✖


Jump to content

Стивен А. Беннер

(Перенаправлено со Стивена Беннера )
Стивен Альберт Беннер
Рожденный ( 1954-10-23 ) 23 октября 1954 г. (69 лет) [ 1 ]
Национальность Американский
Альма-матер Йельский университет
Гарвардский университет
Научная карьера
Поля Химия , синтетическая биология
Учреждения Гарвардский университет
ETH Цюрих
Университет Флориды , Фонд прикладной молекулярной эволюции
Докторантура Роберт Бернс Вудворд , Фрэнк Вестхаймер
Веб-сайт www.ffame.org

Стивен Альберт Беннер (родился 23 октября 1954 г.) — американский химик . Он был профессором Гарвардского университета , ETH Цюриха , а в последнее время — в Университете Флориды , где он был заслуженным профессором химии VT и Луизы Джексон. В 2005 году он основал Институт науки и технологий Вестхаймера (TWIST) и Фонд прикладной молекулярной эволюции. Беннер также основал компании EraGen Biosciences и Firebird BioMolecular Sciences LLC.

Беннер и его коллеги первыми синтезировали ген, положив начало области синтетической биологии . Он сыграл важную роль в создании области палеогенетики . Его интересует происхождение жизни , а также химические условия и процессы, необходимые для производства РНК . Беннер работал с НАСА над разработкой детекторов инопланетных генетических материалов, используя определение жизни, разработанное Рабочей группой НАСА по экзобиологии в 1992 году, «самоподдерживающаяся химическая система, способная к дарвиновской эволюции». [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]

Образование

[ редактировать ]

Беннер учился в Йельском университете , получив степень бакалавра/магистра наук в области молекулярной биофизики и биохимии в 1976 году. Затем он поступил в Гарвардский университет , получив докторскую степень. по химии в 1979 году. [ 6 ] Он работал под руководством Роберта Бернса Вудворда , завершив дипломную работу вместе с Фрэнком Вестхаймером после смерти Вудворда. Его доктор философии. защитил диссертацию на тему « Абсолютная стереохимия ацетоацетатдекарбоксилазы, бетаин-гомоцистеинтрансметилазы и 3-гидроксибутиратдегидрогеназы». [ 7 ]

Карьера

[ редактировать ]

После окончания Гарвардского университета Беннер стал научным сотрудником Гарварда, получив в 1982 году премию Дрейфуса для молодых преподавателей. С 1982 по 1986 год он был доцентом кафедры химии Гарвардского университета. [ 8 ]

В 1986 году Беннер перешёл в ETH Zurich , Швейцарский федеральный технологический институт в Цюрихе. [ 9 ] Занимал должности доцента кафедры биоорганической химии с 1986 по 1993 год и профессора биоорганической химии с 1993 по 1996 год. [ 8 ]

К 1996 году [ 10 ] Беннер поступил на факультет Флоридского университета в качестве профессора химии, клеточной и молекулярной биологии. В 2004 году он был назначен заслуженным профессором химии VT и Луизы Джексон на химическом факультете Университета Флориды. [ 11 ]

Беннер покинул Университет Флориды в конце декабря 2005 года, чтобы основать Институт науки и технологий Вестхаймера (TWIST) в честь Фрэнка Вестхаймера . Он является частью Фонда прикладной молекулярной эволюции (FfAME) в Алачуа, Флорида , который Беннер основал в 2001 году. [ 12 ]

Беннер основал EraGen Biosciences в 1999 году. Компания была приобретена Luminex в 2011 году. [ 13 ] [ 14 ] В 2005 году он основал Firebird BioMolecular Sciences LLC. [ 12 ] [ 15 ] [ 16 ]

Исследовать

[ редактировать ]

Исследования Беннера делятся на четыре основных области:

  1. расширение генетического алфавита за счет синтеза искусственных структур
  2. пребиотическая химия, воссоздание химического происхождения жизни
  3. палеогенетика, изучение древних белков давно вымерших видов.
  4. обнаружение внеземной жизни [ 17 ]

Лаборатория Беннера является создателем области « синтетической биологии », которая стремится создавать путем химического синтеза молекулы, воспроизводящие сложное поведение живых систем, включая их генетику, наследование и эволюцию. Ниже перечислены некоторые важные моменты прошлых работ в области химической генетики.

