ТРДМТ1

ТРДМТ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1G55
Идентификаторы
Псевдонимы	TRDMT1 , DMNT2, DNMT2, MHSAIIP, PUMET, RNMT1, тРНК метилтрансфераза аспарагиновой кислоты 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 602478 ; МГИ : 1274787 ; Гомологен : 3249 ; GeneCards : TRDMT1 ; ОМА : TRDMT1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	17,202,054 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	13,549,479 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; buccal mucosa cell; ; Achilles tendon; ; ganglionic eminence; ; right uterine tube; ; testicle; ; epithelium of colon; ; monocyte; ; sural nerve; ; gonad;
	Top expressed in
	otic placode; ; saccule; ; otic vesicle; ; atrioventricular valve; ; spermatocyte; ; granulocyte; ; secondary oocyte; ; zygote; ; primitive streak; ; primary oocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	methyltransferase activity; transferase activity; tRNA methyltransferase activity; RNA binding; tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	response to amphetamine; methylation; tRNA methylation; tRNA modification; tRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1787
	13434
	ENSG00000107614
	ENSMUSG00000026723
	О14717
	О55055
showНМ_004412 ; НМ_176081 ; НМ_176083 ; НМ_176084 ; НМ_176085 ;
	NM_176086; NM_001321006; NM_001321007; NM_001351219; NM_001351220; NM_001351221; NM_001351222; NM_001351223
	НМ_010067
showНП_001307935 ; НП_001307936 ; НП_004403 ; НП_001338148 ; НП_001338149 ;
	NP_001338150; NP_001338151; NP_001338152
	НП_034197
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

тРНК (цитозин-5-)-метилтрансфераза — фермент , который у человека кодируется TRDMT1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Метилирование CpG — это эпигенетическая модификация, которая важна для эмбрионального развития, импринтинга и инактивации Х-хромосомы. Исследования на мышах показали, что метилирование ДНК необходимо для развития млекопитающих. Этот ген кодирует белок, сходный с ДНК-метилтрансферазами, но этот белок не проявляет метилтрансферазной активности. Белок прочно связывает ДНК, что позволяет предположить, что он может маркировать определенные последовательности в геноме. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию множества вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. ^{[ 8 ]}

Было показано, что DNMT2 человека не метилирует ДНК, а вместо этого метилирует цитозин 38 в антикодоновой петле РНК-переносчика аспарагиновой кислоты ( тРНК(Asp) ). ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000107614 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026723 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Йодер Дж. А., Бестор TH (март 1998 г.). «Кандидат ДНК-метилтрансферазы млекопитающих, родственная pmt1p делящихся дрожжей» . Хум Мол Жене . 7 (2): 279–84. дои : 10.1093/hmg/7.2.279 . ПМИД 9425235 .
^ Вилен А., Апиу Ф., Дютрилья Б., Малфой Б. (ноябрь 1998 г.). «Присвоение кандидатного гена ДНК-метилтрансферазы (DNMT2) полосе хромосомы человека 10p15.1 путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 82 (1–2): 120. дои : 10.1159/000015083 . ПМИД 9763678 . S2CID 46803768 .
^ Голл М.Г., Кирпекар Ф., Маггерт К.А., Йодер Дж.А., Се С.Л., Чжан Х, Голич К.Г., Якобсен С.Е., Бестор Т.Х. (январь 2006 г.). «Метилирование тРНКАсп гомологом ДНК-метилтрансферазы Dnmt2». Наука . 311 (5759): 395–8. Бибкод : 2006Sci...311..395G . дои : 10.1126/science.1120976 . ПМИД 16424344 . S2CID 39089541 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TRDMT1 тРНК метилтрансфераза аспарагиновой кислоты 1» .
^ Голл М.Г., Кирпекар Ф., Маггерт К.А. и др. (2006). «Метилирование тРНКАсп гомологом ДНК-метилтрансферазы Dnmt2». Наука . 311 (5759): 395–8. Бибкод : 2006Sci...311..395G . дои : 10.1126/science.1120976 . ПМИД 16424344 . S2CID 39089541 .

