Pseudomonas amydali

Pseudomonas amydali
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Филум:	Pseudomonadota
Сорт:	Gammaproteobacteria
Заказ:	Pseudomonadales
Семья:	Pseudomonadaceae
Род:	Pseudomonas
Разновидность:	П. Аминдали
Биномиальное название
	Pseudomonas amydali ; Psallidas and Panagopoulos 1975
Тип напряжения
	ATCC 33614 ; CCUG 32770 ; CFBP 3205 ; CIP 106734 ; DSM 7298 ; ICMP 3918 ; LMG 13184 ; NCPPB 2607
Патовары
	А. Пв. aesculi ; П. пв. Аминдали ; П. пв. Ciccaronei ; П. пв. Дендропанацис ; П. пв. eriobotryae ; П. пв. глицинея ; Лопата. Пв. Гибиски ; А. Пв. Лахриманс ; П. пв. Меллея ; П. пв. умирать ; А. П. Мать Пруморум ; П. пв. Myricae ; П. пв. Фазеликола ; П. пв. Патиния ; А. П. Сезим ; П. пв. Табачи ; П. пв. Ульми

Pseudomonas Amygdali -это грамотрицательная растения патогенная бактерия . ^{[ 1 ]} Он назван в честь его способности вызывать болезни на миндале ( Prunus amydalus ) деревья. Различные анализы, включая анализ 16S рРНК , ^{[ 2 ]} ДНК-ДНК-гибридизация, ^{[ 3 ]} и mlst ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Явно разместил P. amydali в группе P. syringae вместе с видами Pseudomonas ficuserectae и Pseudomonas meliae , и 27 патоварами Pseudomonas Syringae / Pseudomonas Savastanoi , составляющие единственную, четко определенную филогеничную группу, которую следует рассматривать как отдельный вид. Эта филогенетическая группа не была формально названа из -за отсутствия надежных средств для дифференциации ее фенотипического от близкородственных видов, ^{[ 3 ]} и в настоящее время он известен как любой геномоспецифии 2 ^{[ 3 ]} или филогруппа 3. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 8 ]} Когда это официально названо, правильным названием для этого нового вида должно быть Pseudomonas amydali , ^{[ 3 ]} который имеет приоритет над всеми другими именами таксона из этой группы, включая Pseudomonas Savastanoi , которое является и неадекватным и запутанным именем, использование которого не рекомендуется. ^{[ 3 ]}^{[ 9 ]}

Патовары

Pseudomonas Amygdali Pv. aesculi заражает деревья Buckeye и Horse Chestnut (род Aesculus ).
Pseudomonas Amygdali Pv. Аминдали был выделен из Прунуса Амидалуса .
Pseudomonas Amygdali Pv. Broussonetiae Причинный агент бактериального падения бумаги ( Broussonetia kazinoki x B. papyrifera ).
Pseudomonas Amygdali Pv. Castaneae, причинный агент бактериального явления каштана ( Castanea Crenata Sieb. Et Zucc.) ^{[ 10 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Cerasicola, причинный агент бактериального галла вишневого дерева ^{[ 11 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Ciccaronei вызывает заболевание на дереве рожкового дерева ( Ceratonia siliqua ).
Pseudomonas Amygdali Pv. Cunninghamiae вызывает болезнь на Каннингхамии Лэнслата
Pseudemonas Amydali Pv. Daphniphyllli, причинный агент бактериального галла из мертвых ( daphniphylum teijsmanni Z.) ^{[ 12 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Dendropanacis является патогенным к Dendropanax trifidus .
Pseudomonas Amygdali Pv. eriobotryae заражает деревья локватов ( eriobotrya japonica ).
Pseudomonas Almond Pv. пепельный ^{[ 13 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Глицинея вызывает заболевание соевых бобов ( глицин макс ).
Pseudomonas Amygdali Pv. Гибисциско является патогенным к гибискуса . растениям
Pseudomonas Amygdali Pv. Lachrymans вызывает угловое пятно на огурце . Только определенные штаммы этого патовара принадлежат к этой филогенетической группе, тогда как другие классифицируются в геномоспециях 3. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Mellea вызывает заболевание на табака . растениях
Pseudomonas Amygdali Pv. Мори патоген на шелковых деревьях.
Pseudomonas Amygdali Pv. Morsprunorum вызывает болезнь на вишне и сливы . Только определенные штаммы этого патовара принадлежат к этой филогенетической группе, тогда как другие классифицируются в геномоспециях 3. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Myricae был первым изолирован на Мирики . деревьях
Pseudomonas Almond Pv. Нерон ^{[ 13 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Фазеликола является патогенной по отношению к общему бобу .
Pseudomonas Amygdali Pv. Photiniae вызывает заболевание на видах Photinia .
Pseudomonas Amygdali Pv. retacarpa ^{[ 13 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Raphiolepidis
Pseudomon Amydali Pv. Savstanioi ^{[ 13 ]}
Pseudomonas Amygdali Pv. Сезами заражает кунжутные растения.
Pseudomonas Amygdali Pv. Ульми была первой изолированной на деревьях вкл .