Синтез генов

[ редактировать ]

В 1984 году лаборатория Беннера в Гарварде первой сообщила о химическом синтезе гена, кодирующего фермент. [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] после синтеза Кораной более короткого гена тРНК в 1970 году. [ 21 ] Это был первый созданный ген любого типа, новаторское достижение, заложившее основу для белковой инженерии . [ 22 ] Стратегии проектирования, представленные в этом синтезе, теперь широко используются для поддержки белковой инженерии. [ 23 ]

Искусственные генетические системы

[ редактировать ]

О попытках создания искусственных генетических систем впервые сообщили Беннер и его коллеги в 1989 году, когда они разработали первую неестественную пару оснований . [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ] Беннер и его коллеги с тех пор разработали шестибуквенную искусственно расширенную генетическую информационную систему под названием « Искусственно расширенная генетическая информационная система» (AEGIS), которая включает в себя два дополнительных нестандартных нуклеотида (Z и P) в дополнение к четырем стандартным нуклеотидам (G, A, C, и Т). [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] У AEGIS есть собственный отдел молекулярной биологии. [ 5 ] Он позволяет синтезировать белки, содержащие более 20 аминокислот, закодированных в природе, и дает представление о том, как нуклеиновые кислоты образуют дуплексные структуры, как белки взаимодействуют с нуклеиновыми кислотами. [ 32 ] и как альтернативные генетические системы могут появиться в внеземной жизни. [ 33 ]

Беннер — один из ряда исследователей, в том числе Эрика Т. Кула, Флойда Э. Ромесберга, Ичиро Хирао, Мицухико Сионоя и Эндрю Эллингтона, которые создали расширенный алфавит синтетических оснований, которые могут быть включены в ДНК (а также РНК). с использованием связи Уотсона-Крика (а также связи не-Ватсона-Крика). Хотя большинство этих синтетических оснований являются производными оснований A, C, G, T, некоторые из них отличаются. Хотя некоторые из них входят в пары Уотсона-Крика (A/T, C/G), некоторые являются самодополняющими (X/X). Таким образом, генетический алфавит был расширен. [ 15 ] [ 25 ] [ 27 ] [ 34 ] [ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ] : 88–98 

Число возможных триплетов нуклеотидов или кодонов , доступных при синтезе белка, зависит от количества доступных нуклеотидов. Стандартный алфавит (G, A, C и T) дает 4 3 = 64 возможных кодона, тогда как расширенный алфавит ДНК с 9 основаниями ДНК будет иметь 9 3 = 729 возможных кодонов, многие из них синтетические. Чтобы эти кодоны были полезны, была создана аминоацил-тРНК-синтетаза , которая может кодировать возможно синтетическую аминокислоту, которая должна быть связана с соответствующим ей синтетическим антикодоном. Беннер описал такую ​​систему, в которой используется синтетическая ДНК изо-C/изо-G, в которой используется синтетический кодон ДНК [изо-C/A/G], который он называет 65-м кодоном. Синтетическая мРНК с синтетическим антикодоном [iso-G/U/C] с синтетической аминоацил-тРНК-синтетазой приводит к эксперименту in vivo , который может кодировать синтетическую аминокислоту, включенную в синтетические полипептиды (синтетическая протеомика ). [ 38 ] : 100–106 

Модель нуклеиновых кислот «второго поколения».

[ редактировать ]

Беннер использовал синтетическую органическую химию и биофизику для создания модели структуры нуклеиновых кислот «второго поколения». Модель ДНК первого поколения была предложена Джеймсом Уотсоном и Фрэнсисом Криком на основе кристаллизованных рентгеновских структур, изучаемых Розалиндой Франклин . Согласно модели двойной спирали , ДНК состоит из двух комплементарных цепочек нуклеотидов, скрученных друг вокруг друга. [ 39 ] Модель Беннера подчеркивает роль сахарного и фосфатного остова в событии генетического молекулярного распознавания. Полианионный остов важен для создания расширенной структуры, которая помогает ДНК реплицироваться. [ 40 ] [ 41 ] [ 42 ]

В 2004 году Беннер сообщил о первой успешной попытке создать искусственную ДНК-подобную молекулу, способную воспроизводить себя. [ 22 ]

Секвенирование генома и предсказание структуры белка

[ редактировать ]