Дальнейшее чтение

Окано М, Се С, Ли Э (1998). «Dnmt2 не требуется для de novo и поддержания метилирования вирусной ДНК в эмбриональных стволовых клетках» . Нуклеиновые кислоты Рез . 26 (11): 2536–40. дои : 10.1093/нар/26.11.2536 . ПМК 147598 . ПМИД 9592134 .
Ван ден Вингаерт И., Шпренгель Дж., Касс С.У., Люйтен В.Х. (1998). «Клонирование и анализ новой предполагаемой ДНК-метилтрансферазы человека» . ФЭБС Летт . 426 (2): 283–9. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00362-7 . ПМИД 9599025 . S2CID 7887099 .
Донг А., Йодер Дж.А., Чжан Х. и др. (2001). «Структура человеческого DNMT2, загадочного гомолога ДНК-метилтрансферазы, который устойчив к денатурации связывается с ДНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (2): 439–48. дои : 10.1093/нар/29.2.439 . ПМК 29660 . ПМИД 11139614 .
Франчина М., Хупер Дж., Кей П.Х. (2001). «Пять новых альтернативно сплайсированных транскриптов ДНК (цитозин-5) метилтрансферазы 2 в лейкоцитах периферической крови человека». Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 33 (11): 1104–15. дои : 10.1016/S1357-2725(01)00074-7 . ПМИД 11551826 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Герман А., Шмитт С., Йельч А. (2003). «Человеческий Dnmt2 обладает остаточной активностью ДНК-(цитозин-C5)-метилтрансферазы» . Ж. Биол. Хим . 278 (34): 31717–21. дои : 10.1074/jbc.M305448200 . ПМИД 12794065 .
Делоукас П., Земляной М.Э., Графхэм Д.В. и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 10 хромосомы человека» . Природа . 429 (6990): 375–81. Бибкод : 2004Natur.429..375D . дои : 10.1038/nature02462 . ПМИД 15164054 .
Сюн Ю, Дауди С.С., Сюэ А и др. (2005). «Противоположные изменения экспрессии гена ДНК-метилтрансферазы при эндометриоидном и серозном раке эндометрия». Гинекол. Онкол . 96 (3): 601–9. дои : 10.1016/j.ygyno.2004.11.047 . ПМИД 15721400 .
Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома» . Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
Панг С.Т., Венг В.Х., Флорес-Моралес А. и др. (2006). «Цитогенетические профили и профили экспрессии, связанные с трансформацией в андроген-резистентный рак простаты». Простата . 66 (2): 157–72. дои : 10.1002/pros.20328 . ПМИД 16173030 . S2CID 26023143 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 10 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000107614 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026723 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9425235-5] Йодер Дж. А., Бестор TH (март 1998 г.). «Кандидат ДНК-метилтрансферазы млекопитающих, родственная pmt1p делящихся дрожжей» . Хум Мол Жене . 7 (2): 279–84. дои : 10.1093/hmg/7.2.279 . ПМИД 9425235 .

[pmid9763678-6] Вилен А., Апиу Ф., Дютрилья Б., Малфой Б. (ноябрь 1998 г.). «Присвоение кандидатного гена ДНК-метилтрансферазы (DNMT2) полосе хромосомы человека 10p15.1 путем гибридизации in situ». Цитогенетический клеточный генетик . 82 (1–2): 120. дои : 10.1159/000015083 . ПМИД 9763678 . S2CID 46803768 .

[pmid16424344-7] Голл М.Г., Кирпекар Ф., Маггерт К.А., Йодер Дж.А., Се С.Л., Чжан Х, Голич К.Г., Якобсен С.Е., Бестор Т.Х. (январь 2006 г.). «Метилирование тРНКАсп гомологом ДНК-метилтрансферазы Dnmt2». Наука . 311 (5759): 395–8. Бибкод : 2006Sci...311..395G . дои : 10.1126/science.1120976 . ПМИД 16424344 . S2CID 39089541 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: TRDMT1 тРНК метилтрансфераза аспарагиновой кислоты 1» .

[9] Голл М.Г., Кирпекар Ф., Маггерт К.А. и др. (2006). «Метилирование тРНКАсп гомологом ДНК-метилтрансферазы Dnmt2». Наука . 311 (5759): 395–8. Бибкод : 2006Sci...311..395G . дои : 10.1126/science.1120976 . ПМИД 16424344 . S2CID 39089541 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]