Бартонегтавириформный

Бартонегтавириформный
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Семья:	Бартогтавириформиды
Род:	Бартонегтавириформный
Разновидность
	Бартонегтавириформный андерсони ;
Синонимы
	Бартонегтавириформный андерсони Агент переноса генов бартонеллы ; БаГТА ;

Bartonegtaviriform — род вируформ семейства Bartogtaviriformidae . Включает один вид: Bartonegtaviriform andersoni (BaGTA), который является агентом переноса генов , обнаруженным у бактерий рода Bartonella . ^{[ 1 ]}

Имя

Фамилия, Bartogtaviriformidae , представляет собой сумку от Barto , от «хозяина» Bartonella , gta от агента переноса генов и viriformidae , того факта, что это вириформа. ^{[ 2 ]}

Название рода, Bartonegtaviriform, представляет собой комбинацию Bartone , от «хозяина» Bartonella , gta, от агента переноса гена, и viriform, того факта, что это вириформ. ^{[ 2 ]}

Видовое название andersoni названо в честь исследователя GTA Берта Андерсона, который первым обнаружил частицы BaGTA. ^{[ 2 ]}

Агенты переноса генов

GTA можно рассматривать как форму «одомашненного» профага — то есть, полученного наследственно от бактериофага генома , но измененного хозяином для придания адаптивного преимущества — и, таким образом, представляют собой одну из многих фага, наблюдаемых в бактериальных геномах. адаптивных функций, происходящих от ^{[ 3 ]}

Филогения

Анализ геномной последовательности показал, что все бактерии рода Bartonella характеризуются наличием специфичной для Bartonella GTA (BaGTA), которая не имеет гомологии с ранее описанными системами GTA. BaGTA кодируется выше точки начала репликации (ROR), еще одной консервативной особенности геномов Bartonella , которая, как предполагается, связана с активностью BaGTA. Филогенетический анализ выявил BaGTA как ключевую инновацию, связанную с адаптивным излучением, которое характеризует эти зоонозные бактериальные патогены. Хотя BaGTA не связан напрямую с патогенностью Bartonella, было предложено стимулировать обмен и диверсификацию факторов взаимодействия с хозяином в сообществах Bartonella, таких как система секреции VirB типа IV ( T4SS ) и родственные ей эффекторные белки Bartonella. Поддержание BaGTA, вероятно, обусловлено отбором, повышающим вероятность генетического обмена и облегчающим адаптацию к специфичным для хозяина защитным системам во время инфекции. ^{[ 3 ]}

Роль

Несмотря на четкие аргументы, основанные на геномике, указывающие на центральную роль BaGTA в биологии Bartonella , прямых экспериментальных доказательств его активности недостаточно, а молекулярные механизмы, лежащие в основе его активности и регуляции, остаются неуловимыми. ^{[ 3 ]}

Геном

Частицы BaGTA крупнее, чем RcGTA, и содержат ДНК фрагменты размером 14 т.п.н. Хотя эта емкость в принципе могла бы позволить BaGTA упаковать и передать свой кластер GTA размером 14 КБ, измерения покрытия ДНК показывают снижение покрытия кластера. Считается, что соседняя область с высоким покрытием обусловлена локальной репликацией ДНК. ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ «Таксономия вирусов: выпуск 2022 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 года . Проверено 13 августа 2023 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Предложение 2022.001G.GTA_viriforms Скачать» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 18 августа 2023 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Кебат М., Кристен М., Хармс А., Кернер Дж., Кристен Б., Дехио С. (июнь 2017 г.). «Агент переноса генов способствует развитию наиболее приспособленной субпопуляции бактериального патогена» . Клеточные системы . 4 (6): 611–621.e6. дои : 10.1016/j.cels.2017.05.011 . ПМЦ 5496983 . ПМИД 28624614 .
^ Берглунд Э.К., Франк А.К., Калто А., Виннер Петтерссон О., Гранберг Ф., Эрикссон А.С., Нэслунд К., Хольмберг М., Линдроос Х., Андерссон С.Г. (июль 2009 г.). «Репликация генов адаптации хозяина связана с агентами переноса генов в геноме мыши, заражающей Bartonella grahamii» . ПЛОС Генетика . 5 (7): e1000546. дои : 10.1371/journal.pgen.1000546 . ПМЦ 2697382 . ПМИД 19578403 .

Эта вирусе статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[ICTV-1] «Таксономия вирусов: выпуск 2022 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Март 2023 года . Проверено 13 августа 2023 г.

[andersoni-2] Jump up to: ^а ^б ^с «Предложение 2022.001G.GTA_viriforms Скачать» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 18 августа 2023 г.

[Québatte2017-3] Jump up to: ^а ^б ^с Кебат М., Кристен М., Хармс А., Кернер Дж., Кристен Б., Дехио С. (июнь 2017 г.). «Агент переноса генов способствует развитию наиболее приспособленной субпопуляции бактериального патогена» . Клеточные системы . 4 (6): 611–621.e6. дои : 10.1016/j.cels.2017.05.011 . ПМЦ 5496983 . ПМИД 28624614 .

[Berglund2009-4] Берглунд Э.К., Франк А.К., Калто А., Виннер Петтерссон О., Гранберг Ф., Эрикссон А.С., Нэслунд К., Хольмберг М., Линдроос Х., Андерссон С.Г. (июль 2009 г.). «Репликация генов адаптации хозяина связана с агентами переноса генов в геноме мыши, заражающей Bartonella grahamii» . ПЛОС Генетика . 5 (7): e1000546. дои : 10.1371/journal.pgen.1000546 . ПМЦ 2697382 . ПМИД 19578403 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]