В конце 1980-х годов Беннер осознал потенциал проектов секвенирования генома, которые позволят генерировать миллионы последовательностей и позволят исследователям проводить обширное картирование молекулярных структур в органической химии. В начале 1990-х Беннер познакомился с Гастоном Гонне , положив начало сотрудничеству, которое применяло инструменты Гонне для поиска текста к управлению белковыми последовательностями. [ 43 ] [ 44 ] В 1990 году в сотрудничестве с Гастоном Гонне лаборатория Беннера представила рабочий стол биоинформатики DARWIN. DARWIN (Анализ и поиск данных с помощью индексированных последовательностей нуклеиновых кислот и пептидов) представлял собой среду программирования высокого уровня для изучения геномных последовательностей. Он поддерживал сопоставление геномных последовательностей в базах данных и генерировал информацию, показывающую, как природные белки могут дивергентно развиваться в условиях функциональных ограничений путем накопления мутаций, вставок и делеций. [ 45 ] Опираясь на Дарвина, лаборатория Беннера предоставила инструменты для прогнозирования трехмерной структуры белков на основе данных о последовательностях. Информация об известных белковых структурах была собрана и продана в виде коммерческой базы данных «Мастер-каталог» стартапом Беннера EraGen. [ 45 ]

Использование информации о множественных последовательностях для прогнозирования вторичной структуры белков стало популярным благодаря работе Беннера и Герлоффа. [ 46 ] [ 47 ] [ 48 ] Прогнозы вторичной структуры белка, сделанные Беннером и его коллегами, достигли высокой точности. [ 49 ] Стало возможным моделировать складки белков, обнаруживать отдаленные гомологи, проводить структурную геномику и соединять последовательность, структуру и функцию белков. Кроме того, эта работа предложила ограничения на предсказание структуры по гомологии, определяя, что можно, а что нельзя сделать с помощью этой стратегии. [ 45 ]

Практические инструменты генотипирования

[ редактировать ]

Подход Беннера открыл новые взгляды на то, как работают нуклеиновые кислоты, а также на инструменты диагностики и нанотехнологий. FDA одобрило продукты, в которых используется ДНК AEGIS для диагностики человека. Они контролируют вирусную нагрузку у пациентов, инфицированных гепатитом В , гепатитом С и ВИЧ . [ 50 ] AEGIS легла в основу разработки инструментов для мультиплексного обнаружения генетических маркеров, таких как раковые клетки. [ 51 ] и однонуклеотидные полиморфизмы в образцах пациентов. Эти инструменты позволят персонализировать медицину с использованием « на месте ». генетического анализа [ 52 ] а также исследовательские инструменты, которые измеряют уровень отдельных молекул мРНК в отдельных отростках отдельных живых нейронов. [ 53 ]

Интерпретационная протеомика

[ редактировать ]

Интерпретируя геномные данные и проецируя их на общего генетического предка, «Луку», лаборатория Беннера представила инструменты, которые анализируют закономерности сохранения и изменчивости с помощью структурной биологии, изучают вариации этих закономерностей в разных ветвях эволюционного древа и коррелируют события в генетическая запись событий в истории биосферы, известная из геологии и окаменелостей. В результате появились примеры, показывающие, как роль биомолекул в современной жизни можно понять с помощью моделей исторического прошлого. [ 54 ] [ 55 ]

Экспериментальная палеогенетика

[ редактировать ]
Дополнительная информация: Воскрешение наследственного гена.

Беннер был основоположником области экспериментальной палеогенетики , где гены и белки древних организмов воскрешаются с помощью биоинформатики и технологии рекомбинантной ДНК. [ 56 ] Экспериментальная работа над древними белками проверила гипотезы об эволюции сложных биологических функций, включая биохимию пищеварения жвачных животных. [ 57 ] [ 58 ] : 209  термофилия древних бактерий и взаимодействие между растениями, фруктами и грибами во время мелового вымирания . [ 58 ] : 17  Они развивают наше понимание биологического поведения, которое простирается от молекулы до клетки, организма, экосистемы и планеты, иногда называемое планетарной биологией. [ 58 ] : 221 

Астробиология

[ редактировать ]

Беннер глубоко интересуется происхождением жизни и условиями, необходимыми для поддержки модели мира РНК , в которой самовоспроизводящаяся РНК является предшественником жизни на Земле. Он определил, что кальций , борат и молибден важны для успешного образования углеводов и стабилизации РНК. [ 59 ] Он предположил, что на планете Марс могли быть более благоприятные условия, чем на Земле, для первоначального производства РНК. [ 60 ] [ 61 ] но совсем недавно пришли к выводу, что модели ранней Земли, показывающие сушу и прерывистую воду, разработанные Стивеном Мойзисом, представляют достаточные условия для развития РНК. [ 12 ]

