Эмаравирус инжирной мозаики
| Эмаравирус инжирной мозаики | |
|---|---|
| |
| Симптомы инжирной мозаики на листьях инжира | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Сорт: | Эллиовирицетес |
| Заказ: | Буньявирусы |
| Семья: | Фимовирусиды |
| Род: | Эмаравирус |
| Разновидность: | Эмаравирус инжирной мозаики
|
| Синонимы | |
| |
Эмаравирус мозаики инжира ( FMV ) представляет собой сегментированный с отрицательным смыслом одноцепочечный РНК-вирус , который, как установлено, является возбудителем мозаичной болезни инжира (ящура) у растений инжира Ficus carica . [ 1 ] Это представитель рода Emaravirus. [ 2 ] и порядка Bunyavirales и передается главным образом эриофидным клещом Aceria ficus . [ 3 ] FMV может вызывать ряд симптомов различной степени тяжести, включая хлороз листьев , деформацию, мозаику или изменение цвета, а также преждевременное опадание плодов. [ 4 ]
История
[ редактировать ]Болезнь мозаики инжира (Ящур) была впервые описана и предположительно имеет вирусное происхождение в 1933 году Ирой Дж. Кондитом и У.Т. Хорном . [ 5 ] установили, что оно вызвано вирусом В 2009 году Дживан Джьот Валия , Нида М. Салем и Брайс В. Фальк . [ 6 ] Заболевание и связанный с ним вирус с тех пор наблюдались в Греции , Италии , Испании , Турции , Сирии , Тунисе , Алжире , Иордании , Новой Зеландии , Китае , Великобритании , Пуэрто-Рико , Австралии и США . [ 6 ]
Классификация
[ редактировать ]FMV был отнесен к роду Emaravirus . [ 7 ] который содержит другие одноцепочечные вирусы растений с сегментированной РНК с отрицательным смыслом. Все эмаравирусы содержат от четырех до шести сегментов генома . Они также распространены по способу передачи: через различные виды эриофидных клещей по неизвестному механизму, а также механическим путем передачи. [ 3 ] Помимо FMV, род Emaravirus включает эмаравирус, связанный с кольцевой пятнистостью европейской рябины (EMARaV), эмаравирус розовой розетки (RRV), эмаравирус пятнистости листьев малины (RLBV) и другие виды. [ 3 ]
Структура генома
[ редактировать ]Геном FMV состоит из сегментированной ( многочастной ) одноцепочечной РНК с отрицательным смыслом . [ 8 ] Долгое время считалось, что геном состоит из четырех сегментов, но недавние открытия подтвердили существование шести сегментов генома РНК. [ 9 ] Каждый сегмент имеет одну открытую рамку считывания (ORF). [ 3 ] Первый сегмент, vcRNA 1 FMV (7093 нт), является общим для всех вирусов рода Emaravirus и кодирует вирусную массой 264 кДа РНК-зависимую РНК-полимеразу (RdRp), которая обладает эндонуклеазной активностью вблизи N-конца . Второй сегмент, vcRNA2 (2252 нт), кодирует предполагаемый гликопротеин массой 73 кДа . vcRNA3 FMV (1490 нт) кодирует белок нуклеокапсида (N) массой 35 кДа. массой 40,5 кДа, vcRNA4 FMV (1472 нт) кодирует белок функция которого пока неизвестна. [ 5 ] Два последних обнаруженных сегмента, РНК5 и РНК6, в отличие от остальных четырех сегментов, не являются высококонсервативными в пределах рода. Возможно, это связано с тем, что они усечены или дефектны, но функции кодируемых ими белков до сих пор не определены. [ 9 ]
Движение между клетками и внутри них (FMV-p4)
[ редактировать ]Как и все вирусы растений, FMV кодирует белок движения (MP), позволяющий ему перемещаться между клетками, обычно за счет увеличения пределов исключения размера (SEL) плазмодесм , чтобы обеспечить проход вируса. [ 10 ] MP FMV, скорее всего, представляет собой p4, этот вывод подтверждается его локализацией в плазматической мембране, но еще не был окончательно доказан. [ 3 ]
Репликация генома посредством захвата кепки
[ редактировать ]vcRNA 1 FMV кодирует РНК-зависимый белок РНК-полимеразы (RdRp), который имеет эндонуклеазную функцию на своем N-конце и упакован в вирион. Как только вирион проникает в клетку, RdRp связывается с мРНК хозяина и использует активность эндонуклеазы для расщепления 5'-метилированного кэпа для использования в качестве праймера для синтеза мРНК и как способ захвата механизма трансляции хозяина. [ 5 ]
DMB и LFP
[ редактировать ]Заражение FMV приводит к образованию в цитозоле инфицированных клеток паренхимы отчетливых двухмембранных тел или частиц, называемых DMB или DMP, диаметром 90–200 нм. [ 6 ] [ 8 ] [ 11 ] Эти связанные с двойной мембраной тельца окружены фибрилловым матриксом и обнаруживаются только в листьях с мозаичными симптомами на макроуровне, но никогда в неинфицированной ткани, используемой в качестве контроля. [ 11 ] У некоторых сортов также наблюдались длинные, гибкие , палочковидные вирусоподобные частицы (LFP) в тканях с признаками некроза. Они также не наблюдаются в неинфицированных контрольных тканях. [ 11 ] Ни один из типов не имеет определенной функции.
