Стандарт цитометрии изображения
| Расширение имени файла | .икс , .ids |
|---|---|
| Тип формата | Форматы файлов изображений |
Стандарт цитометрии изображений цифровых многомерных изображений, (ICS) — это формат файлов используемый в в области медико-биологических наук микроскопии . Он хранит не только данные изображения , но и микроскопические параметры, описывающие оптику во время съемки.
ICS был впервые предложен в: P. Dean, L. Mascio, D. Ow, D. Sudar, J. Mullikin, Proposed Standard for Files Data Cytometry Data , Cytometry, n. 11, стр. 561-569, 1990 г. [1] .
Исходный формат файла ICS фактически использует два отдельных файла: текстовый файл заголовка с расширением .ics и другой, гораздо больший и содержащий фактические данные изображения, с расширением .ids. Это позволяет сжимать данные, оставляя доступным файл заголовка. С другой стороны, новый формат файла ICS2 использует только один файл .ics, содержащий и заголовок, и данные вместе.
Файл .ics в двухфайловом формате представляет собой текстовый файл с полями, разделенными табуляцией , и строками, заканчивающимися символом новой строки . В новом формате ICS2 этот текстовый заголовок предшествует двоичным данным.
Формат ICS способен хранить:
- многомерные и многоканальные данные
- изображения в 8, 16, 32 или 64-битном целочисленном формате, 32- или 64-битном формате с плавающей запятой и комплексных данных с плавающей запятой
- все микроскопические параметры, имеющие непосредственное отношение к формированию изображения
- комментарии в свободной форме
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Исходные коды библиотеки чтения/записи файлов ICS, выпущенной по лицензии LGPL v2.1: https://github.com/svi-opensource/libics . Текущая версия — 1.6.5, выпущенная 18 августа 2021 г.
- Интерфейс Python для libics: pylibics
- Программа открытия ICS для ImageJ .
- Биоформаты для Фиджи_(программное обеспечение) / ImageJ .