Группа Беннера работала над выявлением молекулярных структур, которые могут быть универсальными характеристиками живых систем независимо от их происхождения, а не продуктами небиологических процессов. Это « биосигнатуры », как для земной жизни, так и для «странных» форм жизни. [ 3 ] [ 62 ] [ 63 ]

Один из таких универсальных идентификаторов жизни был предложен в Полиэлектролитной теории гена . Эта идея предполагает, что для того, чтобы линейный генетический биополимер, растворенный в воде, такой как ДНК , претерпел дарвиновскую эволюцию в любой точке Вселенной, он должен быть полиэлектролитом , полимером, содержащим повторяющиеся ионные заряды. [ 64 ] Эту концепцию Беннер связал с «апериодическим кристаллическим» взглядом на ген, предложенным в Эрвина Шрёдингера книге « Что такое жизнь? », чтобы создать надежный, универсально обобщаемый взгляд на генетическую биомолекулу. [ 65 ] Эта идея была предложена в качестве основы, с помощью которой ученые могут искать жизнь на других солнечных телах, помимо Земли. [ 66 ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ «Беннер, Стивен А. (Стивен Альберт), 1954-» . Авторитетные отчеты Библиотеки Конгресса . Проверено 30 июня 2016 г.
  2. ^ Маллен, Лесли (1 августа 2013 г.). «Определение жизни: вопросы и ответы с ученым Джеральдом Джойсом» . Журнал астробиологии . Проверено 5 июля 2016 г.
  3. ^ Jump up to: а б Беннер, Стивен А. (декабрь 2010 г.). «Определение жизни» . Астробиология . 10 (10): 1021–1030. Бибкод : 2010AsBio..10.1021B . дои : 10.1089/ast.2010.0524 . ПМЦ   3005285 . ПМИД   21162682 .
  4. ^ Клотц, Ирен (27 февраля 2009 г.). «Синтетическая форма жизни растет в лаборатории Флориды» . Наука . Архивировано из оригинала 13 января 2016 года . Проверено 5 июля 2016 г.
  5. ^ Jump up to: а б Ллойд, Робин (14 февраля 2009 г.). «Новая искусственная ДНК указывает на инопланетную жизнь» . ЖиваяНаука . Проверено 5 июля 2016 г.
  6. ^ Импи, Крис Импи; Шпиц, Анна Х.; Стогер, Уильям, ред. (2013). Встреча с жизнью во Вселенной: этические основы и социальные последствия астробиологии . Тусон: Издательство Университета Аризоны. п. 259. ИСБН  978-0-8165-2870-7 . Проверено 30 июня 2016 г.
  7. ^ «Стивен А. Беннер» . Химическое дерево . Проверено 30 июня 2016 г.
  8. ^ Jump up to: а б «События в Райсе» . Университет Райса . Архивировано из оригинала 19 сентября 2016 года . Проверено 1 июля 2016 г.
  9. ^ Квок, Роберта (21 ноября 2012 г.). «Химическая биология: новый алфавит ДНК» . Природа . 491 (7425): 516–518. Бибкод : 2012Natur.491..516K . дои : 10.1038/491516а . ПМИД   23172197 .
  10. ^ Беннер, Стивен А. «Нестандартные пары оснований как инструменты биомедицинских исследований» . Грантоме . Проверено 1 июля 2016 г.
  11. ^ «Участники» . Инициатива «Скромный подход» . Проверено 1 июля 2016 г.
  12. ^ Jump up to: а б с Кларк, Энтони (24 марта 2016 г.). «Местная команда возглавит проект стоимостью 5,4 миллиона долларов по изучению происхождения жизни на Земле» . Гейнсвилл Сан . Проверено 30 июня 2016 г.
  13. ^ Визан, Эндрю (12 июля 2011 г.). «Бывшая биотехнологическая компания Гейнсвилля продана за 34 миллиона долларов» . Гейнсвилл Сан . Проверено 1 июля 2016 г.
  14. ^ Кэрролл, Джон. «Luminex покупает EraGen Biosciences в сделке на 34 миллиона долларов» . Жестокие биотехнологии . Проверено 22 июня 2011 г.
  15. ^ Jump up to: а б Хоугего, Джош (25 февраля 2014 г.). «О чужих нуклеотидах» . Химический мир . Проверено 1 июля 2016 г.
