Регулятор метаболизма жирных кислот белок FADR
| FADR C-концевой домен | |||
|---|---|---|---|
 FADR, Жесткий фактор транскрипции, от e. Коли в комплексе с оператором FADB | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Fadr_c | ||
| Pfam | PF07840 | ||
| PFAM клан | CL0388 | ||
| InterPro | IPR008920 | ||
| Краткое содержание | 1h9g / scope / supfam | ||
| |||
В молекулярной биологии белок FADR регулятора метаболизма жирных кислот является бактериальным фактором транскрипции .
Бактерии регулируют текучесть мембраны , манипулируя относительными уровнями насыщенных и ненасыщенных жирных кислот в фосфолипидах их мембранных бислоев. В Escherichia coli фактор транскрипции, FADR, функционирует как переключатель, который совместно регулирует механизм, необходимый для жирных кислот бета-окисления , и экспрессии ключевого фермента в биосинтезе жирных кислот . Этот сингл [репрессор контролирует транскрипцию всего причудливого регулона. [ 1 ] Связывание FADR специфически ингибируется с помощью длинноцепочечных жирных ацил-коа- соединений.
Кристаллическая структура FADR показывает с двумя доменом димерную молекулу , где N-концевая домен крылатой спирали связывает ДНК , а С-концевой домен связывает ацил-КоА. [ 1 ] Связывание ацил-КоА с С-концевым доменом приводит к конформационному изменению , которое влияет на аффинность связывания ДНК N-концевого домена. [ 2 ]
FADR является членом семейства GNTR регуляторов бактериальной транскрипции . ДНК-связывающий домен хорошо сохраняется для этого семейства, тогда как С-концевой эффектор-связывающий домен является более изменчивым и, следовательно, используется для определения подсемейств GNTR. [ 3 ] Группа FADR является самой большой подгруппой и характеризуется все- спиральной С-концевой доменом, состоящим из 6-7 альфа-спиралей . [ 2 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный Xu Y, Heath RJ, Li Z, Rock Co, White SW (май 2001). «Комплекс FADR.DNA. Транскрипционная контроль метаболизма жирных кислот в Escherichia coli» . Дж. Биол. Химический 276 (20): 17373–9. doi : 10.1074/jbc.m100195200 . PMID 11279025 .
- ^ Jump up to: а беременный Van Aalten DM, Dirusso CC, Knudsen J, Wierenga RK (октябрь 2000 г.). «Кристаллическая структура FADR, фактор транскрипции, чувствительный к жирным кислотам с новым ацильным коферментом A-связывающим складом» . Embo j . 19 (19): 5167–77. doi : 10.1093/emboj/19.19.5167 . PMC 302096 . PMID 11013219 .
- ^ Ригали С., Дерууо А., Джаннотта Ф., Дусарт Дж (апрель 2002 г.). «Подразделение семейства бактериальных регуляторов GNTR-спираль в подростках в подсемействах FADR, HUTC, MOCR и YTRA» (PDF) . Дж. Биол. Химический 277 (15): 12507–15. doi : 10.1074/jbc.m110968200 . PMID 11756427 .