Ссылки

^ Смит, Дюнес, Леллиот, Филлипс и Арчер (1988) Европейский справочник по болезням растений. Blackwell Scientific Publications.
^ Анзай; и др. (Июль 2000). «Филогенетическая принадлежность псевдомонадов на основе последовательности 16S рРНК». Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. doi : 10.1099/00207713-50-4-1563 . PMID 10939664 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Gardan, L.; Shafik, H.; Belouin, S.; Брохл, Р.; Гримонт, Ф.; Grimont, Pad (1999). «Связанность ДНК среди патоваров Pseudomonas syringae и описание Pseudomonas tremae sp. Nov. И Pseudomonas cannabina sp. Nov. (Ex Sutic and Dowson 1959)» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 49 (2): 469–478. doi : 10.1099/00207713-49-2-469 . PMID 10319466 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Berge, Odile; Monteil, Caroline L.; Bartoli, Claudia; Chandeysson, Charlotte; Guilbaud, Caroline; Sands, David C.; Morris, Cindy E. (2014-09-03). "A User's Guide to a Data Base of the Diversity of Pseudomonas syringae and Its Application to Classifying Strains in This Phylogenetic Complex". PLOS ONE. 9 (9): e105547. Bibcode:2014PLoSO...9j5547B. doi:10.1371/journal.pone.0105547. ISSN 1932-6203. PMC 4153583. PMID 25184292.
^ Jump up to: ^a ^b Hwang, Michael S. H.; Morgan, Robyn L.; Sarkar, Sara F.; Wang, Pauline W.; Guttman, David S. (2005-09-01). "Phylogenetic Characterization of Virulence and Resistance Phenotypes of Pseudomonas syringae". Applied and Environmental Microbiology. 71 (9): 5182–5191. Bibcode:2005ApEnM..71.5182H. doi:10.1128/AEM.71.9.5182-5191.2005. ISSN 0099-2240. PMC 1214625. PMID 16151103.
^ Bull, Carolee T.; Clarke, Christopher R.; Cai, Rongman; Vinatzer, Boris A.; Jardini, Teresa M.; Koike, Steven T. (2011-02-15). "Multilocus Sequence Typing of Pseudomonas syringae Sensu Lato Confirms Previously Described Genomospecies and Permits Rapid Identification of P. syringae pv. coriandricola and P. syringae pv. apii Causing Bacterial Leaf Spot on Parsley". Phytopathology. 101 (7): 847–858. doi:10.1094/PHYTO-11-10-0318. ISSN 0031-949X. PMID 21323469.
^ Parkinson, N.; Bryant, R.; Bew, J.; Elphinstone, J. (2010). "Rapid phylogenetic identification of members of the Pseudomonas syringae species complex using the rpoD locus". Plant Pathology. 60 (2): 338–344. doi:10.1111/j.1365-3059.2010.02366.x.
^ Baltrus, David A.; McCann, Honour C.; Guttman, David S. (2017-01-01). "Evolution, genomics and epidemiology of Pseudomonas syringae". Molecular Plant Pathology. 18 (1): 152–168. doi:10.1111/mpp.12506. ISSN 1364-3703. PMC 6638251. PMID 27798954.
^ Young, J. M. (September 2010). "Taxonomy of Pseudomonas syringae". Journal of Plant Pathology. 92 (1sup): S1.5–S1.14.
^ 和雄, 高梨; 寛二, 清水 (1989). "クリかいよう病を起こすPseudomonas syringae pv. castaneae pv. nov". 日本植物病理学会報. 55 (4): 397–403. doi:10.3186/jjphytopath.55.397.
^ Kamiunten, Hiroshi; Nakao, Takeharu; Oshida, Shiomi (2000-08-01). "Pseudomonas syringae pv. cerasicola, pv. nov., the Causal Agent of Bacterial Gall of Cherry Tree". Journal of General Plant Pathology. 66 (3): 219–224. doi:10.1007/PL00012949. ISSN 1345-2630. S2CID 8057063.
^ Oginh, Choei; Kubo, Yoshibumi; Higuchi, Hiroshi; Takikawa, Yuichi (1990). "Bacterial gall diseases of himeyuzuriha (Daphniphyllum teijsmanni Z.) caused by Pseudomonas syringae pv. daphniphylli pv. nov". Journal of the Japanese Forestry Society. 72 (1): 17–22. doi:10.11519/jjfs1953.72.1_17.
^ Jump up to: ^a ^b ^c ^d Caballo-Ponce, Eloy; Murillo, Jesús; Martínez-Gil, Marta; Moreno-Pérez, Alba; Pintado, Adrián; Ramos, Cayo (2017). "Knots Untie: Molecular Determinants Involved in Knot Formation Induced by Pseudomonas savastanoi in Woody Hosts". Frontiers in Plant Science. 8: 1089. doi:10.3389/fpls.2017.01089. ISSN 1664-462X. PMC 5478681. PMID 28680437.