  16. ^ ООО «Жар-Птица Биомолекулярные Науки» .
  17. ^ «Коллоквиум «Мечта президента» . Университет Саймона Фрейзера . Проверено 1 июля 2016 г.
  18. ^ Гросс, Майкл (август 2011 г.). «Что такое синтетическая биология?» . Современная биология . 21 (16): Р611–Р614. Бибкод : 2011CBio...21.R611G . дои : 10.1016/j.cub.2011.08.002 .
  19. ^ Намбияр, К.; Стэкхаус, Дж; Стауффер, Д.; Кеннеди, В.; Элдридж, Дж.; Беннер, С. (23 марта 1984 г.). «Полный синтез и клонирование гена, кодирующего белок рибонуклеазы S» (PDF) . Наука . 223 (4642): 1299–1301. Бибкод : 1984Sci...223.1299N . дои : 10.1126/science.6322300 . ПМИД   6322300 . Проверено 5 июля 2016 г.
  20. ^ Д'Алессио, Джузеппе; Риордан, Джеймс Ф. (1997). Строение и функции рибонуклеаз . Сан-Диего: Академическая пресса. п. 214. ИСБН  9780125889452 . Проверено 5 июля 2016 г.
  21. ^ Корана, Х.Г.; Агарвал, КЛ ; Бучи, Х.; Карутерс, Миннесота; Гупта, Северная Каролина; Клбппе, К.; Кумар, А.; Оцука, Э.; РаджБхандари, UL; ван де Санде, Дж. Х.; Сгарамелла, В.; Тебао, Т.; Вебер, Х.; Ямада, Т. (декабрь 1972 г.). «CIII. Полный синтез структурного гена рибонуклеиновой кислоты, переносящей аланин, из дрожжей». Журнал молекулярной биологии . 72 (2): 209–217. дои : 10.1016/0022-2836(72) 90146-5 ПМИД   4571075 .
  22. ^ Jump up to: а б Грэмлинг, Кэролайн (2005). «Для профессора химии Стивена Беннера жизнь, какой мы ее знаем, может быть не единственной альтернативой» . Удивительная наука . 10 (1) . Проверено 9 июля 2016 г.
  23. ^ Кёрер, Кэролайн; РаджБхандари, Уттам Л., ред. (2009). Белковая инженерия . Берлин: Шпрингер. стр. 274–281, 297. ISBN.  978-3-540-70941-1 . Проверено 5 июля 2016 г.
  24. ^ Файкс, Брэдли Дж. (8 мая 2014 г.). «Жизнь создана с использованием расширенного генетического кода» . Сан-Диего Юнион Трибьюн . Проверено 5 июля 2016 г.
  25. ^ Jump up to: а б Мацуда, Сигео; Филло, Джеремия Д.; Генри, Эллисон А.; Рай, Приямрада; Уилкенс, Стивен Дж.; Дуайер, Тэмми Дж.; Гейерстангер, Бернхард Х.; Веммер, Дэвид Э.; Шульц, Питер Г.; Спраггон, Глен; Ромесберг, Флойд Э. (август 2007 г.). «Усилия по расширению генетического алфавита: структура и репликация неестественных пар оснований» . Журнал Американского химического общества . 129 (34): 10466–10473. дои : 10.1021/ja072276d . ПМК   2536688 . ПМИД   17685517 .
  26. ^ Свитцер, Кристофер; Морони, Саймон Э.; Беннер, Стивен А. (октябрь 1989 г.). «Ферментативное включение новой пары оснований в ДНК и РНК». Журнал Американского химического общества . 111 (21): 8322–8323. дои : 10.1021/ja00203a067 .
  27. ^ Jump up to: а б Пиччирилли, Джозеф А.; Беннер, Стивен А.; Краух, Тилман; Морони, Саймон Э.; Беннер, Стивен А. (4 января 1990 г.). «Ферментативное включение новой пары оснований в ДНК и РНК расширяет генетический алфавит». Природа . 343 (6253): 33–37. Бибкод : 1990Natur.343...33P . дои : 10.1038/343033a0 . ПМИД   1688644 . S2CID   4363955 .
  28. ^ Беннер, ЮАР; Хаттер, Д; Сисмур, AM (2003). «Синтетическая биология с искусственно расширенными генетическими информационными системами. От персонализированной медицины к внеземной жизни». Исследования нуклеиновых кислот. Добавка . 3 (3): 125–6. дои : 10.1093/насс/3.1.125 . ПМИД   14510412 .
