Ли Альтенберг
Ли Альтенберг | |
---|---|
Рожденный | Ли Альтенберг |
Национальность | Американский |
Альма-матер | Калифорнийский университет, Беркли |
Известный | Эволюция эволюционности Принцип сокращения |
Награды | Премия Онипаа (2011) |
Научная карьера | |
Поля | Эволюционная теория Популяционная генетика Линейная алгебра |
Учреждения | Гавайский университет в Маноа Институт Конрада Лоренца Университет Дьюка Институт Ронинов |
Диссертация | Обобщение теории эволюции генов-модификаторов (1984) |
Докторантура | Маркус В. Фельдман [1] |
Другие научные консультанты | Гленис Томсон |
Веб-сайт | динамика |
Ли Альтенберг — американский биолог-теоретик . Он работает на факультете информатики, компьютерных наук и математики Гавайского университета в Маноа . Он наиболее известен своей работой, которая помогла установить эволюцию эволюционности и модульности на карте генотип-фенотип как области исследований в эволюционной биологии. [2] [3] для перемещения теоретических концепций между областями эволюционной биологии и эволюционных вычислений , [4] [5] [6] и за математическую унификацию и обобщение моделей генов-модификаторов для эволюции передачи биологической информации, поместив в единую математическую основу эволюцию скорости мутаций, скорости рекомбинации, скорости полового размножения и скорости расселения. [7] [8]
Альтенберг является заместителем редактора журнала BioSystems и входит в состав редакционных советов журналов «Генетическое программирование, развивающиеся машины и искусственная жизнь» , а также в Общества вычислительного интеллекта IEEE по искусственной жизни и сложным адаптивным системам. рабочей группе [9]
Образование [ править ]
Альтенберг получил степень бакалавра генетики в 1980 году в Калифорнийском университете в Беркли, защитив диссертацию под руководством Гленис Томсон по теории частотно-зависимого отбора . [10] Он получил докторскую степень. получил степень бакалавра биологических наук в 1985 году в Стэнфордском университете под руководством Маркуса В. Фельдмана с диссертацией, объединяющей модели эволюции генов-модификаторов. [11]
Карьера [ править ]
Альтенберг получил постдокторантуру в Стэнфордском университете, Университете штата Северная Каролина и Университете Дьюка. Будучи постдокторантом в Университете Дьюка первый курс по эволюционным вычислениям , Альтенберг предложил там . Когда его отец заболел криоглобулинемией , он переехал с ним на Гавайи из-за теплых температур. [12] В 2002 году Альтенберг был назначен доцентом кафедры информатики и компьютерных наук Гавайского университета в Маноа . Он снова предложил провести там первые курсы по эволюционным вычислениям. В 2013 году Альтенберг был постоянным посетителем Института математических биологических наук Университета штата Огайо , а в 2014–2016 годах — старшим научным сотрудником Института исследований эволюции и познания Конрада Лоренца . утвердил Попечительский совет Гавайского университета его повышение до профессора в 2020 году. [13] С 2013 года Альтенберг является научным сотрудником Института Ронина . [14] [15]
Исследования [ править ]
Исследования Альтенберга сосредоточены на раскрытии математических взаимосвязей в динамике биологической эволюции и эволюционных алгоритмах . Его особенно интересуют явления более высокого порядка, такие как эволюция эволюционности , эволюция передачи генетической информации и эволюция карты генотип-фенотип . Его главными достижениями были (1) унификация теории эволюции генетических систем (скорости рекомбинации и мутаций) путем включения их в пространство инклюзивного наследования, которое включает как пространственную, так и культурную информацию, и (2) разработку представление об изменчивых свойствах организмов как явлениях, подчиняющихся эволюционной динамике. Это включает в себя открытие механизмов, которые приводят к эволюции эволюционности и модульности карты генотип-фенотип. [16] [7]
Математическая широта его теоретических работ сделала их применимыми к проблемам эволюционных вычислений. [8] Его работа по эволюции передачи биологической информации потребовала разработки новых спектральных теорем для линейных операторов , включая объединение теории реакции-диффузии, предсказывающей эволюцию медленного рассеяния, с предсказаниями принципа редукции для моделей мутации, рекомбинации и эволюции скорости миграции. [17] Он применил спектральную теорию, чтобы понять эволюцию мутационной устойчивости . [18]
Альтенберг представил ряд концепций, которые были приняты в нескольких областях:
- введение уравнения Прайса в эволюционную теорию вычислений [16] [19]
- механизмы эволюции эволюционности и модульности [16] [20] [21] [22] [23]
- концептуальное разграничение генеративных и вариационных свойств карты генотип-фенотип [22] [24]
- отбор выводка в эволюционных алгоритмах [16] [25]
- обобщение Стюарта Кауфмана » « НК-пейзажей , [20] применяется к технологической эволюции [26]
- обобщение принципа редукции на бесконечномерные пространства, которое объединило модели реакции-диффузии для эволюции рассеяния, [17] и применялся к моделям эпидемий. [27]
Экологическая и социальная работа [ править ]
- История Лиландом Стэнфордом забытой защиты рабочих кооперативов [28] [29]
- Постановление о световом загрязнении для Мауи, Гавайи [30]
- Сохранение низинных сухих естественных лесов на острове Мауи, Гавайи. [31]
- Во время пандемии SARS-CoV-2 он работал в рабочей группе по прикладному моделированию пандемии на Гавайях. [32]
Награды и почести [ править ]
- Делегат Калифорнии в Национальном молодежном научном лагере в 1975 году. [33]
- Риджентс Калифорнийского университета , 1975–1979 гг. Стипендиат [33]
- Избран в Фи Бета Каппа в 1979 году. [33]
- Бакалавр гуманитарных наук с отличием по общей стипендии, Калифорнийский университет, Беркли, 1980 год.