External links

Type strain of Pseudomonas amygdali at BacDive - the Bacterial Diversity Metadatabase

[1] Смит, Дюнес, Леллиот, Филлипс и Арчер (1988) Европейский справочник по болезням растений. Blackwell Scientific Publications.

[Anzai-2] Анзай; и др. (Июль 2000). «Филогенетическая принадлежность псевдомонадов на основе последовательности 16S рРНК». Int J Syst Evol Microbiol . 50 (4): 1563–89. doi : 10.1099/00207713-50-4-1563 . PMID 10939664 .

[:0-3] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Gardan, L.; Shafik, H.; Belouin, S.; Брохл, Р.; Гримонт, Ф.; Grimont, Pad (1999). «Связанность ДНК среди патоваров Pseudomonas syringae и описание Pseudomonas tremae sp. Nov. И Pseudomonas cannabina sp. Nov. (Ex Sutic and Dowson 1959)» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 49 (2): 469–478. doi : 10.1099/00207713-49-2-469 . PMID 10319466 .

[:1-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Berge, Odile; Monteil, Caroline L.; Bartoli, Claudia; Chandeysson, Charlotte; Guilbaud, Caroline; Sands, David C.; Morris, Cindy E. (2014-09-03). "A User's Guide to a Data Base of the Diversity of Pseudomonas syringae and Its Application to Classifying Strains in This Phylogenetic Complex". PLOS ONE. 9 (9): e105547. Bibcode:2014PLoSO...9j5547B. doi:10.1371/journal.pone.0105547. ISSN 1932-6203. PMC 4153583. PMID 25184292.

[:2-5] Jump up to: ^a ^b Hwang, Michael S. H.; Morgan, Robyn L.; Sarkar, Sara F.; Wang, Pauline W.; Guttman, David S. (2005-09-01). "Phylogenetic Characterization of Virulence and Resistance Phenotypes of Pseudomonas syringae". Applied and Environmental Microbiology. 71 (9): 5182–5191. Bibcode:2005ApEnM..71.5182H. doi:10.1128/AEM.71.9.5182-5191.2005. ISSN 0099-2240. PMC 1214625. PMID 16151103.

[6] Bull, Carolee T.; Clarke, Christopher R.; Cai, Rongman; Vinatzer, Boris A.; Jardini, Teresa M.; Koike, Steven T. (2011-02-15). "Multilocus Sequence Typing of Pseudomonas syringae Sensu Lato Confirms Previously Described Genomospecies and Permits Rapid Identification of P. syringae pv. coriandricola and P. syringae pv. apii Causing Bacterial Leaf Spot on Parsley". Phytopathology. 101 (7): 847–858. doi:10.1094/PHYTO-11-10-0318. ISSN 0031-949X. PMID 21323469.

[7] Parkinson, N.; Bryant, R.; Bew, J.; Elphinstone, J. (2010). "Rapid phylogenetic identification of members of the Pseudomonas syringae species complex using the rpoD locus". Plant Pathology. 60 (2): 338–344. doi:10.1111/j.1365-3059.2010.02366.x.

[8] Baltrus, David A.; McCann, Honour C.; Guttman, David S. (2017-01-01). "Evolution, genomics and epidemiology of Pseudomonas syringae". Molecular Plant Pathology. 18 (1): 152–168. doi:10.1111/mpp.12506. ISSN 1364-3703. PMC 6638251. PMID 27798954.

[9] Young, J. M. (September 2010). "Taxonomy of Pseudomonas syringae". Journal of Plant Pathology. 92 (1sup): S1.5–S1.14.

[10] 和雄, 高梨; 寛二, 清水 (1989). "クリかいよう病を起こすPseudomonas syringae pv. castaneae pv. nov". 日本植物病理学会報. 55 (4): 397–403. doi:10.3186/jjphytopath.55.397.

[11] Kamiunten, Hiroshi; Nakao, Takeharu; Oshida, Shiomi (2000-08-01). "Pseudomonas syringae pv. cerasicola, pv. nov., the Causal Agent of Bacterial Gall of Cherry Tree". Journal of General Plant Pathology. 66 (3): 219–224. doi:10.1007/PL00012949. ISSN 1345-2630. S2CID 8057063.

[12] Oginh, Choei; Kubo, Yoshibumi; Higuchi, Hiroshi; Takikawa, Yuichi (1990). "Bacterial gall diseases of himeyuzuriha (Daphniphyllum teijsmanni Z.) caused by Pseudomonas syringae pv. daphniphylli pv. nov". Journal of the Japanese Forestry Society. 72 (1): 17–22. doi:10.11519/jjfs1953.72.1_17.

[:3-13] Jump up to: ^a ^b ^c ^d Caballo-Ponce, Eloy; Murillo, Jesús; Martínez-Gil, Marta; Moreno-Pérez, Alba; Pintado, Adrián; Ramos, Cayo (2017). "Knots Untie: Molecular Determinants Involved in Knot Formation Induced by Pseudomonas savastanoi in Woody Hosts". Frontiers in Plant Science. 8: 1089. doi:10.3389/fpls.2017.01089. ISSN 1664-462X. PMC 5478681. PMID 28680437.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]