  29. ^ Ян, З; Хаттер, Д; Шэн, П; Сисмур, AM; Беннер, С.А. (2006). «Искусственно расширенная генетическая информационная система: новая пара оснований с альтернативным паттерном водородных связей» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (21): 6095–101. дои : 10.1093/нар/gkl633 . ПМЦ   1635279 . ПМИД   17074747 .
  30. ^ Ян, Цзуньи; Чен, Фэй; Альварадо, Дж. Брайан; Беннер, Стивен А. (28 сентября 2011 г.). «Амплификация, мутация и секвенирование шестибуквенной синтетической генетической системы» . Журнал Американского химического общества . 133 (38): 15105–15112. дои : 10.1021/ja204910n . ПМЦ   3427765 . ПМИД   21842904 .
  31. ^ Мерритт, Кристен К; Брэдли, Кевин М; Хаттер, Дэниел; Мацуура, Марико Ф; Роуолд, Дайан Дж; Беннер, Стивен А. (9 октября 2014 г.). «Автономная сборка синтетических олигонуклеотидов, построенных из расширенного алфавита ДНК. Полный синтез гена, кодирующего устойчивость к канамицину» . Журнал органической химии Байльштейна . 10 : 2348–2360. дои : 10.3762/bjoc.10.245 . ПМЦ   4222377 . ПМИД   25383105 .
  32. ^ Лаос, Роберто; Томсон, Дж. Майкл; Беннер, Стивен А. (31 октября 2014 г.). «ДНК-полимеразы, созданные в результате направленной эволюции для включения нестандартных нуклеотидов» . Границы микробиологии . 5 : 565. дои : 10.3389/fmicb.2014.00565 . ПМК   4215692 . ПМИД   25400626 .
  33. ^ Комитет по пределам органической жизни в планетных системах, Комитет по происхождению и эволюции жизни; Совет космических исследований, Отдел инженерных и физических наук; Совет по наукам о жизни, отдел наук о Земле и жизни; Национальный исследовательский совет национальных академий (2007 г.). «4. Альтернативы терранской биохимии в воде» . Границы органической жизни в планетных системах . Вашингтон, округ Колумбия: Издательство национальных академий. ISBN  978-0-309-10484-5 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  34. ^ Поллак, Эндрю (24 июля 2001 г.). «Ученые начинают добавлять буквы в алфавит жизни» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 30 июня 2016 г.
  35. ^ Певица Эмили (10 июля 2015 г.). «Новые буквы добавлены в генетический алфавит» . Журнал Кванта . Проверено 30 июня 2016 г.
  36. ^ Свитцер, Калифорния; Морони, ЮВ; Беннер, Ю.А. (5 октября 1993 г.). «Ферментативное распознавание пары оснований между изоцитидином и изогуанозином». Биохимия . 32 (39): 10489–96. CiteSeerX   10.1.1.690.1426 . дои : 10.1021/bi00090a027 . ПМИД   7691174 .
  37. ^ Такезава, Юсуке; Сионоя, Мицухико (18 декабря 2012 г.). «Металло-опосредованное спаривание оснований ДНК: альтернативы парам оснований Уотсона-Крика с водородными связями». Отчеты о химических исследованиях . 45 (12): 2066–2076. дои : 10.1021/ar200313h . ПМИД   22452649 .
  38. ^ Jump up to: а б Саймон, Мэтью (2005). Новые вычисления с упором на биоинформатику . Нью-Йорк: AIP Press/Springer Science+Business Media. ISBN  978-0-387-27270-2 .
  39. ^ Уотсон Дж.Д., Крик Ф.Х. (1953). «Структура ДНК». Холодный источник Харб. Симп. Квант. Биол . 18 : 123–31. дои : 10.1101/SQB.1953.018.01.020 . ПМИД   13168976 .
  40. ^ Комитет по пределам органической жизни в планетных системах, Комитет по происхождению и эволюции жизни; Совет космических исследований, Отдел инженерных и физических наук; Совет по наукам о жизни, отдел наук о Земле и жизни; Национальный исследовательский совет национальных академий (2007 г.). «4. Альтернативы терранской биохимии в воде» . Границы органической жизни в планетных системах . Вашингтон, округ Колумбия: Издательство национальных академий. ISBN  978-0-309-10484-5 . {{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  41. ^ Беннер, Стивен (2004). «Анализ генома, основанный на эволюции: альтернатива анализу складки и функций белков» . В Вестхофе, Э.; Харди, Н. (ред.). Складывание и самосборка биологических и макромолекул: материалы конференции Deuxièmes Entretiens de Bures, Бюр-сюр-Иветт, Франция, 27 ноября - 1 декабря 2001 г. Сингапур: World Scientific. стр. 1–42. ISBN  978-981-238-500-0 . Проверено 6 июля 2016 г.