Симптомы
[ редактировать ]FMV приводит к множеству симптомов, некоторые из которых могут нанести серьезный ущерб сельскому хозяйству, например, снижение урожайности фруктов. Симптомы включают появление мозаичного рисунка листьев, опадение листвы, снижение урожайности плодов, полосатость жилок, кольцевую пятнистость, деформацию и хлороз листьев, а также желтую пятнистость на плодах. [ 6 ] [ 9 ]
Неизвестные и будущие исследования
[ редактировать ]Многие аспекты молекулярной структуры и функций этого вируса до сих пор неизвестны. Белок, кодируемый четвертым сегментом вирусного генома, РНК4, до сих пор выполняет неизвестную функцию. [ 5 ] Кроме того, точные молекулярные механизмы репликации FMV и репликации эмаравируса в целом до сих пор не подтверждены. [ 4 ] Текущие исследования также направлены на изучение природы DMB/DMP, поскольку их трудно изолировать от зараженных растений. [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Эльбейно, Т; Дигиаро, М; Мартелли, врач общей практики (сентябрь 2009 г.). «Полная нуклеотидная последовательность четырех сегментов РНК вируса мозаики инжира». Архив вирусологии . 154 (11): 1719–1727. дои : 10.1007/s00705-009-0509-3 . ПМИД 19777155 . S2CID 898250 .
- ^ Эльбейно, Т; Дигиаро, М; Мильке-Эрет, Н; Мюльбах, HP; Мартелли, врач общей практики; Отчет Ictv, Консорциум (ноябрь 2018 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Fimoviridae» . Журнал общей вирусологии . 99 (11): 1478–1479. дои : 10.1099/jgv.0.001143 . ПМИД 30204080 . S2CID 52180832 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Исикава, К; Маэдзима, К; Комацу, К. (2013). «Белок p4 эмаравируса инжирной мозаики участвует в движении от клетки к клетке» . Журнал общей вирусологии . 94 (3): 682–686. дои : 10.1099/vir.0.047860-0 . ПМИД 23152372 .
- ^ Перейти обратно: а б Исикава, К; Маэдзима, К; Нагашима, С. (январь 2012 г.). «Первый отчет о вирусе мозаики инжира, заражающем инжир обыкновенный (Ficus carica) в Японии». Журнал общей патологии растений . 78 (2): 136–139. Бибкод : 2012JGPP...78..136I . дои : 10.1007/s10327-012-0359-9 . S2CID 13946882 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Валия, Джей-Джей; Фальк, BW (май 2012 г.). «МРНК вируса мозаики риса демонстрируют образование путем захвата крышки» . Вирусология . 426 (2): 162–166. дои : 10.1016/j.virol.2012.01.035 . ПМИД 22356803 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Валия, Джей-Джей; Салем, Нью-Мексико; Фальк, Б.М. (январь 2009 г.). «Частичная последовательность и обзорный анализ идентифицируют многочастный РНК-вирус с отрицательным смыслом, связанный с мозаикой инжира». Болезни растений . 93 (1): 4–10. дои : 10.1094/PDIS-93-1-0004 . ПМИД 30764262 .
- ^ "ICTV Report: Fimoviridae" .
- ^ Перейти обратно: а б Эльбейно, Т; Дигиаро, М; Алабдулла, А. (май 2009 г.). «Многочастный одноцепочечный РНК-вирус с отрицательным смыслом является предполагаемым возбудителем мозаичной болезни инжира» . Журнал общей вирусологии . 90 (5): 1281–1288. дои : 10.1099/vir.0.008649-0 . ПМИД 19264612 .
- ^ Перейти обратно: а б с Исикава, К; Маэдзима, К; Комацу, К. (апрель 2012 г.). «Идентификация и характеристика двух новых сегментов геномной РНК вируса мозаики инжира, РНК5 и РНК6» . Журнал общей вирусологии . 93 (7): 1612–1619. дои : 10.1099/vir.0.042663-0 . ПМИД 22513386 .
- ^ Лазаровица, СГ; Бичи, Р.Н. (апрель 1999 г.). «Белки вирусного движения как зонды внутриклеточного и межклеточного перемещения растений» . Растительная клетка . 11 (4): 535–548. дои : 10.1105/tpc.11.4.535 . ПМК 144200 . ПМИД 10213776 .
- ^ Перейти обратно: а б с Чаглаян, К; Медина, В; Газель, М (октябрь 2009 г.). «Предположительные возбудители мозаичной болезни инжира в Турции» . Турецкий журнал сельского и лесного хозяйства . 33 : 469–476. дои : 10.3906/tar-0807-20 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]