Jump to content

Apektx1

Apektx1
Идентификаторы
Символ N/a
Refseq P86862.1
Uniprot P86862
Искать
StructuresSwiss-model
DomainsInterPro

Ингибитор сериновой протеазы типа Kunitz Apektx1 представляет собой пептидный токсин , полученный из морского анемона Anthopleura elegantissima . Этот токсин выполняет двойную функцию, действуя как ингибитор сериновой протеазы , так и в качестве селективного и мощного блокатора пор K V 1.1 , канала калиевого калиевого калиевого калиета , связанного с напряжением.

Источники

[ редактировать ]

Apektx1 - это мощный токсин, очищенный от морского анемона A. elegantissima . [ 1 ] Помимо Apektx1, другие токсины, такие как Apetx1 , [ 2 ] APE1-1, APE1-2, APE2-2, APC, [ 3 ] и apetx2 [ 4 ] были идентифицированы в A. elegantissima .

Прогнозирование мономерной структуры APEKTX1 (альфа-разворота модели). Средняя достоверность на остаток (PLDDT) составляет 91,46%. Уровни уверенности модели представлены цветной кодировкой: темно -синий очень высокий (PLDDT> 90), светло -синий высокий (90> PLDDT> 70), оранжевый низкий (70> PLDDT> 50) и желтый очень низкий (PLDDT <50 )

Этот пептид имеет 65 аминокислот, сшитые 3 дисульфидными мостами , и имеет молекулярную массу 7475 Да. Это действует как мономер. Токсин принадлежит к пептидам морского анемона типа 2, нацеленными на K-каналы, управляемые напряжением. Другие токсины типа 2 - это каликладины из аневмонных сульков , которые избирательно блокируют K V 1,2, каналы [ 5 ] и SHTX II из Стиходактилы Хаддони . [ 6 ] Структурная гомология также используется с основным ингибитором трипсина поджелудочной железы (BPTI) , очень мощным ингибитором протеазы типа Kunitz и дендротоксинами (DTX I и α-DTX), которые являются мощными ингибиторами калимовых каналов, управляемых напряжением. [ 1 ]

Apektx1
Аминокислотная последовательность
Insicllpkkqgfcrarfprfyynsstrrcemfy

Yggcggnannfntleecekvclgygeawkap

Apektx1 является высокоселективным блокировщиком калиевых каналов, управляемого напряжением, K V 1,1 без влияния на другие протестированные каналы калия ( K V 1,2 , K V 1,3 , K V 1,4 , K V 1,5 , K V 1,6 , Shaker IR, K V 2.1 , k v 3.1 , k v 4.2 и k v 4.3 ). [ 1 ] APEKTX1 селективно блокирует K V каналы 1,1 со значением IC50 0,9 нм, что делает его в 700-3000 раз больше мощного ингибитора, чем два известных пептидов морских анемонов, нацеленных на каналы k V (каликладины и SHTX II). [ 1 ] Считается, что apektx1 взаимодействует с k v 1,1 через алифатический остаток аланин (A352), кислый глутамат остатка (E353) и ароматический остаток тирозин (Y379), поскольку мутация в этих местах вызывает потерю аффинности токсина K V 1.1. [ 1 ] [ 7 ] Эти остатки расположены в петле H5 между доменами S5 и S6 и являются частью пор канала. [ 7 ] [ 8 ]

Кроме того, APEKTX1 действует как мощный ингибитор трипсина ( K D = 124 нм), вероятно, конкурентоспособный. Тем не менее, ингибирование трипсина является более мощным (поскольку оно имеет более высокую аффинность) в BPTI, что может быть объяснено присутствием PHE13 и Pro19 в apektx1, вызывая неблагоприятное взаимодействие. [ 1 ]

Способ действия

[ редактировать ]

APEKTX1 работает, блокируя канал K V 1.1 в его открытой конформации, не демонстрируя влияния на зависимость от напряжения канала. [ 1 ] В отличие от некоторых гомологичных токсинов, таких как DTX-K, APEKTX1 может полностью заблокировать K + текущий. Предполагается, что сайт связывания токсина расположен на внеклеточной стороне, о чем свидетельствует быстрое ингибирование тока через каналы K V 1.1 и обратимое связывание при вымывании. В отличие от необратимого связывания DTX K дендротоксинов (которые гомологичны APEKTX1), действие APEKTX1 обратимо. Возможно, это связано с заменой лизина (Lys3 или Lys26) нейтральным аргинином в apektx1. [ 1 ] APEKTX1, вероятно, содержит диаду: пара аминокислотных остатков, состоящих из базового остатка, и гидрофобный остаток, отделенный друг от друга на 6,6 ± 1,0 Å, которые взаимодействуют с ароматическими остатками на P-петле, участвующем в аффинности взаимодействия канала-токсина. [ 1 ] [ 9 ] Диада apektx1 образуется ARG15 и PHE13, разделенной на 6,2 Å, способствуя образованию физического барьера, который противостоит K + отток. [ 10 ] Предположительно, боковая цепь Arg15 входит в поры K V 1.1 и взаимодействует с остатками ASP377, в то время как PHE13 взаимодействует с гидрофобными остатками, включая TYR375, который критически связан с аффинностью взаимодействия с токсинами морских анемонов. [ 1 ] [ 11 ]