  42. ^ Беннер, Стивен А.; Хаттер, Дэниел (февраль 2002 г.). «Фосфаты, ДНК и поиск внеземной жизни: модель второго поколения генетических молекул» (PDF) . Биоорганическая химия . 30 (1): 62–80. дои : 10.1006/bioo.2001.1232 . ПМИД   11955003 . Проверено 6 июля 2016 г.
  43. ^ «Профессор Гастон Гонне: когда технология является ключом к эволюции» . ETH Цюрих . Проверено 9 июля 2016 г.
  44. ^ Гонне, GH; Коэн, Массачусетс; Беннер, Ю.А. (5 июня 1992 г.). «Исчерпывающее сопоставление всей базы данных последовательностей белков» (PDF) . Наука . 256 (5062): 1443–5. Бибкод : 1992Sci...256.1443G . дои : 10.1126/science.1604319 . ПМИД   1604319 . Проверено 9 июля 2016 г.
  45. ^ Jump up to: а б с «Геномика встречается с геологией» . Журнал «Астробиология» . 10 сентября 2001 года . Проверено 1 июля 2016 г.
  46. ^ Джонс, Дэвид Т. (1999). «Прогнозирование вторичной структуры белка на основе оценочных матриц для конкретных позиций» (PDF) . Журнал молекулярной биологии . 292 (2): 195–202. дои : 10.1006/jmbi.1999.3091 . ПМИД   10493868 . Архивировано из оригинала (PDF) 18 августа 2016 г. Проверено 6 июля 2016 г.
  47. ^ Беннер, ЮАР; Герлофф, Д. (1991). «Закономерности дивергенции гомологичных белков как индикаторы вторичной и третичной структуры: предсказание структуры каталитического домена протеинкиназ». Достижения в регуляции ферментов . 31 : 121–81. дои : 10.1016/0065-2571(91)90012-б . ПМИД   1877385 .
  48. ^ Гонне, Гастон Х.; Коростенский, Шанталь; Беннер, Стив (февраль 2000 г.). «Меры оценки множественного выравнивания последовательностей». Журнал вычислительной биологии . 7 (1–2): 261–276. CiteSeerX   10.1.1.48.4250 . дои : 10.1089/10665270050081513 . ПМИД   10890401 .
  49. ^ Рассел, РБ; Штернберг, MJE (май 1995 г.). «Прогнозирование структуры: насколько мы хороши?» . Современная биология . 5 (5): 488–490. Бибкод : 1995CBio....5..488R . дои : 10.1016/S0960-9822(95)00099-6 . ПМИД   7583096 .
  50. ^ Спото, Джузеппе; Коррадини, Роберто, ред. (2012). Обнаружение неамплифицированной геномной ДНК . Дордрехт: Спрингер. п. 104. ИСБН  978-94-007-1226-3 . Проверено 6 июля 2016 г.
  51. ^ Дамброт, Стюарт Мейсон (24 января 2014 г.). «Связующие узы: воссоздание дарвиновской эволюции лигандов in vitro» . Физика.орг . Проверено 6 июля 2016 г.
  52. ^ Джаннетто, Пол Дж.; Лалели-Сахин, Эльван; Вонг, Стивен Х. (1 января 2004 г.). «Методики фармакогеномного генотипирования». Клиническая химия и лабораторная медицина . 42 (11): 1256–64. дои : 10.1515/CCLM.2004.246 . ПМИД   15576288 . S2CID   34338787 .
  53. ^ «Резюме премии № 0304569 Наномасштабные массивы для прямого профилирования РНК в отдельных клетках и их компартментах» . Национальный научный фонд . Проверено 6 июля 2016 г.
  54. ^ Пласко, Кевин В.; Гросс, Майкл (2006). Астробиология: краткое введение . Балтимор: Издательство Университета Джонса Хопкинса. стр. 165–170. ISBN  978-0801883675 . Проверено 6 июля 2016 г.