- медицинского факультета Стэнфордского университета , 1985–1986 годы. Постдокторант декана [33]
- Председатель Общества коренных гавайских растений на Мауи, 2005–2007 гг.
- Премия Онипаа в 2011 году, [34] награжден Гавайским отделением Сьерра-клуба за работу по принятию законодательства по предотвращению светового загрязнения на острове Мауи . [30] и навсегда сохранить находящуюся под угрозой исчезновения среду обитания сухих лесов в гавайских низменностях на острове Мауи. [31]
- Старший научный сотрудник Института исследований эволюции и познания Конрада Лоренца, 2014–2016 гг. [7]
- IEEE Computational Intelligence Society в 2017 году Интервью проекта устной истории [6]
- Член Института фундаментальных вопросов (FQXi) в 2020 г. [35]
Профессиональные общества [ править ]
Альтенберг является пожизненным членом:
Внешние ссылки [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ Ли Альтенберг в проекте математической генеалогии
- ^ Баранюк, Крис (2 марта 2017 г.). «Жизнь, возможно, на самом деле становится лучше по мере развития» . BBC Земля . Проверено 14 сентября 2019 г.
- ^ Нуньо де ла Роса, Лаура (2017). «Вычисление расширенного синтеза: отображение динамики и концептуальной структуры фронта исследования эволюционности». Журнал экспериментальной зоологии, часть B: Молекулярная эволюция и эволюция развития . 328 (5): 395–411. дои : 10.1002/jez.b.22741 . ПМИД 28488750 . S2CID 22229072 .
- ^ Чарльз В. Пети (27 июля 1998 г.). «Прикосновение к природе: заставляем эволюцию работать на конвейере» . Генетическое программирование . Новости США и мировой отчет . Проверено 19 сентября 2019 г.
- ^ Ли Альтенберг (2016). Климан, Ричард М. (ред.). Энциклопедия эволюционной биологии . Эльзевир. стр. 40–47. ISBN 9780128000496 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Рудольф Зейзинг; Ли Альтенберг (6 апреля 2018 г.). «Интервью с Ли Альтенбергом, 2017: Проект устной истории СНГ» (Видео) . Общество вычислительной разведки IEEE . Гонолулу, Гавайи: IEEE . Проверено 16 сентября 2019 г.
Интервью с членом СНГ Ли Альтенбергом, записанное на серии симпозиумов IEEE по вычислительному интеллекту 2017 года (IEEE SSCI 2017). Интервью Рудольфа Зейзинга.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с «Феллоуз Ли Альтенберг» . Институт Конрада Лоренца . КЛИ . Проверено 16 сентября 2019 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Биография Ли Альтенберга» . 2017: Проект «Устная история СНГ» . IEEE.TV. Проверено 15 сентября 2019 г.
- ^ «Целевая группа по искусственной жизни и сложным адаптивным системам» . binghamton.edu . Проверено 18 сентября 2019 г.
- ^ Альтенберг, Ли (1991). «Хаос от линейного частотно-зависимого выбора». Американский натуралист . 138 (1): 51–68. дои : 10.1086/285204 . S2CID 84389673 .
- ^ Альтенберг, Ли (1984). Обобщение теории эволюции генов-модификаторов . Стэнфордский университет: Университетские микрофильмы. п. 237. CiteSeerX 10.1.1.187.5507 .
- ^ Дайк, доктор Дайан (22 февраля 2013 г.). «Путешествие папы с криоглобулинемией, доктор Ли Альтенберг» (Видео) . Блог Talk Radio . Игл, Колорадо, 81631 . Проверено 19 сентября 2019 г.
{{cite web}}
: CS1 maint: местоположение ( ссылка ) - ^ «Список полномочий и продвижения по службе UH 2020» . Новости Гавайского университета . Гавайский университет. 22 июня 2020 г. Проверено 28 июля 2020 г.
- ^ «Домашняя страница Ли Альтенберга» . динамика.орг . Проверено 21 марта 2021 г.
