SAH рибопереключатель
S-аденозил-L-гомоцистеиновый рибопереключатель | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | SAH_riboswitch |
Рфам | RF01057 |
Другие данные | |
РНК Тип | Цис-рег ; рибопереключатель |
Домен(ы) | Бактерии |
ТАК | ТАК: 0005836 |
PDB Структуры | ПДБе |
Рибопереключатели SAH представляют собой разновидность рибопереключателей , которые связывают S-аденозилгомоцистеин (SAH). [ 1 ] Когда кофермент S-аденозилметионин (SAM) используется в реакции метилирования , образуется SAH. Рибопереключатели SAH обычно активируют гены, участвующие в переработке SAH, для создания большего количества SAM (или метаболически связанного метионина ). Это особенно актуально для клеток, поскольку высокие уровни SAH могут быть токсичными. [ 2 ] Первоначально идентифицированный биоинформатиками, [ 3 ] Рибопереключатели SAH обнаруживаются у многих видов бактерий , преимущественно у некоторых Pseudomonadota и Actinomycetota . Трехмерная структура рибопереключателя SAH с атомным разрешением была решена с помощью рентгеновской кристаллографии. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Ван Дж.К., Ли Э.Р., Моралес Д.Р., Лим Дж., Брейкер Р.Р. (2008). «Рибопереключатели, которые воспринимают S-аденозилгомоцистеин и активируют гены, участвующие в переработке коферментов» . Мол. Клетка . 29 (6): 691–702. doi : 10.1016/j.molcel.2008.01.012 . ПМК 2712820 . ПМИД 18374645 .
- ^ Уеланд ПМ (1982). «Фармакологические и биохимические аспекты S-аденозилгомоцистеина и S-аденозилгомоцистеингидролазы». Фармакол. Преподобный . 34 (3): 223–253. ПМИД 6760211 .
- ^ Вайнберг З., Баррик Дж.Э., Яо З. и др. (2007). «Идентификация 22 структурированных РНК-кандидатов в бактериях с использованием конвейера сравнительной геномики CMfinder» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (14): 4809–4819. дои : 10.1093/нар/gkm487 . ПМК 1950547 . ПМИД 17621584 .
- ^ Jump up to: а б Эдвардс А.Л., Рейес Ф.Е., Эру А., Бэти Р.Т. (сентябрь 2010 г.). «Структурные основы распознавания S -аденозилгомоцистеина рибопереключателями» . РНК . 16 (11): 2144–2155. дои : 10.1261/rna.2341610 . ПМК 2957054 . ПМИД 20864509 .