Эндорибонуклеаза XendoU
| КсендоУ | |||
|---|---|---|---|
 структура ксенду: независимая от сплайсинга эндорибонуклеаза, процессирующая снорну | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | КсендоУ | ||
| Пфам | PF09412 | ||
| ИнтерПро | ИПР018998 | ||
| |||
В молекулярной биологии эндорибонуклеаза XendoU относится к белковому домену . Эта конкретная запись представляет эндорибонуклеазы, РНК участвующие в биосинтезе , которые получили название XendoU у Xenopus laevis (африканская шпорцевая лягушка). Этот белковый домен принадлежит к семейству эволюционно родственных белков . XendoU представляет собой U-специфичный металлозависимый фермент , который производит продукты с 2'- 3'- циклическими фосфатными концами.
Функция
[ редактировать ]Эндонуклеаза (snoRNA) , XendoU активно участвует в биосинтезе определенного подкласса Xenopus laevis, кодирующего малые ядрышковые РНК которые представляют собой большое семейство некодирующих РНК , играющих важную роль в биогенезе рибосом . Большинство мякРНК кодируются в интронах и высвобождаются в результате реакции сплайсинга . Другие, напротив, производятся альтернативным путем, состоящим из эндонуклеолитического процессинга пре-мРНК . XendoU – эндорибонуклеаза, ответственная за эту активность. [ 1 ]
Комплекс XendoU-РНК представляет собой марганец (Mn 2+ )-независимый. Это означает, что активности связывания и процессинга РНК могут быть функционально разделены, поскольку ионы необходимы для расщепления. [ 2 ]
Структура
[ редактировать ]XendoU представляет собой однодоменный белок примерно глобулярной формы. Он содержит девять альфа-спиралей и три антипараллельных бета-листа ; последние сгруппированы на одной стороне белка. [ 1 ]
Гомология
[ редактировать ]XendoU не имеет гомологии ни с одной известной клеточной РНКазой . Однако он имеет сходство последовательности с белками, предварительно обозначенными как сериновые протеазы . [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Ренци Ф., Каффарелли Э., Ланеве П., Боццони И., Брунори М., Валлоне Б. (2006). «Структура эндорибонуклеазы XendoU: от обработки малой ядрышковой РНК до репликации коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома» . Proc Natl Acad Sci США . 103 (33): 12365–70. Бибкод : 2006PNAS..10312365R . дои : 10.1073/pnas.0602426103 . ПМЦ 1567885 . ПМИД 16895992 .
- ^ Jump up to: а б Джоя У., Ланеве П., Длакич М., Арчечи М., Боццони И., Каффарелли Э. (2005). «Функциональная характеристика XendoU, эндорибонуклеазы, участвующей в биосинтезе малых ядрышек РНК» . J Биол Хим . 280 (19): 18996–9002. дои : 10.1074/jbc.M501160200 . ПМИД 15755742 .