- ^ «Профиль научного сотрудника Института Ронина» . Институт Ронина . Проверено 21 марта 2021 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Ли Альтенберг (1994). Киннер, Кеннет (ред.). Эволюция эволюционности в генетическом программировании . Кембридж, Массачусетс: MIT Press. стр. 47–74. ISBN 9780262515535 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Альтенберг, Ли (2012). «Резолвентные положительные линейные операторы демонстрируют феномен редукции» . Труды Национальной академии наук . 109 (10): 3705–3710. arXiv : 1108.4546 . Бибкод : 2012PNAS..109.3705A . дои : 10.1073/pnas.1113833109 . ПМК 3309728 . ПМИД 22357763 .
- ^ Альтенберг, Ли (2015). «Фундаментальные свойства эволюции мутационной устойчивости». п. 1508.07866. arXiv : 1508.07866 [ q-bio.PE ].
- ^ Альтенберг, Ли (1995). Уитли, Даррелл Л.; Восе, Майкл Д. (ред.). Теорема о схеме и теорема Прайса . Сан-Матео, Калифорния: Морган Кауфманн. стр. 23–49. ISBN 978-1-55860-356-1 . Проверено 24 ноября 2019 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Альтенберг, Ли (1994). «Развитие лучших представлений посредством избирательного роста генома». Материалы Первой конференции IEEE по эволюционным вычислениям Всемирного конгресса IEEE по вычислительному интеллекту ICEC-94 . Том. 1. С. 182–187. дои : 10.1109/ICEC.1994.350019 . ISBN 0-7803-1899-4 . S2CID 5140043 .
- ^ Альтенберг, Ли (1994). Зебальд, А.В. (ред.). Эмерджентные явления в генетическом программировании . Мировое научное издательство. стр. 233–241. ISBN 9810218109 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Альтенберг, Ли (1995). «Рост генома и эволюция карты генотип-фенотип». В Банцхафе, Вольфганг; Экман, Фрэнк Х. (ред.). Эволюция и биовычисления: вычислительные модели эволюции . Конспекты лекций по информатике. Том. 899. Берлин; Нью-Йорк: Springer-Verlag Berlin Heidelberg . стр. 205–259. дои : 10.1007/3-540-59046-3_11 . ISBN 978-3-540-59046-0 . S2CID 10378755 .
- ^ Вагнер, Гюнтер П.; Альтенберг, Ли (июнь 1996 г.). «Сложные адаптации и эволюция эволюционности» . Эволюция . 50 (3): 967–976. дои : 10.1111/j.1558-5646.1996.tb02339.x . ISSN 0014-3820 . ПМИД 28565291 . S2CID 21040413 .
- ^ Армбрустер, В. Скотт (2014). «Интегрированные фенотипы: понимание ковариации признаков у растений и животных» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 369 (1649): 20130245. doi : 10.1098/rstb.2013.0245 . ПМК 4084533 . ПМИД 25002693 .
- ^ Уй, Нгуен Куанг (2011). «Семантический кроссовер в генетическом программировании: применение к символической регрессии с действительным знаком» (PDF) . Генетическое программирование и развивающиеся машины . 12 (2). Спрингер: 91–119. дои : 10.1007/s10710-010-9121-2 . hdl : 10197/3528 . S2CID 901032 .
- ^ Иоганн Петер Мурманн; Коэн Френкен (2006). «На пути к систематической основе исследований доминирующих дизайнов, технологических инноваций и промышленных изменений» (PDF) . Исследовательская политика . 35 (7). Эльзевир: 925–952. дои : 10.1016/j.respol.2006.04.011 . hdl : 1874/387421 . S2CID 10623052 . Архивировано из оригинала (PDF) 21 сентября 2019 г.
- ^ Гао, Даочжоу; Донг, Чао-Пин (2020). «Быстрая диффузия препятствует вспышкам болезней». Труды Американского математического общества . 148 (4): 1709–1722. arXiv : 1907.12229 . дои : 10.1090/proc/14868 . S2CID 198968008 .
- ^ Альтенберг, Ли (1990). «За пределами капитализма: забытое видение Леланда Стэнфорда» . Песчаник и плитка . 14 (1). Стэнфорд, Калифорния: Стэнфордское историческое общество: 8–20 . Проверено 16 сентября 2019 г.
- ^ Шотт-Розенфилд, Эбигейл (23 декабря 2014 г.). «Уголок истории: видение Стэнфорда Леландом Стэнфордом» . Стэнфорд Дейли . Проверено 14 сентября 2019 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Херли, Тимоти (24 января 2002 г.). «Любители звезд Мауи хотят темного неба» . Рекламодатель Гонолулу . Проверено 14 сентября 2019 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Сан-Николас, Клодин (16 мая 2007 г.). «Проект Мауи на 1400 квартир подвергается атаке» . Новости Мауи . Проверено 16 сентября 2019 г.
- ^ «Рабочая группа по прикладному моделированию пандемии на Гавайях» . Привет ПАМ . Проверено 25 мая 2022 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Альтенберг, Ли. "Резюме" . динамика.орг . Проверено 16 сентября 2019 г.
- ^ «Руководитель ДЛНР выступит на ежегодном собрании Sierra Club» . Новости Лахайны . Проверено 14 сентября 2019 г.
- ^ «Членство в FQXi» . Институт фундаментальных вопросов . Проверено 21 апреля 2020 г.