  55. ^ Беннер, Стивен А. (июнь 2003 г.). «Интерпретационная протеомика - поиск биологического значения в базах данных генома и протеома» (PDF) . Достижения в регуляции ферментов . 43 (1): 271–359. CiteSeerX   10.1.1.104.7549 . дои : 10.1016/S0065-2571(02)00024-9 . ПМИД   12791396 . Проверено 6 июля 2016 г.
  56. ^ Джерманн, ТМ; Опиц, Дж.Г.; Стэкхаус, Дж; Беннер, Ю.А. (2 марта 1995 г.). «Реконструкция истории эволюции суперсемейства парнокопытных рибонуклеаз» (PDF) . Природа . 374 (6517): 57–9. Бибкод : 1995Natur.374...57J . дои : 10.1038/374057a0 . ПМИД   7532788 . S2CID   4315312 . Проверено 6 июля 2016 г.
  57. ^ Беннер, ЮАР; Карако, доктор медицины; Томсон, Дж. М.; Гоше, Е.А. (3 мая 2002 г.). «Планетарная биология - палеонтологическая, геологическая и молекулярная история жизни». Наука . 296 (5569): 864–8. Бибкод : 2002Sci...296..864B . дои : 10.1126/science.1069863 . ПМИД   11988562 . S2CID   2316101 .
  58. ^ Jump up to: а б с Либерлес, Дэвид А. (2007). Реконструкция наследственной последовательности . Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. п. 221. ИСБН  9780199299188 .
  59. ^ Уорд, Питер; Киршвинк, Джо (2014). Новая история жизни: радикально новые открытия о происхождении и эволюции жизни на Земле . США: Блумсбери. стр. 55–60. ISBN  978-1608199075 . Проверено 6 июля 2016 г.
  60. ^ Циммер, Карл (26 июня 2004 г.). «Что было до ДНК?» . Обнаружить . ISSN   0274-7529 .
  61. ^ Циммер, Карл (12 сентября 2013 г.). «Расширенная возможность возникновения жизни» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 1 июля 2016 г.
  62. ^ Бойд, Роберт С. (11 ноября 2002 г.). «Здесь есть кто-нибудь? Экстремальные условия Земли проверяют идеи астробиологии» . Филадельфийский исследователь . Проверено 6 июля 2016 г.
  63. ^ Гринвуд, Вероника (9 ноября 2009 г.). «Что жизнь оставляет за тем, что мы знаем: поиски жизни за пределами нашей бледно-голубой точки чреваты разбитыми надеждами. Будут ли химические и минеральные отпечатки земных организмов применимы в других мирах?» . Журнал семян . Архивировано из оригинала 15 ноября 2009 года . Проверено 6 июля 2016 г. {{cite journal}}: CS1 maint: неподходящий URL ( ссылка )
  64. ^ Беннер, Стивен А.; Хаттер, Дэниел (01 февраля 2002 г.). «Фосфаты, ДНК и поиск внеземной жизни: модель второго поколения генетических молекул» . Биоорганическая химия . 30 (1): 62–80. дои : 10.1006/bioo.2001.1232 . ПМИД   11955003 .
  65. ^ Беннер, Стивен А. (27 февраля 2023 г.). «Переосмысление нуклеиновых кислот от их происхождения до их применения» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 378 (1871). дои : 10.1098/rstb.2022.0027 . ISSN   0962-8436 . ПМЦ   9835595 . ПМИД   36633284 .
  66. ^ Шпачек, Ян; Беннер, Стивен А. (01 октября 2022 г.). «Агностический искатель жизни (ALF) для крупномасштабного обследования марсианской жизни во время дозаправки на месте» . Астробиология . 22 (10): 1255–1263. Бибкод : 2022AsBio..22.1255S . дои : 10.1089/ast.2021.0070 . ISSN   1531-1074 . ПМИД   35796703 .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Steven_A._Benner&oldid=1239876844"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 3f9848ded329cda17e8bcd56da2c0230__1723423740
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/3f/30/3f9848ded329cda17e8bcd56da2c0230.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Steven A. Benner - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)