Наутилия глубокая
| Наутилия глубокая | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | " Наутилия "
|
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | Н. профундикола
|
| Биномиальное имя | |
| Наутилия глубокая Смит и др. , 2008 г.
| |
Nautilia profundicola — грамотрицательная хемолитоавтотрофная бактерия, обитающая вокруг гидротермальных источников в глубоком океане. [ 1 ] Впервые он был обнаружен в 1999 году на Восточно-Тихоокеанском поднятии на глубине 2500 метров (8200 футов), на поверхности многощетинкового червя Alvinella pompejana . [ 2 ] Nautilia profundicola симбиотически живет на спинных волосках A. pompejana, но они также могут образовывать биопленки и жить независимо на стенках гидротермальных источников. Способность N. profundicola выживать в анаэробной среде, богатой серой , H 2 и CO 2 при различной температуре, делает его полезным организмом для изучения, поскольку именно эти условия, согласно теории, преобладали во времена самой ранней жизни. на земле. [ 1 ]
Морфология
[ редактировать ]Nautilia profundicola — подвижная палочковидная бактерия длиной около 0,4 мкм и шириной 0,3 мкм. [ 2 ] Как и большинство Campylobacterota (син. Epsilonproteobacteria), он имеет непокрытый полярный жгутик . [ 3 ]
Физиология
[ редактировать ]Nautilia profundicola обитает среди гидротермальных источников и может расти при температуре 30–55 ° C (86–131 ° F). Он использует анаэробное дыхание и является хемолитоавтотрофом. Nautilia profundicola использует водород или формиат в качестве донора электронов , а серу — в качестве акцептора электронов для производства сероводорода . [ 2 ] Nautilia profundicola содержит белок обратной гиразы , который был обнаружен среди термофильных бактерий и который помогает ей выдерживать большие колебания температуры, связанные с окружающей средой. [ 1 ] Предполагается, что обратная гираза поддерживает стабильность генома и предотвращает повреждение от сильной жары. [ 4 ] Анализ генома Nautilia profundicola помимо способности фиксировать углерод и серу указывает на новый путь фиксации азота . [ 1 ]
Таксономия
[ редактировать ]Анализ последовательности 16S рРНК гена Nautilia profundicola позволил отнести ее к семейству Nautiliaceae порядка Nautiliales типа Campylobacterota . Анализ этого гена показал, что этот организм на 97,8% разделяет ДНК этого гена с родственной бактерией Nautilia Lithotropica . Используя гибридизацию ДНК-ДНК , общее ДНК-ДНК-родство двух организмов составило 34,6 процента, что, наряду с различиями в филогении , позволило Nautilia profundicola как отдельный вид. классифицировать [ 2 ]
Геномная информация
[ редактировать ]Геном Nautilia profundicola состоит из одной кольцевой хромосомы из 1,7 миллиона пар оснований , что мало по сравнению с другими свободноживущими кампилобактериями. [ 1 ] Существует относительно мало доказательств влияния горизонтального переноса генов в геноме Nautilia profundicola , и теоретически этот недостаток внешней ДНК является продуктом ее собственных защитных механизмов или отсутствием свободной ДНК в окружающей негостеприимной среде. [ 1 ]
Экологическая функция
[ редактировать ]Nautilia profundicola является представителем семейства Campylobacterota, которое доминирует в жерловой экосистеме и, вероятно, играет ключевую роль в круговороте углерода, азота и серы. [ 1 ] Nautilia profundicola Было обнаружено, что имеет симбиотические отношения с Alvinella pompejana , при которой червь выделяет съедобную слизь , возможно, в обмен на термостойкие ферменты бактерии . Это может объяснить, как Alvinella pompejana может выжить, если одна часть тела находится в воде с температурой 80 ° C (176 ° F) в вентиляционном отверстии, а остальная часть тела - в воде с температурой 22 ° C (72 ° F) за пределами вентиляционного отверстия. [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Барбара Дж. Кэмпбелл; Джули Л. Смит; Томас Э. Хэнсон; Мартин Г. Клотц; Лиза Ю. Штайн; Чарльз К. Ли; Дунъин Ву; Джеффри М. Робинсон; Хода М. Хури; Джонатан А. Эйзен; С. Крейг Кэри (2009). «Адаптация к подводной гидротермальной среде на примере генома Nautilia profundicola » . ПЛОС Генетика . 5 (2): e1000362. дои : 10.1371/journal.pgen.1000362 . ПМЦ 2628731 . ПМИД 19197347 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Джули Л. Смит; Барбара Дж. Кэмпбелл; Томас Э. Хэнсон; Чуанлунь Л. Чжан; С. Крейг Кэри (2008). « Nautilia profundicola sp. nov., термофильная, восстанавливающая серу эпсилонпротеобактерия из глубоководных гидротермальных источников». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (7): 1598–1602. дои : 10.1099/ijs.0.65435-0 . ПМИД 18599701 . S2CID 12751566 .
- ^ Джек Р. Холт (2009). «Знакомство с эпсилонпротеобактериями» . Разнообразие жизни . Университет Саскуэханны . Проверено 8 января 2012 г.
- ^ Анна Валенти; Джузеппе Перуджино; Такэхико Номи; Мозес Росси; Мария Чарамелла (2009). «Ингибирование ДНК-полимеразы трансфекции обратной гиразой архей» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (13): 4287–4295. дои : 10.1093/nar/gkp386 . ПМЦ 2715243 . ПМИД 19443439 .
- ^ «Глубоководные жерла приютили самое жаркое животное на Земле» . Университет штата Делавэр . 2001 . Проверено 8 января 2012 г.