME . 7 (12): 2349–2360. Бибкод : 2013ISMEJ...7.2349M . дои : 10.1038/ismej.2013.113 . ISSN 1751-7370 . ПМЦ 3834846 . ПМИД 23842654 .
- ^ Чистосердова, Людмила (2017). «Применение подходов омики к изучению метилотрофов и сообществ метилотрофов» . Актуальные проблемы молекулярной биологии . 24 : 119–142. дои : 10.21775/cimb.024.119 . ISSN 1467-3037 . ПМИД 28686571 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Кумар, Маниш; Сингх Томар, Раджеш; Лейд, Харшад; Пол, Диби (2016). «Метилотрофные бактерии в устойчивом сельском хозяйстве». Всемирный журнал микробиологии и биотехнологии . 32 (7): 120. дои : 10.1007/s11274-016-2074-8 . ПМИД 27263015 . S2CID 23566439 .
- ^ Перейти обратно: а б с Игучи, Х.; Юримото, Х.; Сакаи, Ю. (2015). «Взаимодействие метилотрофов с растениями и другими гетеротрофными бактериями» . Микроорганизмы . 3 (2): 137–151. дои : 10.3390/микроорганизмы3020137 . ПМК 5023238 . ПМИД 27682083 .