Взаимодействие apektx1 с K v 1.1 каналы следует кинетическому поведению бимолекулярной реакции, что означает, что скорость связывания зависит от концентрации обоих реагентов (токсин и канал). [ 1 ]

  1. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k Peigneur S, Billen B, Derua R, Waelkens E, Debaveye S, Béreses L, Tytgat J (июль 2011 г.). «Бифункциональный пептид морского анемона с протеазой типа Куниц и свойствами, ингибирующими калиевый канал» . Биохимическая фармакология . 82 (1): 81–90. doi : 10.1016/j.bcp.2011.03.023 . PMID   21477583 . S2CID   20886727 .
  2. ^ Diochot S, Loret E, Bruhn T, Béress L, Lazdunski M (июль 2003 г.). «Apetx1, новый токсин из морского анемона Anthopleura elegantissima, блокирует управляемые напряжением генные каналы, связанные с человеческим эфиром, связанные с геном». Молекулярная фармакология . 64 (1): 59–69. doi : 10.1124/моль.64.1.59 . PMID   12815161 .
  3. ^ Bruhn T, Schaller C, Schulze C, Sanchez-Rodriguez J, Dannmeier C, Ravens U, et al. (Май 2001). «Выделение и характеристика пяти нейротоксических и кардиотоксических полипептидов из морского анемона антоплевра Elegantissima». Токсикона . 39 (5): 693–702. doi : 10.1016/s0041-0101 (00) 00199-9 . PMID   11072049 .
  4. ^ Diochot S, Baron A, Rash LD, Deval E, Escoubas P, Scrzello S, et al. (Апрель 2004 г.). «Новый пептид морского анемона APETX2 ингибирует ASIC3, основной чувствительный к кислоте канал в сенсорных нейронах» . Embo Journal . 23 (7): 1516–1525. doi : 10.1038/sj.emboj.7600177 . PMC   391081 . PMID   15044953 .
  5. ^ Schweitz H, Bruhn T, Guillemare E, Moinier D, Lancelin JM, Béress L, Lazdunski M (октябрь 1995 г.). «Каликлудины и калисептин. Два разных класса токсинов морского анемона для чувствительных к напряжению K+ каналов» . Журнал биологической химии . 270 (42): 25121–25126. doi : 10.1074/jbc.270.42.25121 . PMID   7559645 .
  6. ^ Хонма Т., Кавахата С., Ишида М., Нагай Х, Нагасима Ю., Шиоми К (апрель 2008 г.). «Новые пептидные токсины из морского анемона Стиходактила Хаддони». Пептиды . 29 (4): 536–544. doi : 10.1016/j.peptides.2007.12.010 . PMID   18243416 . S2CID   207356560 .
  7. ^ Jump up to: а беременный Херст Р.С., Буш А.Е., Кавано -депутат, Осборн П.Б., Норт Р.А., Адельман Дж.П. (октябрь 1991 г.). «Идентификация аминокислотных остатков, вовлеченных в блок дендротоксина напряжения крыс, зависимых от калиевого канала». Молекулярная фармакология . 40 (4): 572–576. PMID   1921987 .
  8. ^ Tytgat J, Debont T, Carmeliet E, Daenens P (октябрь 1995). «Альфа-дендротоксин на канале калия млекопитающего» . Журнал биологической химии . 270 (42): 24776–24781. doi : 10.1074/jbc.270.42.24776 . PMID   7559595 .
  9. ^ Dauplais M, Lecoq A, Song J, Cotton J, Jamin N, Gilquin B, et al. (Февраль 1997 г.). «О конвергентной эволюции токсинов животных. Сохранение диада функциональных остатков в токсинах блокирующих калиевые каналы с не связанными структурами» . Журнал биологической химии . 272 (7): 4302–4309. doi : 10.1074/jbc.272.7.4302 . PMID   9020148 .
  10. ^ Mouhat S, De Waard M, Sabatier JM (февраль 2005 г.). «Вклад функциональной диады токсинов животных, действующих на управляемые напряжением каналы типа KV1». Журнал пептидной науки . 11 (2): 65–68. doi : 10.1002/psc.630 . PMID   15635666 . S2CID   31444823 .
  11. ^ Gilquin B, Braud S, Eriksson MA, Roux B, Bailey TD, Sriest BT, et al. (Июль 2005 г.). «Переменный остаток в поре каналов KV1 имеет решающее значение для высокого сродства блокаторов из морских анемонов и скорпионов» . Журнал биологической химии . 280 (29): 27093–27102. doi : 10.1074/jbc.m413626200 . PMID   15890656 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 445e72772534e0edf0b6c702eb2c7d93__1702145820
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/44/93/445e72772534e0edf0b6c702eb2c7d93.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
APEKTx1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)